生物化学课程教学大纲.docx
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生物化学课程教学大纲
生物化学教学大纲开课院系:
海洋生命学院海洋生物系
课程教学目标与基本要求:
通过本课程的学习,要求生物科学及相关专业学生较全面了解生物体的基本化学组成,理解其主要组成物质的结构特点、性质和功能以及这些物质在体内的合成、降解、相互转化及调控等的代谢规律,深入了解这些代谢活动与各种重要生命现象之间的关系。
掌握常用的生物化学研究方法,学会综合运用所学的基本理论知识和技术来解决一些实际问题,并为学习后续课程打好基础。
授课内容与学时分配:
教学内容
教学目标
授课方式
课时
章
具体内容
第一章
绪论
一、生物化学的含义
理解生物化学的涵义
多媒体
2学时
第1周
二、生物化学的分类
了解生物化学研究内容
三、生物化学的发展史
通过学习生物化学发展简史明确生物化学与其它学科的关系、生物化学在整个生命科学中的重要地位
㈠历史背景
㈡生物化学的诞生
㈢生物化学的建立
㈣发展中的生物化学
四、中国对生物化学的贡献
了解我国科学家对生物化学的贡献
五、生物化学的应用
了解生物化学在工农业生产中的应用
明确生物化学的学习方法
第二章
糖类生物化学
一、糖类化学概论
了解糖的现代概念、分类及生物功能
多媒体\讨论
4学时
第1-2周
㈠糖类的概念与分类
㈡糖类分布及重要性
二、单糖
掌握单糖的分子结构、性质和几种重要单糖的分子结构
㈠、单糖的分子结构
㈡、单糖的性质
㈢、单糖衍生物
三、寡糖
了解常见寡糖的结构、性质
㈠、二糖
㈡、三糖
㈢、寡糖链
四、多糖
掌握几种常见多糖的结构、性质和生物功能
㈠概述
㈡同多糖
㈢、杂多糖
五、结合糖
重点掌握糖蛋白、蛋白聚糖的概念、结构、类型,寡糖链的类型、结构及生物学特性和功能
了解糖肽的结构、作用
㈠、糖蛋白
㈡、蛋白聚糖
㈢、糖肽
第三章
脂类化学
一、概论
了解脂类的概念、分类和生物学功能
多媒体
2学时
第2周
㈠、脂类的概念及生物学功能
㈡、脂类的分类
二、脂酰甘油类
了解脂酰甘油类的概念、类型,甘油三酯的类型和性质
㈠、脂肪酸
㈡、甘油三酯的物理与化学性质
三、磷脂类
掌握磷脂的基本结构、常见磷脂的结构、性质和生物功能
㈠、甘油磷脂的结构
㈡、常见的甘油磷脂
㈢、醚甘油磷脂
㈣、鞘磷脂
四、萜类、类固醇类
了解萜类、类固醇的结构和功能
掌握糖脂、脂多糖的概念、性质和功能,了解脂蛋白的类型和功能
㈠、萜类
㈡、类固醇
五、脂复合物
㈠糖脂
㈡脂多糖
㈢脂蛋白
第四章
氨基酸
一、氨基酸基本结构
掌握氨基酸的结构特点,
多媒体
4学时
第3周
二、氨基酸的分类
从各氨基酸的结构特点上理解氨基酸的分类和各自的生物特性
了解不常见蛋白质氨基酸和非蛋白质氨基酸
㈠、常见蛋白质氨基酸
㈡、不常见的蛋白质氨基酸
㈢、非蛋白质氨基酸
三、氨基酸的酸碱化学
掌握氨基酸的理化性质,重点掌握两性电离与等电点含义,
㈠、氨基酸的兼性离子形式
㈡、氨基酸的解离
㈢、氨基酸的等电点
㈣、氨基酸的甲醛滴定
四、氨基酸的化学性质
氨基酸参加的化学反应,特别是测链基团的反应,是多肽和蛋白质合成、修饰的基础
㈠、α-氨基参加的反应
㈡、α-羧基参加的反应
㈢、α-氨基和α-羧基共同参加的反应
