1212北京大学生物动态光学成像中心生物信息平台招标文件doc.docx
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1212北京大学生物动态光学成像中心生物信息平台招标文件doc
北京大学
生物动态光学成像中心生物信息平台
招标采购项目
招标文件
编号:
2012[12]
北京大学实验室与设备管理部
二〇一二年二月二十二日
目录
第一部分投标邀请2
第二部分招标文件3
第三部分投标须知4
第四部分货物需求一览表及技术规格9
第五部分技术规格偏离表21
第一部分投标邀请
公告日期:
2012年2月22日
项目名称:
北京大学生物动态光学成像中心生物信息平台招标采购项目
招标编号:
2012[12]
招标机构名称:
北京大学实验室与设备管理部
地 址:
北京市海淀区颐和园路5号北京大学(红1楼、红2楼之间的横楼5216)
邮 编:
100871
电 话:
62758587;传真:
62751411
联系人:
王洋洋荆明伟
北京大学实验室与设备管理部就“北京大学生物动态光学成像中心生物信息平台招标采购项目”相关货物和有关服务进行招标采购,邀请合格投标人就该项目的货物和有关服务提交密封投标。
有关问题说明如下:
1、招标货物名称、数量、交货期及地点:
(1)招标货物名称:
生物信息平台;
(2)技术规格要求:
详见第四部分;
(3)交货期:
2012年4月20日前完成送货,2012年4月26日前完成安装和调试;
(4)交货地点:
北京大学生物动态光学成像中心。
2、合格投标人必须符合《中华人民共和国政府采购法》第二十二条之规定。
3、招标文件的获取:
2012年2月22-29日,上午8:
30-11:
30,下午13:
30-16:
30(北京时间)。
北京大学实验室与设备管理部购买招标文件,每套200元人民币,售后不退。
4、投标人可从北京大学招标公告栏或实验室与设备管理部网站下载本次招标的电子版标书(
5、投标人购买一份标书只能投一个方案,一份标书投2个或以上方案视为无效。
6、投标地点:
北京大学实验室与设备管理部。
7、投标截止时间:
2012年3月9日上午8:
30前(北京时间),逾期恕不接受。
8、开标时间:
2012年3月9日上午8:
30。
9、投标地点和开标地点:
北京大学实验室与设备管理部。
第二部分招标文件的说明
一、招标文件构成:
招标文件共六部分,内容如下:
第一部分投标邀请
第二部分招标文件的说明
第三部分投标须知
第四部分货物需求一览表及技术规格
第五部分技术规格偏离表
投标人应认真阅读招标文件中所有的事项、格式、条款和技术规范等。
投标人没有按照招标文件要求提交全部资料,或者投标没有对招标文件在各方面都做出实质性响应是投标人的风险,并可能导致其投标被拒绝。
二、招标文件的澄清
1.任何要求对招标文件进行澄清的投标人,均应以书面形式通知北京大学实验室与设备管理部;
2.在投标截止期以前收到的对招标文件的澄清要求均以书面形式予以答复,同时将书面答复发给每个购买招标文件的投标人。
三、招标文件的修改
1.在投标截止期前的任何时候,无论出于何种原因,招标机构可主动地或在解答投标人提出的澄清问题时对招标文件进行修改。
2.招标文件的修改将以书面形式通知所有购买招标文件的投标人,并对其具有约束力。
投标人在收到上述通知后,应立即向招标机构回函确认。
3.为使投标人准备投标时有充分时间对招标文件的修改部分进行研究,招标机构可自行决定是否延长投标截止期。
第三部分投标须知
一.说明
1.适用范围
本招标文件仅适用于本投标邀请函中所叙述项目的货物、工程及服务。
2.定义
(1)“招标人”系指北京大学。
