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北京师范大学生物化学真题解析
海文专业课09年北京师范大学生物化学冲刺班讲义(七)答题技巧
一、名解
一般要求答到以下几点:
基本概念、意义或者举例。
如果是一名词,则解释结构、功能、(特点)。
如G-蛋白:
在细胞内信号传导途径中起着重要作用的GTP结合蛋白,由αβγ三个亚基组成。
激素与激素受体结合诱导GTP与G蛋白结合的GDP进行交换,结果激活了位于信号途径中下游的腺苷酸环化酶。
G蛋白将细胞外的第一信使(肾上腺素等激素)和细胞内的腺苷酸环化酶催化的腺苷酸环化生成的第二信使cAMP联系起来。
G蛋白具有内源GTP酶活性。
如果是一过程,则解释过程和意义即可。
如丙氨酸-葡萄糖循环:
指丙氨酸和葡萄糖在肌肉和肝脏之间进行氨转运的过程。
其具体过程是:
肌肉中的氨基酸经转氨基作用将氨基转给丙酮酸生成丙氨酸,丙氨酸经血液循环运到肝脏。
在肝脏内丙氨酸通过联合脱氨基作用释放氨基用于合成尿素,转氨基生成的丙酮可经糖异生作用生成葡萄糖,后者经血液循环到达肌肉组织,通过糖酵解途径再生成丙酮酸,再接受氨基生成丙氨酸,丙氨酸和葡萄糖在肌肉和肝脏之间反复进行氨的转运的过程称为丙氨酸-葡萄糖循环。
二、填空
遇到不会的,先跳过。
一般,北师考研填空题集中在以下几个方面:
1.重要酶,尤其是限速酶。
E.g.脂肪酸β氧化的限速酶是,它存在于细胞的
E.g.催化乙醛酸循环途径的特有酶是和。
(08真题)
2.重要代谢产物。
e.g.由尿素循环过程中产生的两种氨基酸和不参与人体蛋白质的合成。
(06真题)
3.重要的基本概念。
如根据酶催化的反应类型,可以把酶分为6大类,它们分别是、、、、和。
北京师范大学生物化学2005年真题解析
一.名词解释
1.等电点和等离子点:
等电点,对于某一种蛋白质在某一pH,他所带的正电荷与负电荷恰好相等,也即净电荷为零,这一pH值称为蛋白质的等电点,蛋白质的等电点和它所含的酸性氨基酸和碱性氨基酸的数目比例有关。
等离子点:
没有其它盐类干扰时,蛋白质质子供体解离出的质子数与质子受体结合的质子数相等时的pH值称等离子点,是每种蛋白质的特征常数。
在等电点条件下,蛋白质的电导性、溶解度最小,粘度最大。
2.氢键的方向性和饱和性:
氢键是一种特殊的分子间作用力,它是由已经与电负性很强的原子形成共价键的氢原子与另一分子中电负性很强的原子之间的作用力。
氢键不属于化学键,是介于范德华力和化学键之间的一种较弱的作用力。
一般表示为X—H------Y。
氢键的方向性是指Y原子与X—H形成氢键时,将尽可能使氢键与X—H键轴在同一方向,即X—H…Y三个原子在同一直线上。
这样,X与Y之间距离最远,两原子电子云之间排斥力最小,所形成的氢键最强,体系更稳定。
氢键的饱和性是指每一个X—H只能与一个Y原子形成氢键。
3.合成酶和合酶:
酶是生物催化剂,除少数RNA外几乎都是蛋白质。
酶不改变反应的平衡,只是通过降低活化能加快反应的速度。
其中催化有ATP参加的合成反应,即由两种物质合成一种新物质的反应的酶叫做合成酶;而催化合成反应并且不需要ATP的酶叫合酶。
4.氨基酸臂和反密码子环:
生物的tRNA的顺序通过碱基互补配对形成三叶草结构,其5’端总是配对的,这与tRNA的稳定性有关。
5’端和3’端配对形成茎区,称为受体臂或氨基酸臂。
在3’端永远是4个碱基的单链区,在其末端有2’-OH或3’-OH,是被氨基酰化位点,此臂负责携带特异的氨基酸。
反密码子环常是由5bp的茎区和7nt的环区组成,在环区的中央总存在着反密码子三联体,他负责对mRNA上的密码子的识别与配对。
5.增色效应和减色效应:
这是DNA变复性过程中发生的现象。
当双螺旋DNA熔解(解链)时,260nm处紫外吸收增加的现象叫做增色效应,增色效应与DNA解链程度有一定的比例关系,是观察DNA是否发生变性的一个重要指标。