㈣、侧链基团参加的反应
五、氨基酸的光学活性和光谱性质
了解氨基酸的光谱学性质
㈠、旋光性
㈡、光谱性质
第五章
蛋白质的共价结构
一、蛋白质通论
了解蛋白质的化学组成、分类、蛋白质分子大小、结构组织层次和蛋白质生物功能的多样性
多媒体\讨论
4学时
第4周
㈠、蛋白质的化学组成与分类
㈡、蛋白质分子的大小和分子量
㈢、蛋白质构象结构的组织层次
㈣、蛋白质功能的多样性
二、肽
了解肽、肽键的概念、结构和常见肽的性质、作用
㈠、肽和肽键的结构
㈡、肽键的特点
㈢、肽的物理和化学性质
㈣、天然存在的活性肽
三、蛋白质一级结构测定
掌握蛋白质一级结构的概念,蛋白质一级结构的测定方法与思路,能根据实验结果分析简单多肽的氨基酸顺序
㈠、测定蛋白质的一级结构的要求
㈡、蛋白质测序策略
㈢、测定步骤
㈣、蛋白质测序举例
㈤、蛋白质序列数据库
四、蛋白质的氨基酸序列与生物功能
了解蛋白质一级结构和生物功能的关系
㈠、同源蛋白质的物种差异与生物进化
㈡、同源蛋白质具有共同的进化起源
㈢、一级结构的局部断裂与蛋白质激活
第六章
蛋白质的三维结构
一、研究蛋白质构象的方法
了解研究蛋白质构象的方法
多媒体\讨论
5学时
第5周
二、稳定蛋白质三维结构的作用力
掌握稳定蛋白质三级结构的作用力的类型、形成机理和作用
㈠、氢键
㈡、范德华力
㈢、疏水作用
㈣、离子键
㈤、二硫键
三、多肽主链折叠的空间限制
了解多肽链折叠的空间限制
㈠、酰胺平面与α-碳原子的二面角
㈡、可允许的ψ和Φ值
四、二级结构
掌握蛋白质二级结构的概念、类型、结构特点
多媒体\讨论
5学时
第5周
㈠、α-螺旋
㈡、β-折叠片
㈢、β-转角和β-凸起
㈣、无规则卷曲
五、纤维状蛋白质
了解纤维蛋白的结构特点和功能
㈠、角蛋白
㈡、胶原蛋白
六、超二级结构和结构域
掌握超二级结构、结构域、三级结构的概念、类型、结构特点
㈠、超二级结构
㈡、结构域
七、球状蛋白质与三级结构
掌握三级结构的概念、类型、结构特点
掌握膜蛋白的类型、结构特点和功能
㈠、球状蛋白质的分类
㈡、球状白分子三维结构的特征
八、膜蛋白的结构
㈠、膜内在蛋白
㈡、脂锚定蛋白
九、蛋白质折叠和结构预测
了解蛋白质折叠的热力学、动力学和蛋白质结构预测的规则
㈠、蛋白质的变性
㈡、氨基酸序列规定蛋白质的三维结构
㈢、蛋白质折叠的热力学
㈣、蛋白质折叠动力学
㈤、蛋白质的结构预测
十、亚基缔合和四级结构
了解蛋白质四级缔合的概念、作用力、方式和优越性
㈠、有关四级结构的一些概念
㈡、四级缔合的驱动力
㈢、亚基相互作用的方式
㈣、四级结构的对称性
㈤、四级缔合在结构和功能上的优越性
第七章
蛋白质结构与功能的关系
一、肌红蛋白质的结构与功能
掌握肌红蛋白结构特征;氧结合的动力学特征及对结构的影响
多媒体\讨论
4学时
第6周
㈠、肌红蛋白质的三级结构
㈡、辅基血红素
㈢、氧与肌红蛋白的结合
㈣、氧的结合改变肌红蛋白的构象
㈤、肌红蛋白氧结合曲线
二、血红蛋白的结构与功能
掌握血红蛋白的结构特征;氧结合的动力学特征及对结构的影响;血红蛋白运输氧高效性的特点;
㈠、血红蛋白的结构
㈡、氧结合引起的血红蛋白构象变化
㈢、血红蛋白的氧结合曲线
三、血红蛋白的分子病
了解血红蛋白分子病和结构变异对功能的影响
㈠、镰刀状细胞贫血病
㈡、地中海贫血病
