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兽医流行病学讲义
兽医流行病学
第一章绪言
兽医流行病学主要研究动物群体中疾病的频率分布及其决定因素,是预防兽医学的一门重要学科。
研究范围是群体中的一切疾病,包括传染病和非传染病;研究对象是动物群体,主要是畜禽群体,但也涉及到人群和野生动物群体;研究方法是对群体中的疾病进行调查研究,收集、分析和解释资料,并作生物学推理;研究任务是确定病因、阐明分布规律、制定防制对策并评价其效果,以达到预防控制和消灭动物疾病的目的。
兽医流行病学的研究内容分为定性调查研究和定量调查研究两个方面。
前者主要是确定疾病的自然史,形成病因假设并进行定性检验;后者涉及到疾病的数量及数字资料的表达和分析,包括调查、监测、观察研究、实验研究、建模及疾病控制的生物学和经济学评价等。
兽医流行病学主要采用描述流行病学、分析流行病学、实验流行病学和理论流行病学等研究方法,此外还有血清流行病学、遗传流行病学、分子流行病学等方法。
兽医流行病学有下列几方面的用途:
确定病因已知疾病的来源;研究病因未知疾病的防制对策;获取有关疾病自然史的资料,确定疾病的分布和感染的传播和维持的生态学机理,及宿主、致病因子和环境病因因素;制定和监测疾病防制规划;估价疾病防制的经济影响。
复习思考题
1.简述兽医流行病学的定义。
2.简述兽医流行病学的研究内容和研究方法。
3.兽医流行病学有哪些用途?
教案:
PPT1:
流行病学发展简史
来源于人类与动物传染病流行长期斗争经验
来源于流行病学研究方法的发展和进步
由单纯描述向描述加分析
由定性向定量研究
两个方面的相互渗透和相互结合,使流行病学研究内容和方法更加丰富、应用更广泛。
PPT2:
一.发展史
学科形成前期——自有文明史以来至18世纪
公元前460——377
古希腊希波克拉底(Hippocrates)
《空气、水及地点》“Epidemic”
我国“疫”、“时疫”、“疫疠”
PPT3:
15世纪中叶
意大利威尼斯海港检疫法规
我国隋朝“疠人坊”
1662年英国JohnGraunt
第一章寿命表
设立比较组思想
PPT4:
(二)学科形成时期
18世纪末至20世纪初
1747年英国JamesLindVitC治疗坏血病——开创流行病学临床试验
1796年Jenner接种牛痘预防天花——开创传染病控制的主动免疫
PPT5:
詹姆斯.琳德(JamesLind1716-1795)是一名英国海军外科医生,他进行了一项相当于流行病学实验的研究,证实新鲜水果柠檬和柑橘等可预防坏血病。
爱德华.琴纳(JennerEdward,1749-1823)英国医生和博物学家,他观察到得过牛痘的牛奶场女工不再得天花。
根据这一现象,他在1796年给一个10岁男孩接种牛痘,随后又接种了22人,均可抵抗天花的感染。
这个给人和人群免疫以预防天花的成功方法直接为1977年全世界天花的最终根除开辟了道路。
PPT6:
第二节定义
PPT7:
第三节原理和应用
一基本原理
疾病与健康在人群/动物中分布原理
疾病发展过程
动物与环境的关系
病因论
病因推断原则
疾病防治原则和策略
疾病发展数学模型等
PPT8:
疾病与健康在人群/动物中分布原理
冰山现象(图片)
PPT9:
生态学研究
生态学是研究人群/动物群体与环境关系的科学,观察单位是人群/动物群体而不是个体,描述不同群体中某因素的暴露状况与疾病的频率,分析该暴露因素与疾病的关系。
生态学研究方法易行,分析技巧简单,但进行生态学推断时难以深入解释,易出现生物学谬误。
PPT10:
病因论
流行病学三角
轮状模型
生态学模型
PPT11:
第四节研究方法
按设计类型:
描述性研究
分析性研究
实验性研究
理论性研究
PPT12:
研究方法
PPT13:
第五节特征
群体的特征
对比的特征
概率论和数理统计学的特征
预防为主的特征
发展的特征
PPT14:
第六节与其它学科的关系及展望
与流行病学有关的主要学科
临床医学
基础医学
统计学
流行病学方法广泛应用的学科
以学科名称命名的分支——药物流行病学
以学科概念命名的分支——分子流行病学
PPT15:
第二章疾病分布
疾病分布是指疾病在畜群间、时间和空间的频率分布状况,又称三间分布。