随着核酸复性,紫外吸收降低的现象叫做减色效应,这是因为双螺旋结构使碱基对的π电子云发生重叠,因而减少了对紫外光的吸收。
6.磷氧比值:
电子经过呼吸链的传递作用最终与氧结合生成水,在此过程中所释放的能量用于ADP磷酸化生成ATP。
经此过程消耗一个原子的氧所要消耗的无机磷酸的分子数(也是生成ATP的分子数)称为磷氧比值(P/O)。
如NADH的磷氧比值是3,FADH2的磷氧比值是2。
7.脂肪酸的β氧化:
是脂肪酸氧化分解的方式,因为其降解始于羧基端的第二位(β位)的碳原子,在这一处断裂切掉两个碳原子,因此被称为β氧化。
其过程发生在线粒体内,共包括5个步骤:
即活化、氧化、水合、氧化、断裂。
每轮循环切掉两个碳原子逐步把脂肪酸完全降解成两个碳的乙酰辅酶A,在进入以后的氧化分解过程。
8.衰减子:
是原核基因调控过程中的一种位于结构基因上游的终止子,用以终止和减弱转录。
前导区编码mRNA的前导序列,该序列可合成一段小肽,他在翻译水平上控制前导区转录的终止。
是一种控制转录后是否继续下去的调控机制,其调节比之阻遏作用更为精细。
9.RAPD:
是建立在PCR(PolymeraseChainReaction)基础之上的一种可对整个未知序列的基因组进行多态性分析的分子技术。
其以基因组DNA为模板,以单个人工合成的随机多态核苷酸序列(通常为10个碱基对)为引物,在热稳定的DNA聚合酶(Taq酶)作用下,进行PCR扩增[1]。
扩增产物经琼脂糖或聚丙烯酰胺电泳分离、溴化乙锭染色后,在紫外透视仪上检测多态性。
扩增产物的多态性反映了基因组的多态性。
RAPD技术现已广泛的应用于生物的品种鉴定、系谱分析及进化关系的研究上。
10.Westernblot:
与Southern或Northern杂交方法类似,但WesternBlot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。
经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。
以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。
该技术也广泛应用于检测蛋白水平的表达。
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(以上是部分真题解析)
查看详情:
二.填空
1、脯氨酸α脯氨酸2、3.83、溴化氢4、胶原5、负6、结合部位
7、02.[s]8、竞争、非竞争10、C-C11、维生素12、高13、G、A
14、RNA、逆转录15、GCU、GCA、GCC16、热变性、酸碱变形17、H、基因调控
18、甘油醛-3-磷酸、1,3-二磷酸甘油酸19、葡萄糖-6-磷酸、EMP、HMP20、线粒体、生物素21、氧化、还原22、细胞色素C、细胞色素氧化酶23、脂酰肉碱转移酶24、甘油-3-磷酸、脂酰-CoA25、乙酰-CoAHMG-CoA还原酶26、乙酰-CoA27、胸腺嘧啶核苷酸合酶、四氢叶酸、甲基28、非编码区、内含子29、解链30、低温退火
三.问答题
1、略
2、结构式
它是维生素PP的衍生物;它主要作为脱氢酶的辅酶;在催化反应中起传递电子(氢原子)的作用。
3、【参考答案】核酸是一种线形多聚核苷酸,基本组成单位是核苷酸。
DNA的结构:
一级:
脱氧核苷酸分子间连接方式及排列顺序。
DNA的一级结构是4种脱氧核苷酸(dAMP、dGMP、dCMP、dTMP)通过3/、5/-磷酸二酯键连接起来的线形多聚体。
3/、5/-磷酸二酯键是DNA、RNA的主链结构
二级:
DNA的两条多聚核苷酸链间通过氢键形成的双螺旋结构。
Watson-Crick双螺旋结构模型a.两条反平行的多核苷酸链绕同一中心轴相缠绕,形成右手双股螺旋,一条5’→3’,另一条3’→5’b.嘌呤与嘧啶碱位于双螺旋的内侧,磷酸与脱氧核糖在外侧。