(2)“投标人”系指按照招标文件的规定,获得招标文件,并向招标人提交投标文件的企业或事业或科研单位的独立法人。
(3)“中标人”系指由评标委员会评审符合招标文件要求,综合竞争实力最强、赢得供货合同的投标人。
(4)“用户”系指北京大学。
(5)“货物”:
就本招标文件而言,投标人在合同项下需要提供、安装的、包括与本次招标设备有关的硬件、软件,以及所有有关的文件,统称为“货物”。
(6)“服务”:
由投标人提供的有关运输、保险、安装调试、培训、技术支持、维护、维修以及其它使货物正常运转所必需的服务,统称为“服务”
3.投标费用
(1)无论投标结果如何,投标方自行承担所有与参加投标有关的全部费用。
(2)中标服务费
中标商应在合同生效后5个工作日内,依照合同金额采用差额定率累进计费方式向北京大学交纳中标服务费。
具体计算方式:
a)100万元人民币以下部分按1%收取;
b)100-500万元人民币部分按0.8%收取;
c)500万元以上人民币部分按0.6%收取
4.授权
参与投标的代理商须持有制造商针对本次投标的授权,或在有效期内的长期授权。
针对本次投标授权少于三家的制造商所授权产品不予优先考虑。
二.投标方条件
1.投标人必须是具有法人资格的企业或事业或科研单位的独立法人,进行工商税务登记且年检合格。
2.投标人应遵守《中华人民共和国招标投标法》、《中华人民共和国合同法》等有关的中国法律法规。
3.具备良好的供应和施工能力,具有完善的售后服务和良好的信誉,无不良经营行为。
有能力提供相应商品和服务的制造商或制造商针对本次招标采购的授权代理商且具有良好的商业信誉。
4.投标人需具有本次招标设备的生产、安装经验以及成功案例。
必须具有良好的售后服务保障体系。
三.投标文件的编写要求
1.投标文件的语言与计量单位
(1)投标文件、资料、往来信函等使用语言为中文。
(2)除招标文件有特殊要求外,投标文件中所使用的计量单位、图形符号等应使用中华人民共和国法定计量单位及通用图形符号。
(3)投标文件中,由于未作解释或解释不当而产生的歧义,招标人可朝对招标人有利的方向理解。
(4)文字(或结合图)说明自己设计的具体优点。
2.投标文件的组成
(1)投标书
a)投标设备报价表;
b)投标货物名称及规格、国别、生产厂家、工作参数、具体性能指标等;
c)投标货物的生产许可证(复印件)或产品代理授权证明;
d)售后服务承诺以及兑现这些承诺所具备的条件和保障措施;
e)技术与商务偏离表;
f)投标人能够给予招标人的其他优惠条件;
g)生产、制造、安装、验收标准;
h)投标人情况一览表;
i)开标一览表。
(2)资格证明文件:
a)营业执照(复印件);
b)法人资格证明或法人代表授权书;
c)税务登记证明(复印件);
d)法定代表人或授权代表的身份证(复印件);
e)投标货物(技术)的鉴定证书(复印件);
f)投标货物(技术)获优、奖等荣誉证书(复印件);
g)有关技术人员及参与项目管理、施工人员的资格证明;
h)投标人认为有必要的其他证明文件。
(3)投标书附件:
a)详细的交货清单;
b)备件清单;
c)专用工具清单;
d)交货时间;
e)投标货物近三年在中国境内外销售业绩;
f)投标人认为需要陈述的其他内容。
3.有关投标报价的规定
(1)所有投标均以人民币报价。
(2)投标报价应是货物(技术)交付之前包括货物及运输、系统集成、安装调试、人员培训等的最终报价。
(3)投标报价应提供单价及本次投标总价。
(4)投标人应详实提供设备投标报价表。
(5)招标人不接受投标人对任何未办理正常进口手续的非中华人民共和国境内生产的货物的投标报价。
(6)未经考验的新产品、试制品不能参加投标。
(7)投标报价为一次性报价。
(8)招标人不保证最低报价中标。
