天津科技大学考研 612分子生物学DNA复制修复及重组练习题.docx
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天津科技大学考研612分子生物学DNA复制修复及重组练习题
核酸的生物合成参考答案
(一)名词解释(部分由作业外的也需要掌握)
1.中心法则(centraldogma):
生物体遗传信息流动途径。
最初由Crick(1958)提出,经后人的不断补充和修改,现包括反转录和RNA复制等内容。
2.半保留复制(简称复制)(semiconservativereplication):
亲代双链DNA以每条链为模板,按碱基配对原则各合成一条互补链,这样一条亲代DNA双螺旋,形成两条完全相同的子代DNA螺旋,子代DNA分子中都有一条合成的“新”链和一条来自亲代的旧链,称为半保留复制。
3.DNA聚合酶(DNApolymerase):
指以脱氧核苷三磷酸为底物,按5’→3’方向合成DNA的一类酶,反应条件:
4种脱氧核苷三磷酸、Mg+、模板、引物。
DNA聚合酶是多功能酶,除具有聚合作用外,还具有其它功能,不同DNA聚合酶所具有的功能不同。
4.解旋酶(helicase):
是一类通过水解ATP提供能量,使DNA双螺旋两条链分开的酶,每解开一对碱基,水解2分子ATP。
5.拓扑异构酶(topoisomerase):
是一类引起DNA拓扑异构反应的酶,分为两类:
类型I的酶能使DNA的一条链发生断裂和再连接,反应无需供给能量,类型Ⅱ的酶能使DNA的两条链同时发生断裂和再连接,当它引入超螺旋时,需要由ATP供给能量。
6.单链DNA结合蛋白(single-strandbindingprotein,SSB):
是一类特异性和单链区DNA结合的蛋白质。
它的功能在于稳定DNA解开的单链,阻止复性和保护单链部分不被核酸酶降解。
7.DNA连接酶(DNAligase):
是专门催化双链DNA中缺口共价连接的酶,不能催化两条游离的单链DNA链间形成磷酸二酯键。
反应需要能量。
8.引物酶及引发体(primase&primosome):
以DNA为模板,以核糖核苷酸为底物,在DNA合成中,催化形成RNA引物的酶称为引物酶及引物体。
大肠杆菌的引物酶单独没有活性,只有与其它蛋白质结合在一起,形成一个复合体,即引发体才有生物活性。
9.复制叉(replicationfork):
复制中的DNA分子,末复制的部分是亲代双螺旋,而复制好的部分是分开的,由两个子代双螺旋组成,复制正在进行的部分呈丫状叫做复制叉。
10.复制眼θ结构:
在一段DNA上,正在复制的部分形成眼状结构。
复制眼在环状DNA上形成的结构与希腊字母θ相象,所以叫θ结构。
11.前导链(1eadingstrand):
在DNA复制过程中,以亲代链(3’→5’为模板时,子代链的合成(5’→3’)是连续的.这条能连续合成的链称前导链。
12.冈崎片段(Okazakifragment)、后随链(1aggingstrand):
在DNA复制过程中,以亲代链(5’→3’)为模板时,子代链的合成不能以3’→5’方向进行,而是按5’→3’方向合成出许多小片段,因为是冈崎等人研究发现,因此称冈崎片段。
由许多冈崎片段连接而成的子代链称为后随链。
13.半不连续复制(Semidiscontinuousreplication):
在DNA复制过程中,一条链的合成是连续的,另一条链的合成是不连续的,所以叫做半不连续复制。
14.逆转录(reversetranscription):
以RNA为模板合成DNA的过程。
15.逆转录酶(reversetranseriptase):
催化以RNA为模板合成DNA的逆转录过程的酶。
Temin(1960)首次从劳氏肉瘤病毒中发现。
逆转录酶具有多种酶活性:
依赖RNA的DNA聚合酶活性;依赖DNA的DNA聚合酶活性,RNA水解酶活性,DNA合成方向5’→3’。
合成时需要引物与模板。
