全国细菌耐药监测网上传数据标准试用版.docx

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全国细菌耐药监测网上传数据标准试用版

全国细菌耐药监测网信息系统

数据上报标准（试用）

全国细菌耐药监测网通过“全国细菌耐药监测网信息系统”收集所有成员单位的耐药监测数据，系统具备完善的数据筛选和容错处理功能。

一、科室代码设置

监测网成员单位首次登录时须先在本院科室维护栏内登记注册医院临床科室并将其映射至系统所要求的标准科室分类上，科室代码为上报数据中DEPARTMENT字段中保存的代码，也可以设置成系统内置的标准科室代码，此代码可为数字代码、英文代码或中文名，最多允许15个字符（不区分中英文），设置后可随时增加和修改。

上传的数据文件格式为Whonet5.6的通用文件格式，后缀必需为“.dbf”（系统未来可能会支持Excel表格与Csv平面文本文件）。

二、数据文件各字段要求

1、来源ORIGIN

非必填字段，最长1个字符。

若填写，则其必须为“h”，若不填写，数据上传后系统会自动补充，若填写值不为“h”，系统将自动替换成“h”。

2、国家COUNTRY_A

非必填字段，最长3个字符。

若填写，则其必须为“CHN”，若未填写，数据上传后系统会自动补充。

3、医院INSTITUT

非必填字段，为卫生部统一分配的标准代码，标准6字符，前两位为国家标准省级代码（如北京为11，云南为53等），后4位为各省编码（从0001开始），如昆明医科大学第一附属医院可能为（），若未填写，数据上传后系统自动补充已注册的医院标准代码，若填写则必须与本院的代码一致，否则系统会自动替换为正确代码，在数据上传时此字段不建议填值。

4、实验室LABORATORY

非必填字段，最长3个字符。

系统不再将此作为医院标识，无具体格式要求，在数据上传时此字段不建议填值。

5、病历号PATIENT_ID

必填字段，要求至少填写总数据量的90%（住院病人要求全部填写，其余10%对应门诊无病历号的数据），最长16字符。

6、姓氏LAST_NAME和名字FIRST_NAME

以上两项只需有一项且必需有其中一项正确填写，最长12各个字符（即6个中文字符），此两项任意一项须100%填写。

7、性别SEX

此字段要求100%必填，最长1个字，WHONET要求只能填写“f”或者“m”，系统提供了相关的容错处理机制，允许填写“男”和“女”，系统会自动将“男”替换成“m”，将“女”替换成“f”。

8、年龄字段AGE

此字段要求100%必填字段，最长3个字符。

（1）不带任何后缀的1~3位整数或者2位数字+"y"后缀，代表年龄是按岁计算。

（2）2位数字+"d"即代表年龄按天计算。

（3）2位数字+"w"即代表年龄按周计算。

（4）2位数字+"m"即代表年龄按月计算。

（5）空值或其它字符，系统会认为是非法值，需补充修改后才能上报。

9、年龄类别PAT_TYPE

非必填字段，系统会根据年龄AGE自动生成该字段，即使是数据中已经填写了该值系统也会强制替换，若要填写，则该字段长度必须为3位字符，具体的计算规则如下：

1）当AGE后缀为“d”代表“天”时：

A.<=28，生成“new”代表“新生儿”；

B.>28，生成“ped”代表“儿童”；

2）当AGE后缀为“w”代表“周”时：

A.<=4，生成“new”代表“新生儿”；

B.>4，生成“ped”代表“儿童”；

3）当AGE后缀为“m”代表“月”时：

A.0，生成“new”代表“新生儿”；

B.>=1，生成“ped”代表“儿童”；

4）当AGE为纯数字，代表“岁”时：

A.0，生成“unk”代表“不明”，需修正后才能上报；

B.>=1并且<=14，生成“ped”代表“儿童”；

C.>=15并且<=65，生成“adu”代表“成人”；

D.>65，生成“ger”代表“老年”。

10、科室（送检科室）WARD

为非必填项，最大长度为15字，中英文不限。

11、科室类别WARD_TYPE

为100%必填项，最大长度为3个字，必须与WHONET内置的代码要求一致，见附表

（1）。

12、专业类别DEPARTMENT

为100%必填项，最大长度为6个字，中英文不限（WHONET默认长度为3），此字段所填写的值，必须在用户系统设置的本院科室代码字典库中（科室代码设置见第一条）。

未在字典库中的科室代码为非法值，无法通过系统校验，当数据上传成功后，系统会自动将此字段中的本院科室代码替换为系统内置的标准科室分类代码，系统内置的标准科室分类代码见附表

