生物统计学复习资料第九章 两因素及多因素方差分析.docx
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生物统计学复习资料第九章两因素及多因素方差分析
第九章两因素及多因素方差分析
9.1双菊饮具有很好的治疗上呼吸道感染的功效,为便于饮用,制成泡袋剂。
研究不同浸泡时间和不同的浸泡温度对浸泡效果的影响,设计了一个两因素交叉分组实验,实验结果(浸出率)见下表[52]:
浸泡温度
/℃
浸泡时间/min
10
15
20
60
23.72
25.42
23.58
80
24.84
28.32
29.55
95
30.64
31.58
32.21
对以上结果做方差分析及Duncan检验。
该设计已经能充分说明问题了吗?
是否还有更能说明问题的设计方案?
答:
无重复二因素方差分析程序及结果如下:
optionslinesize=76nodate;
datahermed;
dotemp=1to3;
dotime=1to3;
inputeffect@@;
output;
end;
end;
cards;
23.7225.4223.58
24.8428.3229.55
30.6431.5832.21
;
run;
procanova;
classtemptime;
modeleffect=temptime;
meanstemptime/duncanalpha=0.05;
run;
TheSASSystem
AnalysisofVarianceProcedure
ClassLevelInformation
ClassLevelsValues
TEMP3123
TIME3123
Numberofobservationsindataset=9
TheSASSystem
AnalysisofVarianceProcedure
DependentVariable:
EFFECT
SumofMean
SourceDFSquaresSquareFValuePr>F
Model487.070777821.767694412.560.0155
Error46.93217781.7330444
CorrectedTotal894.0029556
R-SquareC.V.RootMSEEFFECTMean
0.9262564.7418811.3164527.7622
SourceDFAnovaSSMeanSquareFValuePr>F
TEMP278.720288939.360144422.710.0066
TIME28.35048894.17524442.410.2058
TheSASSystem
AnalysisofVarianceProcedure
Duncan'sMultipleRangeTestforvariable:
EFFECT
NOTE:
ThistestcontrolsthetypeIcomparisonwiseerrorrate,not
theexperimentwiseerrorrate
Alpha=0.05df=4MSE=1.733044
NumberofMeans23
CriticalRange2.9843.050
Meanswiththesameletterarenotsignificantlydifferent.
DuncanGroupingMeanNTEMP
A31.47733
B27.57032
C24.24031
TheSASSystem
AnalysisofVarianceProcedure
Duncan'sMultipleRangeTestforvariable:
EFFECT
NOTE:
ThistestcontrolsthetypeIcomparisonwiseerrorrate,not
theexperimentwiseerrorrate
Alpha=0.05df=4MSE=1.733044
NumberofMeans23
CriticalRange2.9843.050
Meanswiththesameletterarenotsignificantlydifferent.