描述疾病的分布涉及到群体中疾病发生的形式和量度。
疾病在群体中有散发流行、地方流行、流行、大流行、等形式。
疾病在不同时间、不同地区和不同畜群中的频率分布,可用动态率和静态率来表示。
动态率是在一定时间内群体中新发生某事件的频率,以发病率为代表,其譬如死亡率、罹患率、治愈率、出生率等;静态率是在一定时间内存在某事件的频率,以患病率为代表,其他如感染率、携带率等。
疾病的畜群分布是指对不同年龄、性别、种和品种等特征的畜群,进行发病率、患病率和死亡率水平的描述和比较。
搞清疾病的畜群分布,有助于了解影响疾病分布的因素和探索病因,为防制工作提供依据。
疾病发生的频率随时间的推移而不断变化,流行形式由散发而流行,乃至变为地方流行或被消灭。
描述疾病的时间分布和变化,有助于判断传染病疫情的发展动态,探索原因不明疾病的病因。
疾病时间分布的表现形式可以分为短期趋向、周期趋向和长期趋向。
疾病的分布往往带有明显的地区性。
研究疾病的地区分布,可以阐明引起疾病分布差异的原因,有助于制定防制对策;对于一些原因不明的疾病,通过对发病率有显著差异的不同地区进行多方面的比较,可以获得有关病因的线索,证明或否定病因假设。
复习思考题
1.什么是疾病的三间分布?
研究它有何意义?
2.疾病流行和地方流行的主要区别是什么?
3.以发病率和患病率为例,说明动态率和静态率的主要区别。
第三章疾病的自然史
疾病的自然史包括疾病的生态学和疾病的病因因素两个方面。
疾病的生态学又包括疾病的分布以及感染的传播和维持的机理。
研究疾病在动物群体中的分布,需要了解宿主、致病因子和环境之间的生态学关系,这些关系支配了疾病的空间和时间分布。
动物群体的分布和大小受生态环境影响,而食物链对疾病传播有重要意义。
小生境的流行病学干预可影响疾病的发生,媒介传播疾病比其他传染病有更精确的地理界限。
传染病是宿主被病原体侵入的结果,病原体的持续存活能否引起疾病取决于它们能否传递到易感宿主,能否在其中引起感染并复制病原体以维持感染循环。
感染的传播可以分为水平传播和垂直传播两种。
水平传播又可分为直接传播和通过中介载体的间接传播;垂直传播又可分为遗传性传播和先天性传播。
传染性病原体在体内和体外对不利因素有不同程度的抵抗力,这对建立感染是必要的,对感染的维持也是很重要的。
此外病原体通过产生抵抗型、传播过程的“快进快出”、在宿主的持续感染、在媒介昆虫体内持续和宽广的宿主范围等,而使感染长期维持。
病因因素是指与疾病有因果联系的决定因素,可以分为宿主决定因素,致病因子决定因素和环境决定因素。
复习思考题
1.什么是疾病自然史?
2.举例说明食物链对疾病传播的重要性。
3.什么是水平传播?
什么是垂直传播?
第四章病因推断
在流行病学中,因果关系研究是为了确定病因。
病因理论在历史上曾经历了从单一病因到多元病因的变化,这分别反映在Koch氏假说和Evans氏假说里。
Koch氏假说提出,一种微生物作为某种传染病病因必须符合的条件是:
它必须存在于该病的所有病例中;它不作为偶然性和非致病性寄生物存在于其他疾病中;它可以从患有该病的动物体内被分离成纯培养,并能在易感动物复制出同样疾病。
Evans氏假说提出了需要确定假设病因因素与所研究疾病之间的联系是统计学上显著的,且是因果性的,这涉及到动物组群之间的比较,而不是个体的联系。
Evans假说克服了Koch氏假说的不足,不仅适用于传染病,而且也适用于非传染病。
在研究疾病和假设病因的联系时,我们应区分统计学联系和非统计学联系,因果联系和非因果联系。
根据因果关系可以把原因分为充分原因和必要原因。
充分原因是指不可避免要产生结果的原因,实质上包括一系列原因组分;必要原因是产生结果所必须存在的原因组分。
混杂因素可产生研究因素与疾病之间的伪联系,应在研究设计时予以考虑和控制。
病因推断的第一步是用求同法、求异法、伴随变异法或类推法形成病因假设;第二步是通过分析流行病学、实验流行病学和发病机理研究对病因假设进行检验。
作出病因推断的一般原则是因先于果的时间顺序、统计学联系强度、联系的一致性、联系的特异性、联系的普遍性、剂量应答关系和联系与现有知识相符。
复习思考题
1.简述Evans病因假说的内容。
它与:
Koch氏假说的主要区别是什么?
