FACSDiva操作说明资料讲解.docx
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FACSDiva操作说明资料讲解.docx
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FACSDiva操作说明资料讲解
FACSDiva操作说明书
首先熟悉一下Diva的操作界面
1
通过点击菜单栏的相应的按钮,可以隐藏或展开相应的模块
2
Browser
通过Browser,可以对数据库进行管理,Browser列出了文件夹、实验、及实验所包含的样本和管子。
3
Acquisitioncontrol对获取和记录数据进行操作
4
Instrument仪器设置
仪器框显示了仪器连接状态,当打开一个实验,试管指向定位于一个试管时,这个框显示的是当前试管的仪器设置。
5
浏览框
浏览框显示了worksheet或者Browser中选中的部件的属性,可进行修改。
6
worksheet
Worksheet框,可进行画图、设门、设逻辑关系,进行统计等。
7
获取状态显示了获取或记录数据时的状态。
在基本熟悉Diva的界面后,下面就进行一个实验。
在Diva软件上进行操作,必须先新建一个实验(实验必须建立在文件夹中)。
下面描述的是如何使用这些命令:
CreatingaFolderandanExperiment
这部分描述了如何创建一个Practice文件夹和包含有基础分析的实验。
1、在浏览框的菜单栏中单击
2、重命名为Practice,如下图
3、选择Practice文件夹,点击浏览框菜单栏的
在文件夹下就创建了一个新的实验,这个实验包含了默认的仪器设置和一个空白的globalworksheet。
4、点及增加Specimen快捷键
,可加一个样本和试管。
5、浏览框中点击左边的样本指向,指向tube-001。
样本指向变成绿色,说明当前Expriment和Acquizitioncontrol中显示该tube的属性。
6、在Browser中选择每一项,看看Inspector框的变化。
当tube-001被选择时,在Inspector中可以看到有四个标签,分别点击看看变化。
在这版软件中,一些仪器设置不能在Inspector中修改。
当与流式细胞仪相连接时,可以在Instrument框中改变电压、域值和补偿。
7、选择Expriment—ExprimentLayout,对每个参数进行定义,如下图。
当你的实验包含有很多试管时,你可以用ExprimentLayout来一次标记所有试管。
8、在ExprimentLayout对话框中,点击Acquisition标签,选择Tube-001,改变计数粒子为10000,点击OK。
当你在浏览框中选择Tube—001时,在Inspector中的Labels和Acqui中的选项也随着改变。
9、在Globalworksheet中创建一个FSCvsSSC点图
在worksheet菜单栏中点击
,再在worksheet中点击一下,就创建了一个默认大小点图。
10、在FSCvsSSC点图中边上创建一个PE直方图
在worksheet菜单栏中点击直方图工具
,再点击worksheet,一个默认大小的直方图就建立好了。
点击X轴标签,在下拉菜单中选择PE-A,可改变图的参数。
注意参数的名字是你先前设定的参数名。
11在FSCvsSSC点图下面创建一个FITCvsPerCP-Cy5.5的点图
按住Ctrl键,点击FSCvsSSC图的边缘,往下拖。
当你拖的时候,就创建了一个复制的点图。
把点图放在合适的位置,松开鼠标,这个方法可以复制任何的点图。
点击坐标轴,选择合适的参数。
12创建一个PopulationHierarchy
PopulationHierarchy是用来列出定义的亚群。
右击任何点图,选择ShowPopulationHierarchy,把结果图拖到FITCvsPerCP-Cy5.5点图的右侧。
Worksheet应该看起来类似于下图:
ExportinganExperimentasaTemplate
现在已经创建好一个实验了,可以导出成为一个模板。
实验模板包括了样本、试管、关键词、仪器设置、标签、worksheet上的图以及worksheets(包括所有设置,如分页),但不包含有数据。
一个实验可以保存为一个模板,为了简化浏览框,模板不通过浏览框选择。
1、在浏览框中选择Expriment-001,再选择File—Export—ExprimentTemplate。
确定选择的是ExprimentTemplate命令,而不是Expriment命令。
ExportExperimentTemplateWizard出现,对话框上的黑体字告诉你每个框的作用
2在模板类型中输入Practice,模板名字中输入SimpleAnalysis。
模板类型用来对类似的模板进行分组,以便于查找。
当你在创建一个模板时,至少要输入类型和名字,后面的选项是可选项。
3点击Next,可查看后面的选项,点击Finish。
CreatinganExperimentfromaTemplate
现在可以用原来保存的模板来创建一个实验。
记住当你想在一个文件夹中创建一个实验时,首先要选择文件夹。
1、选择Practice文件夹,选择Experiment—NewExperiment。
当你想用原来保存的Exprement模板时,使用菜单栏而不是快捷键,你也可以按Ctrl-E。
ExperimentTemplates对话框出现
2、在对话框中,点击Practice标签,选择SimpleAnalysistemplate,点击
键。
ExperimentLayout对话框出现,显示试管标记、关键词、模板的设置等。
