硕博连读博士研究生培养方案厦门大学化学生物学系.docx

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硕博连读博士研究生培养方案厦门大学化学生物学系

厦门大学

硕博连读研究生培养方案

（报表）

一级学科名称化学

专业名称化学生物学

专业代码070320

研究生院2009年10月制表

2010年6月27日修订

一、主要研究方向

序号

号

研究方向

主要研究内容、特色与意义

研究生导师（博导注明）

1

生命有机磷化学

生命起源与进化的化学与生物学基础，尤其是磷和氨基酸在生命起源与进化过程中的作用与地位

赵玉芬（*）院士

傅瑾（*）

黄河清（*）

黄培强（*）

韩守法（*）

李耀群（*）

颜晓梅（*）

杨朝勇（*）

林东海（*）

高锦豪（*）

2

小分子调节剂与药物化学

小分子调节剂的合成、小分子调节剂与蛋白质、核酸的相互作用研究；药物设计、药物合成以及药物的作用机制的研究。

3

生命体系中的分子识别与传感

通过合成、改造、天然来源及生物转化等途径发展和获取分子探针，研究这些分子探针在生物传感和生理（基因表达、细胞周期、细胞凋亡、细胞信号转导、免疫反应）调控等领域的应用。

4

生物分析

发展高灵敏、高通量的生物分析技术和方法，研究化学物质与生物大分子相互作用和分子识别的分析技术，发展高通量的筛选技术，建立实时、动态的单细胞分子成像系统。

开发这些生物医学分析技术在疾病诊断、检验检疫、环境检测及药物研发中的应用。

5

生物信息学

结合生物信息学、化学信息学和药物信息学等专业领域信息学技术，建设一个有特色的生物信息学辅助虚拟药物开发平台，进行药物靶点蛋白的搜索和先导化合物的高通量筛选和设计工作，使得有机合成和新药开发更加理性化和高效。

6

结构生物学

结构生物学是一门以生物物理学和生物化学手段来研究生物大分子的三维结构，并研究结构与对应功能的关系的学科。

由于结构生物学能够解释生物大分子的构象和相互作用的方式，而所有的生命活动都是通过各种生物大分子的相互作用来实现，因此，这是一个非常有吸引力的领域。

7

纳米生物

随着现代生物学和现代医学的不断发展，人类在生物学和医学等领域的研究内容早已从细胞，染色体等微米尺度的结构深入到更小的层次，进入到单个分子甚至分子内部的结构。

研究这些纳米尺度的分子结构和生命现象的学科，就是纳米生物学

8

生物医学研究

围绕心脑血管疾病、糖尿病、肝病、癌症、危重传染病及老年性疾病等严重威胁人类健康的重大疾病，以生命科学、化学和医学交叉领域的重大科学问题为主攻方向。

通过各学科的整合，阐明多种疾病的分子机理，并借生物技术及药物研究，将科学研究成果转化为药物、治疗和预防方法。

该方向主要侧重以下方面研究：

1核受体及配体相互作用的化学基础

2蛋白质转运机制

3代谢调控

4天然产物化学

5分子诊断学

6神经退行性疾病及衰老研究

7转化医学研究

张晓坤（*）

洪万进（*）

姚新生（*）

许华曦（*）

郑立谋（*）

注：

本表不够可加页。

注：

博导请用*号注明。

二、培养目标、学制及学分要求

培养目标（本表可不填政治标准）：

1.热爱祖国，树立强烈的事业心和敬业精神，具有良好的道德理想素养和精神风貌。

2.掌握本学科坚实宽广的基础理论、系统深入的专门知识和熟练的实验技能；具有严谨的学风，能够独立从事科研工作，并取得创新性的成果，达到《中华人民共和国学位条例》规定的博士学位学术水平。

