某省发热呼吸道症候群病原分析.docx
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某省发热呼吸道症候群病原分析
2009-2020年某省发热呼吸道症候群病原分析
目的:
了解和掌握某省发热呼吸道症候群的病原谱构成和流行特征。
方法:
收集某省内各哨点医院2009-2020年间发热呼吸道症候群症状患者的个人信息、临床症状及病原检测等信息,采用描述性流行病学方法分析发热呼吸道症候群病原谱构成和病原流行特征。
结果:
(1)发热呼吸道症候群的病原谱包括病毒和细菌,每年检出的病原种类在增加。
病毒病原居前三位的是人流行性感冒病毒(Flu,15.3%)、鼻病毒(HRV,8.6%)、呼吸道合胞病毒(RSV,2.2%),细菌病原居前三位的是肺炎链球菌(SP,42.8%)、流感嗜血杆菌(HI,14.6%)、肺炎支原体(MP,2.5%),并且肺炎链球菌的阳性率在逐年增加。
(2)肺炎链球菌25~组阳性率最高,1~3月为感染高峰季节;流感嗜血杆菌5~组阳性率最高,8~10月为感染高峰季节;人流行性感冒病毒5~组阳性率最高,10~12月为感染高峰季节;鼻病毒25~组阳性率最高,9~10月为感染高峰季节。
结论:
2009-2020年某省发热呼吸道症候群病原谱在逐年变化,病原感染以肺炎链球菌、人流行性感冒病毒为主。
关键词:
发热呼吸道症候群,流行病学,病原学
前言
发热呼吸道症候群(FRS)是一组具有相似临床体征的呼吸系统的疾病,临床症状主要有发热、咳嗽、咳痰等[1]。
可由多种病原引起,其病原包括病毒和细菌等。
其中病毒主要有流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒、偏肺病毒、人冠状病毒、人博卡病毒、鼻病毒等,细菌主要有铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌、金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、A组链球菌、肺炎衣原体、肺炎支原体、军团菌等[2,3]。
病毒感染引起的疾病病情凶险,极易在短时间内快速传播流行,造成疫情暴发,甚至全球流行,且病死率高[4]。
病毒性呼吸道疾病成为人类传染病中最常见、发病率最高的疾病,仅20世纪,全球死亡人数中就有超过一亿的人是因感染了流感病毒,病毒对急性呼吸道疾病有重大的影响作用。
在我国,90%以上的急性呼吸道感染是由病毒引起的[5]。
自2009年4月底墨西哥发生首例新型H1N1流感(甲流)以来,甲流在世界范围迅速蔓延,急性呼吸道疾病成为全球范围内人类疾病和死亡的主要原因之一[5,6]。
跟据世界卫生组织的数据,世界上至少6%的残疾和死亡是由急性呼吸道感染造成的,就伤残调整寿命年来说,急性呼吸道感染造成9403.7万全球疾病负担[7]。
呼吸道类传染病给人类健康、社会稳定和经济发展带来了严重的威胁[8]。
急性呼吸道感染也是全球儿童死亡的主要原因之一。
即使在发达国家,严重急性呼吸道感染引起的5岁以下儿童的死亡率也非常高,给社会带来了沉重负担[9]。
学龄前儿童每年被感染6-9次,急性呼吸道感染已是儿童的常见病与多发病,其在发展中国家的致死率占儿童死亡率的30%[10]。
据世界卫生组织调查的儿童死亡病因,2000-2003年占73%的六大原因中,肺炎以19%居于首位[11],由此可见,预防呼吸道感染十分重要。
预防传染病不仅是关乎人民群众身体健康的工作,而且是关乎经济发展和社会稳定的工作。
国家高度重视传染病预防工作,特别是2003年抗击非典以来,传染病防治工作已纳入国民经济和社会发展规划。
2004年传染病防治法相关规定修订以后,《病原微生物实验室生物安全管理条例》、《重大动物疫情应急条例》等法规相继公布,保证传染病防治工作确实落实。
并且发热呼吸道症候群监测工作作为国家传染病防治科技重大专项传染病检测技术平台项目,在全国陆续展开。
2008年“十一五”科技计划传染病重大专项“我国传染病实验室监测技术平台的建立和病原谱监测研究”课题就要求完成发热呼吸道症候群的病原筛查和监测技术,2020年“十二五”对其采样要求进行了进一步规范。
病原谱结构的复杂性、疾病传播的快速性以及较高的致病性给临床诊断、治疗及疾病的防控带来了极大的挑战。
但目前现有技术难以快速准确的判断出发热呼吸道症候群的病原。
