Western操作步骤.docx
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Western操作步骤
Western操作步骤
Western-Blot操作流程及注意事项
Western操作步骤
(一)蛋白样品制备
(1)单层贴壁细胞总蛋白的提取:
1.倒掉培养液,并将瓶倒扣在吸水纸上使吸水纸吸干培养液(或将瓶直立放置一会儿使残余培养液流到瓶底然后再用移液器将其吸走)。
2.每瓶细胞加3ml4℃预冷的PBS(0.01MpH7.2~7.3)。
平放轻轻摇动1min洗涤细胞,然后弃去洗液。
重复以上操作两次,共洗细胞三次以洗去培养液。
将PBS弃净后把培养瓶置于冰上。
3.按1ml裂解液加10μlPMSF(100mM),摇匀置于冰上。
(PMSF要摇匀至无结晶时才可与裂解液混合)
4.每瓶细胞加400μl含PMSF的裂解液,冰上裂解30min,为使细胞充分裂解培养瓶要经常来回摇动。
5.裂解完后,用干净的刮棒将细胞刮于培养瓶的一侧(动作要快),然后用枪将细胞碎片和裂解液移至1.5ml离心管中。
(整个操作尽量在冰上进行)
6.于4℃下12000rpm离心5min。
(提前开离心机预冷)
7.将离心后的上清分装转移倒0.5min的离心管中放于-20℃保存。
(个人感觉上述方法可操作性有待加强,细胞中蛋白本来就很少,一瓶50ml的细胞有时按照实验要求只能加100~200μl的裂解液,按照上述操作,直接用200μl裂解液进行裂解,根本就不够瓶壁上沾的。
本人是先用预冷的PBS(一般数毫升)加入后,用细胞刮刮下细胞,转移至试管中,如果数瓶细胞是收集同一蛋白的,可以放在同一试管,离心后再将蛋白转移到EP管中,这样可操作性就比较强)
(2)组织中总蛋白的提取:
1.将少量组织块置于1~2ml匀浆器中球状部位,用干净的剪刀将组织块尽量剪碎。
2.加400μl单去污剂裂解液裂(含PMSF)于匀浆器中进行匀浆。
然后置于冰上。
3.几分钟后再碾一会儿再置于冰上,要重复碾几次使组织尽量碾碎。
4.裂解30min后,即可用移液器将裂解液移至1.5ml离心管中,然后在4℃下12000rpm离心5min,取上清分装于0.5ml离心管中并置于-20℃保存。
(3)加药物处理的贴壁细胞总蛋白的提取:
由于受药物的影响,一些细胞脱落下来,所以除按
(一)操作外还应收集培养液中的细胞。
以下是培养液中细胞总蛋白的提取:
1.将培养液倒至15ml离心管中,于2500rpm离心5min。
2.弃上清,加入4mlPBS并用枪轻吹打洗涤,然后2500rpm离心5min。
弃上清后PBS重复洗涤一次。
3.用枪吸干上清后,加100μl裂解液(含PMSF)冰上裂解30min,裂解过程中要经常弹一弹以使细胞充分裂解。
4.将裂解液与培养瓶中裂解液混在一起4℃、12000rpm离心5min,取上清分装于0.5ml离心管中并置于-20℃保存。
(二)蛋白含量的测定
(1)制作标准曲线
1.从-20℃取出1mg/mlBSA,室温融化后,备用。
2.取18个1.5ml离心管,3个一组,分别标记为0μg,2.5μg,5.0μg,10.0μg,20.0μg,40.0μg。
3.按下表在各管中加入各种试剂。
0μg
2.5μg
5.0μg
10.0μg
20.0μg
40.0μg
1mg/mlBSA
-
2.5μl
5.0μl
10.0μl
20.0μl
40.0μl
0.15mol/LNaCl
