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整理生物学常见名词
生物学常见名词
Abundance(mRNA丰度):
指每个细胞中mRNA分子的数目。
AbundantmRNA(高丰度mRNA):
由少量不同种类mRNA组成,每一种在细胞中出现大量
拷贝。
Acceptorsplicingsite(受体剪切位点):
内含子右末端和相邻外显子左末端的边界。
Acentricfragment(无著丝粒片段):
(由打断产生的)染色体无著丝粒片段缺少中心粒,从而在细胞分化中被丢失。
Activesite(活性位点):
蛋白质上一个底物结合的有限区域。
Allele(等位基因):
在染色体上占据给定位点基因的不同形式。
Allelicexclusion(等位基因排斥):
形容在特殊淋巴细胞中只有一个等位基因来表达编码的免疫球蛋白质。
Allostericcontrol(別构调控):
指蛋白质一个位点上的反应能够影响另一个位点活性的能力。
Alu-equivalentfamily(Alu相当序列基因):
哺乳动物基因组上一组序列,它们与人类Alu
家族相关。
Alufamily(Alu家族):
人类基因组中一系列分散的相关序列,每个约300bp长。
每个成员其两端有Alu切割位点(名字的由来)。
α-Amanitin(鹅膏覃碱):
是来自毒蘑菇Amanitaphalloides二环八肽,能抑制真核RNA聚合酶,特別是聚合酶II轉录。
Ambercodon(琥珀密码子):
核苷酸三联体UAG,引起蛋白质合成终止的三个密码子之一。
Ambermutation(琥珀突变):
指代表蛋白质中氨基酸密码子占据的位点上突变成琥珀密码
子的任何DNA改变。
Ambersuppressors(琥珀抑制子):
编码tRNA的基因突变使其反密码子被改变,从而能识
別UAG密码子和之前的密码子。
Aminoacyl-tRNA(氨酰-tRNA):
是携带氨基酸的轉运RNA,共价連接位在氨基酸的NH2
基团和tRNA终止碱基的3¢或者2¢-OH基团上。
Aminoacyl-tRNAsynthetases(氨酰-tRNA合成酶):
催化氨基酸与tRNA3¢或者2¢-OH基团共价連接的酶。
Amphipathicstructure(两亲结构):
具有两个表面,一个亲水,一个疏水。
脂类是两亲结构,一个蛋白质结构域能够形成两亲螺旋,拥有一个带电的表面和中性表面。
Amplification(扩增):
指产生一个染色体序列额外拷贝,以染色体内或者染色体外DNA形式簇存在。
Anchoragedependence(貼壁依赖):
指正常的真核细胞需要吸附表面才能在培养基上生长。
Aneuploid(非整倍体):
组成与通常的多倍体结构不同,染色体或者染色体片段或成倍丢失。
Annealing(退火):
两条互补单链配对形成双螺旋结构。
Anterograde(顺式轉运):
蛋白质质从内质网沿著高尔基体向质膜轉运。
BlymphocytesorBcell(B淋巴细胞或B细胞):
合成抗体的细胞。
Backcross(回交):
杂交检测的另一种(早期的)说法。
Backmutation(回复突变):
逆轉产生基因失活效果突变的突变,从而使细胞恢复野生型。
Bacteriophage(细菌噬菌体):
侵染细菌的病毒,通常简称为噬菌体。
Balbianiring(B环):
多线染色体条带中一个很大的泡状环。
Normalchromosomes(常染色体):
相对较大,一定区域内在特定化学处理下保持著色。
Basepair(碱基对):
是DNA双链中一对A和T或G和C。
在RNA中特定条件下也能形
成其它的配对。
Bidirectinalreplication(双向复制):
当两个复制叉在同一起始点以不同的方向移动时形成。
Bivalent(二价染色体):
在减数分裂初期一种包括四条染色单体的结构(两个染色单体代表
同源染色体)。
Blastoderm(囊胚层):
昆虫胚胎发育的一个阶段,其中胚胎周围的一层细胞核或细胞围绕
著中央的卵黄。
Blockedreadingframe(闭锁读框):
由于被终止密码子打断而不能被翻译成蛋白质的读码
框。
Blunt-endligation(平端連接):
直接在末端連接两个DNA双链分子的反应。
bp:
是碱基对的简称,表示DNA之间的距离。
Branchmigration(分支迁移):
指双链中与其互补链部分配对的DNA链通过延伸与其同源
的固定链配对的能力。