2.解释统计学联系和非统计学联系,因果联系和非因果联系。
3.什么是必要原因?
它与充分原因的关系如何?
4.何谓混杂因素?
它对研究的病因因素与疾病之间的联系起什么作用?
试举例说明。
5.简述病因推断的方法和应遵循的原则。
第五章兽医流行病学资料
流行病学定性和定量调查研究的第一步都是收集资料,它可能与临诊症状、治疗和死亡剖检及实验室检查有关。
病因推断涉及将动物个体分为无病组和有病组,因此疾病的命名和分类以及诊断评价是最重要的资料要素。
疾病一般按特异病因、病变或症状3个不同水平命名。
以表现命名时,如划归有病的动物都只有一个共同的充分原因,则有利于病因推断。
按病因命名则更有利于病因推断,因为共同的充分原因可能在被归入有病的所有病例中显现。
诊断评价主要包括诊断指标和标准、敏感性和特异性、可靠性和真实性。
资料通常用文字和数字来表示,也可以用编码来表示,如数字编码、字母数字编码和符号编码等。
资料的来源有很多,包括政府兽医机构、基层兽医、畜禽屠宰场、产业部门(畜禽生产单位、药品销售部门等)、血清库、其他机构(计划、经济和统计等非兽医政府机构、医学卫生部门、大专院校和科研机关的兽医诊断实验室等)。
不同的来源其资料性质、合作程度、偏倚程度、追溯情况和收集费用有很大差异,这些都应考虑。
资料收集分为常规数据资料收集和专门安排的流行病学调查资料收集。
后者包括死亡和发病统计资料以及其他背景资料。
收集的原始资料经检查、设计分组、拟整理表和归组等过程进行科学整理,使之系统化,以便作进一步研究分析。
归组资料可按一定程序输入电脑贮存并供随时调用,亦可作普通书写记录或打孔卡片记录。
任何流行病学调查研究的第一步都是收集资料,不论是定性或定量调查研究。
本章将介绍兽医流行病学资料的性质、来源以及收集和整理。
资料的性质
兽医流行病学研究不同组群动物疾病的频率分布,这涉及资料的收集和分析。
资料是指收集在一起用作参考或信息的事实,尤其是数字事实。
资料可能与生产性能、临诊症状、治疗和死亡剖检及实验室检查有关。
资料要素
病因推断涉及将动物个体分为无病组和有病组,因此疾病的命名和分类以及诊断评价是最重要的资料要素。
疾病一般按特异病因、病变或症状3个不同水平命名。
以表现命名时,如划归有病的动物都只有一个共同的充分原因,则有利于病因推断。
按病因命名则更有利于病因推断,因为共同的充分原因可能在被归入有病的所有病例中显现。
诊断评价
诊断评价主要包括诊断指标和标准、敏感性和特异性、可靠性和真实性。
金标准是指目前临床应用的敏感性和特异性都最高的标准方法,按金标准诊断最接近真实情况。
诊断方法的真实性和可靠性
真实性可以用正确诊断指数r来表示。
ad-bc
r=1-(假阳性率+假阴性率)=(敏感性+特异性)–1=(a+c)(b+d)
诊断方法的可靠性是指在重复时产生相似的结果。
可靠方法的特征是可重复性。
影响因素有两方面;方法本身和观察差异。
资料的来源
资料的来源有很多,包括政府兽医机构、基层兽医、畜禽屠宰场、产业部门(畜禽生产单位、药品销售部门等)、血清库、其他机构(计划、经济和统计等非兽医政府机构、医学卫生部门、大专院校和科研机关的兽医诊断实验室等)。
不同的来源其资料性质、合作程度、偏倚程度、追溯情况和收集费用有很大差异,这些都应考虑。
资料收集
分为常规数据资料收集和专门安排的流行病学调查资料收集。
后者包括死亡和发病统计资料以及其他背景资料。
资料整理
收集的原始资料经检查、设计分组、拟整理表和归组等过程进行科学整理,使之系统化,以便作进一步研究分析。
复习思考题
1.为什么说疾病的命名和分类与诊断评价是流行病学研究中最重要的资料要素?