磷酸与脱氧核糖彼此通过3/、5/-磷酸二酯键相连接,构成DNA分子的骨架。
c.螺旋平均直径2nm,每圈螺旋含10个核苷酸,碱基堆积距离:
0.34nm,螺距:
3.4nmd.两条核苷酸链,依靠彼此碱基间形成的氢链结合在一起。
碱基平面垂直于螺旋轴。
A=T、G=C。
三级:
DNA双链进一步折叠卷曲形成的构象。
形成正超螺旋与负超螺旋DNARNA的结构:
RNA是AMP、GMP、CMP、UMP通过3/、5/磷酸二酯键形成的线形多聚体。
(1)组成RNA的戊糖是核糖
(2)碱基中RNA的U替代DNA中的T,此外,RNA中还有一些稀有碱基。
(3)天然RNA分子都是单链线形分子,只有部分区域是A-型双螺旋结构。
双螺旋区一般占RNA分子的50%左右。
tRNA形成了特殊的高级结构—三叶草结构,其结构特点是①分子量在25kd左右,70-90b,沉降系数4S左右。
②碱基组成中有较多稀有碱基。
③3’末端为…CpCpA-OH,用来接受活化的氨基酸,此末端称接受末端。
④5’末端大多为pG…或pC…。
⑤二级结构是三叶草形。
mRNA和rRNA结构没有复杂的高级结构,但在真核和原核生物中其结果有差别。
4、【参考答案】
(一)代谢途径交叉形成网络
细胞内有数百种小分子在代谢中起着关键的作用,由它们构成了成千上万种生物大分子,其代谢有着密切的联系。
细胞代谢的原则和方略:
将各类物质分别纳入各自的共同代谢途径,以少数种类的反应(氧化还原、基团转移、水解合成、基团脱加、异构反应),转化种类繁多的分子。
不同的代谢途径可通过交叉点上关键的中间代谢物而相互作用、相互转化。
这些共同的中间代谢物使各代谢途径得以沟通,形成经济有效、运作良好的代谢网络。
生物体内的糖、脂、蛋白质与核酸之间可以相互转化,构成了代谢的网络。
(二)分解代谢和合成代谢的单向性
分解代谢与相应的合成代谢途径通常是不重合的,存在重要差别。
差别方式有两种:
1.部分代谢途径相同,个别或少数过程不相同,并由不同的酶催化;
2.合成和分解途径完全不相同,由不同酶催化。
(三)ATP是能量的通用载体
分解代谢过程如葡萄糖和其它燃料分子降解,所释放的能量通过ADP-->ATP过程被贮存,然后再经过ATP的水解释放可作功的自由能,做四种功:
1.驱动合成反应;2.细胞运动或肌肉收缩;3.跨膜逆浓度梯度主动运输营养物质;4.DNA、RNA、Protein生物合成过程中参与遗传信息传递。
(四)NADPH以还原力携带能量
NADPH系携带分解代谢释放能量的另一种形式,NADP+是一些分解代谢中脱氢酶辅酶,结合释放的高能原子转化为NADPH再通过其氧化,将能量转移到需能的合成反应,提供还原力。
生物合成过程系一还原反应过程,需要氢原子或电子形式的还原力,通过NADPH将分解代谢释放部分能量供给生物合成需要,从而实现能量的传递,在此过程中NADP++H++e←→NADPH实现自身循环。
(五)代谢的基本要略在于形成ATP、还原力和构造单元以用于生物合成
代谢途径是由一系列的酶促反应驱动;代谢的总轮廓特征为:
分解代谢汇聚到少数几个终产物,各成代谢分叉产生许多产物;代谢的基本要略在于形成ATP、还原力和构造单元,以用于生物合成。
分解代谢产生能量和构造材料,再由ATP、NADPH和构造单元合成各类生物分子,并进而装配成生物不同层次的结构。
5、【参考答案】
(一)氨基端和羧基端的修饰
在原核生物中几乎所有蛋白质都是从N-甲酰蛋氨酸开始,真核生物从蛋氨酸开始。
甲酰基经酶水介而除去,蛋氨酸或者氨基端的一些氨基酸残基常由氨肽酶催化而水介除去。
包括除去信号肽序列。
因此,成熟的蛋白质分子N-端没有甲酰基,或没有蛋氨酸。
同时,某些蛋白质分子氨基端要进行乙酰化在羧基端也要进行修饰。
(二)共价修饰
许多的蛋白质可以进行不同的类型化学基团的共价修饰,修饰后可以表现为激活状态,也可以表现为失活状态。