本研究通过对某省内的发热呼吸道症候群的病例、病原进行监测,了解某省发热呼吸道症候群的病原感染状况,并进一步掌握发热呼吸道症候群的病原谱构成与分布特征、流行特点,提高对呼吸道传染病的病原检测能力,为临床诊断、治疗和预防策略提供科学依据。
第一章资料与方法
1.1资料来源
本研究通过收集某省内各哨点医院2009-2020年间发热呼吸道症候群症状患者的个人信息、临床症状及病原检测等信息,采用流行病学描述性研究方法分析发热呼吸道症候群病例病原谱构成和病原流行特征。
1.2研究对象
符合“十二五”传染病重大专项的监测方案中定义发热呼吸道症候群的病例,以某省十三家哨点医院2012-2020年就诊的发热呼吸道疾病患者为研究对象。
其中发热呼吸道症候群病例的定义为:
具备发热(从发病开始有报告和记录)、WBC升高或降低(或WBC分布异常)、寒战、体温降低(考虑年龄)上述急性感染表现中的任何一项;咳嗽(新发或咳嗽加重)、咳痰、气短、听诊呼吸音异常(湿啰音,干啰音,哮鸣音,浊音)、呼吸急促、胸痛上述呼吸道疾病表现中的任何一项;胸部X线片提示肺部炎性改变,如肺片状阴影或肺实变影等。
1.3研究内容与研究方法
选择某省内兰州市、平凉市、天水市、张掖市等各地代表性医院作为哨点医院,主要收集发热呼吸道症候群患者个人的性别、年龄、发病日期、就诊日期等基本信息,及其临床症状和实验室检查结果。
通过收集发热呼吸道症候群病例的鼻/咽拭子、血液、痰液、尿液、胸腔穿刺液、支气管肺泡灌洗液、血清为标本,检测病例的病原微生物即细菌和病毒(人流感病毒、人副流感病毒、呼吸道合胞病毒、人腺病毒、人偏肺病毒、人冠状病毒、人博卡病毒、鼻病毒等病毒和铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌、金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、A组链球菌、肺炎衣原体、肺炎支原体、军团菌等细菌)的感染情况。
通过采用流行病学描述性研究方法分析发热呼吸道症候群病例病原谱构成和病原流行特征。
1.4统计方法
将原始数据导出在Excel软件中,运用SPSS21软件对数据进行统计分析,将分析结果用三线表、图等表示出来。
采用X2检验进行率的比较,双侧P≤0.05判定为差异有统计学意义。
1.5质量控制
本研究的数据来源于“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”国家科技重大专项“传染病监测技术平台”信息管理系统。
第2章结果
2.12009-2020年某省FRS的病原检测及检出状况
2009-2020年某省13家哨点医院共采集到5455例发热呼吸道症候群病例。
其每年采集到的病例数分别为1188例、1612例、1303例、443例、909例。
2.1.12009-2020年某省FRS的病原检测状况
2009-2020年发热呼吸道症候群病例任一病原检测率均在90.0%以上,2009年任一病原检测率最高,为99.7%。
其中,任一病毒检测率2009年最高(99.7%),2012年最低(86.0%);任一细菌检测率2009年、2010年均非常低,分别为0.1%、5.2%,最高2020年检测率也仅为63.9%。
详见表2.1。
表2.12009-2020年FRS病原检测
年份
任一病毒
任一细菌
任一病原
采集数
检测数
检测率(%)
采集数
检测数
检测率(%)
采集数
检测数
检测率(%)
2009
1188
1185
99.7
1188
1
0.1
1188
1185
99.7
2010
1612
1545
95.8
1612
84
5.2
1612
1550
96.2
2011
1303
1268
97.3
1303
130
10.0
1303
1270
97.5
2012
443
381
86.0
443
240
54.2
443
434
98.0
2020
909
819
90.1
909
581
63.9
909
843
92.7
合计
5455
5198
95.3
5455
1036
19.0
5455
5282
96.8
2.1.22009-2020年某省FRS的病原检出状况
2009-2020年发热呼吸道症候群病例任一病毒与任一细菌的阳性率分别为21.7%、27.3%。
2009-2012年任一病毒的阳性检出率较高,均为25.7%;任一细菌的阳性检出率在2020年最高,为41.3%。
详见表2.2。
表2.22009-2020年FRS的病原检出状况
年份
任一病毒
任一细菌