DuncanGroupingMeanNTIME
A28.44733
A
A28.44032
A
A26.40031
从方差分析结果可以得知,温度是极显著的影响因素,时间是不显著因素。
在Duncan检验中,温度的三个水平之间差异是显著的。
时间的三个水平间差异不显著。
本实验是二因素固定模型设计,如果设置重复,会得到两个因素之间的交互作用(如果存在的话),其结果能更好地说明问题。
以上方差分析的结果可以归纳成下表:
变差来源
平方和
自由度
均方
F
P
温度(temp)
78.7202889
2
39.3601444
22.71
0.0066
时间(time)
8.3504889
2
4.1752444
2.41
0.2058
误差
6.9321778
4
1.7330444
总和
94.0029556
8
9.2研究浙江蜡梅大苗移栽技术,处理方式包括移栽后的不同覆盖方式和做床方法,统计每100株移栽苗的成活率,结果见下表[53]:
做床方法
精细作床
仅挖穴
覆盖方法
遮阴
93%
85%
未遮阴
90%
81%
根据以往经验在覆盖方法与作床方法之间不存在交互作用,对上述结果做方差分析。
请注意,这里的结果是百分数。
答:
本例需对数据做反正弦变换,程序和结果如下:
optionslinesize=76nodate;
dataplum;
docover=1to2;
doseedbed=1to2;
inputy@@;
surrate=arsin(sqrt(y/100))*180/3.14159265;
output;
end;
end;
cards;
9385
9081
;
run;
procanova;
classcoverseedbed;
modelsurrate=coverseedbed;
run;
TheSASSystem
AnalysisofVarianceProcedure
ClassLevelInformation
ClassLevelsValues
COVER212
SEEDBED212
Numberofobservationsindataset=4
TheSASSystem
AnalysisofVarianceProcedure
DependentVariable:
SURRATE
SumofMean
SourceDFSquaresSquareFValuePr>F
Model264.595344532.297672290390.150.0024
Error10.00035730.0003573
CorrectedTotal364.5957018
R-SquareC.V.RootMSESURRATEMean
0.9999940.0272380.0189069.3987
SourceDFAnovaSSMeanSquareFValuePr>F
COVER19.45155129.451551226451.660.0039
SEEDBED155.143793355.143793399999.990.0001
从结果可以看出,覆盖方式和做床方式都是极显著因素。
以上结果可以归纳成下表:
变差来源
平方和
自由度
均方
F
P
覆盖方法(cover)
9.4515512
1
9.4515512
26451.66
0.0039
做床方法(seedbed)
55.1437933
1
55.1437933
99999.99
0.0001
误差
0.0003573
1
0.0003573
总和
64.5957018
3
9.3为了研究不同NaCl质量浓度对小麦愈伤组织生长的影响。
配制质量浓度分别为0、0.1%、0.3%和0.5%的NaClMS培养基,接种15天后,测定每块愈伤组织平均增重百分率,结果见下表[54]:
材料名称
NaCl质量浓度/%/
H8706-34/%
G8901/%
极早熟/%
中国春/%
0
103.80
63.70
67.32
67.10
0.1
99.31
56.27
52.24
52.30
0.3
52.26
45.01
24.17
34.30
0.5
18.38
15.37
20.40
13.22
对上述结果进行方差分析。
作者已经给出四种实验材料都是盐敏感型小麦,但是不同的小麦品种必定对盐的抗性不同。
也就是说,品种与盐浓度之间存在交互作用,更完善的实验应当怎样设计?
答:
这是一个固定模型设计,程序不再给出,结果如下。
TheSASSystem
AnalysisofVarianceProcedure
ClassLevelInformation
ClassLevelsValues
CONCEN41234
MATERIAL41234
Numberofobservationsindataset=16
TheSASSystem
AnalysisofVarianceProcedure
DependentVariable:
INCREASE
SumofMean
SourceDFSquaresSquareFValuePr>F
Model610411.90811735.318014.180.0004
Error91101.6046122.4005
CorrectedTotal1511513.5126
R-SquareC.V.RootMSEINCREASEMean
0.90432122.5454511.063549.0719
SourceDFAnovaSSMeanSquareFValuePr>F
CONCEN38374.158672791.3862222.810.0002
MATERIAL32037.74942679.249815.550.0196
方差分析结果指出,盐浓度是极显著的影响因素,不同基因型的愈伤组织是显著影响因素。
根据以往的研究工作的经验,盐浓度与基因型之间可能存在交互作用,最理想的设计应当设置重复,从总平方和中分离出交互作用平方和,问题可以说明得更确切。
以上结果可以归纳成下表。
变差来源
平方和
自由度
均方
F
P
浓度间
8374.1587
3
2791.3862
22.81
0.0002
品系间
2037.7494
3
679.2498
5.55
0.0196
误差
1101.6046
9
122.4005
总和
11513.5127
15
9.4为了研究植物的光合作用,设计了一个实验。
将烟草的两个变种种植在田间,利用CO2-depletion技术检测单位叶面积捕获CO2的比率。
实验共涉及两个因素:
一个是变种,选用了两个变种;另一个是抽样时期,在整个生长季共进行40次田间抽样。
这是一个无重复两因素实验设计,方差分析表如下[55]:
变差来源
平方和
自由度
均方
F
抽样时期
3.356
39
0.0604
33.25*
变种
0.0157
1
0.0157
8.66*
误差
0.0711
39
0.00182
总和
2.443
79
注:
*P<0.01。
根据实验设计,该设计是一种什么模型?
