化学分子式查询.docx
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化学分子式查询.docx
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化学分子式查询
CA(美化学文摘)网络版数据库使用说明
一、数据库简介
CA(ChemicalAbstracts)由美国化学文摘社(CAS--ChemicalAbstractsService)编辑出版,就是涉及学科领域最广、收集文献类型最全、提供检索途径最多、部卷也最为庞大的一部著名的世界性检索工具。
CA报道了世界上150多个国家、56种文字出版的9500多种科技期刊、科技报告、会议论文、学位论文、资料汇编、技术报告、新书及视听资料,摘录了世界范围约98%的化学化工文献,所报道的内容几乎涉及化学家感兴趣的所有领域。
SciFinderScholar数据库为CA(化学文摘)的网络版数据库,收录内容比CA更广泛,功能更强大。
利用现代机检技术,进一步提高了化学化工文献的可检性与速检性,更整合了Medline医学数据库、欧洲与美国等50几家专利机构的全文专利资料、以及化学文摘1907年至今的所有内容。
它涵盖的学科包括应用化学、化学工程、普通化学、物理、生物学、生命科学、医学、聚合体学、材料学、地质学、食品科学与农学等诸多领域。
它可以透过网络直接查瞧“化学文摘”1907年以来的所有期刊文献与专利摘要;以及八千多万的化学物质记录与CAS注册号。
SciFinderScholar可检索数据库包括:
CAplusSM:
包含来自150多个国家、9000多种期刊的文献,覆盖1907年到现在的所有文献以及部分1907年以前的文献,包括有期刊、专利、会议录、论文、技术报告、书等,涵盖化学、生化、化学工程以及相关学科,还有尚未完全编目收录的最新文献。
(目前>2,430万条参考书目记录,每天更新3000条以上)
MEDLINE®:
包含来自70多个国家、3900多种期刊的生物医学文献,覆盖1951到现在的所有文献,以及尚未完全编目收录的最新文献。
(目前>1300万参考书目记录,每周更新4次)
REGISTRYSM:
涵盖从1957年到现在的特定的化学物质,包括有机化合物、生物序列、配位化合物、聚合物、合金、片状无机物。
REGISTRY包括了在CASM中引用的物质以及特定的注册。
例如:
管制化学品列表如TSCA与EINECS中的注册。
(目前>7400万条物质记录,每天更新约7万条,每种化学物质有唯一对应的CAS注册号)
CASREACT®:
包括从1907年到现在的单步或多步反应信息。
CASREACT中的反应包括CAS编目的反应以及下列来源:
ZIC/VINITI数据库(1974—1991,byInfoChemGmbH),INPI(InstitutNationaldelaProprieteInsutrielle,法国)1986年以前的数据,以及由教授KlausKieslich博士指导编辑的生物转化数据库。
(目前>800万条反应记录与403,000条文献记录,每周更新约700-1300条)
CHEMCATS®:
化学品的来源信息,包括化学品目录手册以及图书馆等内的供应商的地址、价格等信息。
(目前>740万条商业化学物质记录,来自655家供应商的793种目录)
CHEMLIST®:
1979年到现在的管制化学品的信息,包括物质的特征、详细目录、来源以及许可信息等。
(>22、8万种化合物的详细清单,来自13个国家与国际性组织,每周更新>50条新记录)
它有多种先进的检索方式,比如化学结构式(其中的亚结构模块对研发工作极具帮助)与化学反应式检索等。
它还可以通过Chemport链接到全文资料库以及进行引文链接。
其强大的检索与服务功能,可以让您了解最新的科研动态,帮助您确认最佳的资源投入与研究方向。
根据统计,全球95%以上的科学家们对SciFinder给予了高度评价,认为它加快了她们的研究进程,并在使用过程中得到了很多启示与创意。
我馆现已正式购买了《美国化学文摘》(SciFinderScholar)网络版的使用权,由于SciFinderScholar的使用需要客户端软件,不同于其她以WEB方式访问的数据库,读者在首次使用该数据库时,请先按照以下步骤完成客户端软件的安装工作(客户端软件已升级至2007最新版本)。
二、数据库安装步骤
(一)下载并安装SFS2007
1、双击SFS2007、exe文件,则开始安装,然后点击Setup,多数步骤都默认即可,点击Next;
2、注意在安装过程中,会弹出一个窗口询问:
DoyouhaveadisklabledCustomSiteFiles?