四、免疫球蛋白结构与相关生化技术
了解免疫球蛋白的结构、类型,掌握westernblot和免疫印迹技术的原理和用途
㈠、免疫球蛋白的结构
㈡、免疫球蛋白的类别
㈢、基于抗体-抗原作用的生化分析方法
第八章
酶通论
一、酶催化作用的特点
了解酶作为生物催化剂的特点,
多媒体
3学时
第7周
㈠、酶和一般催化剂的比较
㈡、酶作为生物催化剂的特点
二、酶的本质、分类与命名
酶的化学本质、分类和命名原则
㈠、酶的化学本质
㈡、蛋白酶的分类
㈢、蛋白酶的命名
三、酶作用专一性机理
掌握酶的专一性及其机理
㈠、锁与钥匙学说
㈡、“三点结合”的催化理论
㈢、诱导契合学说
四、酶的活力测定和分离纯化
掌握酶活力、比活力、总活力的概念和测定方法
㈠、酶活力测定
㈡、酶活力测定实例
五、核酶
掌握核酶、抗体酶的概念,
㈠、核酶的概念
㈡、核酶的种类
㈢、核酶研究的意义及应用前景
六、抗体酶
了解核酶的类型和抗体酶的诱导原理。
七、酶工程简介
了解酶工程的概念和研究范畴,常见酶工程的技术
㈠、化学酶工程
㈡、生物酶工程
第九章
酶促反应动力学
一、化学动力学基础
了解化学反应的动力学基础
多媒体\讨论
1学时
第7周
㈠、反应速率及其测定
㈡、反应分子数和反应级数
二、底物浓度对酶反应速度的影响
重点掌握酶促反应动力学:
米氏方程推导过程米氏方程
掌握过渡态理论含义,了解过渡态底物类似物对酶的抑制作用。
㈠、中间络合物学说
㈡、酶促反应的动力学方程式(单底物)
㈢、酶促反应的动力学方程式(多底物)
三、酶的抑制作用
掌握三种可逆抑制作用的动力学特点
㈠、抑制程度的表示方法
㈡、抑制作用类型
㈢、可逆抑制的动力学
㈣、一些重要的抑制剂
四、温度对酶反应速度的影响
掌握温度对酶反应速度的影响
五、pH对酶反应速度的影响
掌握pH对酶反应速度的影响
六、激活剂对酶反应速度的影响
掌握激活剂对酶反应速度的影响
第十章
酶的作用机制和酶的调节
一、酶的活性部位
理解、掌握酶活性部位的相关概念和特点
多媒体\讨论
3学时
第8周
㈠、酶的活性部位的特点
㈡、研究酶活性部位的方法
二、酶催化反应的独特性质
掌握酶催化反应的性质
三、影响催化效率的有关因素
掌握酶催化高效性的相关机理
㈠、底物和酶的邻近效应与定向效应
㈡、底物的形变和诱导契合
㈢、酸碱催化
㈣、共价催化
㈤、金属离子催化
㈥、多元催化和协同效应
㈦、活性部位的微环境的影响
四、催化反应机制的实例
了解几种酶的催化机制,理解结构和功能的适应性
了解酶活性的调节方式,
㈠、溶菌酶
㈡、胰核糖核酸酶A
㈢、丝氨酸蛋白酶
㈣、天冬氨酸蛋白酶
五、酶活性的调节控制
掌握酶活性的别构调节、可逆共价调节和酶原激活调节方式及生物代谢中的作用
㈠、别构调控
㈡、酶原激活
㈢、可逆的共价修饰
㈣、同工酶
第十一章
维生素和辅酶
一、维生素概论
了解维生素的分类及各种维生素的结构、生物功能以及缺陷症
多媒体\讨论
1学时
第8周
㈠、维生素的概念
㈡、维生素的发现
二、脂溶性维生素
了解脂溶性维生素的结构和功能
㈠、维生素A族
㈡、维生素D族
㈢、维生素E
㈣、维生素K
三、水溶性维生素
重点掌握维生素B与辅酶的关系以及在代谢中的催化作用
㈠、维生素B1和硫胺素焦磷酸
㈡、维生素PP和烟酰胺辅酶
㈢、维生素B2和黄素辅酶
㈣、维生素B3(泛酸)和辅酶A