16.突变(mutation):
基因组DNA顺序上的任何一种改变都叫做突变。
分点突变和结构畸变。
17.点突变(Pointmutation):
是指一个或几个碱基对被置换(replacement),这种置换又分两种形式:
转换(transition)一--指用一个嘌呤碱置换另一个嘌呤碱,一个嘧啶碱置换另一个嘧啶碱;颠换(transversion)一--指用嘌呤碱置换嘧啶碱或用嘧啶碱置换嘌呤碱。
18.结构畸变:
基因中的缺口、或插入(insertion)或缺失(deletion)某些碱基造成移码突变使DNA的模板链失去功能。
19.诱变剂(mutagen):
使基因组发生突变的物理、化学、生物因素叫诱变剂。
20.修复(repair):
除去DNA上的损伤,恢复DNA的正常结构和功能是生物机体的一种保护功能。
21.光裂合酶修复(又称光复活)(photoreactivation):
可见光将光裂合酶激活,它分解DNA上由紫外线照射而形成的嘧啶二聚体,使它们恢复成两个单独的嘧啶碱。
22.切除修复(excisionrepair):
在一系列酶的作用下,将DNA分子中受损伤部分切除,以互补链为模板,合成出空缺的部分,使DNA恢复正常结构的过程。
23.重组修复(recombinationrepair):
DNA在有损伤的情况下也可以复制,复制时子代链跃过损伤部位并留下缺口,通过分子间重组,从完整的另一条母链上将相应的核苷酸序列片段移至子链缺口处,然后用再合成的多核苷酸的序列补上母链的空缺,此过程称重组修复。
24.诱导修复和应急反应(inductionrepairandSOSresponse)(SOS修复):
由于DNA受到损伤或复制系统受到抑制所诱导引起的一系列复杂的应急效应,称为应急反应。
SOS反应主要包括两个方面:
DNA损伤修复(SOS修复或称诱导修复)和诱变效应。
SOS修复是一种易出差错的修复过程,虽能修复DNA的损伤而避免死亡。
但却带来高的变异率。
25.DNA重组(recombination):
DNA重组是指在真核生物减数分裂过程中,细菌细胞的转化中、病毒转导中等发生的DNA片段的交换或插入。
26.基因工程(又称基因重组技术)(gene/geneticengineering):
是将外源基因经过剪切加工,再插入到一个具有自我复制能力的载体DNA中,将新组合的DNA转移到一个寄主细胞中,外源基因就可以随着寄主细胞的分裂进行繁殖,寄主细胞也借此获得外源基因所携带的新特性。
27.转录(transcription):
由依赖于DNA的RNA聚合酶催化,以DNA的一条链的一定区段为模板,按照碱基配对原则,合成一条与DNA链互补的RNA链的过程。
28.模板链(templatestrand)[又称负(-)链,反意义链(antisensestrand)]:
转录过程中用作模板的这条DNA链,称模板链。
29.非模板链(nontemplatestrand)[又称正(+)链,编码链(codingstrand),有意义链(sensestrand)]:
与模板链互补的那条DNA链,称非模板链。
30.不对称转录(asymmetrictranscription):
因为RNA的转录只在DNA的任一条链上进行,所以把RNA的合成叫做不对称转录。
31.启动子(promoter):
DNA链上能指示RNA转录起始的DNA序列称启动子。
32.转录单位(transcriptionunit):
RNA的转录只在DNA的一个片段上进行,这段DNA序列叫转录单位。
33.内含子(intron):
真核生物基因中,不为蛋白质编码的、在mRNA加工过程中消失的DNA序列,称内含子。
34.外显子(exon):
真核生物基因中,在mRNA上出现并代表蛋白质的DNA序列,叫外显子。
35.转录加工(post-transcriptionalprocessing):