100μl
97.5μl
95.0μl
90.0μl
80.0μl
60.0μl
G250考马斯亮蓝溶液
1ml
1ml
1ml
1ml
1ml
1ml
4.混匀后,室温放置2min。
在生物分光光度计上比色分析。
(2)检测样品蛋白含量
1.取足量的1.5ml离心管,每管加入4℃储存的考马斯亮蓝1ml。
室温放置30min后即可用于测蛋白。
2.取一管考马斯亮蓝加0.15mol/LNaCl溶液100μl,混匀放置2分钟可做为空白样品,将空白倒入比色杯中在做好标准曲线的程序下按blank测空白样品。
3.弃空白样品,用无水乙醇清洗比色杯2次(每次0.5ml),再用无菌水洗一次。
4.取一管考马斯亮蓝加95μl0.15mol/LNaCl溶液和5μl待测蛋白样品,混匀后静置2min,倒入扣干的比色杯中按sample键测样品。
注意:
每测一个样品都要将比色杯用无水乙醇洗2次,无菌水洗一次。
可同时混合好多个样品再一起测,这样对测定大量的蛋白样品可节省很多时间。
测得的结果是5μl样品含的蛋白量。
(上述方法只是一家之言,可以自我变通,本人就不是按照上述方法进行的)
(三)SDS-PAGE电泳
(1)清洗玻璃板:
一只手扣紧玻璃板,另一只手蘸点洗衣粉轻轻擦洗。
两面都擦洗过后用自来水冲,再用蒸馏水冲洗干净后立在筐里晾干。
(2)灌胶与上样
1. 玻璃板对齐后放入夹中卡紧。
然后垂直卡在架子上准备灌胶。
(可以用1%琼脂糖在垂直电泳槽的左、右和下部封边,五分钟后重复一次,这样可以保证基本不漏胶)
2. 按前面方法配10%分离胶,加入TEMED后立即摇匀即可灌胶。
灌胶时,可用10ml枪吸取5ml胶沿玻璃放出,待胶面升到绿带中间线高度时即可。
然后胶上加一层水,液封后的胶凝的更快。
(灌胶时开始可快一些,胶面快到所需高度时要放慢速度。
操作时胶一定要沿玻璃板流下,这样胶中才不会有气泡。
加水液封时要慢,否则胶会被冲变型。
)
3.当水和胶之间有一条折射线时,说明胶已凝了。
再等3min使胶充分凝固就可倒去胶上层水并用吸水纸将水吸干。
4.按前面方法配4%的浓缩胶,加入TEMED后立即摇匀即可灌胶。
将剩余空间灌满浓缩胶然后将梳子插入浓缩胶中。
灌胶时也要使胶沿玻璃板流下以免胶中有气泡产生。
插梳子时要使梳子保持水平。
由于胶凝固时体积会收缩减小,从而使加样孔的上样体积减小,所以在浓缩胶凝固的过程中要经常在两边补胶(其实说经常有点过了,补1~2次就行了,不补胶问题也不大)。
待到浓缩胶凝固后,两手分别捏住梳子的两边竖直向上轻轻将其拔出。
5.用水冲洗一下浓缩胶,将其放入电泳槽中。
(冲洗的话个人感觉可以使用5ml的针筒,当然操作不能太粗暴了)
6.测完蛋白含量后,计算含20-50μg蛋白(根据自己的实验需要进行选择,没有固定的量)的溶液体积即为上样量。
取出上样样品至200μl的EP管中,加入5×SDS上样缓冲液至终浓度为1×。
(上样总体积一般不超过15μl,加样孔的最大限度可加20μl样品)(其实大一点的垂直电泳槽每孔最大上样量可以达到40μl,胶做得很好的话50μl也是问题不大的)上样前要将样品于沸水中煮5~10min使蛋白变性。
(本人心得:
可以使用PCR仪进行变性,加快速度,这样就不用将水煮沸了,同时在水中煮蛋白样品有下面弊端:
1.EP管容易炸开,样品丢失;2.容易进水,使样品体积增加,超过电泳最大上样量)
7.加足够的电泳液后开始准备上样。
(电泳液至少要漫过内测的小玻璃板)用微量进样器贴壁吸取样品,将样品吸出不要吸进气泡。