4.有关投标的其他规定
(1)投标文件正本必须用不退色的墨水填写或打印,幅面规格A4并装订成册,副本可用复印件。
投标文件须一式7份(正本1份,副本6份),分别加盖“正本”“副本”印章。
正本与副本如有差别,以正本为准,责任由投标人自负。
(2)投标文件中不许有加行、涂抹或改写。
若修改错漏处,须由法定代表人或其授权代表签字并加盖单位公章方可生效。
(3)投标文件封面应标明“正本”或“副本”字样。
(4)为方便开标唱标,投标人应将开标一览表单独密封提交,并在信封上标明“开标一览表”字样。
(5)全部投标文件应装入同一密封袋内,密封包装,封口处应有投标人法定代表人或其授权代表签字并加盖投标单位公章;封面注明招标项目名称和编号,投标人的名称、地址、邮编、传真、联系电话、联系人。
四.开标和评标
1.开标
(1)开标仪式由招标人主持,在投标邀请函中规定的地点和时间开标。
(2)开标时当众查验投标文件密封情况,确认无误后拆封。
2.评标
(1)评标委员会:
招标人将依照《中华人民共和国招标投标法》、国家计委等七部委制定的《评标委员会和评标方法暂行规定》、《北京大学招标采购管理办法》等法律法规的有关规定组建评标委员会;评标委员会成员由专家、用户代表等五人组成。
(2)评标原则:
评标委员会按照有关法律、法规规定和招标文件要求,遵循公平、公正、科学、择优的原则,采用相同的程序和标准,不受外界任何因素干扰和影响独立对投标文件进行评审。
(3)评标主要内容:
对投标文件的初审、质疑、综合评审、择优定标。
具体内容:
技术性能、相关业绩、综合商务及投标报价。
(4)评标办法:
本次招标采用综合评分法,是指在最大限度地满足招标文件实质性要求前提下,按照招标文件中规定的各项因素进行综合评审后,以评标总得分最高的投标人作为中标候选供应商或者中标供应商的评标方法。
(5)评分因素(总分100分):
a)投标报价:
30分;
b)综合商务:
20分,考虑投标商资质状况;考虑投标人供货方案;考虑投标人近3年来做过的与本项目相同或相似的项目业绩等;
c)技术性能:
40分,考虑投标商的设计方案、投标产品的配置、性能等;
d)服务:
10分;售后服务,培训等。
3.中标条件
(1)最大限度满足招标文件要求;
(2)投标报价合理;
(3)具有综合竞争优势。
五.授予合同
1.招标人在授标时的权利
(1)在授予合同时,招标人有权变更货物数量和服务内容,其增减变更范围不超过10%。
但不对单价或其它的条款和条件做任何改变。
(2)若投标人数达不到法定要求或评标委员会否决所有投标,招标人有权选择其他采购方式。
2.中标通知
(1)评标委员会确定中标厂商后,由招标人签发《中标通知书》。
(2)对未中标的投标人,招标人可以不解释落标原因,投标文件不予退还。
3.签订合同
(1)中标人应按中标通知书规定的时间、地点及其他要求与招标人签订中标经济合同。
(2)投标人接到中标通知后未按规定签订中标经济合同,或要求修改其投标文件,或转包者,招标人有权撤销其中标资格并按开标后撤回投标处理,投标人应承担由此给招标人造成的一切损失。
招标人可另选评标排序第二位的投标人为中标人或另行招标。
六.验收
1.投标人应提供生产、安装及验收标准以及货物清单;
2.货物运抵安装现场后,招标方提供货物储存和安装调试场所,并对货物质量、规格等技术指标进行检验;
3.中标人未在规定日期进行安装、调试工作的,按如下约定支付违约罚金:
推迟一周,违约罚金为合同总额的1%;
推迟两周,违约罚金为合同总额的3%;
推迟三周,违约罚金为合同总额的5%。
推迟三周以上,每增加一周,违约罚金从合同总额的5%递增合同总额的1%。
第四部分货物需求一览表及技术规格