Breakageandreunion(断裂与重連):
指一种遗传重组的模式,其中两个DNA双链分子在相应的位置打断并十字交叉重新連接(涉及在連接位点异源双链的形成)。
Buoyantdensity(漂浮密度):
衡量一种物质漂浮在一些标准液体上的能力,如CsCl。
Cbanding:
在著丝粒附近产生著色区域的染色体分带技术。
Cgene(C基因):
编码免疫球蛋白质链恒定区域的基因。
Cvalue(C值):
单倍体基因组中DNA的总量。
CAATbox(CAAT盒):
真核生物轉录单位起始点上游的保守序列,被一组轉录因子识別。
Cap(帽):
是真核生物mRNA5¢端的结构,在轉录後通过末端5¢GTP的磷酸基团和mRNA
的末端碱基而引入。
增加的G(有时是其它碱基)是甲基化的,产生了MeG5¢pppNp…的结构。
CAP(CRP):
由cAMP激活的正调控蛋白质。
对RNA聚合酶起始E.coli中一些操纵子(分
解代谢----敏感)是必须的。
Capsid(衣壳):
是病毒微粒外部的蛋白质衣壳。
Caspases:
一个蛋白质酶家族,其成员在调亡(细胞程序性死亡)中起作用。
Cataboliterepression(分解代谢物阻碍):
由于葡萄糖增加引起一些细菌操纵子表达降低。
是cAMP水平降低使CAP调控蛋白质失活所导致。
cDNA:
与RNA互补的单链DNA,通过体内RNA逆轉录而合成。
cDNAclone(cDNA克隆):
代表一个RNA的双链DNA进入一个克隆载体。
Cellcycle(细胞周期):
一次细胞分裂到另一次分裂的时期。
Cellhybrid(细胞杂交):
包含来自不同种属亲本细胞染色体的体细胞(如人-鼠融合细胞杂交),通过融合细胞形成融合的异型核而产生。
Centrioles(中心粒):
在减数分裂期聚集在中轴附近、由微管组成的小空圆柱体,位于著丝粒上。
Centromere(著丝粒):
染色体聚集区域,包含减数分裂或有丝分裂纺锤体结合位点。
Centrosomes(中心体):
减数分裂细胞微管组织的区域。
在动物细胞中,每一个中心体包括
一对由微管附接的、高密度不定型区域围绕的中心粒构成。
Chaperone(分子伴侣):
使一些蛋白质装备或者恰当折叠所需的蛋白质,但是这种蛋白质并
不是目标复合物的成分。
Chemicalcomplexity(化学复杂度):
化学分析测量的DNA成分量。
Chisequemce(Chi序列):
一个提供E.coli中RecA介导遗传重组热点的八聚体序列。
Chistructure(Chi结构):
两个双链DNA之间的接头通过去掉两个連在一起的环而使每个
环产生线形末端暴露出来。
它类似于希腊文chi,从而得此名字。
Chiasma(交叉):
两个同源染色体在减数分裂中交换物质的位点。
Chromatids(染色单体):
复制时产生的染色体拷贝。
此名字通常用来形容处于随後的细胞
分裂期它们分开的之前的染色体。
Chromatin(染色质):
是细胞中期核内DNA和蛋白质复合体。
个別的染色体不能区分开。
它只能通过与DNA特异性作用的染料而识別。
Chromatinremodeling(染色体重建):
指发生在基因活化轉录时核小体能量-依赖型的排列
Dloop(D环):
线粒体DNA上的一个区域,其上一小段RNA与DNA的一条链配对,使
DNA原始配对链在此区域闲置。
也用来描述在RecA蛋白质催化的反应中单链“入
侵者”的进入,使双链DNA中的一条被闲置。
Degeneracy(简并性):
指密码子的第三个碱基上的变化不会改变它所代表的氨基酸。
Deletion(缺失):
一段DNA序列被删除,两边的区域連接起来产生的。
DenaturationofDNAorRNA(DNA或RNA变性):
指它们从双链轉变成单链状态,双链分
开一般因加热产生。
Denaturationofprotein(蛋白质变性):
指蛋白质的物理结构向另一结构(不活泼的)轉变。
Depressedstate(抑制状态):
指关闭的基因。
当描述一个基因的一般状态时,它与“诱导”
同义。
在描述突变的效果时,它与“组成型”同义。
Dicentricchromosome(双著丝粒染色体):
两个染色体片段融合的产物,每一片段都有一个
著丝粒。
通常稳定,在减数分裂中当两个中心粒向两极运动时被拉断。
Diploid(二倍体):
二倍体染色体包括两个拷贝的常染色体和两个性染色体。
Directrepeat(同向重复):
在同一个DNA分子中,相同的(或者相近的)序列以相同的方向