将加样器针头插至加样孔中缓慢加入样品。
(加样太快可使样品冲出加样孔,若有气泡也可能使样品溢出。
加入下一个样品时,进样器需在外槽电泳缓冲液中洗涤数次,以免交叉污染)
(3)电泳:
电泳时间一般4~5h,电压为40V较好,也可用60V。
(本人为了加快速度,浓缩胶时用80-100V跑,到分离胶以后用150-200跑,结果也不错,总时间2h左右)电泳至溴酚兰刚跑出即可终止电泳,进行转膜(如果目的条带比较大的话,最好使用可视的蛋白marker,Fermentas的0441和0671比较好,就是有点贵。
一般要让目的条带跑过分离胶的1/3比较好,不要局限于此说明)。
(四)转膜
(1)转一张膜需准备6张7.0~8.3cm的滤纸和1张7.3~8.6cm的PVDF膜。
切滤纸和膜时一定要戴手套,因为手上的蛋白会污染膜。
将切好的PVDF膜置于水上浸2h才可使用。
(用镊子捏住膜的一边轻轻置于有超纯水的平皿里,要使膜浮于水上,只有下层才与水接触。
这样由于毛细管作用可使整个膜浸湿。
若膜沉入水里,膜与水之间形成一层空气膜,这样会阻止膜吸水)(个人感觉其实转膜之前浸湿一下就ok了,没有多大问题,可能按照上述操作结果会更好)
(2)在加有转移液的搪瓷盘里放入转膜用的夹子、两块海绵垫、一支玻棒、滤纸和浸过的膜。
(3)将夹子打开使黑的一面保持水平。
在上面垫一张海绵垫,用玻棒来回擀几遍以擀走里面的气泡。
(一手擀另一手要压住垫子使其不能随便移动)在垫子上垫三层滤纸(可三张纸先叠在一起再垫于垫子上,注:
个人感觉就垫1张滤纸也没问题呀),一手固定滤纸一手用玻棒擀去其中的气泡。
(4)要先将玻璃板撬掉才可剥胶,撬的时候动作要轻,要在两个边上轻轻的反复撬(应该边撬边用流水缓缓冲洗)。
撬一会儿玻璃板便开始松动,直到撬去玻板。
(撬时一定要小心,胶很易裂,要用巧劲)除去小玻璃板后,将浓缩胶轻轻刮去(浓缩胶影响操作),要避免把分离胶刮破。
小心剥下分离胶盖于滤纸上,用手调整使其与滤纸对齐,轻轻用玻棒擀去气泡。
将膜盖于胶上,要盖满整个胶(膜盖下后不可再移动)并除气泡。
在膜上盖3张滤纸并除去气泡。
最后盖上另一个海绵垫,擀几下就可合起夹子。
整个操作在转移液中进行,要不断的擀去气泡。
膜两边的滤纸不能相互接触,接触后会发生短路。
(转移液含甲醇,操作时要戴手套,实验室要开门以使空气流通)(最后做成的“三明治”千万不能形成短路,不然有可能会短路烧坏转膜装置(价格不菲,尤其是进口的),第一次做的应请老手指教)
(5)将夹子放入转移槽槽中,要使夹的黑面对槽的黑面,夹的白面对槽的红面。
电转移时会产热,在槽的一边放一块冰来降温。
一般用60V转移2h或40V转移3h。
(1.实际上应该根据蛋白分子量的大小确定转膜时间,对于小分子量的蛋白,转膜时最好垫两块PVDF膜,以免转膜过头,因为如果第一张膜上蛋白质已经转过了,第二张膜上还有蛋白质可以进行检测;对于大分子量的蛋白,转膜时电压要高一点,一般80-100V,时间也要延长一点,开始最好也用两块膜,特别是务必注意加强降温措施。
当然转膜是要摸条件的,最好刚开始做的时候摸个转膜的时间梯度。
如果由于时间原因来不及做下面实验,可以在4度下12V转膜过夜)(2.PVDF膜建议使用0.22μm的小孔径膜,不容易转膜过头)(3.不同的转膜装置,转移效率是不一样的,所以换用转膜装置,最好再摸个条件)(4. 转膜时电极方向注意是膜正胶负)