细菌中很多RNA分子和几乎全部真核生物的RNA在合成后都需要不同程度的加工,才能形成成熟的RNA分子,这个过程叫转录后加工。
36.核内不均一RNA(hnRNA):
是真核生物细胞核内的mRNA前体分子,分子量较大,并且不均一,含有许多内含子。
37.RNA的复制(RNAreplication):
某些病毒RNA既可以做为模板合成病毒蛋白质又可在RNA复制酶(RNAreplicase)的催化下,以自身RNA为模板,合成互补的RNA新链,合成方向5'→3’,这一过程叫RNA复制。
(二)问答题
l.提示:
①将E.coli放入以15NH4Cl为唯一氮源的培养基中连续培养十几代,使所有DNA分子标记上15N;②将15N标记的E.coli再放入普通的14N培养基中培养,在细胞生长一代、二代、…、n代的时间间隔内采样;③采用氯化铯密度梯度离心分离DNA,并用紫外照相技术检测DNA所在位置;④结果如下:
其结果确切地证明DNA以半保留方式复制。
2.E.coliDNA聚合酶I是多功能酶,具有:
①DNA聚合酶活性,能按模板要求,以5’→3’方向合成DNA,在DNA复制中,常用以填补引物切除后留下的空隙;②5'→3’外切酶活性,DNA复制后期,用于切除RNA引物;③3'→5’外切酶活性,用以校对复制的正确性,当出现错配碱基时,切除错配碱基直到正确配对为止;DNA聚合酶I不是DNA复制和校正中的主要聚合酶,它的功能主要是修复。
3.以E.coli为例,DNA复制过程分三个阶段;①起始:
从DNA上控制复制起始的序列即起始点开始复制,形成复制叉,复制方向多为双向,也可以是单向,若以双向进行复制,两个方向的复制速度不一定相同。
由于DNA聚合酶不能从无到有合成新链,所以DNA复制需要有含3’-OH的引物,引物由含有引物酶的引发体合成一段含3一10个核苷酸的RNA片段;②延长:
DNA复制时,分别以两条亲代DNA链为模板,当复制叉沿DNA移动时,以亲代3’→5’链为模板时,子链的合成方向是5'→3',可连续进行,以亲代5’→3’链为模板时,子链不能以3’→5’方向合成,而是先合成出许多5’→3’方向的冈崎片段,然后连接起来形成一条子链;③终止:
当一个冈崎片段的3'-OH与前一个冈崎片段的5’-磷酸接近时,复制停止,由DNA聚合酶I切除引物,填补空隙,连接酶连接相邻的DNA片段。
DNA复制时,由DNA解旋酶(又称解链酶)通过水解ATP获得能量来解开DNA双链,并沿复制叉方向移动,所产生的单链很快被单链结合蛋白所覆盖,防止DNA的变性并保护其单链不被降解,复制叉前进过程中,双螺旋产生的应力在拓扑异构酶的作用下得到调整。
DNA复制基本规律:
①复制过程为半保留方式;②原核生物单点起始,真核生物多点起始,复制方向多为双向,也有单向;③复制方式呈多样性,(直线型、Q型、滚动环型…等);④新链合成需要引物,引物RNA长度—般为几个~10个核苷酸,新链合成方向5’→3’,与模板链反向,碱基互补;⑤复制为半不连续的,以解决复制过程中,两条不同极性的链同时延伸问题,即…—条链可按5’→3’方向连续合成称为前导链,另一条链先按5’→3’方向合成许多不连续的冈崎片段(原核生物一般长1000-2000个核苷酸,真核生物一般长100--200个核苷酸),再通过连接酶连接成完整链,称后随链,且前导链与后随链合成速度不完全—致,前者快,后者慢;⑥复制终止时,需切除前导链、冈崎片段的全部引物,填补空缺,连接成完整DNA链;⑦修复和校正DNA复制过程出现的损伤和错误,以确保DNA复制的精确性。
4.提示:
见名词解释“逆转录”。
病毒的单链RNA在病毒进入寄主细胞后被释放出来,此RNA带有与模板互补的tRNA引物,病毒的逆转录酶以此RNA为模板,从引物的3’-OH端,按碱基互补原则以5’→3’方向合成DNA链(-),形成RNA—DNA杂交分子,然后逆转酶发挥RNA水解酶活性,水解杂交分子中的RNA链,最后以
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