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ebsgrxa医学文献检索汇总

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--GuoGeTech

医学文献检索

MedicalLiteratureRetrieval

指导老师：

李祥华老师

第一章医学文献检索基本知识

第二章中文书目型检索工具

第三章中文全文检索数据库

第四章外文医学检索工具

第五章BA&BIOSISPreviews

第六章CHEMICALABSTRACTS

上机实习要求及实习内容

长江大学

医学文献检索

MedicalLiteratureRetrieval

主讲：

李祥华

引言

文献检索是一门关于如何查询、获得文献资料、知识和信息的工具性课程，是培养人们独立学习能力的一种专门知识。

由于科学技术发展的日新月异和新知识的快速增长，独立学习能力成为对信息时代新型劳动者素质的必然要求。

研究表明，一个科技人员应用的知识总量大约只有20%是学校学习中获得，其余80%是在工作和生活中为适应需要获得的。

美国著名未来学家Alwen.Toffler在《权力的转移》一书中说：

“谁掌握了知识和信息，谁就掌握了支配他人的权力。

”让大学生接受信息素质教育，培养学生收集处理信息的能力、获取新知识的能力、分析和解决问题的能力是大学教育的基本目标。

文献检索被人们喻为开启知识宝库的钥匙。

当你在学习、工作乃至生活保健方面遇到难题，或要开展一项新的研究，或要完成一篇论文、一种发明等等，都可以借助文献检索来完成。

即使你已学富五车，也要借助文献检索。

文献检索领域犹如一个大千世界，初学者难免或多或少遇到困惑，检索系统繁多，内容不尽相同，用途各异，如何选择？

学会单个检索系统的用法、规则不难，实际检索课题时，往往不知如何做更好。

同一时间使用同一检索系统检索同一课题，如果采用的检索策略不同，其检索结果可能不同。

故文献检索是让大家掌握如何从浩瀚的文献数据库中去查找，去甄别的一门课程。

第一章医学文献检索的基本知识

一、信息、知识、情报和文献

INFORMATION：

1973年美国社会学家Daniel.Bell提出了“后工业社会”的概念。

人与人、细胞、人与机器、机器与机器、动物、植物之间都有信息存在。

定义：

指事物存在和运动状态及其特征的反映。

医学信息是指病人的症状、体征以及实验数据。

1.KNOWLEDGE：

知识：

人们通过实践对客观事物及其运动过程和规律的认识。

是信息的一部分，即指被人们理解和认识并重新组织和系统化后的部分信息。

是客观存在事物的现象，是本质和规律的反映，是人类实践的总结。

2.INFORMATION：

情报1：

指人们以各种方式传递和交流的具有一定目的和时效的信息。

情报2：

是指作为人们传递和交流对象的知识。

是一种活化的知识和信息。

分类：

按服务对象：

军事情报、科技情报、战略情报、战术情报。

按传递媒介：

文字情报、实物情报、声像情报。

按传递范围：

大众情报、专门情报。

按传递内容：

科技情报、政治情报、市场情报。

情报的属性：

知识、传递、效益。

3.DOCUMENTS：

记录和传递知识的介质如甲骨、青铜器、石头、帛布、纸、录音带、光盘、U盘等通称为载体。

把用一定方式记录有知识的特定载体统称为文献。

文献的属性：

知识、载体、符号。

二、现代医学文献的类型与特征

按载体类型划分：

书写型；

印刷型：

BOOK:

monograph,textbook;referencebook,yearbook,handbook,dictionary,acta,encyclopedia；JOURNAL;PROCEEDINGS;GOVERMENTPUBLICA-TION;PATENTDOCUMENT;TECHNICALREPORT;TECHNICALSTANDARD;PRODUCTMATERIAL;DISSERTATION;TECHNICALARCHIVES.

