设备参考技术参数生物信息学试验室.docx
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设备参考技术参数生物信息学试验室
第一包:
参考数据库及样本管理设备
项目名称
数量
参数
人类遗传突变数据库
1
一、数据类型:
文献已经报道的与人类遗传疾病相关的遗传突变数据,包括近3年数据
二、技术参数:
突变数据量>190000条
基因数量>7000
HGVS>170000个
mRNA剪切突变>17000个
三、资质要求:
1、投标人需从事高通量测序相关业务不低于5年,需自主拥有不少于5台二代测序平台并提供平台证明材料;
2、具有多组学平台和联合分析能力;
3、具有ISO9001质量管理体系认证证书;
4、具有优良项目工作环境,如风淋系统;
5、近5年投标人的服务对象在高影响因子期刊上以第一作者(或通讯作者)发表论著,并提供支撑材料。
肿瘤组学数据库
1
一、数据类型:
恶性肿瘤病人组织和体液样本的组学数据以及病人临床预后等表型信息。
二、技术参数:
1、宏转录组数据要求:
1)每个样品分别建库测序,采用宏转录组的建库方式;
2)样品每个产生不低于10G的cleandata;
3)Q20>90,Q30≥80%;
4)碱基类型分布均匀且无分离现象;
5)信息分析要求:
原始数据统计,序列拼接组装,基因预测,物种分类学注释,功能注释等;
6)项目完成周期不超过60个工作日。
2、宏蛋白组数据要求:
1)鉴定的蛋白质数目需在500-1000之间,通常情况下,差异蛋白质数目占总蛋白质数目的5%-15%,谱图3W-20W,谱图利用率20%-50%;
2)信息分析要求:
蛋白质表达差异分析、差异蛋白功能注释;
3)项目完成周期不超过40个工作日。
3、宏代谢组数据要求:
1)数据来源:
非靶向代谢组学,LC-MS法测定;
2)分析要求:
多元统计分析(PCA分析,偏最小二乘法-判别分析,正交偏最小二乘法-判别分析)、差异代谢物筛选、代谢通路分析.
三、资质要求:
1、投标人需从事高通量测序相关业务不低于5年,需自主拥有不少于5台二代测序平台并提供平台证明材料;
2、具有多组学平台和联合分析能力;
3、具有ISO9001质量管理体系认证证书;
4、具有优良项目工作环境,如风淋系统;
5、近5年投标人的服务对象在高影响因子期刊上以第一作者(或通讯作者)发表论著,并提供支撑材料。
人类复杂疾病相关的微生物组学数据库
1
一、数据类型:
人类复杂疾病相关的人体样本如粪便,血液,皮肤和唾液等微生物组的组学数据。
二、技术参数:
1、每个样品分别建库测序,采用宏转录组的建库方式;
2、唾液样品每个产生不低于10G的cleandata;
3、Q20>90,Q30≥80%;
4、碱基类型分布均匀且无分离现象;
5、信息分析要求:
原始数据统计,序列拼接组装,基因预测,物种分类学注释,功能注释等;
6、项目完成周期不超过60个工作日。
三、配置参数:
1、投标人需从事高通量测序相关业务不低于5年,需自主拥有不少于5台二代测序平台并提供平台证明材料;
2、具有多组学平台和联合分析能力;
3、具有ISO9001质量管理体系认证证书;
4、具有优良项目工作环境,如风淋系统;
5、近5年投标人的服务对象在高影响因子期刊上以第一作者(或通讯作者)发表论著,并提供支撑材料。
小分子化合物数据库
1
一、技术参数:
1.小分子化合物数量2000万个以上;
2.包含3000种以上具有生物活性的化合物;
3.可用于高通量筛选(HTS)和高内涵筛选(HCS);
4.包含的子化合物库大于20个,可用于GPCR、激酶、抗癌、表观遗传学、干细胞等研究领域;
5.靶点要求涵盖PI3K、NMDA、InfluenzaVirus、EGFR、CXCR等;
6.能够提供独有的临床阶段化合物库和最新的在研临床小分子化合物
样本存储和管理设备
1
一、技术参数:
1.压缩机功率(W):
1HP×2
2.箱内温度(℃):
-10~-86
3.外部尺寸(W×D×H)(mm):
1000×890×1960
4.内部尺寸(W×D×H)(mm):
760×630×1300
5.有效容积(L):
626,立式
6.搁架/内门(板):
3/2
7.单位存储数量:
20
二、配置参数:
包含20个五层四列,130*130*52mm的生物样本存储归类装置
第二包:
高性能并行计算和大数据分析系统参考技术参数
项目名称
数量
配置和参数
管理节点
1
国产品牌;
2U机架式服务器,配置安装导轨
配置2颗IntelXeonProcessorE5-2609V48C/8T1.7GHz20M6.4GT/s85W;
配置2根16GB/DDR4/2133/MHz/ECC/REG/2RANK;不少于24DIMM内存插槽,支持2133MHzDDR4的RDIMM内存.
