单细胞凝胶电泳CASP分析软件的使用.docx
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单细胞凝胶电泳CASP分析软件的使用.docx
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单细胞凝胶电泳CASP分析软件的使用
单细胞凝胶电泳CASP分析软件的使用
(2010-03-1213:
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丁香园刘强老师的总结
一、这是该软件的工作界面,注意箭头所指的几个按钮,主要用这几个按钮工作。
二、单击红色箭头所指按钮,即打开文件,注意图像文件应是TIF格式,(蓝色圈定所指),按住SHIFT键,可以同时选定多个文件,点击OK,(绿色圈定),CASP软件就读入了您所选的图像文件。
三、点击view下拉菜单,选红色箭头所指的”resultwindow",在分析后您就可以看到您的结果窗口,绿色箭头所指是我做的彗星图像。
四、下面就可以开始分析了,分析之前最好把右侧的head和tail选中,(绿色箭头所指,这样可以出现头、尾分明的视觉效果,如图),在图像分析框内按住左键下拉,出现黄色箭头所指的框,这个框一定要圈住整个要分析的一个彗星图像,然后就是用到红色圈定区域的按钮了,我分别做了标号,逐一解释:
1和2:
可以选前或后面的图像进行分析,即上一个和下一个的功能,分析完第一个,当然要选下一个分析,很简单!
!
!
3:
这是分析的功能键,黄色箭头所指的框圈住彗星后,点击此按钮就可以分析了。
4:
每分析完一个彗星后,都要点击一下它,它会把结果数据保存到结果窗口,点击后,它会变灰。
(这很关键)。
5:
背景选择按钮,点击它,框的背景会上下变化,(注意黄色箭头所指的框,较小的框是背景框,较大的是工作框,这两个框在分析之前是可以调整的,一般工作框要大于背景框。
6:
正式分析前一定要点击它,否则没有结果,如果不点击它,只是预分析状态,在这种状态下,可以把分析条件调好,然后进入正式分析,点击它后,此钮上会出现一斜杠。
(如图)。
蓝色箭头所指区域是分析后的曲线,主曲线是单峰,如果是双峰,就是凋亡细胞。
曲线图下面列举了几个数据,不全,全部结果在结果窗口。
(下图)
五、分析过程中或分析完成后,都可以看您的result窗口,如图,将图像分析窗口最小化(红色箭头),就显示出结果窗口(绿色箭头),从左到右依次是文件名(name)和分析的各个指标。
六、分析完成后,别忘了输出结果,点file下拉菜单,选红色箭头所指区域的“输出结果”,将会出现第七步的图像。
第七步、选输出结果后,出现如下的结果输出窗口,(黄色区域),先建立一个文件夹用于保存您的结果文件,也就是给您的结果安个窝,呵呵,好了,给您的文件取个名字吧,别忘了它的扩展名是.txt,点击OK!
第八步:
找到您保存的结果文件,我刚才保存的是1.txt,打开看看,结果好像有点乱,怎么办?
第九步:
没关系,把结果稍微调整一下就好看了,(要把结果直接转入SPSS统计软件分析,必须做调整!
!
!
)。
调整文本框的宽度(绿色箭头处),把分析的指标都放到第一行,可是各个指标的英文单词比较长,简化一下,如:
taillength变成tl,cometlength变成cl,红色圈定区,我不再一一赘述。
调整后,左侧就是图像的name,向右依次是各个指标的数据,注意!
!
!
各个指标名和数据之间一定要有空格相隔!
!
!
否则无法转入SPSS统计软件!
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