3点击ExperimentLayout对话框中的各种标签,查看设置,然后点击Cancle。
这些设置是你建立模板时设定的,注意:
这些数据是只读的,不能修改。
4点击OK建立一个新的实验
注意原先的实验已经关闭,一个新的实验SimpleAnalysis在浏览框中。
当你在做实验时,一次只能打开一个实验。
注意globalworksheet中包含有点图和PopulationHierarchy,在点图中没有数据。
ImportinganExperiment
接下来,你将在Practice文件夹中导入一个实验。
导入实验与导入模板的不同之处在于它们包含有记录的数据。
1、选择Practice文件夹,选择File—Import—Expriments
默认情况下,当导入一个实验时,D:
\BDExport\Experimentfolder将会出现,除非你以前改变路径导向到另一个文件夹。
2、选择命名为ManualComp的文件夹,点击Import。
导入的实验都是以文件夹形式出现,文件夹在导入后在浏览框中将会以实验Expriment出现。
注意原先的实验没有关闭,新的实验加在SimpleAnalysisExperiment后面
有三种方法在浏览框中增加实验:
1、用浏览框工具栏中的快捷键
来新建一个空的实验(默认条件设置)。
2、Expriment—NewExpriment命令新建一个新的实验,实验来自于一个原来保存的模板,模版包含下列部分:
点图、门、统计图和仪器设置。
3、File—import—Expriment命令,可新建一个实验,通过这个方法获得的实验包括原来保存的实验条件等和数据。
WorkingwithExperimentsintheBrowser
现在在浏览框中有三个实验,一个关闭的实验(Experiment_001),一个打开的实验模板(SimpleAnalysis)和一个关闭的导入的实验(ManualComp)。
接下来的练习来证明关闭和打开的实验之间的不同,以及如何来比较仪器设置。
1、点击ManualCompExperiment前面的(+),展开实验。
尽管在browser框中显示出实验组分,但点图依旧是空白的,你必须打开一个实验来获得它的数据。
注意:
展开一个实验和双击打开一个实验是不同的
2、双击ManualCompExperiment来打开
SimpleAnalysisExperiment关闭,在worksheet中显示ManualCompExperiment中的分析目标。
3、点击其中一个实验样本
ManualCompExperiment中,在每个样本下面含有多个试管,注意每个试管都是绿色的,说明每个试管都包含有数据。
4、点击试管指示到任何一个试管。
在globalworksheet中包含有点图、试管中含有数据,数据就显示在worksheet中,可用试管指示来定位试管,则将显示所选择试管的数据。
5、在browser中选择其它试管
注意:
数据并没有改变,必须依靠试管指示,才能在globalworksheet中显示其他试管的数据。
尝试把试管指示指向另一个试管,注意数据的变化。
6、展开SimpleAnalysisExperiment,选择InstrSettings。
注意Inspector上的仪器设置是所选Instrusettings的设置,尽管实验已经关闭。
7点击Instrumengt框中的各个参数
Instrment框显示了试管指示所对应的试管的仪器设置(ManualCompExperiment中的tube)。
Inspector显示的是试管的设置或者是所选择的InstrSettings的设置。
在这个例子里,Inspector显示的是SimpleAnalysisExperiment实验的仪器设置,你可以用Instrument框和Inspector来比较浏览器中的任何两个仪器设置。
UsingGatingFeatures
在BDFACSDiva软件中:
可以创建四种类型的门:
polygon、rectangle、quadrant和interval。
自动圈门工具Automatic和Snap-To门工具可用来设置polygon和interval门。
在这一节中,你需要先前所建立的SimpleAnalysis和ManualComp实验。
CreatingGates
这部分说明了在ManualCompExperiment中怎么用worksheet中的菜单栏来设不同的门:
1、打开ManualCompExperiment
2、把试管指向对准Calibrite样本下的PreSort试管,如下图:
3、在FSCvsSSC点图上建一个Autopolygon门
选中worksheet菜单栏的
(Autopolygon)工具。
在点图中点击粒子,一个门将会自动地画成。
4、试管指示指向下一个试管,可以看到一些粒子在门外。
5、选择FSCvsSSC图的Autopolygon门,Delete
按Delete键而不是Backspace键,如果Delete键不工作的话,右击门,选择delete。
这将会激活Delete键,下次就可以使用。
6、在FSCvsSSC点图上创建Snap-Topolygon门
Snap-Topolygon和autopolygon门不同,Snap-Topolygon门自动重新计算。
可看见Snap-Topolygon门的边框比较粗。
7、把试管指示回到PreSort试管,注意门的变化。
8、(可选)用其它设门工具进行练习,在点图上去除Snap-To门,创建一个Rectangle门(
)和一个Polygon门(
)
EditingGates
这部分描述怎样移动和改变门的大小
1、选中FSCvs
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