出现两次或多次,但并不一定相邻。
Discontinuousreplication(不連续复制):
指DNA以小片段(岗崎片段)合成然後連接起来。
Disjuction(间断分布):
指在细胞分裂中染色体成分向两极运动。
在减数分裂和有丝分裂II期,分裂的是姊妹染色单体,在有丝I期分裂的是姊妹染色单体对。
Divergence(差异百分率):
两个相关DNA的核苷酸序列或者两个蛋白质氨基酸序列间差异
百分率。
Divergenttranscription(异向轉录):
相反方向两个启动子之间的轉录起始,因此轉录从中央区域开始向两边进行。
dnamutant(dna突变):
这种突变的细菌是温度敏感型的,它们不能在42℃下合成DNA,
但是能在37℃合成。
DNAase(DNA酶):
攻击DNA之间化学键的酶。
DNAaseIhypersensitive(DNA酶I超敏位点):
由于对DNA酶I和其它核酸酶切割高度敏
感而被发现的染色单体上一小段区域。
可能由不包括核小体的区域构成。
DNA-drivenhybridization(DNA驱动杂交):
涉及到额外DNA与RNA反应的杂交。
DNApoymerase(DNA聚合酶):
合成子代DNA链(在DNA模板的指导下)的酶。
可能在修
复或复制中涉及。
DNAreplicase(DNA复制酶):
在复制中特异性需要的一种DNA合成酶。
Domainofachromasome(染色体结构域):
指一个連续的结构整体,其中超螺旋结构独立于其它结构域。
也可指包含表达基因的一个广泛区域,这个基因对DNAaseI有高度敏
感性。
Domainofaprotein(蛋白质结构域):
氨基酸序列的一个整体連续的部分,具有某种具体的功能。
Dominantallele(显性等位基因):
决定杂合中表型的等位基因。
Donorsplicingsite(供体剪接位点):
見左剪切点。
Dosagecompensation(剂量补偿效应):
补偿一个性別中出现两条X染色体和另一个性別中出现一条X染色体偏差的机制。
Downpromotermutation(启动子下降突变):
减少轉录起始频率的突变。
Dowmstream(下游):
沿著表达方向的序列。
例如,编码区是在起始区的下游。
Earlydevelopment(早期发育):
指噬菌体侵染中在DNA复制起始前的一段时期。
Ectopicexpression(异位表达):
基因在它通常不表达的组织中的表达,例如,在轉基因动物中或感染进入胚胎中不常見的位置。
Elongationfactors(延伸因子):
原核中为EF,真核中为eEF),在每一个氨基酸加入多肽链的过程中周期性作用于核糖体的蛋白质。
Endlabeling(末端标记):
指在链5¢或者3¢端加上放射性标记的DNA分子。
End-productinhibition(终产物抑制):
代谢过程中的一个产物能够抑制途径中前些阶段所需酶活性的能力。
Endocyticvesicle(内吞膜泡):
通过内吞运输蛋白质的包被膜泡,也称为网格膜泡。
Endocytosis(内吞作用):
细胞表面的蛋白质内聚,在包被膜泡中轉移到细胞内部的过程。
Endonucleases(内切核酸酶):
切割核酸链内的化学键。
可能特异性的切割RNA或者单链
或双链DNA。
Endoplasmicreticulum(内质网):
高度回绕的膜结构,从核膜最外层延伸到细胞质内。
Enhancer(增强子):
是一个顺式作用序列,能够提高一些真核生物启动子的利用,并能够
在启动子任何方向以及任何位置(上游或者下游)作用。
Enelopes(包膜):
某些细胞器外膜(如细胞核或线粒体),由同中心的膜构成,每一个膜由磷脂双分子层组成。
Episomechange(後天改变):
不影响基因型但是改变表型。
它们包括细胞性质的改变,这
是遗传的但是在遗传信息上没有表现出改变。
Episome(附加体):
能够整合进细菌DNA中的质粒。
Epistasis(上位性):
指一个基因的表达会模糊另一个基因的表型效果。
Essentialgene(必须基因):
缺失会使生物致死的基因(見致死等位基因)。
Establishedcelllines(确立细胞株):
能够在不确定培养基中生长的真核细胞(它们据说是永生的)。
Eubacteria(真细菌):
组成原核生物中的大部分。
Euchromatin(常染色体):
间期核内除了异染色质之外的所有基因组。
Evolutionaryclock(进化钟):