这里点击 否(No)。
3、当出现窗口显示安装后的快捷键的图标时,可以选择关闭或最小化窗口,则会出现提示询问就是否安装工具条:
DoyouwanttoinstallSciFinderScholarToolbarnow?
建议选择 就是(Y) 以后只要点击Next即可。
(二)下载拷贝Site、prf文件(或文件名为site的文件)到主文件夹,即C:
\SFSCHLR文件夹中。
(三)下载并安装ViewerLite50-4Cas(一个查瞧3D模型的视图工具,默认安装即可,请先将您的浏览器IE升级到6、0版本后再安装!
)。
(四)至此就已经全部安装配置完毕,可以点击开始>程序>SciFinderScholar2007>SciFinderScholar就可以开始使用了。
(五)系统要求客户端必须装有AdobeAcrobatReader4、0或者更高版本。
三、数据库检索指南
1、登录
打开数据库,检索界面如下
工具条按钮简述:
ToolbarButton
Function
NewTask
开始一个新任务;
Back
显示上一屏;
Forward
显示下一屏;
依据打印设定进行打印;
SaveAs
按不同格式进行保存;
FullText
通过ChemPort®ConnectionSM索取全文;
Prefs
打开PreferenceEditor,个性化设置使用SciFinderScholar;
Database
打开PreferenceEditor中的Databases栏,对执行任务时需要检索的数据库进行选择;
History
显示您当前进程所执行过的操作;
Internet
显示SciFinderScholar的网上资源;
Help
帮助;
Exit
退出;
检索主界面
2、Explore检索
2、1检索文献(ExploreLiterature)
2、1、1 ResearchTopic(按研究主题搜索):
在Describeyourtopicusingaphrase检索框中输入关键词、短语或句子搜索研究领域。
运用关键词之间的关系迅速检索相关的结果。
在输入检索词时注意以下几点:
一般最佳在2-3个Concepts(关键词),最多不超过5个
最好使用介词而不用Boolean运算符,如AND、OR、NOT;介词能被识别;
识别常用缩写、单复数、过去式等;
支持同意词,近义词检索;
不能用!
或*(删减字符或通配符)
可用括号,括号内为前词的同义词;
修饰语不能自行分配,需各自写明;
以“获得关于纳米结构材料方面的参考文献”为例”,
输入“nanostructurewithmaterial”,点击“OK”
结果显示有多少篇文献相匹配,如上图,“Closelyassociatedwithoneanother”表示在同一个句子中出现。
点中前面的选择框,点击“GetReferences”获取文献信息。
我们注意到所列文献中出现了nano-structured,nanosizedstructure,nanoscale这样的词那就是SciFinder能够自动识别同义词,近义词,缩写,并有截词,断词等功能。
选定文献,点击“Analyze/Refine”,出现以下窗口,
选择“Analyze”
以基于内容的“IndexTerm”分析为例,点击“ok”,则可以根据内容将文献分类,选择自己关心的文献,点击“GetReferences”即可获得文献信息
如果我对防火方面感兴趣,那么可以用主题再次限定,选择“Refine”
出现以下页面:
选择“ResearchTopic”,输入“Fireresisitant”,点击“ok”,
获得想要的文献,如下图
点击文献后面的
可以获取文献信息
但就是,IndexTerm分析的结果有近200的索引词,Categorize功能可以提供系统分类方法。
点击“Analyze/Refine”,出现以下窗口,
选择“Categorize”,则进行系统分类,分类结果如下图,左侧为技术大类,右侧为对应的小类,同时还显示文献数目。
选择关心的类别,点击“GetReferences”获取文献信息。
综上,IndexTerm分析与Categorize分析的区别在于通过IndexTerm的分析,我们可以瞧到被检索到的文献的内容分布情况。
通过Categorize的分析,我们让我们根据各自的研究领域去找寻关心的参考文献。
2、1、2根据科学家或研究员姓名来查找科技信息(AuthorName)
在输入检索词时注意以下几点:
(1)输入有关此姓名尽可能多的信息,如姓、名(或缩写)、中间名等。
(2)请根据需要输入空格、连字符与省略符。
(3)使用相当的字符来代替特殊字符,如使用a或ae来替代?