缩微型（microformdocument）;听型（Audio-visualdocument）；电子型（Electronicdocument）。

按加工深度划分：

Primaryliterature（originalarticles）;econdaryliterature（index,abstract）;

Thirdliterature（review,advanced）;eroliterature。

医学文献的特点：

类型复杂；数量庞大；文种繁多；重复交叉，出版分散；

代谢频繁；交流传播速度加快；学科越分越细；

质量下降；时滞问题严重；载体现代化。

三、图书馆文献的利用

图书分类：

以学科为依据。

图书馆目录：

即对文献的外部特征和内部特征进行加工并作一般介绍。

图书期刊排架及查找：

排架：

分类；刊名；代号等。

查找：

开架查找；馆藏目录。

参考工具书的类型及使用：

参考工具书是根据一定需要，以特定的编辑形式和检索方法，为人们迅速提供某方面的基本知识或资料线索，专供查阅的特定类型图书：

Dictionary,yearbook,handbook,

Encyclopedia,year-table&calendartable.

四、文献检索语言与途径

检索语言的定义：

是在文献检索过程中用来描述文献特征和表达检索提问的专门人工语言。

文献检索的概念：

一是指文献的储存过程；二是指文献的查找过程。

检索语言的作用：

1）表达内外部特征；2）表达概念的唯一性；）便于手工和机检。

检索语言的分类：

描述文献外部特征的检索语言：

著者索引；题名索引；文献序号索引；引文索引。

描述文献内部特征的检索语言：

分类语言；主题检索语言：

主题词，关键词；代码语言。

常用法：

是指利用检索工具书查找文献的方法。

由于是利用工具书，又叫做工具法。

具体可分为：

顺查法；倒查法；抽查法。

追溯法：

指利用论文后的参考文献去查找文献的一种方法。

循环法：

指利用以上两种方法交替使用检索文献的方法。

医学文献检索的途径：

篇名途径；著者途径；著者地址；刊名途径；主题词途径；关键词途径；

分类途径；序号途径；其他如分子式索引、生物体索引、生物分类索引等。

五、文献检索工具与步骤

作用：

存储、检索、报道作用。

特点：

收录文献的有限性；报道文献的时滞性；文献标引的有限性。

结构：

编辑说明；分类目次；正文；索引；附录。

检索工具的种类：

按照对文献收录的范围：

综合性；专业性；专题性；单一性。

按载体或出版方式：

书本式；机读式数据库。

按对文献揭示的程度：

目录；索引；文摘。

文献检索步骤：

分析检索课题，明确检索要求；

选择检索工具，确定检索方法；

选择检索途径，确定检索标识；

检索文献；获取原文献。

六、计算机文献检索

（一）计算机检索的基本知识

计算机检索的特点：

检索速度快；检索途径多；更新快；资源共享；方便灵活；直接输出检索结果。

计算机检索系统的构成：

计算机硬件、软件、数据库、通讯线路、检索终端。

数据库的类型及其特点：

1、factdatabase：

存储有关人物、机构、课题研究动态等事实资料。

2、numericdatabase：

存储有关科研数据、数值等。

3、bibliographicdatabase：

二次文献数据库。

4、full-textdatabase：

为检索者提供文献原文的全文。

5、hypertextdatabase：

存储声音、图象、文字等多媒体信息。

数据库（database）的结构：

概念：

作为计算机学中的专业术语，指在计算机存储设备上合理存放的相互关联的数据集合。

文献数据库是指一定专业范围内的文献信息记录及其索引的集合体，

是计算机文献信息检索系统的重要组成部分，是信息资源，文献检索对象。

数据库通常有若干个文档，每个文档又由若干个记录组成，每条记录又包含若干个字段。

record：

是构成文献数据库的信息单元，每条记录描述一篇原始文献的外部特征和内容特征。

外部特征指例如作者，刊名，摘要，关键词等；内容特征即文献正文。

每条记录即每篇文献！

field：

是比记录更小的单位，是组成记录的数据项目。

如：

au（著者）,ti（标题）,ab（摘要）,so（来源）,py（出版年限）.