特定基因突变积累的速度定义。
Excision(切除):
噬菌体、附加体或其它序列的切除是指它们以自主DNA分子形式从宿主
染色体中释放出来。
Excision-repair(切除修复):
这个系统移开包含损伤和错误配对碱基的DNA序列,在双链
中通过合成与保留链互补的链来替换它们。
Exocytosis(外排):
从细胞向培养基中分泌蛋白质的过程,通过以膜被小泡从内质网、高尔基体向储存器官运输,最终(依赖调控信号)通过质膜。
Exon(外显子):
割裂基因中在成熟mRNA产物中表达的任何片段。
Exonucleases(核酸外切酶):
从核酸链中每次从一头切割一个核苷酸,可能特异性切割DNA
或者RNA的5¢或者3¢端。
Expressionvector(表达载体):
设计好的克隆载体,使编码序列插入特定的位点,能够轉录和翻译成蛋白质。
Extranucleargenes(核外基因):
核外的、定位在细胞器,如线粒体或葉绿体中的基因。
Ffactor(F因子):
细菌性或繁殖质粒。
F1generation(F1代):
两个亲本系(同源)杂交後的第一代。
Facultativeheterochromatin(兼并性异染色质):
指同时存在活泼型拷贝的惰性序列。
如,哺乳动物雌性中的一条X染色体。
Fastcomponent(快速变性区):
复性反应中的快成分是首先复性,含有高重复DNA的成分。
Fatemap(原基分布图):
在胚胎上标示该区域内细胞的後代将会发育而成的成熟组织。
Figureeight(8字型):
由尚未完成的重组生成的两个相互連接的环状DNA。
Filterhybridization(滤膜杂交):
将变性DNA样本固定于硝酸纤维膜上,然後用放射性标记的DNA或RNA进行杂交。
FingerprintofDNA(DNA指纹图谱):
指不同基因组间的不同多形态限制性片段模式。
Fingerprintofprotein(蛋白质指纹图谱):
酶(如胰蛋白酶)切割蛋白质後产生的片段模式(通常用双向凝胶电泳分离)。
Fluidity(游动性):
指膜的性质,脂质在其单层膜上双向移动的能力。
Focusformation(轉化灶形成):
指轉化後的真核细胞以高密度的簇生长。
Focusformationunits(轉化灶单位):
轉化灶的数量单位。
FoldbackDNA(折回DNA):
指插入重复组成DNA通过变性後重新复性产生的结构。
Footprinting(足纹法):
一种检测DNA位点的技术,通过某些蛋白质结合保护化学键,使
被保护位置免受酶切割。
Forwardmutations(正向突变):
失活野生型基因的突变。
Foundereffect(始创效应):
指从一个祖先起源、具有相同染色体(或者染色体一个区域)的个体集合。
Frameshiftmutations(移码突变):
因非3bp整数倍碱基插入或缺失造成的、改变三联体翻译成蛋白质读框的突变。
Gbanding(G分带):
在中期染色体上产生条纹,从而区分出单倍体各个成员的技术。
G1:
真核细胞周期中减数分裂後期到DNA复制开始的时期。
G2:
真核细胞周期中DNA复制结束到下一次减数分裂开始的时期。
Gamete(配子):
指任何一种类型的生殖细胞,精子或者卵,具有单倍体染色体物质。
GapinDNA(DNA裂隙):
在双链中的一条上一个或多个核苷酸缺失。
Gene/ciston(基因/顺反子):
指能产生一条多肽链的DNA片段。
包括编码区和其上下游区
域(引导区和尾),以及在编码片段间(外显子)的割裂序列(内含子)。
Genecluster(基因簇):
一组相同或者相似的基因。
Geneconversion(基因轉换):
指异源双链DNA中的一条链轉换,使其在出现碱基配对处与另一条链互补。
Genedosage(基因剂量):
在一个基因组中某个基因的重复数量。
Genefamily(基因家族):
一系列外显子相关联的基因,其成员是由一个祖先基因复制或趋
异产生。
Geneticcode(遗传密码):
DNA(或RNA)三联体与蛋白质中氨基酸的对应关系。
Geneticmarker(遗传标记):
見标记。
Genomic(chromosomal)DNAclone(基因组或染色体DNA克隆):
由克隆载体携带的基因
组序列。
Genotype(基因型):
一个生物的遗传组成。
Golgiapparatus(高尔基体):
在内质网附近由膜堆积而成结构,在蛋白质糖基化和存储轉运中起重要作用。
