胃肠道间质瘤的ckit基因突变检测.docx
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胃肠道间质瘤的ckit基因突变检测
胃肠道间质瘤的ckit基因突变检测
作者:
杨锋丁宝国杨堂斗贺慧颖钟镐镐李燕郑杰吴秉铨
【摘要】目的探讨CD117阳性的胃肠道间质肿瘤ckit基因突变分布及类型。
方法采用免疫组化技术,对10例GIST标本行CD117、CD34、SMA和S100检测,以确诊为GIST;采用PCR技术对CD117阳性的GIST进行ckit基因突变检测;采用直接测序方法对突变ckit基因11、9、13和17号的外显子突变进行序列分析。
结果4例成功提取了肿瘤DNA,其中3例检出了ckit基因突变,均分布于第11号外显子,均为557~558的缺失性突变;其中2例为纯合子性突变,1例为杂合子性突变。
结论CD117阳性的GIST通常有ckit基因突变,其11号外显子是经典分布热点,变异纯合子和杂合子突变为常见类型。
【关键词】胃肠道间质肿瘤;DNA突变分析;ckit基因
[ABSTRACT]ObjectiveToexplorethelocusandtypesofckit(CD117)mutationsingastrointestinalstromaltumors(GIST).MethodsSpecimensof10GISTcasesweredetectedimmunohistologicallyforCD117,CD34,SMAandS100toconfirmthediagnosisofGIST.ForCD117positiveGIST,themutationofckitwasdetectedbyPCR,anditsexons11,9,13and17analyzedbydirectsequencingwassuccessfullyisolatedinfourcases,inwhich,mutationofckitwasfoundinthreecases,allthegenesdetectedwereatckitexon11withcodon557-558(WK),homozygousmutationbeingnotedintwocasesandheterozygousinisusuallyckitgenemutationsinCD117positiveGIST,theexon11beingclassic“hotspot”ofthemutations.Thehomozygousandheterozygousaretheircommontypes.
[KEYWORDS]Gastrointestinalstromaltumor;DNAmutationaanalysis;ckitgene
胃肠道间质瘤是近年来被认识并命名的新实体瘤,CD117是其特异性敏感标志物[1]。
GIST具有ckit基因的11号外显子突变,从而导致酪氨酸激酶持续激活[2]。
GIST对酪氨酸激酶抑制剂Gleevec治疗敏感[3]。
基因诊断和分型为临床深入认识该病提供了重要前提[4]。
探讨了GISTckit基因突变分布及类型,现报告如下。
1材料和方法
标本及其来源
收集胶南市人民医院外科收治的10例临床病理诊断为GIST的肿瘤石蜡包埋组织标本,其中男6例,女4例,年龄31~72岁。
根据临床病理组织学形态特征将GIST分为:
梭形细胞型4例,上皮样细胞型3例和两者混合型3例。
肿瘤直径5cm、核分裂象>5/50HPF或肿瘤直径>10cm或核分裂象>10/50HPF3例。
免疫组化方法
将40g/L甲醛溶液固定、石蜡包埋的组织制成4μm连续切片,以CD117(A4502,1∶200)、CD34(M7165,1∶50)、SMA(M851,1∶100)、S100(Z231,1∶200)进行免疫组化标记。
CD117免疫标记采用Envision两步法;余者均采用SP三步法[5]。
CD117阳性细胞胞膜呈棕黄色;S100阳性细胞胞核和胞质呈棕黄色;CD34、SMA阳性细胞胞质呈棕黄色。
ckit基因突变检测分析
用QiagenDNA试剂盒提取石蜡包埋组织的DNA,行PCR扩增。