一、生物信息平台系统技术指标
序号
设备及主要配件名称
技术指标
数量
备注
1
系统与应用软件
1
1.1
★系统组成
集群系统包含刀片计算节点、SMP胖节点、GPU计算节点、登录管理节点、并行存储系统、InfiniBand高速计算网络和千兆以太网管理网络、KVM系统、机柜及配电系统、集群管理软件、作业调度软件、并行开发环境等全套软硬件组成部分
1套
1.2
★集群操作系统
提供RedhatLinuxAS5.0或CentOS4.6以上版本,实现引导Linux操作系统,满足不同平台下作业计算要求。
1套
1.3
★集群监控、管理
建立良好合理的集群环境;要求做到易学、易用、性能稳定、直观、维护方便,满足集群的正常运营、管理、调优;有效进行作业调度;3年软件升级维护。
1套
具体招标参数要求参见下面文件描述
1.4
★数据库系统
采用复杂的数据模型表示数据结构,数据冗余小,易扩充,实现了数据共享;具有较高的数据和程序独立性;为用户提供了方便的用户接口;提供4个方面的数据控制功能,分别是并发控制、恢复、完整性和安全性。
基于web浏览器,供用户实现对数据的追加、删除、更新、查询等操作。
1套
具体招标参数要求参见下面文件描述
1.5
★生物信息应用相关软件
基因组学和生物信息学应用基本软件体系。
包括编程环境,编程调试环境,基因组常用数据分析软件,数据统计分析软件,基因组与生物数据库与数据浏览系统等。
3年的维护升级。
1套
具体招标参数要求参见下面文件描述
2
高性能计算和云存储
2.1
★高性能集群存储
国际知名品牌,统一NAS存储系统,支持N+1到N+4节点间冗余保护,单节点裸容量达到72TB存储空间,统一界面专用存储操作系统,支持NFS、CIFS、iSCSI通用协议
3
具体招标参数要求参见下面文件描述
2.2
★刀片中心
刀片式机箱,可自由组合的插入全高单元,智能电源与风扇系统,电源转换效率高于90%,支持IntelXeon或AMDOpteron,64位多核处理器,热插拔冗余电源,冗余风扇,内置KVM;
网络模块:
不少于20口(16对内,4对外)以太网千兆交换模块,1个10GbESFP+光纤收发器LC连接器,一个以太网直通模块
2
每个刀片中心需要配置2个网络模块
具体招标参数要求参见下面文件描述
2.3
★计算节点
2颗IntelXeonE5系列64位8核处理器,主频不小于2.0Ghz,32GB内存,2*300GBSAS硬盘,半高刀片
25
具体招标参数要求参见下面文件描述
2.4
★胖节点I
4颗IntelXeonE764位多核处理器,不少于8核,主频不小于2.0Ghz;1TB内存,最高可扩至2TB;2*146GB10KSAS硬盘,不少于16个硬盘槽位;服务器空间不少于4U;
1
2.5
★胖节点II
4颗IntelXeonE764位多核处理器,cpu核数不小于8核,主频不小于2.0Ghz,512GB(32x16GB)RDIMM内存;冗余电源;2块146GB10KRPMSAS2.5寸硬盘;
2
2.6
★管理和登录节点
2颗IntelXeon64位6核处理器,主频不小于2.66Ghz,内存32G,2×300GB15kSAS硬盘,2个电源,4个千兆以太网口
1
2.7
★GPU节点
2颗IntelXeonE5系列64位8核处理器,主频不小于2.0Ghz,内存64GB,内置GPU为M2070或以上M系列GPU,2x500GBSAS硬盘,2U机架式服务器
2
2.8
★备份存储服务器
2颗IntelXeon64位4核处理器,主频不小于2.4Ghz,内存24G,12*2TBSATA硬盘,2*146G10KSAS硬盘,不少于6个千兆以太网口
3
RAID卡配备1GB非易失性高速缓存,支持且能成功配置RAID0,1,5,6