（2）。

13、标本类型数字代码SPEC_TYPE和英文代码SPEC_CODE

不要求两者都完整，只要有其中一项即可，系统会根据其中一项自动补齐另一项。

英文代码必须是2字符，数字代码最大3字符，两个字段都分别有自己的标准代码库（同样源自WHONET数据库，见附表3）。

如果两者都有，但不匹配的例如痰标本的英文代码为“sp”，数字代码应该为“3”，如果填写了其它数字代码，系统会给出提示，要求修正不匹配的数据后再次上传。

超出附表内的标本类型系统视为非法值，需修正后才能上报数据。

另外，当标本类型为质控标本（即SPEC_TYPE为qc或者ex，并且SPEC_CODE为75或99）时，系统会给出提示并自动忽略该条数据。

14、标本编号SPEC_NUM字段

100%必填字段，最大长度12字。

15、检验结果（细菌）ORGANISM

100%必填字段，标准3位英文字符代码，此代码为WHONET5.6标准细菌代码；系统仅接受附表（4）所列出的细菌，不接受真菌，支原体，厌氧菌和分枝杆菌等。

附表（4）所规定的标准代码外的数据，系统会给出提示并自动忽略该条数据。

16、细菌类别ORG_TYPE

系统仅接受革兰阳性菌“+”和革兰阴性菌代码“-”，最大允许1字符，此字段可不填写。

当系统发现未填写时会自动根据ORGANISM字段的值推导出来，当系统发现本字段中填写的值与系统所推导的合法值不匹配的时候，会自动将其替换成合法值。

17、β-内酰胺酶BETA_LACT

非必填字段，1字符，且值仅能为“+”或“-”，若填写为“n”、“ne”、“neg”、“negative”或者中文全角“＋”，系统会自动将其修正为半角英文“+”，若填写为“p”、“po”、“pos”、“positive”或者中文全角“－”，系统会自动将其修正为半角英文“-”。

18、超广谱β-内酰胺酶ESBL

规则同上。

19、耐甲氧西林葡萄球菌检测试验MRSA_SCRN

规则同上。

20、诱导型克林霉素耐药试验INDUC_CLI

规则同上。

21、霍奇试验HODGE

非必需字段，规则同上。

22、碳青酶烯酶CARBAPENEM

规则同上。

23、送检日期（标本日期）SPEC_DATE

为100%必填字段，格式为2013/10/13或者2013-10-13，必须为10字符，若为其它格式，系统自动修正为yyyy-mm-dd格式。

24、报告日期（数据录入日期）DATE_DATA

为非必填字段，规则同上。

25、抗生素

所有抗生素代码采用Whonet5.6标准代码。

抗生素代码见附表（5）。

1）纸片法（K-b法）：

代码须包含抗生素含量，如填写结果只能为6至80之间的整数，不能是小数，也不能带任何符号，否则视为填写错误，系统会将该值忽略，这会影响该列的通过率。

2）MIC法：

如果填写，则长度不能超出6个字符，否则视为填写错误，系统会将该值忽略，这会影响该列的通过率。

填写规则：

A.不接受S、I、R，若填写S、I、R视为填写错误，系统会将该值忽略，这会影响该列的通过率。

B.数字为半角纯数字，可为小数，不允许出现全角数字，否则视为填写错误，系统会将该值忽略，这会影响该列的通过率。

C.允许带>、>=、<、<=的数字，例如：

<=1、>=4等。

D.允许带“/”分隔符的格式，例如：

64/4，上传后系统自将“/”后面的字符含“/”一起删除掉，仅保留“/”前面的字符。

E.允许结果“SYN-S”、“SYN-R”，上传后系统自动将GEH_NM结果为SYN-S替换为<=500，SYN-R替换为>=1000；将STH_NM结果为SYN-S替换为<=1000，SYN-R替换为>=2000。

F.关于复方新诺明（SXT_NM）结果，上传后系统自动将数据为320的字符替换为16，160替换为8，80替换4，40替换为2，20替换为1，10替换为0.5，其余字符保持原始数据。

G.系统会将数据中出现的一些特殊字符替换为合法字符，具体如下：

a）全角“≧”或“≥”将替换为半角“>=”

b）全角“≦”、“≤”将替换为半角“<=”

c）全角“＞”将替换为半角“>”

d）全角“＜”将替换为半角“<”

e）全角“＝”将替换为半角“=”

f）全角“．”与“。

”将替换为半角“.”