所有病例均首先进行ckit第11号外显子的扩增检测,发现有突变者,不再进行其他突变检测;对11号外显子突变无阳性发现者,再进行ckit9号外显子的扩增检测;无ckit9号外显子突变者,再进行13号和17号外显子的扩增。
所用引物序列、退火温度和PCR产物片段大小见表1。
表1PCR扩增引物序列、退火温度和产物片段外显子编号引物序列
PCR反应条件为:
95℃变性2min;94℃40s,退火40s,72℃35s,循环30~35次;最后72℃延伸5min。
以双蒸水代替模板作为阴性对照。
PCR产物北京华大中生生物科技发展公司纯化并测序。
有突变的病例再行反向测序证实,并与NCBI基因库ckit基因序列进行比对。
2结果
经免疫组化检测CD117、CD34、SMA和S100,确认10例为CD117阳性GIST病例。
10例石蜡标本中仅4例成功提取了DNA,并进行了PCR扩增和测序。
按细胞类型分为上皮样细胞2例,梭形细胞1例,混合型1例。
按侵袭危险性分为高度危险性3例,其核分裂象(8~15)/50HPF;中度危险性1例,其核分裂象(1~2)/50HPF。
该4例中,有3例检出了ckit基因第11号外显子缺失突变,均为累及557~558的缺失性突变。
其中1例CD117、CD34,第11号外显子缺失突变,缺失片段为TGGAAGG,为杂合子性缺失突变;1例CD117、CD34,第11号外显子缺失突变;1例CD117、CD34,第11号外显子缺失突变。
后两者均为纯合子性缺失突变。
1例CD117、CD34,未检测到11、9、13、17号外显子的突变,属野生型序列。
其余6例,经反复提取DNA和检测,均失败。
3讨论
本组10例GIST的组织病理学研究显示,GIST肿瘤细胞主要有3种类型:
梭形细胞型、上皮样细胞型和梭形细胞与上皮样细胞混合型,但主要以梭形细胞型为常见。
组织学检查表明,GIST肿瘤细胞的核分裂象数目差异很大,而且与肿瘤的大小不相关。
光镜高倍视野下GIST肿瘤细胞核分裂象数目与肿瘤大小,均为FLETCHER等[6]对GIST侵袭危险度分级的主要指标,在评估病人预后上有重要意义。
研究结果进一步表明,免疫组织化学几项检测指标,特别是CD117和CD34对GIST的诊断是必需的。
95%以上GIST表达CD117阳性,70%左右表达CD34阳性。
因此,CD117和CD34是GIST病理诊断和鉴别诊断的关键性免疫形态学指标。
GIST从组织学上,被认为胃肠道间质中的Cajal细胞和其前身细胞[7],这两种细胞都显示CD117和CD34阳性表达;SMA和S100则是用于鉴别平滑肌和神经源性肿瘤的免疫学指标。
本研究对10例GIST组织进行ckit基因突变检测分析,目的是揭示肿瘤赖以发生的突变基因靶点,寻找在基因水平上的序列异常改变,帮助临床选择恰当治疗方案。
但是,其中6例检测失败。
分析失败原因,主要是组织标本处理不规范,造成无法有效提取组织DNA。
因此,规范GIST的组织处理过程,是必须首先解决的问题。
本组GIST中有3例为ckit基因突变肿瘤,突变位点均位于11号外显子,并表现为纯合子缺失突变和杂合子缺失突变两种类型。
ckit基因是一种原癌基因,它的配体是细胞因子,ckit基因被激活后会引起受体的二聚体,并促进酪氨酸磷酸化,启动细胞内的信号传导,产生一系列增殖、分化、凋亡的调节功能。
ckit基因11号外显子是酪氨酸激酶抑制剂的靶向位点,因此是Gleevec药物作用的敏感位点。
按基因分类诊断,是推荐选择Gleevec靶向治疗药物的适宜对象。
而另1例病人的基因突变检测未发现ckit基因9、11、13、17号外显子突变,基因类型为野生型。
同时,根据其肿瘤大小和核分裂象分级,属高侵袭危险性GIST者,免疫组织化学检测其CD117和CD34均为阳性,属对靶向治疗药物Gleevec不敏感的GIST肿瘤病人。
因此,基因诊断分型是GIST的重要临床指标,为临床治疗提供依据,有重要意义。
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- 关 键 词:
- 胃肠道 间质 ckit 基因突变 检测