配置3块600GB/SAS/10000RPM/2.5寸/企业级;支持8个3.5”/2.5”SATA/SAS/SSD硬盘,可内置两个2.5”SATA/SAS/SSD硬盘,最大支持存储容量52TB。
支持SATARAID0、1、10、5,
配置一张LR282A2/8口/SAS6GB/512MB/半高/SFF8087/PCLE2.0*8;可选缓存掉电保护;
1张Mellanox/56GB/40GB/单口IB卡/主要用于56GB交换网络/HCA卡
1张16Gb/PCI-E双口/光纤HBA卡;
配置指纹安全加密认证系统,开机密码保护,提高服务器管理安全性保护级别;
DVD/RW/SATA薄、2U550W1+1 冗余电源;
提供6个PCI-E扩展插槽(3PCI-E3.0x8,1PCI-E3.0x4(in*8),1PCI-E3.0x16,1PCI-E2.0x4(in*8))
2端口Inteli210千兆网卡支持I/OAT、负载均衡、链路汇聚、绑定冗余等特性,可选配外接千兆及万兆网卡
集成ASPEEDAST2400
支持前置LCD屏,动态显示LOGO、固定资产号、操作系统、IP、电源,整机温度、RAID级别和硬盘运行状态等
支持基于国际标准IPMI2.0协议基础设计的PLNM服务器管理功能,通常的功能和监控功能包括服务器关键硬件组件监控、散热风扇速度、温度、指引灯诊断、电压
标配远程管理控制端口,可实现与操作系统无关的远程对服务器的完全控制,功能包括:
1、虚拟电源可远程开机、重启、关机;
2、更新Firmware;支持远程故障现象重现;
3、虚拟控制台可远程监控图形界面,可远程从本地软盘和光盘或其影像启动安装、操作Windows,Linux等软件(虚拟软驱、虚拟光驱、虚拟目录和虚拟U盘);
4:
主板集成iBMC,可实现远程iKVM;
WindowsServer2008R2SP1
WindowsServer2012R2
RedHat*EnterpriseAdvancedServer6.5
SuseLinuxEnterpriseServer11SP3
中标麒麟高级服务器操作系统V6.0Update5
Ubuntu14.04
VMwareESXi5.5
原厂商3年有限保修及上门服务,原厂5年7*24小时电话支持服务
提供原厂售后服务承诺函和对此项目的授权函原件;提供国家节能认证证书;
普通计算节点
2
国产品牌
2U机架式服务器,四节点,配置安装导轨
配置8颗IntelXeonProcessorE5-2697AV416C/32T2.6GHz40M9.6GT/s145W;
配置32根32GB/DDR4/2133MHz/ECC/REG/2RANK每个节点至少16DIMM插槽,每台至少64DIMM插槽;支持2400MHzDDR4的RDIMM内存。
每个节点支持至少3个3.5”/2.5”SATA/SAS/SSD硬盘,最大支持存储容量24TB。
可选支持RAID0、1、10、5、50、6、60等,可选RAID1GB/2G/4GCache,可选缓存掉电保护
每个节点提供至少1个PCI-E16扩展槽,支持半高设备扩展
集成2个Inteli350千兆GE网口;配置4个56GBFDRInfiniBand接口。
USB接口光驱、软驱仿真U盘
标配2000W(1+1)钛金冗余电源,96%的效率,220VAC,支持270V高压直流。
如需支持-48V
支持IPMI2.0,对外提供4个1000MbpsRJ45管理网口,集成iKVM,支持远程管理
标配远程管理控制端口,可实现与操作系统无关的远程对服务器的完全控制,功能包括:
1、虚拟电源可远程开机、重启、关机;
2、更新Firmware;支持远程故障现象重现;
3、虚拟控制台可远程监控图形界面,可远程从本地软盘和光盘或其影像启动安装、操作Windows,Linux等软件(虚拟软驱、虚拟光驱、虚拟目录和虚拟U盘);
4:
主板集成iBMC,可实现远程iKVM;
WindowsServer2008R2SP1
WindowsServer2012R2
RedHat*EnterpriseAdvancedServer6.5
SuseLinuxEnterpriseServer11SP3
中标麒麟高级服务器操作系统V6.0Update5
Ubuntu14.04
VMwareESXi5.5
原厂商3年有限保修及上门服务,原厂5年7*24小时电话支持服务
提供原厂售后服务承诺函和对此项目的授权函原件;提供国家节能认证证书;
胖节点带GPU运算
1
国产品牌
标准2U机架式服务器,配置安装导轨;
配置2颗IntelXeonProcessorE5-2697AV416C/32T2.6GHz40M9.6GT/s145W
配置16根32GB/DDR4/2133MHz/ECC/REG/2RANK;内存插槽数不少于24DIMM;
配置2块Intel/SSD/DC/S3500/Series/(300GB/2.5in/SATA/6Gb/s/20nm/MLC);
默认支持8个2.5”SATA/SAS/SSD硬盘,最大支持存储容量16TB,配置支持4个NVMESSD,后置2个2.5”SATA/SAS/SSD硬盘
支持3种硬盘可选配置
•可选8个3.5”/2.5”SAS/SATA/SSD硬盘,最高存储容量48TB;
•可选16个2.5”SAS/SATA/SSD硬盘,最高存储容量32TB;
•可选24个2.5”SAS/SATA/SSD硬盘,最高存储容量为48TB;
配置1块NVIDIA/TESLA/K80/4992C/24GB/KEPLER/GP;
配置1张Mellanox/56GB/40GB/单口IB卡/主要用于56GB交换网络/HCA卡
提供8个PCI-E3.0扩展插槽,4*全高PCI-E3.0x8(in*16),2*全高PCI-E3.0x8,1*半高PCI-E3.0x8,1*半高PCI-E3.0x4(in*8);可选2*全高PCI-E3.0x16,2*全高PCI-E3.0x8,1*半高PCI-E3.0x8,1*半高PCI-E3.0x4(in*8)。
可选支持2GPU协同工作;
2端口Inteli350千兆网卡支持I/OAT、负载均衡、链路汇聚、绑定冗余等特性,可选配千兆及万兆网卡模块;6个热插拔冗余风扇
集成MatroxG200e
配置1100W(1+1)白金冗余AC电源模块;可改配750W金牌DC冗余电源模块
支持IPM
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- 关 键 词:
- 设备 参考 技术参数 生物 信息学 试验室
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