2.简述资料编码的几种方法。
3.简述兽医流行病学研究的资料来源。
4.资料整理有哪些步骤?
第6章动物疾病的防制及其经济评价
摘要
一切兽医活动都是以预防、控制和消灭动物疾病为最终目的。
制定疾病防制对策,实行疾病监测,搞好畜禽保健,并对疾病防制作出经济评价是兽医流行病学工作者的主要任务。
动物疾病可以通过预防、控制或消灭的对策来解决。
动物疾病的防制措施,针对传染源的有检疫、扑杀、治疗性和预防性给药等方法;针对传播途径的有改变放牧制度,控制传染媒介、宿主迁移、消毒、最少疾病法、改善环境条件和饲养管理等方法;针对易感畜群的有疫苗接种、小生境填充和遗传改善等方法。
制定疾病的控制或消灭规划时应考虑对该疾病病因认识的程度、兽医内部结构、诊断技术的可行性、是否有替换动物、公众的理解、疾病的公共卫生意义、立法补偿、生态学后果、财政支持等。
制定畜群保健和生产计划的目的是:
鉴别畜群中存在的疾病问题;按技术和经济指标确定各种疾病问题的重要性;启用合适的控制方法,并在技术上和在资源利用的经济效益上度量其成功的程度,指出那种方法应增强,那些方法应减弱。
在保健和生产计划中,兽医流行病学工作者的主要任务是:
诊断与预防主要的流行性疾病;对环境决定因素(营养、畜舍和管理)提出咨询;对畜禽生产技术和一般政策提出指导意见。
疾病监测是对某种或某些具体疾病(包括传染病和非传染病)进行系统、完整、连续和定期的观察,调查其分布动态和影响因素,以便及时采取有效防制对策。
监测可分为大范围的畜群的监测和个别畜群的监测两种形式。
与医学流行病学不同的是,兽医流行病学必须对畜禽疾病防制作出经济评价。
畜禽疾病造成经济损失,而疾病的预防和控制措施也是要花钱的,因此,疾病防制的净结果不是避免由疾病造成的经济损失本身,而是避免由疾病造成的经济损失减去防制疾病的费用。
所以对动物保健应作财务评价,对疾病防制应做成本效应分析。
要确定一个农场是否从一项畜禽保健改进中获益,可进行毛利分析。
重点:
疾病防制方案制定的社会、经济效益的估计。
要求:
掌握制定疾病防制方案的原则与方法。
主要内容:
动物疾病的防制对策
畜禽保健和生产计划
动物疾病的监测
疾病防制的经济评价
第一节动物疾病的防制对策
一、基本概念
1、预防(Prevention)
采取一切措施,将疾病排除于未受害的畜群之外。
途径:
病因预防,针对病因,如消毒杀虫;畜群预防:
保护宿主,如疫苗接种。
2、控制(control)
采取各种措施降低已出现于畜群中疾病的发病数和死亡数,并把疾病限制在局部范围内。
途径:
治疗、处理病畜。
阻止新病例出现与疫病蔓延。
3、消灭(eradication)
(1)一种传染性病原体的消灭,与病原体生物学特征有关,少见。
1980年WHO宣布消灭天花。
宿主单一,潜伏期不排毒,康复后终身免疫不带毒、病原体只有一个血清型、无隐性带毒者、有稳定而效果好的疫苗。
(2)一种传染性病原体的地区性消灭:
常见形式,如我国消灭了牛瘟、牛肺疫。
(3)一种传染性病原体的现患率(prevalencerate)减少到不发生传染的水平。
(4)现患率减少很低的水平,不再是主要的保健问题。
二、动物疾病的防制措施
针对传染病流行的三个环节:
传染源、传播途径、易感动物采取的疾病防治方法。
1、针对传染源
检疫(quarantine)是指利用各种诊断和检测方法对动物及其相关产品和物品进行疫病或病原体或抗体检查。
检疫的目的是查出传染源、切断传播途径,防止疫病传播。
在我国执行检疫的技术和执法部门有两大系统,一是中华人民共和国出入境检验检疫局(简称检验检疫局),下设各级分局,专门负责进出口动植物及其相关产品和物品的检疫;二是国家畜牧兽医总站,下设各级分站(简称动检站),隶属于各级畜牧兽医局,专门负责国内动物及其产品的各种检疫。