3）在数据中若出现未在附表（5）中的其它抗生素字段，系统会自动忽略该字段的数据，不予保存。

4）本系统目前抗菌药物敏感性执行标准为CLSIM100-S23，上传数据如果有未达到该折点标准的数据，系统会将该组数据中的未达到CLSIM100-S23标准的抗生素结果忽略。

如某一抗生素，CLSIM100-S23折点为S:

<=2，I:

4-8，R:

>=16，测定结果为<=8，这样的数据系统无法判断是敏感还是中介，系统会自动将该组数据中的这个抗生素结果忽略掉，不予保存，不影响通过率。

2014新版细菌耐药监测信息系统具备了强大的数据容错处理功能，能将上传的不合格数据自动修正或删除，处理为合格的数据文件，同时具备一定的学习功能，用户可以下载经容错处理后的数据发现并纠正错误，不断改进，提高数据质量，同时可将修正后数据用于本机构细菌耐药监测统计分析。

附表1.WARD_TYPE代码表

代码

含义

out

门诊病人

in

住院病人

inx

住院病人（非-ICD）

icu

重症监护病房

int

过度监护病房

eme

急诊

nur

家庭护理

com

社区

hos

其它医院

lab

实验室

aba

Abattoir（屠宰场）

vet

Veterinaryclinic（兽医诊所）

far

Farm（农场）

fie

Field（野外）

sto

Store/Market（商店/超市）

res

Restaurant（饭店）

zoo

Zoo（动物园）

mix

混合

unk

未知（不明来源）

oth

其他（来源明确但不属于上述任何一种情况）

附表2.系统内置标准科室代码表

（待定）

附表3.SPEC_TYPE与SPEC_CODE对照表

名　称

SPEC_CODE数字代码

SPEC_NUM英文代码

名　称

SPEC_CODE

数字代码

SPEC_NUM

英文代码

鼻腔拭子

1

no

水

96

wa

咽拭子

2

th

食物

97

fo

痰

3

sp

不明标本

98

un

支气管分泌物

4

br

质控

99

qc

耳部标本

5

ea

头发

100

hr

眼分泌物

6

ey

指甲

101

nl

口腔拭子

7

mo

鼻咽拭子

102

np

皮肤拭子

8

sk

足拭子

103

ft

关节拭子

9

jt

尸检标本

104

au

导尿管尿

10

uc

异物

105

fb

尿液

11

ur

胎粪

106

mc

血液

12

bl

子宫内避孕器

107

iu

脑脊液

13

sf

前段尿

108

fv

肺穿刺液

14

lu

脐部拭子

109

us

腹水

15

ab

隔离标本

110

is

胃液

16

ga

腹部脓肿

111

ad

排泄物

17

dr

烧伤标本

112

bs

液体

18

fl

永久导管

113

cp

胆汁

19

bi

角膜标本

114

cr

伤口拭子

21

wd

脓胸

115

ee

外科手术伤口拭子

22

sw

胸膜脓肿

116

ep

脓肿

23

as

硬膜下脓肿

117

es

脓液

24

ps

人工心脏瓣膜

118

hp

羊水

25

am

小支气管肺泡灌洗液

119

mb

气管插管

26

tr

起博器

120

pm

窦道拭子

27

si

胰腺标本

121

pn

棉签

28

sb

心包积液

122

pd

吸气管

29

at

导管尖端

123

cs

无菌体液

30

fn

人工骨

124

pb

器官

31

og

人工分流管

125

sh

宫颈拭子

32

cx

人工血管

126

pv

脐带标本

33

um

保护性导管刷

127

pc

阴道拭子

34

va

扁桃体穿刺液

128

tn

活检组织

35

bx

褥疮溃疡

129

ud

组织

36

ti

非导管尿

130

uz

脑部组织

37

bn

肾穿刺尿

131

uo

心脏标本

38

he

未知来源尿

132

uu

心脏瓣膜

39

hv

扁桃体脓肿

133

pt

肝脏穿刺液

40

li

牙龈脓肿

134

de

粪便

41

st

肛周脓肿

135

ac

直肠拭子

42

re

皮肤脓肿

136

ak

肌肉标本

43

mu

阑尾

137

ap

手部拭子

44

ha

外周导管

138

ch

手臂拭子

45

ar

培养基