㈤、维生素B6和磷酸吡哆醛、磷酸吡哆胺
㈥、维生素B12(氰钴胺素)及辅酶
㈦、维生素B7(生物素)
㈧、叶酸和四氢叶酸
㈨、硫辛酸
㈩、维生素C
四、作为辅酶的金属离子
了解金属离子作为辅酶的意义
㈠、概论
㈡、金属酶类和金属激活酶类
第十二章
生化分离技术及应用
一、离心机
掌握离心机的原理和应用
多媒体\讨论
4学时
第9周
㈠、离心机的种类
㈡、原理和相关概念
㈢、离心技术类型
二、层析
掌握层析技术的原理和应用
㈠、概述
㈡、分配层析技术
㈢、吸附层析技术
㈣、疏水作用层析
㈤、凝胶过滤层析技术
㈥、离子交换层析法
㈦、亲和层析
㈧、高效液相层析和快速蛋白液相层析
三、电泳
掌握电泳技术的原理和应用
㈠、概述
㈡、电泳的基本原理
㈢、聚丙烯酰胺凝胶电泳
四、蛋白质的性质
了解蛋白质的物理性质及沉淀机理
掌握蛋白质分离纯化的一般步骤和原则,能根据特定条件设计分离纯化方案
㈠蛋白质的酸碱性质
㈡、蛋白质的沉淀
五、蛋白质分离纯化
掌握蛋白质含量、纯度和分子量的测定方法和原理
㈠、概述
㈡、蛋白质混合物纯化方法
㈢、蛋白质的含量测定与纯度鉴定
㈣、蛋白质相对分子量的测定方法
㈤、酶的分离提纯
第十三章
核酸
一、核酸概论
了解核酸的种类、分布
掌握核酸的生物功能,特别是RNA的生物功能
多媒体\讨论
3学时
第10周
㈠、核酸的发现和研究简史
㈡、核酸的种类别和分布
㈢、核酸的生物功能
二、酸的结构
掌握几种重要核苷酸的结构和性质,核酸的一级、二级和高级结构及特征
㈠、核苷酸
㈡、核酸的共价结构
㈢、DNA的高级结构
㈣、核糖核酸(RNA)的高级结构
三、核酸的物理化学性质
掌握核酸水解、紫外吸收、变性、复性等的理化性质
㈠、核酸的水解
㈡、核酸的酸碱性质
㈢、核酸的紫外吸收
㈣、核酸的变性、复性及杂交
四、核酸的研究方法
掌握核酸常见研究方法和原理
㈠、核酸的分离、提纯和定量测定
㈡、核酸的超速离心
㈢、核酸的凝胶电泳
㈣、核酸的核苷酸序列测定
㈤、DNA聚合酶链反应(PCR)
㈥、DNA的化学合成
第十四章
代谢总论
一、基本概念
了解代谢的基本概念
多媒体
1学时
第10周
二、代谢的基本特点
掌握代谢的基本特征
㈠、代谢途径是系列酶促反应
㈡、代谢总轮廓
㈢、分解代谢和合成代谢途径通常不重
和,存在重要的差异
㈣、代谢途径存在区隔化
㈤、ATP是代谢反应中能量转移的重要载体
㈥、细胞代谢是经济而精密的调节过程
三、新陈代谢研究方法
了解新陈代谢研究方法
四、学习方法
了解代谢的学习方法
第十五章
糖酵解
一、糖酵解研究简史
了解糖酵解的研究历史,
多媒体\讨论
4学时
第11周
二、糖酵解全过程
掌握糖酵解的十步反应过程
三、糖酵解的反应机制
掌握、参与的酶和反应机理,能量代谢,生理作用和代谢调节
四、糖酵解全过程总结
掌握糖酵解全过
五、糖酵解的生理作用
掌握糖酵解的生理意义
六、糖酵解作用的调节
掌握糖酵解作用的几种调节方式
七、其他六碳糖进入糖酵解途径
其他六碳糖单糖进入糖酵解的方式
八、丙酮酸去路
掌握丙酮酸去路
第十六章
柠檬酸循环
一、柠檬酸循环概貌
掌握柠檬酸循环概念
多媒体\讨论
2学时
第12周
二、柠檬酸循环的反应机制
掌握柠檬酸循环的过程
三、柠檬酸循环总结
掌握柠檬酸循环的机理、能量代谢过程
四、柠檬酸循环的生理意义