检测数
检出数
阳性率(%)
检测数
检出数
阳性率(%)
2009
1185
305
25.7
1
0
0.0
2010
1545
259
16.8
84
15
17.9
2011
1268
264
20.8
130
12
9.2
2012
381
98
25.7
240
16
6.7
2020
819
203
24.8
581
240
41.3
合计
5198
1129
21.7
1036
283
27.3
2.22009-2020年某省FRS的病原谱构成及病原变迁
2.2.12009-2020年某省FRS的病原构成
2009-2020年某省发热呼吸道症候群的病原包括病毒和细菌。
在发热呼吸道症候群病毒检测中,阳性率居前三位的是人流行性感冒病毒、鼻病毒、呼吸道合胞病毒;细菌检测中,阳性率居前三位的是肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、肺炎支原体。
详见表2.3和表2.4。
表2.32009-2020年某省发热呼吸道症候群病毒检出情况
病毒
检测数
阳性数
阳性率(%)
人流感病毒
5194
794
15.3
鼻病毒
1343
115
8.6
呼吸道合胞病毒
4317
93
2.2
人副流感病毒
4315
75
1.7
人冠状病毒
4315
74
1.7
人腺病毒
4315
38
0.9
人偏肺病毒
4315
23
0.5
人博卡病毒
1554
7
0.4
表2.42009-2020年某省发热呼吸道症候群细菌检出情况
检出数
阳性数
阳性率(%)
肺炎链球菌
594
254
42.8
流感嗜血杆菌
500
73
14.6
肺炎支原体
828
21
2.5
铜绿假单胞菌
398
7
1.8
肺炎克雷伯菌
398
7
1.8
金黄色葡萄球菌
398
2
0.5
肺炎衣原体
829
2
0.2
2.2.22009-2020年某省FRS的病原变迁
2009-2020年发热呼吸道症候群病例各病原阳性率检出最高的是肺炎链球菌,为42.8%,其次为人流行性感冒病毒、流感嗜血杆菌,阳性率分别为15.3%、14.6%,肺炎衣原体阳性率最低,仅0.2%。
2009年仅检出人流行性感冒病毒,阳性率为25.7%。
2010年阳性检出率较高的是肺炎支原体、人流行性感冒病毒。
2011年肺炎链球菌阳性率(31.0)明显高于其他病原。
2012年病原检出阳性率较高的是人流行性感冒病毒、肺炎链球菌。
2020年肺炎链球菌阳性率达到五年来最高,为53.2%。
详见表2.5,图2.1和图2.2。
表2.52009-2020年发热呼吸道症候群病原变迁状况
病原
阳性率(%)
2009
2010
2011
2012
2020
合计
病毒
人流行性感冒病毒
25.7
15.6
11.0
18.8
4.6
15.3
呼吸道合胞病毒
0.0
0.3
7.4
8.7
3.4
2.2
人副流感病毒
0.0
5.0
5.5
1.5
3.9
1.7
人腺病毒
0.0
0.2
2.8
1.0
2.0
0.9
人偏肺病毒
0.0
0.0
1.3
2.1
1.4
0.5
人冠状病毒
0.0
0.2
2.7
2.6
6.1
1.7
人博卡病毒
0.0
0.0
1.3
0.0
0.3
0.4
鼻病毒
-
1.4
11.3
5.7
8.0
8.6
细菌
铜绿假单胞菌
-
3.3
0.0
4.3
1.5
1.8
肺炎克雷伯菌
-
3.3
0.0
4.3
1.5
1.8
金黄色葡萄球菌
-
0.0
0.0
0.0
0.6
0.5
肺炎链球菌
-
11.1
31.0
14.4
53.2
42.8
流感嗜血杆菌
-
5.9
3.7
2.2
17.5
14.6
肺炎衣原体
0.0
0.0
0.0
0.0
0.4
0.2
肺炎支原体
0.0
15.8
2.9
0.6
1.6
2.5
图2.12009-2020年发热呼吸道症候群病毒检出状况
图2.22009-2020年发热呼吸道症候群细菌检出状况
2.32009-2020年某省FRS的主要病原的流行分布
2.3.12009-2020年某省FRS主要细菌病原的流行分布
2.3.1.12009-2020年肺炎链球菌的流行分布
2.3.1.1.1性别分布
2009-2020年共检测肺炎链球菌594例,其中男性421例,女性173例。
男女病例肺炎链球菌阳性检出率分别为41.1%和46.8%。
两组阳性检出率无统计学差异(X2=1.644,P=0.203>0.05)。
详见表2.6。