1、磷酸化
磷酸化多发生在多肽链丝氨酸,苏氨酸的羟基上,偶尔也发生在酪氨酸残基上(磷酸化分子式如下图),这种磷酸化的过程受细胞内一种蛋白激酶催化,磷酸化后的蛋白质可以增加或降低它们的活性。
2、糖基化
质膜蛋白质和许多分泌性蛋白质都具有糖链,这些寡糖链结合在丝氨酸或苏氨酸的羟基上,3、羟基化
4、二硫键的形成:
mRNA上没有胱氨酸的密码子,多肽链中的二硫键,是在肽链合成后,通过二个半胱氨酸的疏基氧化而形成的,二硫键的形成对于许多酶和蛋白质的活性是必需的。
(三)亚基的聚合:
有许多蛋白质是由二个以上亚基构成的,这就需这些多肽链通过非共价键聚合成多聚体才能表现生物活性。
(四)水解断链:
一般真核细胞中一个基因对应一个mRNA,一个mRNA对应一条多肽链,但也有少数的情况,即一种多肽链经水解后产生几种不同的蛋白质或多肽。
6、【参考答案】原核生物和真核生物的基因表达都经历的复杂的调节过程,受多种调节过程,原核生物的基因表达主要发生在转录前,而真核生物基因的调控可发生在整个基因表达的过程中。
其中原核生物的基因表达调控主要有:
(1)操纵子模型:
原核生物的几个不同基因组成一个操纵子一起表达,共同受到调控,它包括结构基因和控制部位。
(2)转录活性的调节-基因能否转录是受到严格控制的其调节机制有降解物阻遏:
有些调节基因起正调节作用,如腺苷酸受体蛋白,可被环腺苷酸活化,作用于启动子,促进转录。
(3)基因转录能否持续下去也是受到调节的,其调节机制是衰减子:
可终止和减弱转录。
(4)生长速度的调节:
生长速度由蛋白质合成速度控制,快速生长时核糖体数量增加。
缺乏氨基酸时核糖体RNA和转运RNA的合成显著下降,关闭大部分代谢活性,称为严紧控制。
未负载转运RNA与核糖体结合后引起鸟苷四磷酸和鸟苷五磷酸的合成,抑制核糖体RNA的转录起始,并增加RNA聚合酶在转录中的暂停,减缓转录。
(5)基因表达的时序控制:
λ噬菌体的发育阶段由几个调节蛋白作用于不同的启动子和终止子而调控,早期基因的表达可打开后期基因,在后期又可关闭早期基因,使遗传信息按时序表达。
(6)翻译水平的调控:
1.翻译能力的差异:
由5’端的核糖体结合部位(SD序列)决定,而且用常见密码子的信使RNA翻译较快。
2.翻译阻遏:
核糖体游离蛋白对自身的翻译有阻遏作用,可以使其蛋白与RNA相适应。
3.反义RNA:
与信使RNA序列互补,结合后抑制其翻译。
可用于抑制有害基因的表达。
真核生物的主要调控:
(1)转录前调节:
通过改变DNA序列和染色质结构而影响基因表达。
包括.染色质的丢失、基因扩增、染色体DNA序列重排、DNA修饰和异染色质化
(2)转录活性的调节:
分两步,先活化,再与其他因素作用。
活化方式主要有染色质的活化、激素的诱导、增强子。
(3)转录后调节:
加帽子和尾可延长寿命,选择性剪接、RNA编辑可产生不同的信使RNA。
(4)翻译水平调节:
主要是控制稳定性和有选择地翻译。
某些蛋白因子可起保护作用,翻译控制RNA可与之形成双链,抑制翻译。
对eIF2的磷酸化也可抑制翻译。
(5)翻译后的调节:
翻译后加工也有调控作用。
不同的加工方式可产生不同蛋白。
将蛋白转变为易降解的形式,促进水解也是调控手段。
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(以上是部分真题解析)
北京师范大学生物化学2006年真题解析
一.名词解释
1.兼性离子和两性电解质:
氨基酸在中性PH时,羧基以-COO-氨基以-NH3+形式存在。
这样的氨基酸分子含有一个正电荷和一个负电荷,称为兼性离子;兼性离子是两性的,它既是算又是碱,在高PH值条件下,带负电荷,在较低PH下带正电荷,兼性离子向其他离子一样是一种电解质,因此又称作两性电解质。
氨基酸的等电点:
在某一pH溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,