掌握柠檬酸循环的生理意义
五、柠檬酸循环的调控
掌握柠檬酸循环调节方式
六、柠檬酸循环的回补反应
了解柠檬酸循环的回补反应
七、乙醛酸途径
了解乙醛酸循环途径
第十七章
生物氧化
一、生物氧化概论
了解生物氧化的概念
多媒体\讨论
4学时
第12-13周
二、生物氧化体系的类型
了解生物氧化体系的类型
三、电子传递链的组成和性质
掌握电子传递链的组成成分的结构和电子传递过程
㈠、NADH-Q还原酶
㈡、辅酶Q
㈢、琥珀酸-Q还原酶
㈣、细胞色素还原酶
㈤、细胞色素C
㈥、细胞色素氧化酶
四、电子传递的抑制剂
了解电子传递抑制剂和氧化磷酸化解偶联剂类型和作用点
五、氧化磷酸化
掌握ATP合酶的结构、氧化磷酸化的机制和电子传递和氧化磷酸化的耦联机制,
㈠、氧化磷酸化假说
㈡、ATP合酶结构
㈢、结合变化学说
㈣、电子传递和氧化磷酸化机制
六、细胞溶胶内NADH的再氧化
细胞溶胶内NADH再氧化途径,
七、葡萄糖彻底氧化产生ATP
会计算葡萄糖等物质完全氧化能量代谢
第十八章
糖的其他代谢途径
一、葡萄糖异生作用
掌握葡萄糖异生作用途径、生理意义和调节
多媒体\讨论
4学时
第13-14周
㈠、糖异生的前体
㈡、糖异生途径
㈢、糖异生的生理意义
㈣、糖异生的调节
二、戊糖磷酸途径
掌握磷酸戊糖途径代谢过程,意义和调节,特别是该途径与糖酵解、糖异生途径共同适应不同细胞代谢状态的调节
㈠、戊糖磷酸途径研究史
㈡、戊糖磷酸途径主要反应
㈢、代谢调节
三、淀粉和糖原代谢
掌握糖原分解和合成相关酶及调节
㈠、淀粉分解代谢
㈡、糖原分解代谢
㈢、糖原的生物合成
㈣、糖原代谢的调节
四、复合糖糖链的合成
了解复合糖寡糖链的合成过程
第十九章
脂肪酸的分解代谢
一、甘油三脂的分解代谢
了解甘油三酯的分解代谢
多媒体\讨论
1学时
第14周
㈠、体内甘油三脂的分解
㈡、甘油的代谢
二、脂肪酸的氧化
掌握脂肪酸的氧化过程、能量代谢
㈠、饱和脂肪酸的β-氧化
㈡、不饱和脂肪酸的氧化
㈢、脂肪酸的α-和ω-氧化
三、磷酸甘油脂的分解代谢(略)
了解磷脂的分解代谢
第二十章
脂肪酸的合成
一、脂肪酸的来源
了解体内脂肪酸的来源
多媒体\讨论
1学时
第14周
二、脂肪酸的合成
掌握脂肪酸的生物合成途径和能量代谢
脂肪酸合成和分解的异同点和调节
㈠、软脂酸的生物合成
㈡、脂肪酸碳链的延长
㈢、碳链的去饱和
㈣、脂肪酸降解和合成的调节
三、甘油三脂的合成
了解甘油三脂的合成
四、磷脂类的生物合成
了解磷脂的生物合成
第二十一章
蛋白质分解和氨基酸代谢
一、蛋白质的降解
了解蛋白质的降解过程
多媒体\讨论
2学时
第15周
㈠、内源蛋白质的降解
㈡、外源蛋白质的降解
㈢、氮平衡
二、氨基酸的分解代谢
掌握氨基酸的去氨基途径、尿素循环
㈠、氨基酸氨基的转移
㈡、氨基酸的脱羧基作用
㈢、氨的命运
㈣、尿素循环
㈤、氨基碳骨架的氧化途径
三、氨基酸的合成(略)
了解氨基酸碳骨架的代谢和氨基酸合成的主要路线
第二十二章
核酸降解和核苷酸代谢
一、核酸的解聚和核苷酸的降解
了解核酸降解过程
多媒体\讨论
2学时
第15周
二、碱基降解
掌握嘌呤碱和嘧啶碱基降解过程
㈠、嘌呤碱的分解
掌握核苷酸、脱氧核糖核苷酸合成与调节
㈡、嘧啶碱
三、核苷酸的生物合成
㈠、嘌呤核糖核苷酸的合成