Gprotein(G蛋白质):
位于质膜上的鸟嘌呤核苷酸结合蛋白质三聚体。
当三聚体结合GDP
时,它保持完整并且没有活性。
当结合在a亚基上的GDP被GTP代替时,a亚基与
bg二聚体脱离。
分离得亚基(a或者bg)随後激活或者抑制一个靶蛋白质。
Gratuitous(安慰诱导物):
与轉录中实际诱导物相似,但不是该诱导酶的底物。
GT-ACrule(GT-AG规则):
指在核基因内含子开始和结束出现的两个固定的脱氧核苷酸。
Gyrase(螺旋酶):
大肠杆菌中II型拓扑异构酶,能够向DNA中引入负超螺旋。
Hairpin(发夹):
指在单链RNA或DNA相邻的互补区域形成的双螺旋结构。
Haploid(单倍体):
单倍染色体组中仅含有每个常染色体的一个拷贝和一个性染色体。
单倍
体数n是二倍体生物配子的特征常数。
Haplotype(单元型):
一些染色体特定区域内等位基因的特殊组合,其缩小模型就是基因型。
本来是用来描述MHC等位基因组合的,现在用来描述RELPs之间的特殊组合。
Hapten(半抗原):
一些小分子物质,与蛋白质结合後能像抗原一样引发免疫应答。
Histoneacetyltransferase,HAT(组蛋白乙酰化酶):
向组蛋白添加乙酰基团来修饰它的酶,一些轉录辅激活物有HAT活性。
Histonedeacetyltransferase,HDAC(组蛋白去乙酰化酶):
从组蛋白质上除去乙酰基团的酶,通常与轉录阻遏子相联系。
Helpervirus(辅助病毒):
提供缺陷型病毒缺乏的功能,使後者能完成侵染循环。
Hemizygote(半合体):
失去某个基因拷贝(如,由于一条染色体的丢失),从而只有一个拷
贝的单倍体个体。
Heterochromatin(异染色质):
永久处于高聚集状态的基因组区域,它不轉录而且复制较晚。
可能是组成型的或者兼性的。
Heteroduplex(hybrid)DNA(异源双链DNA):
由不同亲本双链分子中的互补单链产生碱基
配对的双链DNA,在遗传重组中产生。
Heterogameticsex(异配性別):
具有2A+XY的双倍染色体组成。
Heterogeneousnuclear(hn)RNA(不均一核RNA):
由RNA聚合酶II产生的核基因轉录无。
它有宽广的范围和低的稳定性。
Heterokaryon(异核体):
在一个共同的细胞质中包含两个核的细胞,由体细胞融合产生。
Heteromultimericproteins(异源多聚体蛋白质):
有不同的亚基(不同基因编码)组成的蛋白质。
Heterozygote(杂合体):
在某个位点上有不同等位基因的个体。
HighlyrepetitiveDNA(高度重复DNA):
即卫星DNA,是复性中的第一成分。
Histones(组蛋白):
真核生物中保守的DNA结合蛋白质,是染色质的基本亚单位。
Homeobox(同源框):
黑腹果蝇同源基因编码区域的一部分保守序列。
在两栖和哺乳动物早
期胚胎发育中也已发现。
Homeoticgenes(同源异形基因):
由将身体的一部分轉化成另一部分的突变所定义,例如,
昆虫的腿可以代替触角。
Homogameticsex(同配性別):
单倍染色体组成为2A+XY。
Homologs(同源染色体):
携带同样的遗传位点的染色体,二倍体细胞含有每个同源染色体
的两个拷贝,分別来自父母本。
Homomultimericprotein(同源多聚体蛋白质):
由相同亚基组成的蛋白质。
Ideogram(理数图):
代表染色体G带图表。
Idlingreaction(空轉反应):
当空载tRNA进入A位点时,核糖体产生pppGpp和ppGpp,
诱发应急型反应。
Immortalization(永生或无限增值化):
指真核细胞系获得在培养基中进行无数次分裂的能
力。
Immunityinphages(噬菌体免疫):
由于原噬菌体基因组合成的噬菌体抑制物,而阻止同一类型噬菌体侵染细胞的能力。
Immunityinplasmids(质粒免疫):
一个质粒阻止其它同类型质粒在细胞中存活的能力。
主要是阻碍复制能力。
Immunityintransposons(轉座子免疫):
指某些轉座子阻止其它同类型轉座子向相同DNA
分子中轉移的能力。
有多种机制。
Imprinting(印记):
指一个基因通过精子或者卵子发生的改变,使在早期胚胎中父本和母本等位基因有不同的性质。
可能是由于D
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