2.超二级结构和结构域:
在蛋白质分子中特别是在球状蛋白质分子中经常看到由若干相邻的二级结构元件组合在一起,彼此相互作用,形成种类不多的、有规则的二级结构组合或二级结构串,在多种蛋白质中充当三级结构的构件,称为超二级结构;结构域是介于二级和三级结构之间的另一种结构层次,所谓结构域是指蛋白质亚基结构中明显分开的紧密球状结构区域,有时候也指功能域。
3.诱导契合学说:
酶对于它所作用的底物有着严格的选择,它只能催化一定结构或者一些结构近似的化合物,使这些化合物发生生物化学反应,有的科学家提出,酶并不是事先就以一种与底物互补的形状存在,而是在受到诱导之后才形成互补的形状。
这种方式如同一只手伸进手套之后,才诱导手套的形状发生变化一样。
底物一旦结合上去,就能诱导酶蛋图白的构像发生相应的变化,从而使酶和底物契合而形成酶-底物络合物,这就是“诱导契合学说”。
4.琼脂糖凝胶电泳:
是一种以琼脂糖为支持物的电泳技术,常用于分析DNA,电泳完毕后将胶在荧光染料溴化乙锭的水溶液中染色,经紫外照射可发射出红-橙色可见光。
方法灵敏,还可以根据荧光强度判断出DNA样品的浓度,判断DNA分子的大小,进行特意片段的回收等。
可对DNA分子进行多方面的操作,具有简便、快速、灵敏、成本低的优点。
5.丙酮酸脱氢酶复合体:
是柠檬酸循环中催化丙酮酸脱羧脱氢形成乙酰CoA的酶,它包括三中酶:
丙酮酸脱氢酶组分、二氢硫辛酸脱氢酶、二氢硫辛酰转乙酰基酶和6种辅因子:
TPP、硫辛酰胺、FAD、NAD+、CoA、Mg2+。
这三种酶在结构上形成一个有秩序的整体,使整个复杂的催化反应相互协调有序地进行且避免不必要的副反应。
6.氧化磷酸化和底物水平磷酸化:
:
ADP或某些其它的核苷-5′—二磷酸的磷酸化是通过来自一个非核苷酸底物的磷酰基的转移实现的,这种磷酸化与电子的转递链无关叫做底物水平磷酸化。
氧化磷酸化是电子从一个底物传递给分子氧的氧化与酶催化的由ADP和Pi生成ATP与磷酸化相偶联的过程,是将生物氧化过程中释放的自由能用以使ADP和无机磷酸生成高能ATP的作用,是生物产生ATP的主要途径。
7.酮尿症和酸中毒:
脂肪酸在肝脏中进行β氧化时产生乙酰辅酶A。
但肝脏由于缺乏某些酶,常不能彻底氧化脂肪酸乃生成酮体。
肝外组织氧化酮体的速度相当快,能及时除去血中的酮体。
因此,在正常情况下,血液中酮体含量很少,通常少于100mg%。
尿中酮体含量极少,不能用一般方法检出。
但在患糖尿病或长期不能进食时,糖的利用发生障碍或缺乏可利用的糖,以致机体必需大量动用储存的脂肪进行分解,以获能量。
在此情况下,大量脂肪酸在肝脏氧化产生大量乙酰辅酶A。
乙酰辅酶A进入三羧酸循环时需与草酰乙酸结合,但在患糖尿病或长期不能进食时,草酰乙酸往往不足,因此乙酰辅酶A不能全部进入三羧酸循环。
不能进入三羧酸循环的那部分乙酰辅酶A即通过酮体生成途径生成酮体。
当肝内生成的酮体超过肝外组织利用的能力时,血中酮体含量就会升高,使血液PH值降低,发生酸中毒。
酮体从尿排出增多即称为酮尿症。
8.RFLP和SSR:
限制性内切酶片段长度多态性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism),当DNA序列的差异发生在限制性内切核酸酶的识别位点时,或当DNA片段的插入、缺失或重复导致基因组DNA经限制性内切核酸酶酶解后,其片段长度的改变可以经凝胶电泳区分时,DNA多态性就可应用限制性内切核酸酶进行分析,这种多态性称为限制性片段长度多态性。
简单序列重复SSR又称微卫星DNA,是一类由2-6个核甘酸组成的短序列首尾相连多次重复构成的一段DNA,每个微卫星DNA两端的序列多是相对保守的单拷贝序列。
SSR在真核生物基因组中的功能有
(1)位于染色体末端的重复序列有保护DNA的完整性,避免降解、融合及丢失的功能