扑杀(slaughter)外来疫病、烈性传染病(一类动物疫病和危害严重的二类疫病如猪2型链球菌和高致病性猪蓝耳病)
2、针对传播途径
(1)混合放牧、交替放牧和顺序放牧。
根据病原对不同动物致病力来确定放牧的动物种类。
(2)控制媒介(controlofvector)
(3)宿主迁移(movementofhost)
(4)消毒(disinfection)
(5)最少疾病法(minimaldiseasemethods):
SPF鸡、猪剖腹产,主要针对垂直传播和呼吸道传播的疾病。
(6)改善饲养管理条件。
3、针对易感畜群
(1)疫苗接种
(2)药物预防和治疗
(3)抗病育种
4、生物安全体系(bio-security)
养殖生产中疫病防控方面的生物安全(Biosecurity)主要是采取必要的有效措施,最大限度地消除各种理化和生物性致病因子对人畜的危害,是动物生产中的一种安全保障体系。
它涉及诸多方面,包括养殖场的设计与控制、人员和物品流动的控制、无规定疫病区的建立和疫病控制等。
其中疫病控制又包括对动物的控制、环境控制和病原体控制。
三、制定疾病防制计划应考虑的因素
1、对病因的认识,疾病的自然史等。
2、兽医机构能力:
人员、诊断设施、研究设施。
3、诊断技术的可行性
4、是否有替换动物,以免对生产造成动荡。
5、公众的理解:
扑杀动物与动物保护等
6、疾病的公共卫生意义;人畜共患病
7、立法补偿:
禽流感、口蹄疫、结核病畜的扑杀。
8、生态学后果
9、财政支持
四、动物疾病地区性消灭实例
以美国消灭猪瘟为例。
1961年美国国会批准消灭猪瘟计划。
计划的阶段性:
(1)准备立法阶段
(2)初级阶段:
疫苗接种、隔离封锁、限制猪流动,达到减少猪瘟流行的目的。
(3)消灭阶段:
将感染猪全群扑杀。
(4)保护抵抗再感染阶段
1967-1975年美国猪瘟的新病例数
检测方法:
使用适用于大群检测的简便、敏感的试验;
疾病新的变化:
通过胎盘传递。
1978年1月31日,宣布消灭了猪瘟。
费时15年,耗资1.4亿美圆。
第二节畜禽保健和生产计划
一、制定保健和生产计划的目的
1、鉴别畜群中存在的疾病问题
2、按技术和经济指标确定各种疾病问题的重要性
3、启用合适的控制计划
兽医流行病学工作者的主要任务
(1)诊断与预防主要的流行性疾病
(2)对环境决定因素(营养、畜舍和管理)提出咨询
(3)对畜禽生产技术和一般政策提出指导意见
二、保健和生产计划内容
1、组成部分
(1).农场的概貌:
动物数、密度、疾病状态、生产水平
(2).鉴别生产短缺
(3).监测生产的各个方面
(4).鉴别主要的疾病问题
(5).针对疾病的主要预防措施
(6).确定生产指标、再进行校正
(7).提出知道意见
2、奶牛保健计划
目的:
最大限度提高奶牛产量和质量,提供生产效益
途径:
有效繁殖、减少重要疾病,最佳生产
措施:
制定与实施奶牛保健计划
从经济学观点考虑畜禽生产
一个奶牛场要达到每头牛的最高产奶量,只有当牛饲料是免费的,从经济学观点上讲才是有效的。
如果计算饲料费,每头牛奶产量小于技术上可能达到的最高产量时可得到最佳经济效益。
疾病防治的经济分析
根据疾病防治中得到的收益来衡量防治措施的成本,以确定防治措施的经济活力。
重大动物疾病(如牛瘟和口蹄疫)对生产影响显著,防治措施的净经济收益是明显的。
但是,常存在于集约化养殖业系统的复杂疾病对产生的影响更微妙。
如奶牛乳房炎对奶产量的影响,在采取合理的控制措施之前需要精确计算成本。