实验所涉及的两个因素属于哪一种类型的因素?
为什么?
答:
这是一个混合模型实验。
变种是固定因素,抽样时期是随机因素。
因为实验没有设置重复,在无重复的情况下,三种模型的检验统计量是一样的,不知作者为什么不考虑设置重复。
两个变种是人为选定的,是固定因素。
田间抽样是随机抽取的,是随机因素。
9.5野生型C57BL/6及STAT-1-/-型小鼠胰岛,在移入四氧嘧啶糖尿病的BALB/c小鼠中之后的存活天数见下表[56]:
实验材料
养生处理
未处理
IL-1ra*
IL-1ra+CsA
野生型C57BL/6
61111111212
131313141414
151517
1014
12141415
151621
STAT-1–/–型
1112131313
1014
10121417
1723
注:
*IL-1ra:
interleukin-1receptorantagonist(白介素-1受体拮抗物)。
**CsA:
cyclosporineA(环孢菌素A)。
对上述结果进行方差分析,判断两种类型小鼠的胰岛存活天数差异是否显著?
不同养生处理对移植的胰岛存活天数的影响是否显著?
不同养生处理与不同型小鼠之间是否存在交互作用?
答:
这是一个重复数不等的两因素固定模型实验,所用程序及计算结果如下。
optionslinesize=76nodate;
datamouse;
infile'e:
\data\exr9-5e.dat';
dotreat=1to3;
dotype=1to2;
inputn@@;
dorepetit=1ton;
inputdays@@;
output;
end;
end;
end;
run;
procglm;
classtreattype;
modeldays=treattypetreat*type;
run;
TheSASSystem
GeneralLinearModelsProcedure
ClassLevelInformation
ClassLevelsValues
TREAT3123
TYPE212
Numberofobservationsindataset=37
TheSASSystem
GeneralLinearModelsProcedure
DependentVariable:
DAYS
SumofMean
SourceDFSquaresSquareFValuePr>F
Model570.127284414.02545691.670.1724
Error31261.06190488.4213518
CorrectedTotal36331.1891892
R-SquareC.V.RootMSEDAYSMean
0.21174421.431622.9019613.5405
SourceDFTypeISSMeanSquareFValuePr>F
TREAT226.515169613.25758481.570.2233
TYPE13.21912273.21912270.380.5409
TREAT*TYPE240.392992120.19649612.400.1075
SourceDFTypeIIISSMeanSquareFValuePr>F
TREAT210.56031975.28015980.630.5408
TYPE10.00899150.00899150.000.9741
TREAT*TYPE240.392992120.19649612.400.1075
在方差分析表中我们选用I型可估函数,从F的显著性概率可以得出,不论是养生处理、小鼠类型还是两者的交互作用都是不显著因素。
上述结果可以归纳成下表:
变差来源
平方和
自由度
均方
F
P
处理间
26.5151696
2
13.2575848
1.57
0.2233
类型间
3.2191227
1
3.2191227
0.38
0.5409
处理×类型
40.3929921
2
20.1964961
2.40
0.1075
误差
261.0619048
31
8.4213518
总和
331.1891892
36
9.6野生型C57BL/6及STAT-1-/-型小鼠胰岛,在移入自发糖尿病的NOD#小鼠中之后的存活天数见下表[56]:
实验材料
养生处理
未处理
IL-1ra*
CsA**
IL-1ra+CsA
野生型C57BL/6
00255
11111213
131517
058
121215
888
101011
18
5101111
121620
STAT-1–/–型
6101013
1012
51314
10111112
1213
注:
#NOD:
nonobesediabetic(非肥胖糖尿病)。
*IL-1ra:
interleukin-1receptorantagonist(白介素-1受体拮抗物)。
**CsA:
cyclosporineA(环孢菌素A)。
对上述结果进行方差分析,判断两种类型小鼠的胰岛存活天数差异是否显著?