file：

其一是指数据库中一部分记录的集合。

其二是指数据库的结构。

（二）计算机文献检索的基本技术

1、布尔逻辑运算：

逻辑“OR”：

检索结果的每一条记录必须含有A或B检索词，也包括同时含有A和B检索词的记录。

例如：

AIDSORHIV——输出所有标记位置包含AIDS或HIV的记录

逻辑“AND”：

检索结果的每一条记录必须同时含有A和B检索词。

例如：

womenANDsmoking——输出所有标记位置包含women和smoking的记录

逻辑“NOT”：

检索结果的每一条记录必须包含A检索词，但不包含B检索词。

例如：

leukemiaNOTadult——输出所有标记位置包含leukemia但不包含adult的记录

运算次序优先度（）＞NOT＞AND＞OR

2、截词符和通配符检索：

*，？

，$，#

“*”可通配o-n个字符；“？

”可通配0-1个字符。

3、限制符：

起着限定或约束检索结果的作用。

如：

LILIinau,au=LILI,[]

4、位置运算符：

在某些数据库检索中要表达检索词在记录中的相互位置关系时使用的运算符。

不同的数据库用不同的符号。

如：

same,with,near.

运算符有如下级别：

记录级检索；字段级检索；子字段或自然句级检索；词位置检索。

七、检索结果评价

1、查全率：

指系统在进行某一检索时，检出的相关文献量与系统文献库中相关文献总量的比率。

查全率=[检出相关文献量/文献库中相关文献总量]×100%

2、查准率：

系统在进行某一检索时，检出的相关文献量与检出文献总量的比率。

查准率=[检出相关文献量/检出文献总量]×100%

3、影响查全率的因素：

文献库收录不全；索引词汇缺乏控制和专指性；词表结构不完整；

词间关系模糊；标引不详和前后不一致；或检索策略过于简单；选词或组配不当；

检索途径、方法太少；检索人员业务不熟或缺乏耐心；检索系统不具备截词功能等。

4、查准率的因素：

索引词不能准确描述文献主题和检索要求；组配规则不严密；

选词和词间关系不正确；标引过于详尽；组配错误；检索时所用检索词专指度不够；

检索面宽于检索要求；检索式中容许容纳的词数量有限；截词部位不当；检索式中使用逻辑“或”不当等。

第三章中文全文检索数据库

ChinaNationalKnowledgeInfrastructure（CNKI）

帐号：

k10398密码：

cjdx

1、概况：

CNKI，中国知识基础设施工程成立于1995年，是目前世界上最大的全文数字图书馆。

收录范围广、内容全面、信息量大、有网络版和光盘版、检索方便。

它涵盖了我国自然科学、工程技术、人文与社会科学期刊、博硕士论文、报纸、图书、会议论文等信息资源。

其主要数据库产品有中国期刊全文数据库、中国优秀博士硕士论文全文数据库、中国重要报纸全文数据库、中国基础教育知识仓库、中国医院知识仓库、中国重要会议论文全文数据库、中国企业知识仓库等。

中国期刊全文数据库是的一个巨大的信息资源，是国内大型学术期刊数据库，共收录有994年至今的国内公开发行的6100余种核心期刊与专业特色期刊全文共800万篇，题录1500余万条。