3.身体健康。

学制：

5年，最长学习年限：

7年。

至少应修满42学分：

其中公共学位课程8学分；

专业学位课程18学分；

选修课程12学分；

其他培养环节4学分。

注：

不用修读博士生公共外语、政治课；硕士阶段课程+博士阶段的总学分应修满42个学分，学生选课需获得导师同意，而且，其中至少必须包含以下三门针对博士生的课程：

6学分博士生专业学位课（可选以下课程设置中不同二级学科针对博士生专业学位课程），

2学分学科进展讲座。

2学分教学实践

三、课程设置

序号

课程类型

课程名称

学期*

学分

总学时

授课语言

任课教师（职称）

1

自然辨证法

秋季

2

36

中文

由研究生院统一安排

2

公共学位

科学社会主义理论与实践

春季

2

36

中文

由研究生院统一安排

3

英语

春季秋季

2

36

双语

由研究生院统一安排

4

专业学位

高等配位化学

春季

3

54

中文

章慧教授

5

有机合成进展

秋季

3

54

中文

黄培强教授

6

有机合成专题

春季

3

54

中文

温庭斌教授/詹庄平教授

7

光谱分析进展

春季

3

54

中文

江云宝教授/赵一兵教授

8

色谱与质谱分析进展

春季

3

54

中文

王秋泉教授/杭纬教授/张博副教授

9

高等量子化学

春季

3

54

中文

吴玮教授

10

量子化学选读

春季

3

54

双语

张乾二教授/谭凯副教授等

11

现代晶体学

春季

3

54

中文

毛少瑜教授

12

催化专题

秋季

3

54

中文

袁友珠教授/王野教授/翁维正教授

13

电化学研究进展

秋季

3

54

中文

田中群教授/孙世刚教授/毛秉伟教授/杨勇教授/詹东平副教授

14

电极过程动力学

秋季

3

54

中文

毛秉伟教授/吴德印教授

15

应用电化学专题

秋季

3

54

中文

杨勇教授/王周成教授

16

生物物理学

秋季

3

54

中文

林东海教授

17

化学生物学

春季

3

54

中文

杨朝勇教授/颜晓梅教授/韩守法教授等

18

高分子科学导论

春季

3

54

双语

许元泽教授/翁文桂副教授

19

高分子合成与分子设计

春季

3

54

中文

夏海平教授

20

生物医学与药物研发前沿进展

秋季

3

54

中文

洪万进（教授）、张晓坤（教授）、许华曦（教授）、郑立谋（教授）

21

分子细胞生物学

秋季

3

54

中文

生科院

22

高级生物化学

秋季

3

54

中文

生科院

23

其它系、专业学位课程

24

选修

化学科研素养与方法ABC

秋季

2

36

中文

郑南峰教授等

25

纳米生物学

秋季

2

36

中文

高锦豪教授

26

结构生物学

春季

2

36

中文

林东海教授

27

可选修其它有关的硕士生各课程

秋季/春季

2

36

28

其他培养环节

学术报告与学术讲座

N/A

2

要求详见后页。

29

综合考试

要求详见后页。

30

开题报告

要求详见后页。

III.Curriculum

No.

Category

NameoftheCourse

Semester*

Credit

TotalHours

WorkingLanguage

Facultymember（s）（withprofessionaltitles）

1

General

courses

DialecticsofNature

A

2

36

Chinese

BearrangedbytheGraduateSchool

2

TheoryandPracticeoftheScientificSocialism

S

2

36

Chinese

BearrangedbytheGraduateSchool

3

English

A/S

4

72

Bilingual

BearrangedbytheGraduateSchool

4

Corecourses

AdvancedCoordinationChemistry

S

3

54

Chinese

Prof.ZHANGHui

5

ProgressinOrganicSynthesis

A

3

54

Chinese

Prof.HUANGPeiqiang

6

TopicsonOrganicSynthesis

S

3

54

Chinese

Prof.WENTingbin/Prof.ZHANZhuangping

7

ProgressesinSpectrometry

S

3

54

Chinese

Prof.JIANGYunbao/Prof.ZHAOYibing

8

ProgressesinChromatographyandMassSpectrometry

S

3

54

Chinese

Prof.WANGQiuquan/Prof.HANGWei/AssociateProf.ZHANGbo

9

AdvancedQuantumChemistry

S

3

54

Chinese

Prof.WUWei

10

SelectedTopicsonQuantumChemistry

S

3

54

Bilingual

Prof.ZHANGQian-Er/AssociateProf.TANKai,etal.