2.9
★网络模块
1个以太网交换模块,不少于20口(16对内,4对外),1个10GbESFP+光纤收发器LC连接器;或1个直通模块,不少于16口
2
每个刀片中心需要配置2个网络模块(其中必须含一个以太网交换模块,)
2.10
★网络交换机
国际知名品牌企业级网络交换机,1RU空间,要求配置不少于4个万兆SFP+光口,44个千兆以太网电口
1
具体招标参数要求参见下面文件描述
二、具体招标参数要求
2.1系统与应用软件(具体指标要求如下):
应用软件和数据库名
主要功能描述
★集群管理系统
(1)提供系统集群管理软件(如Rocks或同等水平管理软件)、以及二次开发接口,以便于自主定制开发管理系统。
(2)管理软件需要同时支持一对多的服务器管理监控,允许管理员在一台管理工作站上安装管理软件,并监控整个网段多台服务器的状态。
(3)支持对机群结点远程一键开关机。
(4)独立的原厂硬件监控系统。
★操作系统
支持操作系统:
MicrosoftWindowsServer2008(Standard、Enterprise、32位和x64)、RedHatEnterpriseLinuxAS5(32/64位)、VmwareESXserver、Suse10等
★作业调度系统
支持任务的提交、排队、监控、删除和给予策略的处理等提供了灵活的作业提交方式;支持基于命令行、web界面、基于应用模板和基于作业脚本的提交;支持批量提交,和众多的资源选择;拥有统一的基于web的界面,管理集群的各个方便,并提供功能完善的管理主控页面和报表,支持监控支援性能和报警功能,具有用户使用记账功能等,推荐使用SGE。
★编译软件
常用开发工具及函数库,如IntelC/C++/Fortran77/Fortran90编译器和MathKernelLibrary,提供基于编译器优化的MPICH等并行运算环境和常用数学库等,并负责调试软件系统。
★生物信息学应用系统
统计学应用系统设计应符合实际生物数据产出特点和数学算法模型,应用部署应考虑不同科研要求;提供实现信息分析的运行平台,perl版本不得低于5.8.8,python不得低于2.4.3;提供满足基因组学DNA、RNA两个水平的常规应用,提供当前常用的生物信息分析软件;
★数据管理系统
支持linux操作系统,支持多线程,充分利用CPU资源,提供TCP/IP、ODBC和JDBC等多种数据库连接途径,可以处理拥有上千万条记录的大型数据库,支持多种存储引擎,能支持生物信息学的分析。
当前常用的软件有mySQL,Oracle等。
★兼容性
必须确保计算软件、集群软件及硬件的兼容性,并提供完整的安装和调试。
★服务支持
所有硬件产品需提供3年原厂质保,提供原厂服务承诺(加盖公章),提供原厂7x24x4小时保修和服务,要求30分钟响应、4小时到达现场,在质保期内,定期派遣责任工程师巡访客户,进行日常维护保养工作。
2.2高性能计算和云存储设备(具体指标要求如下):
2.2.1高性能集群存储:
技术参数
指标要求
品牌要求
投标产品需为国际知名品牌
高性能集群存储
★一体化NAS存储系统
架构
采用分布式并行存储架构
存储IO能力
统一存储实际稳定流量为6Gb/s
磁盘裸容量
★不小于216TB,需保证高性能存储和备份存储的总量不少于200TB
集群存储内部数据连接方式
★InfiniBand
客户端软件
▲不需要安装客户端软件
内存
单个节点>=16GB。
系统可扩展到576GB以上
不掉电内存
单个节点>=512MB。
系统可扩展到72GB以上
网络接口
100/1000Base-T接口>=12
文件系统
★文件系统能够满足系统使用需求,系统能自动均衡所有节点的数据负载,单一文件系统可以支持>=10368TB