表2.62009-2020年某省发热呼吸道症候群肺炎链球菌阳性病例性别分布
性别
检测数
阳性数
阳性率(%)
男性
421
173
41.1
女性
173
81
46.8
合计
594
254
42.8
2.3.1.1.2年龄分布
在594例肺炎链球菌检测病例中,阳性254例,阴性340例,阳性检出率为42.8%。
其中25~组阳性检出率最高,为55.2%,其次为1~组和5~组,两组阳性检出率均为50.0%。
15~组的阳性检出率最低,为28.1%。
详见表2.7。
表2.72009-2020年某省FRS不同年龄段肺炎链球菌阳性率分布
年龄(岁)
检测数
阳性数
阳性率(%)
0~
29
10
34.5
1~
22
11
50.0
5~
18
9
50.0
15~
32
9
28.1
25~
29
16
55.2
35~
42
20
47.6
45~
78
35
44.9
55~
124
48
38.7
65~
220
96
43.6
合计
594
254
42.8
2.3.1.1.3时间分布
2009年未对发热呼吸道症候群病例标本进行肺炎链球菌的检测,2010-2020年肺炎链球菌阳性检出率分别为11.1%、31.0%、14.4%、53.2%。
2020年阳性检出率明显高于其他年份。
其中1月份阳性检出率最高,为72.7%,之后依次为2月、3月、9月、12月,阳性检出率分别为51.7%、45.5%、44.4%、42.8%。
6月份的阳性检出率最低,为21.2%。
详见图2.3。
图2.32009-2020年某省发热呼吸道症候群肺炎链球菌时间分布
2.3.1.22009-2020年流感嗜血杆菌的流行分布
2.3.1.2.1性别分布
2009-2020年共检测流感嗜血杆菌500例,其中男性360例,女性140例。
男女病例流感嗜血杆菌阳性检出率分别为14.7%和14.3%。
两组阳性检出率无统计学差异(X2=0.015,P=1.00>0.05)。
详见表2.8。
表2.82009-2020年某省发热呼吸道症候群流感嗜血杆菌阳性病例性别分布
性别
检测数
阳性数
阳性率(%)
男性
360
53
14.7
女性
140
20
14.3
合计
500
73
14.6
2.3.1.2.2年龄分布
在500例发热呼吸道症候群流感嗜血杆菌检测病例中,阳性有73例,阳性检出率为14.6%。
其中5~组的阳性检出率最高为37.5%,其次为35~组,阳性检出率为25.0%,阳性检出率最低的是15~组,为7.7%。
详见表2.9。
表2.92009-2020年某省FRS不同年龄段流感嗜血杆菌阳性率分布
年龄(岁)
检测数
阳性数
阳性率(%)
0~
21
4
19.0
1~
18
4
22.2
5~
16
6
37.5
15~
26
2
7.7
25~
29
5
17.2
35~
36
9
25.0
45~
67
12
17.9
55~
103
13
12.6
65~
184
18
9.8
合计
500
73
14.6
(X2=16.52,P=0.036<0.05)
2.3.1.2.3时间分布
2009年未对发热呼吸道症候群病例标本进行流感嗜血杆菌进行检测,2010-2020年流感嗜血杆菌的阳性检出率分别为5.9%、3.7%、2.2%、17.5%。
2020年的阳性检出率最高。
其中9月份的阳性检出率最高为33.3%,其后三位依次是8月、10月、6月,阳性检出率分别为32.6%、25.0%、16.1%,2月份的阳性检出率最低为4.3%。
详见图2.4。
图2.42009-2020年某省发热呼吸道症候群流感嗜血杆菌时间分布
2.3.22009-2020年某省FRS主要病毒病原的流行分布
2.3.2.12009-2020年人流行性感冒病毒的流行分布
2.3.2.1.1性别分布
2009-2020年共检测人流行性感冒病毒5194例,其中男性3234例,女性1960例。
男女病例人流行性感冒病毒阳性检出率分别为15.3%和15.2%。
两组阳性检出率无统计学差异(X2=0.017,P=0.897>0.05)。
详见表2.10。
表2.102009-2020年某省发热呼吸道症候群人流行性感冒病毒阳性病例性别分布
性别
检测数
阳性数
阳性率(%)
男性
3234
496
15.3
女性
1960
298
15.2
合计
5194
794
15.3
2.3.2.1.2年龄分布
5194例发热呼吸道症候群病例人流感病毒检测标本中,794例检测出人流感病毒阳性,阳性检出率为15.3%。