11

ModernCrystallography

S

3

54

Chinese

Prof.MAOShao-Yu

12

CurrentOpinioninCatalysis

A

3

54

Chinese

Prof.YUANYouzhu/Prof.WANGYe/Prof.WENGWeizheng

13

ProgressinElectrochemistry

A

3

54

Chinese

Prof.TIANZhongqun/Prof.SUNShigang/Prof.MAOBingwei/Prof.YANGYong/AssociateProf.ZHANDongping

14

ElectrodeKinetics

A

3

54

Chinese

Prof.MAOBingwei/Prof.

WUDeyin

15

TopicsinAppliedChemistry

A

3

54

Chinese

Prof.YANGYong/Prof.WANGZhoucheng

16

Biophysics

A

3

54

Chinese

Prof.LINDonghai

17

ChemicalBiology

S

2

36

Chinese

Prof.YANGChaoyong/Prof.YANXiaomei/Prof.HANShoufa

18

IntroductiontotheEssentialPolymerScience

S

2

36

Bilingual

Prof.XUYuanze/AssociateProf.WENGWengui

19

PolymerSynthesisandMolecularDesign

S

3

54

Chinese

Prof.XIAHaiping

20

CurrenttopicsinBiomedicalResearchandDrugDiscovery

A

3

54

Chinese

Prof.HONGWanjin、Prof.ZHANGXiaokun、Prof.XUHuaxi、Prof.ZHENGLimou

21

MolecularCellBiology

S

3

54

chinese

SchoolofLifeSciences

22

AdvancedBiochemistry

S

3

54

chinese

SchoolofLifeSciences

23

CoursesfromOtherProg.,Dept.orColleges.

24

Optionalcourses

BasicResearchMannersandMethodsinChemistry

A

2

36

Chinese

Prof.ZHENGNanfeng

25

Nanobiotechnology

A

2

36

Chinese

Prof.GAOJinhao

26

StructuralBiology

S

2

36

Chinese

Prof.LINDonghai

27

OthercoursesinChemistryforMSc

A/S

2

36

28

Other

academic

sections

AttendingAcademicLectures

N/A

2

Detailsareinthefollowingpages.

29

Ph.D.ComprehensiveExamination

Detailsareinthefollowingpages.

30

Dissertationresearchproposal

Detailsareinthefollowingpages.

*.S—Springsemester;A—Autumnsemester;SS—Summersemester.

课程内容纲要

课程名称

有机合成进展

课程英文名称

ProgressinOrganicSynthesis

课程类型

专业学位课

开课时间

秋季学期

课程级别

博士

学分

3

总学时

54

中文内容简介

本课程包括以下专题，部分内容将根据学科的发展作适当调整。

1、有机硼、硅、锡、钯试剂的在有机合成中的应用；

2、环化反应，包括BALDWIN环化规则，烯烃复分解反应

3、有机化学中的立体电子效应

4、羟醛缩合反应及其立体化学

5、复杂天然产物全合成

6、有机合成进展专题

7、学生演讲/课堂讨论

英文内容简介

Thiscourseincludesometopicsofprogressinmodernorganicsynthesis,suchas:

1.Theapplicationoforganicboron,silicon,tinandpalladiumreagents

2.Ringclosurereactions,includingBaldwin’srules,Olefinmetathesis

3.Stereoelectroniceffectsinorganicchemistry

4.Aldolreactionandit’sstereochemistry

5.Thetotalsynthesisofcomplexnaturalproducts

6.Topicsofrecentprogressinorganicsynthesis

7.Student’spresentationandclassdiscussion

教学方式

讲授、讨论

考试方式

笔试

参考教材

教材：

讲义，PPT

黄培强，靳立人，陈安齐，《有机合成》，高等教育出版社，北京：

2004

参考书：

1.J.A.Gewert,etal.,“OrganicSynthesisWorkbook”,Wiley-VCH,Weihein:

2000

2.Carey,F.A.,Sundberg,R.J,AdvancedOrganicChemistry,4thEd.,PlenumPress:

NewYork:

3.Smith,M.B.,OrganicSynthesis,2ndedition,McGraw-Hill:

NewYork,2002

4.Jurgen，F.,Gustav,P.,OrganicSynthesis:

Concepts,Methods,StartingMaterials,3rdEdition,JohnWiley&Sons;NewYork,2003

5.P.Deslonchamps著，李国清，放秀华译，叶秀林校，《有机化学中的立体电子效应》，北京大学出版社，北京：

1991

6.吴毓林，姚祝军，《现代有机合成化学》，科学出版社，北京：

2001

7.黄宪编，有机合成．上册，高等教育出版社:

北京，1992

8.吴世晖,徐汉生编，有机合成．下册，高等教育出版社:

北京，1993

9.有机化学现行期刊

注：

每门课程都须填写此表。

本表不够可加页。

课程内容纲要

课程名称

有机合成专题

课程英文名称

TopicsonOrganicSynthesis

课程类型

专业学位课

开课时间

春季学期

课程级别

博士

学分

3

总学时

54

中文内容简介

有机合成研究最新动态与研究进展方面的专题综述报告。

包括有机合成新方法和新试剂在有机合成中的应用。

新药研究与开发中有机合成新方法、新技术的应用。

英文内容简介

Thiscourseintroducestherecenttrendandprogressinorganicsynthesis,includingtheapplicationofnewmethods,technologiesandnewreagentsinorganicsynthesisaswellasdrugresearchanddevelopment.

教学方式

课堂授课，文献综述和课堂讨论

考试方式

文献综述报告

参考教材

教材：

自编讲义

参考书：

近期有机化学有机合成的文献及综述。

注：

每门课程都须填写此表。

本表不够可加页

课程内容纲要

课程名称

高等配位化学

课程英文名称

AdvancedCoordinationChemistry

课程类型

专业学位课

开课时间

春季学期

课程级别

硕士/博士

学分

3

总学时

54

中文内容简介

适应当前配位化学迅猛发展的需要，讲授配位化学基本原理及其在相关前沿领域（或交叉学科）应用的有选择性的课题。

其目标是使修过这门课程的研究生能够从结构和成键的微观角度去认识并理解络合物的宏观特征和性质，从而使得他们所掌握的基础理论和现代化学实验之间有较密切的结合，为熟悉和理解现代化学文献（特别是配位化学文献）架起一座桥梁，同时为顺利开展有关的硕博士论文研究工作提供一些新的方法和思路。

课程的主要内容如下：

1.配位化学的发展简史和基础知识；

2.络合物的立体结构与异构现象，以专题讲座的形式介绍手性、手性对称性破缺、手性络合物、立体化学及圆二色（CD）光谱的有关知识；

3.多电子原子结构和谱项，特别是dn离子的谱项及群论和对称性的基础知识；

4.络合物的晶体场-配体场理论及其在络合物电子光谱等方面的应用；

5.络合物的分子轨道理论（MOT），着重于其在络合物荷移光谱的应用；

6.络合物反应动力学和机理的基础知识，例如取代、异构化和外消旋反应，特别是电子转移反应；

7.简要介绍络合物的合成。

修课学生

英文内容简介

Thebasicprinciplesofcoordinationchemistryandtheirapplicationsintheselectivetopicsontherelatedfrontfields（orotherinterdisciplinarysubjects）areintroducedtokeepupwiththerapiddevelopmentofcurrentcoordinationchemistry.Themainobjectiveofthelectureattheclassroomistohelpthegraduatestudentsattendedthiscourseunderstandmacro-characteristicsandpropertiesofcoordinationcompoundsfromthemicroscopicviewofstructureandbonding.Asaresult,thegraduatestudentsshouldknowhowtocombinebasictheorywithmodernchemicalexperiments,andthismayalsomakethembecomefamiliarwithcurrentchemistryliteratures（especiallyonmoderncoordinationchemistry）.Additionally,thiscourseshouldprovidesomenewmethodsandideasfortheirfuturegraduateresearchwork,too.Themaincontentsofthecourseareasfollows:

1.Abriefdevelopmenthistoryandfundamentalknowledgeofcoordinationchemistry

2.Stereoscopicstructuresandisomerismofmetalcomplexes,introducingtherelatedknowledgeofchirality,chiralsymmetrybreaking,chiralmetalcomplexes,stereochemistryandcirculardichroism（CD）spectroscopybyspecialtopiclectures

3.Structuresandspectraltermsofmany-electronatoms,especiallyfocusingonthespectraltermsofdnionandbasicknowledgeofgrouptheoryandsymmetry

4.CrystalField-LigandFieldTheoryandtheirapplicationsinelectronicspectroscopyofmetalcomplexes

5.MolecularOrbitalTheo