存储容量
★具有良好的可扩展性,单个集群最大可扩展至144节点,10368TB以上
节点保护
★文件系统中的文件可以根据需要分别设置不同的保护级别,并且能在线修改数据保护级别.支持节点冗余保护,目前要求配置N+1节点保护。
在任意一个机头失效的情况下,都可以保证数据的完整性。
数据重构
磁盘损坏可自动完成数据重构,重构时间<=2小时
可扩展性
★支持在不停机、业务不中断情况下,向群集中增加节点,增加1台节点所需时间<=2分钟;能够通过增加节点自由扩展存储容量和群集的数据吞吐能力,操作简便;支持在线容量扩展及在线数据迁移
Cache保护
意外断电后,能够保护Cache数据不丢失
支持操作系统平台
支持主流的主机平台同时访问,包括:
AIX,HP-UX,Solaris,Linux,Windows,Macintosh
数据访问协议
★同时支持NFS、CIFS、FTP、HTTP,不需要在客户端主机增加任何软件或驱动程序
负载均衡
▲支持在不修改客户端主机配置的前提下,自动均衡客户端数据访问的负载,并且可以灵活设置均衡策略
存储管软件
阵列管理软件
图形化存储管理软件。
支持Telnet/SSH管理,提供基于Web浏览器的管理界面,管理界面要简单易用,不能因为增加节点而增加管理的复杂度
内部拷贝软件
▲具有支持远程数据异步复制的功能;数据复制能够针对特定的数据集,比如:
特定类型的文件、特定大小的文件等;数据复制要能够灵活设定时间表和策略;支持一对一、一对多、多对多复制方式;支持单向和双向复制;支持增量复制。
此功能需要时即可提供。
报警功能
具有电子邮件故障报警功能
安装
应含安装所需的光纤跳线、支架、导轨等各种配件,可使用标准机柜上架
服务
★提供三年的原厂硬件保修服务和软件的免费升级服务,提供三年7*24小时硬件设备免费更换服务。
2.2.2刀片中心及高性能HPC计算节点服务器:
序号
类别
指标项
技术规格要求
1
外观
服务器外观
▲刀片式机箱,含16个独立的半高单元插槽,可自由组合的插入全高单元,智能电源与风扇系统,电源转换效率高于90%
2
处理器
处理器类型
▲IntelXeonE5、E7系列处理器,64位8核处理器
3
处理器型号
★主频≥2.0GHz
4
处理器配置数目
每单元2个
5
内存
内存类型
1GB/2GB/4GB/8GB/16GBECCDDR3可选
6
内存配置数目
★半高32GB;支持≥12个内存插槽,最大可支持到768GB内存
7
磁盘
内置硬盘类型
≥10000rpm(2.5寸),热插拔SAS硬盘,可支持PCIeSSD
8
内置硬盘容量及数目
≥2块,单盘容量≥300GB
9
阵列卡
配置SAS阵列控制器,支持RAID0/1/10
10
IO接口
外部接口
USB2.0接口≥2
11
网络
连接端口
≥2个千兆自适应网口
12
I/O扩展
PCIeI/O插槽
≥2个第三代PCI-E夹层卡插槽
13
输入输出
输入输出部件
可外置DVD-ROM
14
刀片节点
计算峰值
刀片计算节点双精度浮点峰值≥6.4Tflops,LINPACK效率实测不低于60%
15
GPU
计算峰值
CPU需使用IntelE5系列处理器,GPU计算节点总双精度浮点峰值≥1Tflops,采用TeslaM系列GPU
其他要求
17
刀片机架附件
▲标准套装
内置KVM
内置1台以太网交换模块,每个交换模块提供不少于20口端口,以及1个10GbESFP+光纤收发器LC连接器;内置1个以太网直通模块
18
可靠性
冗余组件
热插拔冗余电源,冗余风扇
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