(2)有的重复序列位于转录的调控区,能上调或者下调附近基因的转录(3)重复序列也是重组的热点,是基因变异的来源之一(4)重复序列也可缓解进化的压力(5)部分的重复序列位于转录区,其上携带的信息可编码氨基酸(6)还有部分SSR具有产生转录启动复合物及活化染色体的功能。
9.增强子和衰减子:
增强子是真核生物中除启动子外能促进转录的序列,他与启动子的相对位置无关,无方向性能在远距离对启动子产生影响,并且它的调节受到发育和分化的影响。
从某种意义上说它可以看作是启动子远离起点的上游元件。
衰减子是原核基因调控过程中的一种位于结构基因上游的终止子,用以终止和减弱转录。
前导区编码mRNA的前导序列,该序列可合成一段小肽,他在翻译水平上控制前导区转录的终止。
是一种控制转录后是否继续下去的调控机制,其调节比之阻遏作用更为精细。
10.抗体酶:
是一种具有催化能力的蛋白质,其本质上是免疫球蛋白,但是在易变区被赋予了酶的属性,所以又成为催化性抗体,它是生物学与化学的研究成果在分子上交叉渗透的产物是将抗体的多样性和酶分子的巨大催化能力结合在一起的蛋白质。
二.填空题
1、92、HS-CH2-CH(NH2)-COOH二肽3、接头蛋白4、部分双键5、α-碳构型不对称和α-螺旋构象不对称6、膜整合蛋白7、Western8、凝胶过滤层析、大9、Asp蛋白酶、疏水裂缝中10、异构酶、转移酶11、竞争性抑制剂、Kcat型不可逆抑制剂12、共价修饰13、脱氧糖、DNA14、糖苷键15、活性氧、过氧化反应16、脱氢酶17、甘油醛-3-磷酸、1,3-二磷酸甘油酸18、已糖激酶、磷酸果糖激酶、丙酮酸激酶19、转酮酶、转醛酶20、UDP-葡萄糖21、线粒体、生物素22、体温条件、酶催化、逐步释放能量、能量储存在特殊化合物中(ATP)23、NADH和辅酶Q之间(NADH脱氢酶)、辅酶Q和细胞色素C之间(细胞色素C还原酶)、细胞色素a和氧之间(细胞色素c氧化酶)24、鸟氨酸、瓜氨酸25、鸟嘌呤26、操纵基因、结构基因27、-10区、-35区
三、简答题
1、【参考答案】
(1)邻近效应与定向效应:
酶把底物分子(一种或两种)从溶液中富集出来,使它们固定在活性中心附近,反应基团相互邻近,同时使反应基团的分子轨道以正确方位相互交叠,反应易于发生。
(2)底物的形变和诱导契合:
酶中某些基团可使底物分子的敏感键中某些基团的电子云密度变化,产生电子张力。
改变方式有:
酶从低活性形式转变为高活性形式、底物扭曲、变形、底物构象变化,变得更像过度态结构,大大降低活化能。
(3)共价催化:
酶作为亲核基团或亲电基团,与底物形成一个反应活性很高的共价中间物,此中间物易变成过渡态,反应活化能大大降低,提高反应速度。
(4)酸碱催化:
酶分子的一些功能基团起质子供体或质子受体的作用。
参与酸碱催化的基团:
氨基、羧基、巯基、酚羟基、咪唑基。
(5)金属离子的催化:
分类(金属酶、金属激活酶)参与催化反应的途径(结合底物为反应定向、可逆的改变金属离子的氧化态调节氧化还原反应、通过静电屏蔽或稳定负电荷)
(6)多元催化和协同效应:
几个集团催化反应结合在一起共同作用
(7)活性中心的微环境:
包括疏水环境和荷环境
酶催化反应的高效性,可能是由于以上五种因素中的几种因素协同作用的结果,而非酶催化反应往往只有一种催化机制。
2、【参考答案】一些寡聚蛋白,每个亚基除了有活性部位(结合底物)外,还有别构部位(结合调节物),别构蛋白的别构部位与效应物的结合改变了蛋白质的构象,从而对活性部位的影响。
有时活性部位和别构部位分属不同的亚基(活性亚基和调节亚基),活性部位之间以及活性部位和调节部位之间通过蛋白质构象的变化而相互作用。
其中包括同位效应和异位效应。
血红蛋白是一个四聚体蛋白质,具有氧合功能,可在血液中运输氧。
研究发
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