目前有（中国学术期刊和期刊专题数据库）光盘版和网络版。

新版网址：

http//

2、检索方法：

（1）分类检索：

分别按9个专辑进行检索：

理工（A物理及数学,B化学及化工,C机械）辑

医药卫生辑

农业辑，文史哲辑，政治经济辑，教育与社会科学辑，电子技术与信息科学辑，

在专辑下共有126专题。

医药卫生辑又分为六个专题：

医学、药学、中国医学、卫生、保健、生物医学。

方法：

选择左栏中的分类导航区，点击所查类目，根据需要逐层点击。

（2）初级检索：

系统默认的界面。

1）选择检索范围：

在左下角导航区。

2）选择检索字段：

在检索项的下拉菜单中选择。

3）选择检索时间：

在下拉菜单中选择。

4）选择排序方式：

无序、相关度、日期。

5）选择是否中英文扩展：

勾选或否

6）输入检索词：

输入检索词，点击“检索”。

7）进行二次检索：

先选定“在结果中搜索”，再点击“检索”。

目的是缩小检索范围。

（3）高级检索：

本检索是通过逻辑关系的组合进行的快速查询方式，有“并且”，“或者”，“不包含”3种。

1）选择检索范围，检索时间。

2）选择多个词的检索字段，输入多个词。

3）确定各个检索词之间的关系：

并且、或者、不包含。

4）点击“检索”按钮进行检索。

5）进行二次检索。

2、检索结果的输出：

浏览、下载和打印。

注意：

由于阅读必须要用特定的阅读器，CNKI使用专门的CAJ阅读器，同时支持PDF。

第四章外文医学检索工具

一、IndexMedicus与Medline数据库

1、概况：

创刊于1879年，由美国NationalLibraryofMedicine（NLM）编辑出版。

是目前国际上影响最大、使用最广的医学文献检索工具。

（1）收录范围：

收录70多个国家和地区的40多种文字的近4000多种生物医学期刊及相关学科期刊，年报道量30余万条。

英文文献占70%。

内容涉及生物医学的各个领域。

如：

解剖学、生物、疾病、化学品与药物、分析诊断及治疗技术与设备、精神疾病与心理学、生物科学、自然科学、人类学、教育、社会学、技术、工业、农业、人文科学、信息科学及卫生保健等。

（2）以题录形式报道，文献类型有：

originalarticles,reviews,letters,

editorials,biographies,obituariesandproceedings等。

（3）特点：

收录文献范围广，报道文献信息量大；编辑力量雄厚，文献标引质量高；报道文献速度快，时差短；索引编制规范，检索方便，适合于手检和机检。

2、编排结构：

12issueof1volumeinoneyear.

ISSUE:

PartI:

subjectSection（A-P）

PartII:

subjectSection（Q-Z）authorSectionandBibliographyofMedicalReviews.

MedicalSubjectHeadings（MeSH）

ListofJournalsIndexedinIndexMedicus

IM期索引主要包含以下几个方面：

（1）Preface,IndexMedicuscitationformat:

（2）Thebody:

Subjectsection&AuthorsectionandBibliographyofMedicalReviews.

Subjectsection的编排：

以主题词作为检索标目，按字母顺序排，每篇文献可给予一个或多个主题词。

1）对某一主题作一般性论述的文献，直接集中在该主题词之下。

2）如文献论述的是主题的某方面时，则集中于对该主题词进行限定的副主题词之下，副主题词按字母顺序排列在各主题词之下。

若在同一副主题词下有多种语言文献时，则先排英语文献，再按语种缩写字顺编排非英语文献，语种相同时，则按刊名缩写字顺排。

AuthorsectionandBibliographyofMedicalReviews的编排：

1）Authorsection：

以作者姓名为检索标目，按姓在前，用全称，名在后，用缩写的字顺排列。

其他作者“see”第一作者。

2）BibliographyofMedicalReviews：

将医学综述集中，排列在相关主题词之下。

著录格式：

SubjectSection:

RETROVIRIDAEPROTEIN——主主题词

METABOLISM——副主题词

Amultigenelentiviralvectorsystembasedondifferentialsplicing.ZhuY,etal.MethodsMolMed2003Mar;76（3）:

433-48

BREASTNEOPLASMS

DRUGTHERAPY

[AnexperimentalstudyonantitumoractivityofpsoralenonmammarycancercelllineEMT6invitroandinvivo.]WuS,etal.ZhongguoZhongYaoZazhi.1998May,23（5）:

303-5,insidebackcover（EngAbstr.）（Chi）——非英文全文的需要用[]标注，同时在末尾标注原文语言

AuthorSection:

WuS,ZhangZ,ZhaoJ.[AnexperimentalstudyonantitumoractivityofpsoralenonmammarycancercelllineEMT6invitroandinvivo.]ZhongguoZhongYaoZazhi.1998May,23（5）:

303-5,insidebackcover（EngAbstr.）（Chi）

BibliographyofMedicalReviews:

Immunophilinsinproteinfoldingandimmunosupression.FrumanDA,etal.FASEBJ.1994;8（6）:

391-400.（92ref）

AlphabeticList:

字顺表的结构：

AustralorbisseeBiomphalarias——请参见B螺

BIOMPHALARIAS——主题词

B1.644.766.185——在主题树中的位置

72——1972年首次使用

XAustralorbis——不可使用A螺做主题词

BIOREACTORS

E7.115J1.879.120.115

97

SeerelatedFermentation——该出题词与F相关

BIOPOLYMERS

D12.472.310

75

SeeunderMACROMOLECULARSYSTEM——该主题词包含在大分子系统中

MACROMOLECULARSYSTEM

D12.472

66

SeerelatedPOLYMERS

XUBIOPOLYMERS

XRPOLYMERS

B）主题词的各种形式：

a）正置形：

lungabscess,healthbehavior

b）倒置形：

anemia:

plastic,hemolytic,hypochromic…

c）名词形：

liver,kidney

d）形容词形：

hepaticcoma

e）功能词形：

thinkingforbrain;digestionfordigestivesystem

f）技术词形：

electrocardiographyforheart;bloodgasanalysis;gastro-scope

C）字顺表中的历史注释

FAMILYPLANNING

N2.421.143.401+

68;BIRTHCONTROLwasseeunderCONTR-ACEPTION1975,wasseeunderFAMILYPLANNING1968-74,washeading1963-1967

SeerelatedContraception

XbirthControl;PlannedParenthood

XRContraception;PopulationControl

D）字顺表中的词（语）义关系：

a）等同关系：

是指正式主题词与非正式主题词之间的关系，有同义和准同义关系。

●同义关系：

指意思相同的词之间的关系。

包括普通、简称和繁称、学名与俗名关系。

普通同义关系：

atrialflutter;auricularflutter

简称与繁称：

DNA;deoxyribonucleicacid

AIDS;acquiredimmunodeficiencysyndrome

学名与俗名：

ascorbicacid;vitaminC

●准同义关系：

指意思相近的词之间的关系。

Angiogenesisseeneovascularization

b）属分关系（等级关系）：

指专指度深浅不同的两个或多个词之间的关系。

属种关系：

primates-hominidae-human

包含关系：

heartdiseases：

anginapectoris，failure，infarction。

整体和部分关系：

hand-fingers

c）相关关系：

两个或多个词之间的相互关联的关系。

AIDS：

HIVantigen，HIVantibody，

HIVserodiagnosis，HIVpositivity

E）字顺表中的参照系统：

a）用代参照：

符号：

see—X

CANCERseeNEOPLASMS

NEOPLASMSXCANCER

b）属分参照：

符号：

seeunder—XU

HealthPrioritiesseeunderHealthPlanning

HealthPlanningXUHealthPriorities

c）相关参照：

符号：

seerelated—XR

PopulationControlseerelatedFamilyPlanning

FamilyPlanningXRPopulationControl

还应考虑参照：

consideralsobloodvesselsconsideralsotermatangi-,vasa-andvaso-;

liverconsideralsohepat-

主题词/副主题词组配参照：

BRAIN/analysisseeBRAINCHEMISTRY

HEART/surgeryseeHEARTSURGERY

TreeStructure

又称范畴表，它是