(6)转完后将膜用1×丽春红染液染5min(于脱色摇床上摇)。
然后用水冲洗掉没染上的染液就可看到膜上的蛋白。
将膜晾干备用。
(一般不需要做这步)
(五)免疫反应(个人建议:
还是使用杂交袋进行一抗和二抗的孵育,节约抗体)
(1)将膜用TBS从下向上浸湿后,移至含有封闭液的平皿中,室温下脱色摇床上摇动封闭1h。
(2)将一抗用TBST稀释至适当浓度(在1.5ml离心管中);撕下适当大小的一块儿保鲜膜铺于实验台面上,四角用水浸湿以使保鲜膜保持平整;将抗体溶液加到保鲜膜上;从封闭液中取出膜,用滤纸吸去残留液后,将膜蛋白面朝下放于抗体液面上,掀动膜四角以赶出残留气泡;室温下孵育1~2h后,用TBST在室温下脱色摇床上洗两次,每次10min;再用TBS洗一次,10min。
(3)同上方法准备二抗稀释液并与膜接触,室温下孵育1~2h后,用TBST在室温下脱色摇床上洗两次,每次10min;再用TBS洗一次,10min,进行化学发光反应。
(六)化学发光,显影,定影
(1)将A和B两种试剂在保鲜膜上等体积混合;1min后,将膜蛋白面朝下与此混合液充分接触;1min后,将膜移至另一保鲜膜上,去尽残液,包好,放入X-光片夹中。
(2)在暗室中,将1×显影液和定影液分别到入塑料盘中;在红灯下取出X-片,用切纸刀剪裁适当大小(比膜的长和宽均需大1cm);打开X-光片夹,把X-光片放在膜上,一旦放上,便不能移动,关上X-光片夹,开始计时;根据信号的强弱适当调整曝光时间,一般为1min或5min,也可选择不同时间多次压片,以达最佳效果;曝光完成后,打开X-光片夹,取出X-光片,迅速浸入显影液中显影,待出现明显条带后,即刻终止显影。
显影时间一般为1~2min(20~25℃),温度过低时(低于16℃)需适当延长显影时间;显影结束后,马上把X-光片浸入定影液中,定影时间一般为5~10min,以胶片透明为止;用自来水冲去残留的定影液后,室温下晾干。
(如果使用柯达的显影定影液,时间很快的,显影结束后最好先用事先准备好的自来水洗一下片子,然后再放到定影液中进行定影,这样可以延长定影液使用时间,从而节约定影液)应注意的是:
显影和定影需移动胶片时,尽量拿胶片一角,手指甲不要划伤胶片,否则会对结果产生影响。
(七)凝胶图象分析
将胶片进行扫描或拍照,用凝胶图象处理系统分析目标带的分子量和净光密度值。
WesternBlot原理
WesternBlot是把电泳分离的组分从凝胶转移到一种固相支持体,并以针对特定氨基酸序列的特异性试剂作为探针检测之。
使用的探针是抗体,它与附着于固相支持体的靶蛋白所呈现的抗原表位发生特异性反应。
Western的作用是对非放射性标记蛋白组成的复杂混合物中的某些特异蛋白进行鉴别和鉴定。
仪器
高压锅、玻璃匀浆器、低温高速离心机、ASP-3700紫外光/可见光微量分光光度计、-20℃低温冰箱、稳压稳流电流仪、垂直式电泳槽、JY-系列半干式转移电泳槽、电热恒温培养箱、多用脱色摇床、杂交袋封口机、分析天平、pH值调节器、暗室红灯、压片暗盒、0.1~2.5µl/100µl/200µl/1000µl移液器
杂品与耗材
10µl/200µl/1000µl吸头;200µl/1000µl离心管;各种规格的烧杯、量筒和平皿等玻璃器材;0.22umPVDF膜;3mm滤纸;吸水纸;乳胶手套;杂交袋;保鲜膜;搪瓷盘(>20×20cm);柯达X-OMATBT胶片;玻璃棒;计时器;ddH2O
试剂