。
(4)选择“查找”以了解姓氏的其它拼写方式,从而应对姓名的变更及印刷上的区别。
(5)对于复杂的姓名,请使用多种搜寻方法并选择可提供最佳结果的方法。
以检索材料学院卢忠远教授发表的文献为例,在“lastname”中输入姓氏,一定要写全,在“firstname”中输入名,只需写首字母,
点击“ok”进入检索,
在后选项中,选择所有的可能,LuZ,LuZY,LuZY,LuZhongYuan,LuZhongYuan等等。
选择“GetReferences”,得到检索结果如下
点击“Analyze/Refine”进行分析,提炼,
选择所有的可能 SouthwestUniversityofScienceandTechnology,PeopRepChina
再次分析,提炼。
选定“JournalName”作为分类标准进行分类,获取文献。
其余操作同上。
2、1、3 按公司名称/组织搜索(CompanyName/Organization)
查找与特定公司、学术机构或政府组织相关的信息,在输入检索词时注意以下几点:
(1)一次仅输入一个组织。
(2)通常情况下,要扩大答案集,请使用较少的短语。
要缩小答案集,请使用较多的短语。
输入的短语越多,查询越详细。
(3)SciFinder在检索结果时,会考虑各种拼写方式、简写、缩写及相关短语,但不会涉及到合并与收购。
(4)SciFinder自动搜索相关短语组。
例如,输入“company”与“co、”将返回相同的结果。
在检索框中输入检索词可获取文献目录,其余操作同上、
2、2 检索物质(ExploreSubstances)
2、2、1化学结构检索(ChemicalStructure)
通过SciFinder的结构绘图工具,可绘制化学结构,然后找出与此结构相匹配的特殊物质或物质组。
实际搜索结果可能包括:
· 已绘制的结构
· 立体异构术
· 互变体(包括酮烯醇)
· 配位化合物
· 带电荷化合物
· 自由基或基离子
· 同位素
· 聚合体、混合物与盐
在“结构绘图”窗口中,使用工具从左下边至底部绘制的结构。
单击“GetSubstances(获取物质)”。
这样我们可以得到以下结果:
1.得到该物质的盐,或者其她的混合物,聚合物。
2.通过修饰物质的部分结构,来获得更多的物质信息。
3.检索存在类似的但就是尚不知道结构的物质。
4.检索到所画结构物质的其它相似结构,进而开拓我们的研究方向。
2、2、1、1Exactsearch(精确结构检索)
在结构绘图工具中绘出要检索的分子机构图,单击“GetSubstances(获取物质)”,选择“Exactsearch”,点击“OK”,在弹出框内选择自己想要的
点击“GetSubstances”得到文献资源,则可进行文献查瞧、分析提炼等操作,操作步骤同上。
2、2、1、2Substance search(亚结构检索)
在结构绘图工具中绘出要检索的分子机构图,单击“GetSubstances(获取物质)”,选择“Substancesearch”,点击“OK”,
检索结果如下:
共有33246种修饰信息。
那么对于这33246种物质,我们再去分析来获得我们需要的信息,点击“Analyze/Refine”
下面分别介绍“Analyze”、“Refine”的功能。
“Analyze”介绍如下
“Refine”功能介绍如下
如果对于上面的3万多种物质,如果我只想获得具有红外光谱数据的物质,那么,应该点击“PropertyAvailability”,选择“IRSpectrum”就可获取具有红外光谱信息的物质。
实际上,我们有的时候,更多关注的就是结构上面的信息修饰信息--后处理功能的运用,修饰某一特定原子后该原子的二次修饰信息。
2、2、1、3Similarity search(相似结构检索)
在结构绘图工具中绘出要检索的分子机构图,单击“GetSubstances(获取物质)”,选择“Similaritysearch”,点击“OK”,