第7章描述性流行病学
主要内容
1.描述性研究的概念及常用研究方法。
2.现况研究
3.暴发调查
4.生态学研究
5.疾病的报告与登记
描述性研究是观察性流行病学研究中的一种类型,主要用于描述疾病或者某种特征在时间、地点、动物群体中的分布以及发生、发展的规律。
描述性研究常用的方法有:
现况调查;暴发调查;生态学研究;纵向研究;筛检。
现况研究
现况研究的概念、特点、种类。
抽样调查的抽样方法。
调查表的编制、调查变量的规定。
现况研究中常见的偏倚及其控制。
一、定义
现况研究又称为横断面研究(cross-sectionalstudy),是研究特定时点或时期和特定范围内动物群体中的有关变量(因素)与疾病或健康状况的关系。
即在某一时点或短时间内,对一个特定动物群体疾病(或某些特征)及有关因素进行的调查。
二、现况研究的目的
1)掌握目标群体中疾病的患病率及其分布状态。
2)提供病因线索。
3)利用普查或筛检可实现疾病的二级预防。
4)确定高危动物群体。
5)进行疾病监测、预防接种效果及其他资料质量的评价。
现况研究的特点
1.一般不设对照组
2.关心的是某一特定时点或短时期内某一群体中暴露和疾病的状况或联系。
3.不能确定暴露与疾病的因果关系。
4.对固定的暴露因素可作因果推论。
5.在现在暴露水平与既往变化不大或存在良好相关性;或已知其变化规律时,可用现在的暴露状态来代替或估计过去的暴露状态。
6.定期重复可获得发病率资料。
1.普查(census)
(1)概念:
在特定时间、对特定范围内的所有个体进行全面调查。
(2)普查目的:
对某些疾病早发现、早诊断、早治疗。
了解动物群体中疾病和健康状况的分布或
制定某生物学检验标准。
(3)普查原则:
所普查的疾病患病率不宜太低。
检测手段和方法应简易而准确。
有足够的人力、物力和财力进行调查。
(4)普查优缺点:
能发现动物群体中的全部病例。
一次调查可观察多个因素和疾病的关系。
不适用于患病率很低和诊断技术复杂的疾病。
质量不易控制。
抽样调查(samplingsurvey)
指从某动物群总体中按一定原则抽取部分有代表性的个体(样本)进行调查,用这部分样本的调查结果推算出该动物群体某病的患病率或某些特征的情况,这是以小窥大,以局部估计总体的调查方法。
抽样方法
1.单纯随机抽样:
最基本的抽样方法,将所有研究对象排列编号,利用随机数字表或抽签、计算机等抽出进入样本的号码。
2.分层抽样:
用于分布不均匀的研究群体,先按不同的特征(如性别、年龄、生产性能等)将研究群体分为若干层,然后从每层抽取一个随机样本。
要求层内变异越小越好。
“层”:
具有某种特征或共同暴露于某一因素的群体称为层。
3.系统抽样:
按照一定的顺序机械地每隔一定数量的单位抽取一个单位。
4.整群抽样:
将总体分为若干群组,抽取其中部分群组作为观察单位组成样本,对被抽到的群体内的所有个体都进行调查。
5.多级抽样:
多用于大型调查,从总体中先抽取一级单元,再在抽中的一级单元中抽取范围较小的二级单元。
3)样本大小:
样本大小的影响因素:
①对调查结果精确性的要求:
精确性要求高则样本大。
②预期的患病率:
患病率高则样本小。
确定样本大小的计算:
①前人的经验
②公式计算:
第二节现况调查的设计与实施
一、明确调查目的和类型(本次调查要达到什么目的;普查还是抽样)
二、确定研究对象
三、确定抽样方法和样本含量
四、确定研究变量和制定调查表:
1.变量的规定
调查表所列项目就是需研究的因素。
变量可分为:
疾病指标(发
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