单去污剂裂解液、0.01mol/LPBS(pH7.3)、10%分离胶、4%浓缩胶、G250考马斯亮蓝溶液、0.15mol/LNaCl溶液、2×(5×)SDS上样缓冲液、电泳缓冲液、转移缓冲液、10×丽春红染液、封闭液、TBST、TBS、洗脱抗体缓冲液、显影液、定影液、抗体、化学发光试剂。
试剂配制
(一)母液
1.0mol/LTris•HCl
Tris(MW121.14)
30.29g
蒸馏水
200ml
溶解后,用浓盐酸调pH至所需点(见下所示),最后用蒸馏水定容至250ml,高温灭菌后室温下保存。
pH
HCl
7.4
约17ml
7.5
约16ml
7.6
约15ml
8.0
约10ml
1.74mg/ml(10mmol/L)PMSF
PMSF
0.174g
异丙醇
100ml
溶解后,分装于1.5ml离心管中,-20℃保存。
0.2mol/LNaH2PO4
NaH2PO4 (MW119.98)
12g
蒸馏水
至500ml
溶解后,高压灭菌,室温保存。
0.2mol/LNa2HPO4
Na2HPO4 •12H2O(MW 358.14)
71.6g
蒸馏水
至1000ml
溶解后,高压灭菌,室温保存。
10%SDS
SDS
10g
蒸馏水
至 100ml
50℃水浴下溶解,室温保存。
如在长期保存中出现沉淀,水浴溶化后,仍可使用。
10%过硫酸胺(AP)
过硫酸胺
0.1g
超纯水
1.0ml
溶解后,4℃保存,保存时间为1周。
(可先将过硫酸胺干粉称好分量后放在EP管中,一次性多装几管,使用时加入超纯水即可)
1.5mol/LTris•HCl(pH8.8)
Tris(MW121.14)
45.43g
超纯水
200ml
溶解后,用浓盐酸调pH至8.8,最后用超纯水定容至250ml,室温下保存。
0.5mol/LTris•HCl(pH6.8)
Tris(MW121.14)
15.14g
超纯水
200ml
溶解后,用浓盐酸调pH至6.8,最后用超纯水定容至250ml,室温下保存。
40%Acr/Bic(37.5:
1)
丙稀酰胺(Acr)
37.5g
甲叉双丙稀酰胺(Bic)
1g
超纯水
至100ml
溶解后4℃保存。
使用时恢复至室温且无沉淀。
20%Tween20
Tween20
20ml
蒸馏水
至 100ml
混匀后4℃保存。
(二)使用液
单去污剂裂解液(50mMTris-HClpH8.0、150mMNaCl、1%TritonX-100、100ug/mlPMSF)
1mol/LTris•HCl(pH8.0)
2.5ml
NaCl
0.438
TritonX-100
0.5ml
蒸馏水
至50ml
混匀后4℃保存。
使用时,加入PMSF至终浓度为100μg/ml(0.87ml裂解液加入1.74mg/mlPMSF50μl)。
(一般实际用的比较多的其实是RIPA裂解配方:
50mMTris-HClpH7.4、150mMNaCl、1mMPMSF、1mMEDTA、1%Tritonx-100、1%脱氧胆酸钠、0.1%SDS)
1mol/LTris•HCl(pH7.4)
2.5ml
NaCl
0.87g
100mMEDTA
0.5ml
TritonX-100
0.5ml
10%Na-deoxycholate(10%脱氧胆酸钠)
5ml
10%SDS
0.5ml
蒸馏水
至50ml
混匀后4℃保存。
使用时,加入PMSF至终浓度为1mMPMSF(1ml裂解液加入1.74mg/mlPMSF100μl)。
0.01mol/LPBS(pH7.2-7.4)