出现相似文献书目统计的对话框,选择后点击“GetSubstances”即可获取文献信息,其她操作同上。
2、2、2、分子式检索(MolecularFormular)
输入栏中输入分子式,点击“OK”即可检索相匹配的文献与物质信息。
2、3、反应检索(ExploreReactions)
通过SciFinder的结构绘图工具绘制化学反应式,工具栏功能介绍如下:
操作步骤如下:
绘出化学反应式,点击“GetRecations”,选择后点击“OK”,弹出对话框后再次点击“OK”,即可得到与此反应相关的文献与物质信息。
文献资料如下:
点击“Analyze/Refine”,将结果进行分析提炼。
下面分别介绍“Analyze”、“Refine”的功能。
“Analyze”介绍如下
“Refine”功能介绍如下
具体分析结果举例显示:
通常利用SciFinderScholar反应检索可以做一些对我们科研有参考意义的反应常会用到的情况:
1、官能团之间的反应。
2、亚结构反应检索。
3、对反应位置与原子有特定要求的反应。
3、查找(Locate)
分为LocateLiterature与LocateSubstance两大部分:
3、1 查找特定参考文献(LocateLiterature)
3、1、1、根据书目信息查找文献(BibliographicInformation)
通过输入所需的书目信息,SciFinder可帮助查找特定的期刊或专利参考文献。
查找期刊文献时,选择JournalReference,输入相关的期刊参考文献信息。
单击确定。
查找专利参考文献时,选择PatentReference,输入相关的专利参考文献信息如专利号、专利应用号、优先顺序应用号等,还可选择高级选项输入发明家或专利权人,单击确定。
3、1、2、根据文献标识符查找文献(DocumentIdentifier)
键入专利号或CAS物质登记号进行查找。
每行输入一个标识符,一次可搜索25个标识符。
或者单击从文件中读取可以导入标识符列表。
3、2、查找物质(LocateSubstances)
使用“物质标识符”及化学名称或CAS登记号查找特定物质或物质组。
通过LocateSubstances,可以获取以下几种信息:
(1)查找与验证化学名称、CAS登记号、分子式与其它物质信息
(2)获取计算与实验属性数据
(3)识别商业来源
(4)检索法规遵循信息
(5)获取讨论物质的文章与专利
键入化学名称、商标名称或CAS登记号进行查找。
每行输入一个标识符,一次可搜索25个标识符。
或者单击从文件中读取可以导入标识符列表。
单击确定。
要查瞧答案中的属性数据,请单击显微镜图标以显示物质详情。
如果属性信息可用,则提供链接。
属性值来源显示于右侧列与脚注区域中。
4、浏览(Browse)
Browse功能,可以让科研工作者浏览核心期刊的内容。
点击“Browse”即可瞧到期刊列表,选择关注的期刊,点击“View”后可以瞧到该期刊的信息,点击“SelectIssue”即可瞧到期刊卷期信息,点击可浏览该期信息。
5、打印与保存结果
SciFinderScholar允许打印参考文献、物质与反应的结果,以及把结果保存至计算机上的文件中。
5、1、打印
选择想要打印的结果,选中对应条目前的方框。
然后选择文件(File)>打印(Print)。
如未选择特定的答案,SciFinder将打印所有的答案。
选择打印格式,指明就是否包含任务历史。
还可以输入打印标题。
然后单击确定进行打印。
5、2、保存答案
选择想要保存的答案,然后选择文件(File)>另存为(SaveAs)。
如未选择特定的答案,SciFinder将保存所有的答案。
选择或创建一个文件夹,并输入文件名。
单击选项按钮,能够访问可选择的文件类型的所有选项。
用rtf或、txt格式至多可保存500个答案。
单击保存,把结果保存至计算机上的文件中。
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