其中5~组阳性检出率最高,为22.6%,其次是15~组,阳性检出率为21.6%,0~组检出率最低,为5.8%。
详见表2.11。
表2.112009-2020年某省FRS不同年龄段人流行性感冒病毒阳性率分布
年龄(岁)
检测数
阳性数
阳性率(%)
0~
520
30
5.8
1~
1514
207
13.7
5~
1037
234
22.6
15~
514
111
21.6
25~
332
47
14.2
35~
264
36
13.6
45~
247
41
16.6
55~
277
32
11.6
65~
489
56
11.5
合计
5194
794
15.3
(X2=107.38,P=0.000<0.05)
2.3.2.1.3时间分布
2009-2020年人流感病毒的阳性检出率分别为25.7%、15.6%、11.0%、18.8%、4.6%。
2009年人流感病毒阳性检出率最高,2020年最低。
其中12月、11月、10月人流感病毒阳性检出率均比较高,分别为28.5%、22.5%、21.6%,7月份阳性检出率最低,为1.0%。
详见图2.5。
图2.52009-2020年某省发热呼吸道症候群人流行性感冒病毒时间分布
2.3.2.22009-2020年鼻病毒的流行分布
2.3.2.2.1性别分布
2009-2020年共检测发热呼吸道症候群患者的鼻病毒病原1343例,其中男性896例,女性447例。
男女病例鼻病毒阳性检出率分别为7.6%和10.5%。
两组阳性检出率无统计学差异(X2=3.259,P=0.079>0.05)。
详见表2.12。
表2.122009-2020年某省发热呼吸道症候群鼻病毒阳性病例性别分布
性别
检测数
阳性数
阳性率(%)
男性
896
68
7.6
女性
447
47
10.5
合计
1343
115
8.6
2.3.2.2.2年龄分布
1343例鼻病毒检测标本中,阳性115例,阴性1228例,阳性检出率为8.6%。
其中25~组阳性检出率最高,为16.7%。
35~组次之,为12.0%。
阳性检出率最低的是15~组,检出率为6.2%。
详见表2.13。
表2.132009-2020年某省FRS不同年龄段鼻病毒阳性率分布
年龄(岁)
检测数
阳性数
阳性率(%)
0~
203
13
6.4
1~
232
20
7.9
5~
114
14
10.9
15~
61
4
6.2
25~
40
8
16.7
35~
66
9
12.0
45~
109
8
6.8
55~
148
14
8.6
65~
268
25
8.5
合计
1343
115
8.6
2.3.2.2.3时间分布
2009年未对鼻病毒进行检测,2011-2020年鼻病毒阳性检出率分别为11.3%、5.7%、8.0%。
其中9月份鼻病毒阳性检出率最高,为20.4%,其次为10月份(15.5%),2、3月份的阳性检出率比较低,为4.3%和3.8%。
详见图2.6。
图2.62009-2020年某省发热呼吸道症候群鼻病毒时间分布
第3章讨论
3.12009-2020年某省FRS的病原检测率较低
2009-2020年任一病原的检测率虽均在90.0%以上,但在此五年间任一病毒的检测率有所下降。
任一细菌的检测率虽逐年上升,但最高也仅63.9%,五年总的检测率只有19.0%,提示要继续加大对细菌的检测。
2009-2020年任一病毒与任一细菌的总阳性率虽相差不大,但在每年的检出阳性率上有差别,尤其是任一细菌的阳性率。
2009-2012年任一细菌的阳性率均比较低,2020年任一细菌的阳性率达到41.3%。
任一细菌的阳性率仅在2010年和2020年高于任一病毒的阳性率。
3.22009-2020年某省FRS的主要病原为人流行感冒病毒和肺炎链球菌,肺炎链球菌感染逐年增加
本次研究中,检测出到病毒有人流行性感冒病毒、呼吸道合胞病毒、人副流感病毒、人腺病毒、人偏肺病毒、人冠状病毒、人博卡病毒、鼻病毒等。
其中阳性检出率居前三位的是人流行性感冒病毒、鼻病毒、呼吸道合胞病毒,与河北、陕西的调查结果大体相同[12,13]。
2009年病毒病原中仅检出人流行性感冒病毒。
2010年,检出病毒种类增加,病毒病原谱改变,但人流行性感冒病毒阳性率仍最高。
2011年病毒阳性率最高是鼻病毒,其次才是人流行性感冒病毒。
2012与2020年检出阳性率最高分别是人流行性感冒病毒和鼻病毒。
可以
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