㈡、嘧啶核糖核苷酸的合成
㈢、脱氧核糖核苷酸的合成
㈣、核苷酸代谢调控
第二十三章
DNA的复制
一、DNA的半保留复制
了解DNA的半保留
多媒体\讨论
2学时
第16周
二、DNA复制的起点和方式
掌握复制的起点和方式
三、DNA的半不连续复制
掌握半不连续复制
四、DNA复制有关的酶和蛋白质
重点掌握DNA复制相关酶和蛋白质
掌握大肠杆菌DNA复制过程,特别是起始过程和调节;
㈠、DNA聚合酶
㈡、拓扑异构酶
㈢、解螺旋酶
㈣、引物合成酶
㈤、DNA连接酶
㈥、复制相关蛋白
五、大肠杆菌DNA复制过程
六、真核生物DNA复制
真核生物DNA复制的特点及与原核生物的异同
了解真核生物端粒复制
㈠、真核生物DNA复制
㈡、真核生物端粒复制
第二十四章
RNA的生物合成和加工
一、DNA指导下RNA合成
了解RNA合成的范畴,启动子、转录因子、终止子和终止因子的概念
多媒体\讨论
2学时
第16周
㈠、概述
㈡、DNA指导下的RNA聚合酶
㈢、启动子和转录因子
㈣、终止子和终止因子
㈤、转录过程
㈥、RNA生物合成的抑制剂
二、RNA的转录后加工
掌握RNA聚合酶的特性和转录过程,特别是转录起始和终止
㈠、原核生物RNA的加工
㈡、真核生物RNA加工
三、RNA指导下的RNA合成
掌握RNA转录后加工的方式和过程
四、RNA指导下的DNA合成
掌握逆转录过程和逆转录酶
第二十五章
蛋白质合成和转运
一、蛋白质合成的分子基础
了解蛋白质合成的分子基础和作用
多媒体\讨论
2学时
第17周
㈠、mRNA是蛋白质合成的模板
㈡、遗传密码
㈢、tRNA转运活化的氨基酸
㈣、核糖体是蛋白质合成的工厂
二、蛋白质合成过程
掌握蛋白质合成的过程,氨酰tRNA酶特性、原核和真核生物蛋白质合成起始复合物形成
了解蛋白质合成的抑制剂
㈠、氨酰tRNA合成酶催化形成氨酰tRNA
㈡、原核生物蛋白质合成的起始
㈢、原核生物蛋白质合成的延伸
㈣、蛋白质合成的终止
㈤、真核生物起始复合物的形成
㈥、蛋白质合成的抑制剂
三、蛋白质合成的修饰和定向转运
了解蛋白质合成后的修饰和定向转运过程
第二十六章
代谢调控
一、物质代谢途径的相互联系
掌握整个代谢途径间的相互关系
多媒体\讨论
1学时
第17周
㈠、糖代谢与脂代谢的联系
㈡、糖代谢与氨基酸代谢的关系
㈢、氨基酸代谢与脂代谢的关系
㈣、核苷酸代谢与糖、脂、氨基酸的关系
二、物质代谢的特点
掌握物质代谢的特点
㈠、TCA是中心环节
㈡、分解合成途径往往分开,非简单逆反应
㈢、ATP是通用的能量载体
㈣、分解为合成提供还原力和能量
㈤、分解、合成受不同方式调节
三、代谢调节
理解酶活性调节、细胞结构、神经和激素对整个代谢过程的调节作用
㈠、酶水平的调节
㈡、细胞水平的调节
㈢、激素水平的调节
生物化学实验课程教学大纲
撰写人:
刘晨光于乐军
撰写时间:
2006年9月1日
开课院系:
海洋生命学院
课程编号:
0731********
课程名称:
生物化学实验
英文名称:
GeneralBiochemistryLaboratory
推荐使用教材:
生物化学实验 编者:
陈钧辉等
- 配套讲稿:
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- 关 键 词:
- 生物化学 课程 教学大纲