140

cm

腋窝拭子

46

ax

前庭大腺囊肿

141

cb

结膜拭子

47

co

引流液

142

dn

中耳拭子

48

em

心内膜

143

ec

外耳拭子

49

eo

附睾标本

144

ed

瘘管

50

fi

会厌拭子

145

eg

生殖器拭子

51

gn

食管拭子

146

eh

男性外生殖器拭子

52

gm

输卵管

147

fa

女性外生殖器拭子

53

gf

疖

148

fu

胎盘组织

54

pl

胆囊标本

149

gb

乳房穿刺液

55

bt

髋关节标本

150

hi

乳汁

56

mi

髋关节液

151

hf

精液

57

sm

昆虫

152

it

尿道拭子

58

ue

关节腔积液

153

jf

清洁中段尿

59

cv

膝盖拭子

154

kn

分泌物

60

se

膝关节液

155

kf

骨组织

61

bo

喉拭子

156

lx

骨髓

62

bm

唇拭子

157

lp

支气管肺泡灌洗液

63

ba

恶露

158

lo

胸水

64

pf

卵巢组织

159

ov

下呼吸道标本

65

rl

阴茎拭子

160

pe

上呼吸道标本

66

ru

阴茎分泌物

161

pg

气管抽出液

67

ta

会阴拭子

162

pi

外部溃疡标本

68

ux

血浆

163

pa

内部溃疡标本

69

ui

前列腺组织

164

po

筛选标本

70

sc

前列腺液

165

pu

筛选MRSA标本

71

mr

直肠子宫陷凹穿刺液

166

rc

筛选VRE标本

72

vr

检测寄生虫用透明胶带

167

tp

科研标本

73

rs

血清

168

sr

实验室标本

74

la

分流液

169

su

外部质控

75

ex

脾组织

170

sl

呼吸道标本

76

rp

抗酸染色痰

171

sa

溃疡标本

77

ul

诱导痰

172

in

膀胱尿

78

ub

吞线试验检测寄生虫

173

sg

肾脏尿

79

uk

睾丸穿刺液

174

te

耻骨弓上穿刺尿

80

ua

牙齿

175

to

肾脏标本

81

ki

蠕虫

176

wo

子宫拭子

82

ut

胸部伤口拭子

177

wt

十二指肠液

83

du

腹部拭子

178

an

纵膈拭子

84

me

血管

179

bv

囊液

85

bu

头部拭子

181

hd

囊肿穿刺液

86

cy

唾液腺穿刺液

182

sv

淋巴结穿刺液

87

ln

腿部拭子

183

lg

腺体穿刺液

88

gl

颈部拭子

184

nk

其它

89

ot

神经

185

nv

导管

91

ca

盆腔积液

186

lv

透析液

92

di

筛选艰难梭菌

187

cd

环境标本

93

en

腹股沟拭子

188

gr

假体

94

pr

腹股沟三角区拭子

189

ig

中央导管

95

cc

脐带导管

190

cu

附表4.细菌代码对应表

代码

名　　称

代码

名　　称

aba

鲍曼不动杆菌

mmo

摩根摩根菌摩根亚种

aca

醋酸钙不动杆菌

ngo

淋病奈瑟菌

acv

豚鼠气单胞菌

nme

脑膜炎奈瑟菌

aeh

嗜水气单胞菌

pae

铜绿假单胞菌

aha

溶血不动杆菌

pce

洋葱伯克霍尔德菌

ajo

约氏不动杆菌

pma

嗜麦芽窄食单胞菌

aju

琼氏不动杆菌

pmi

奇异变形杆菌

alw

鲁氏不动杆菌

ppm

假鼻疽伯克霍尔德菌

asa

杀鲑气单胞菌

ppu

恶臭假单胞菌

axy

木糖氧化无色杆菌

pre

雷极普罗威登斯菌

bca

卡他摩拉菌

pst

斯氏普罗威登斯菌

bma

鼻疽伯克霍尔德菌

saa

甲型副伤寒沙门菌

bsa

A群β-溶血链球菌

sab

乙型副伤寒沙门菌

bsb

B群β-溶血链球菌

sac

丙型副伤寒沙门菌

bsc

C群β-溶血链球菌

sam

沙门菌鼠伤寒血清型

bse

E群β-溶血链球菌

san

咽峡炎链球菌

bsf

F群β-溶血链球菌

sap

腐生葡萄球菌

bsg

G群β-溶血链球菌

sat

伤寒沙门菌血清型

cfr

弗劳地柠檬酸杆菌

sau

金黄色葡萄球菌

cyo

杨氏柠檬酸杆菌

sdy

停乳链球菌