不同养生处理对移植的胰岛存活天数的影响是否显著?
不同养生处理与不同型小鼠之间是否存在交互作用?
答:
本题与第5题的程序基本一样,下面只给出计算的结果。
TheSASSystem
GeneralLinearModelsProcedure
DependentVariable:
DAYS
SumofMean
SourceDFSquaresSquareFValuePr>F
Model781.745947311.67799250.550.7939
Error39833.488095221.3714896
CorrectedTotal46915.2340426
R-SquareC.V.RootMSEDAYSMean
0.08931745.646594.6229310.1277
SourceDFTypeISSMeanSquareFValuePr>F
TREAT367.988010822.66267031.060.3770
TYPE18.04102568.04102560.380.5432
TREAT*TYPE35.71691091.90563700.090.9656
SourceDFTypeIIISSMeanSquareFValuePr>F
TREAT360.485164820.16172160.940.4290
TYPE18.07626988.07626980.380.5423
TREAT*TYPE35.71691091.90563700.090.9656
本题的两个主效应和它们的交互作用都是不显著因素。
以上结果可以归纳成下表:
变差来源
平方和
自由度
均方
F
P
处理间
67.9880108
3
22.6626703
1.06
0.3370
类型间
8.0410256
1
8.0410256
0.38
0.5432
处理×类型
5.7169109
3
1.9056370
0.09
0.9656
误差
833.4880952
39
21.3714896
总和
915.2340426
46
9.7一项音乐心理学研究,实验是这样设计的:
为了避免熟悉的音乐环境,实验安排在两种非典型的音乐练习和演出环境中进行。
一种环境是在剧场底层敞开的大厅中(环境A),另一种是在办公室中(环境B)。
要求实验参与者学习并回忆所学习的练习曲。
学习和回忆包括在相同环境中(AA,BB)和不同环境中(AB,BA),评判学习和回忆的得分,从而判断得分与环境之间的关系[57]。
该实验是一个典型的两因素交叉分组实验设计,方差分析表如下:
变差来源
平方和
自由度
均方
F
P
学习环境
180.267
1
180.267
1.441
0.275
回忆环境
640.267
1
640.267
5.120
0.064
学习环境×回忆环境
1008.600
1
1008.600
8.065
0.030
误差
750.333
6
125.056
总和
2579.467
9
问:
(1)本实验共有几次重复?
为什么?
(2)本实验属于哪一种模型?
为什么?
(3)本实验的两个因素中哪些因素是显著因素?
在本实验中显著因素的意义是什么?
你可以得到什么结论?
答:
(1)因为本实验共有4种条件组合,df误差=(组合1重复数-1)+(组合2重复数-1)+(组合3重复数-1)+(组合4重复数-1)=重复数-4=6。
因此,重复数=6+4=10。
(2)属固定模型。
因为:
①根据作者所用的检验统计量,②由①推断,环境的水平是人为选定的。
(3)只有交互作用是显著的。
说明音乐的学习是与环境的两种特定水平有关的。
结论:
音乐的学习属本例的两种特定环境依赖型记忆。
作者的结论是:
音乐的学习属环境依赖型记忆。
这样的叙述不够严格,只有随机模型才能够得到这样的结论,固定模型只能说“音乐的学习属本例的两种特定环境依赖型记忆”。
9.8与上一实验类似,这次是记忆一段16小节的钢琴曲。
在同一房间中放置两台钢琴,一台是平台式大钢琴(环境A),一台是播音室钢琴(环境B)。
参与者在一台钢琴上学习这段曲谱之后,在同一台钢琴上(AA,BB)或不同钢琴上(AB,BA),回忆这段曲子。
根据回忆的正确性获得评分[57]。
变差来
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