0.2mol/L NaH2PO4
19ml
0.2mol/L Na2HPO4
81ml
NaCl
17g
蒸馏水
至 2000ml
(如果用TBST进行洗膜的话,其实PBS用得很少,大可不必自己配制,向试剂公司购买20×的PBS浓缩液即可,500ml的浓缩液不到50元,很方便)
G250考马斯亮蓝溶液(蛋白定量专用)
考马斯亮蓝G250
100mg
95%乙醇
50ml
磷酸
100ml
蒸馏水
至1000ml
配制时,先用乙醇溶解考马斯亮蓝染料,再加入磷酸和水,混匀后,用滤纸过滤,4℃保存。
0.15mol/LNaCl
NaCl(MW58.44)
0.877g
蒸馏水
至100ml
高温灭菌后,室温保存。
100mg/ml牛血清白蛋白(BSA)
BSA
0.1g
0.15mol/LNaCl
1ml
溶解后-20℃保存。
制作蛋白标准曲线时,用0.15mol/LNaCl进行100倍稀释成1mg/ml,-20℃保存。
10%分离胶和4%浓缩胶
10%分离胶(两块胶,10ml)
4%浓缩胶(两块胶,5ml)
超纯水
4.85ml
3.16ml
40%Acr/Bic(37.5:
1)
2.5ml
0.5ml
1.5mol/LTris•HCl(pH8.8)
2.5ml
-
0.5mol/LTris•HCl(pH6.8)
-
1.26ml
10%SDS
100μl
50μl
10%AP(过硫酸胺)
50μl
25μl
TEMED
5μl
5μl
加TEMED后,立即混匀即可灌胶。
(为了加快凝胶,可以将过硫酸胺和TEMED量加大,一般加至原来的2-3倍,根据实验当时的温度适当调整)
还原型5×SDS上样缓冲液(0.25mol/LTris•HCl(pH6.8),0.5mol/L二硫叔糖醇,10%SDS,0.5% 溴酚蓝,50%甘油)
0.5mol/LTris•HCl(pH6.8)
2.5ml
二硫叔糖醇(DTT,MW154.5)
0.39g
SDS
0.5g
溴酚蓝
0.025
甘油
2.5ml
混匀后,分装于1.5ml离心管中,4℃保存。
电泳液缓冲液
Tris(MW121.14)
3.03g
甘氨酸(MW75.07)
18.77g
SDS
1g
蒸馏水至
1000ml
溶解后室温保存,此溶液可重复使用3~5次。
(电泳液可以回收重复利用,一般将回收的电泳液加入垂直电泳槽的下半部分,上半部分最好使用新鲜的电泳缓冲液)
(可以配制成10×电泳液缓冲液进行保存,稀释10倍使用)
转移缓冲液
甘氨酸(MW75.07)
2.9g
Tris(MW121.14)
5.8g
SDS
0.37g
甲醇
200ml
蒸馏水
至1000ml
溶解后室温保存,次溶液可重复使用3~5次(此溶液最好保存在4度冰箱,最多使用5次左右,不然影响转移效率)。
(先用蒸馏水溶解甘氨酸、Tris和SDS,然后再加入甲醇,最后补足液体。
如果先加入甲醇,溶解甘氨酸、Tris和SDS等比较困难)
(可以配制成2×转移缓冲液进行保存,稀释后使用)
10×丽春红染液
丽春红S
2g
三氯乙酸
30g
磺基水杨酸
30g
蒸馏水
至100ml
使用时将其稀释10倍。
TBS缓冲液
1mol/LTris•HCl(pH7.5)
10ml
NaCl
8.8g
蒸馏水
至1000ml
(可以配制成10×TBS缓冲液进行保存,稀
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