eae

产气肠杆菌

sep

表皮葡萄球菌

eav

鸟肠球菌

sgc

无乳链球菌

eca

铅黄肠球菌

sha

痢疾志贺菌

ecl

阴沟肠杆菌

shb

福氏志贺菌

eco

大肠埃希菌

shc

鲍氏志贺菌

efa

粪肠球菌

sho

人葡萄球菌人亚种

efm

屎肠球菌

slq

液化沙雷菌

ega

鹑鸡肠球菌

slu

路邓葡萄球菌

egg

日沟维肠杆菌

sma

粘质沙雷菌

esa

阪崎肠杆菌

sod

气味沙雷菌

fin

产吲哚金黄杆菌

spn

肺炎链球菌

hin

流感嗜血杆菌

spy

化脓性链球菌

kor

解鸟氨酸拉乌尔菌

ssn

血链球菌

kox

产酸克雷伯菌

ssr

松鼠葡萄球菌

koz

肺炎克雷伯菌臭鼻亚种

svi

草绿色链球菌

kpn

肺炎克雷伯菌

sxy

木糖葡萄球菌

krn

肺炎克雷伯菌鼻硬结亚种

vic

霍乱弧菌

krn

鼻硬结克雷伯菌

vip

副溶血弧菌

附表5.抗菌药物代码表

抗生素

代码

英文名称

中文名称

WHONET

字段名

AMC

Amoxicillin/Clavulanicacid

阿莫西林/克拉维酸

AMC_ND20

AMC

Amoxicillin/Clavulanicacid

阿莫西林/克拉维酸

AMC_NM

AMK

Amikacin

阿米卡星

AMK_ND30

AMK

Amikacin

阿米卡星

AMK_NM

AMP

Ampicillin

氨苄西林

AMP_ND10

AMP

Ampicillin

氨苄西林

AMP_NM

AMX

Amoxicillin

阿莫西林

AMX_ND25

AMX

Amoxicillin

阿莫西林

AMX_ND30

AMX

Amoxicillin

阿莫西林

AMX_NM

ATM

Aztreonam

氨曲南

ATM_ND30

ATM

Aztreonam

氨曲南

ATM_NM

AZM

Azithromycin

阿奇霉素

AZM_ND15

AZM

Azithromycin

阿奇霉素

AZM_NM

CAZ

Ceftazidime

头孢他啶

CAZ_ND30

CAZ

Ceftazidime

头孢他啶

CAZ_NM

CEC

Cefaclor

头孢克洛

CEC_ND30

CEC

Cefaclor

头孢克洛

CEC_NM

CEP

Cephalothin

头孢噻吩

CEP_ND30

CFP

Cefoperazone

头孢哌酮

CFP_ND75

CFP

Cefoperazone

头孢哌酮

CFP_NM

CHL

Chloramphenicol

氯霉素

CHL_ND30

CHL

Chloramphenicol

氯霉素

CHL_NM

CIP

Ciprofloxacin

环丙沙星

CIP_ND5

CIP

Ciprofloxacin

环丙沙星

CIP_NM

CLI

Clindamycin

克林霉素

CLI_ND2

CLI

Clindamycin

克林霉素

CLI_NM

CRB

Carbenicillin

羧苄西林

CRB_ND100

CRO

Ceftriaxone

头孢曲松

CRO_ND30

CRO

Ceftriaxone

头孢曲松

CRO_NM

CSL

Cefoperazone/Sulbactam

头孢哌酮/舒巴坦

CSL_ND30

CSL

Cefoperazone/Sulbactam

头孢哌酮/舒巴坦

CSL_ND75

CSL

Cefoperazone/Sulbactam

头孢哌酮/舒巴坦

CSL_NDXX

CSL

Cefoperazone/Sulbactam

头孢哌酮/舒巴坦

CSL_NM

CTT

Cefotetan

头孢替坦

CTT_ND30

CTT

Cefotetan

头孢替坦

CTT_NM

CTX

Cefotaxime

头孢噻肟

CTX_ND30

CTX

Cefotaxime

头孢噻肟

CTX_NE

CTX

Cefotaxime

头孢噻肟

CTX_NM

CXM

Cefuroxime

头孢呋辛

CXM_ND30

CXM

Cefuroxime

头孢呋辛

CXM_NM

CZO

Cefazolin

头孢唑啉

CZO_ND30

CZO

Cefazolin

头孢唑啉

CZO_NM

CZX

Ceftizoxime

头孢唑肟

CZX_ND30

DOR

Doripenem

多尼培南

DOR_ND10

DOR

Doripenem