64位linux vasp安装.docx

64位linux vasp安装.docx

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64位linuxvasp安装

如何在64位RedHat5.2Enterpriselinux下安装VASP

一安装linux系统

采用的系统是64位RedHat5.2Enterpriselinux，两个CPU8核，内存12G。

利用光盘安装，进入安装界面

直接回车安装系统

这里跳过光盘检测

“Next”开始安装

选择语言“English”

选择美国英语式键盘

这项可以选择输入序列号，也可以选跳过（不输入序列号），然后单击Next。

因为我们想装双系统，原来已经有window7系统，所以选择自定义安装，Createcustomlayout，接下来单击“Next”。

根据需要创建分区：

基本分三个区/boot区（ext3），/区（ext3），swap区。

这里直接下一步

修改主机名（例如linux也可以不修改），这里我们是单机运行，所以没有配置网关和DNS。

选择时区

输入“root”密码

这里我们选择SoftwareDevelopment，如果前面没有注册的话，这里可能没有Virtualization这一项。

如果你想选择你需要的软件的包，那就选择Customizenow，我们选择Customizelater这一项，一般按默认安装就已经能满足我们的需要。

选择“Next”开始安装程序

安装完成后，光盘弹出，重启系统。

系统安装完成后，安装vasp需要以下的安装软件：

编译器和数学库，我们选择intel的，编译器和数学库是在一起的；fftw（傅里叶变换）；vasp库和vasp源代码；vasp所需的赝势库；mpi并行包。

这些软件放在指定的目录里：

/home/film/yanghua/。

在这个目录下，分别建立四个文件夹ifort，fftw，mpich2，vasp，将这些软件对应放入各自的文件夹。

二安装intel编译器和数学库

首先进入压缩包所放的目录/home/film/yanghua/ifort（目录可以更改）下，在此目录下打开一个终端，输入命令：

解压tar–zxvfl_fcompxe_intel64_2011.4.191.tgz

进入安装包cdl_fcompxe_intel64_2011.4.191

安装./install.sh回车

选择1viewthelicenseagreement

一直敲空格读完

输入：

accept回车

选择3alternativeactivation*****necessary

选择2usealicensefile

输入ifc.lic文件所在的全路径，到文件。

选1，选1，回车=====>OK

设置环境变量，输入如下命令：

vi~/.bashrc

出现下面一个文本，按字母I进入插入模式，加入以下两行后：

exportPATH=/opt/intel/composerxe-2011.4.191/bin/intel64/:

$PATH

exportLD_LIBRARY_PATH=/opt/intel/composerxe-2011.4.191/mkl/lib/intel64/:

$LD_LIBRARY_PATH

按esc建退出插入模式，输入：

“：

wq”回车保存。

输入命令:

source~/.bashrc永久保存。

在终端输入：

whichifort出现/opt/intel/composerxe-2011.4.191/bin/intel64/ifort，或者输入：

ifort-V出现版本的相应信息，说明编译器安装成功。

三安装fftw-3.1.2

事先将安装包放在指定目录/home/film/yanghua/fftw（目录可以更改）下，进入后打开终端，输入以下命令进行安装：

解压tar-zxvffftw-3.1.2.tar.gz

进入安装包cdfftw-3.1.2

检查环境并指定安装目录./configure--prefix=/home/film/soft/fftwGCC=ifortF77=ifort--enable-mpi，安装路径可以更改。

进行编译make

编译安装makeinstallall

到此，fftw-3.1.2安装成功。

四安装VASP库

进入事先指定的目录/home/film/yanghua/vasp（目录可以更改）下，进入后打开终端，输入以下命令进行安装：

解压tar-zxvfvasp.5.lib.tar.gz

进入安装包cdvasp.5.lib

显示安装包中文件ls

更改文件名字cpmake.linux_ifort_P4makefile

新生成makefile，打开进行修改，将FC=ifc修改为FC=ifort，保存退出。

进行编译make。

五VASP串行编译

进入指定目录/home/film/yanghua/vasp（目录可以更改）下，进入后打开终端，输入以下命令进行安装：

解压tar-zxvfvasp.5.2.tar.gz

进入安装包cdtar-zxvfvasp.5.2

显示安装包中文件ls

更改文件名字cpmake.linux_ifort_P4makefile

将/home/film/yanghua/fftw-3.1.2/api/fftw3.f拷贝到解压后的VASP安装源代码文件夹下（/home/film/yanghua/vasp/vasp.5.2）。

修改makefile文件。

如下所示，如何更改见红色标记。

#allCPPprocessedfortranfileshavetheextension.f90

SUFFIX=.f90

#-----------------------------------------------------------------------

#fortrancompilerandlinker

#-----------------------------------------------------------------------

FC=ifort

#fortranlinker

FCL=$（FC）

#-----------------------------------------------------------------------

#mkl.10.0

#set-DRPROMU_DGEMV-DRACCMU_DGEMVintheCPPlines

#BLAS=-L/opt/intel/mkl100/lib/em64t-lmkl-lpthread

BLAS=-L/opt/intel/composerxe-2011.4.191/mkl/lib/intel64-lmkl_intel_lp64-lmkl_core-lmkl_sequential-lpthread

#evenfasterforVASPKazushigeGoto'sBLAS

#http:

//www.cs.utexas.edu/users/kgoto/signup_first.html

#parallelgotoversionrequiressometimes-libverbs

#BLAS=/opt/libs/libgoto/libgoto.so

#LAPACK,simplestusevasp.5.lib/lapack_double

#LAPACK=../vasp.5.lib/lapack_double.o

#usethemklIntellapack

LAPACK=-L/opt/intel/composerxe-2011.4.191/mkl/lib/intel64-lmkl_intel_lp64-lmkl_core-lmkl_sequential-lpthread

#-----------------------------------------------------------------------

#fftlibraries:

#VASP.5.2canusefftw.3.1.X（http:

//www.fftw.org）

#sincethisversionisfasteronP4machines,werecommendtouseit

#FFT3D=fft3dfurth.offt3dlib.o

#alternatively:

fftw.3.1.Xisslighlyfasterandshouldbeusedifavailable

FFT3D=fftw3d.offt3dlib.o/home/film/soft/fftw/lib/libfftw3.a

然后保存退出，输入命令：

make。

make之后会在文件夹/home/film/yanghua/vasp/vasp.5.2生成一个二进制文件vasp。

将vasp二进制文件复制到/bin/输入cpvasp/bin/（在超级用户下完成）。

六MPI（mpich2-1.0.8）安装

进入进入指定目录/home/film/yanghua/mpich2（目录可以更改）下，进入后打开终端，输入以下命令进行安装：

解压tar-zxvfmpich2-1.0.8.tar.gz

进入安装包cdmpich2-1.0.8

输入命令exportF90=ifortFC=ifort

检查环境指定目录./configure--prefix=/home/film/soft/mpich2/--enable-f90--enable-f77

进行编译make

编译安装makeinstallall

修改环境变量vi~/.bashrc，加入以下两句

exportPATH=/home/film/soft/mpich2/bin/:

$PATH

exportLD_LIBRARY_PATH=/home/soft/mpich2/lib/:

$LD_LIBRARY_PATH

ulimit-sunlimited

保存source~/.bashrc。

输入mpd&之后会出现这样的提示：

configurationfile/shared/home/kwanous/.mpd.confnotfound

Afilenamed.mpd.conffilemustbepresentintheuser'shome

directory（/etc/mpd.confifroot）withreadandwriteaccess

onlyfortheuser,andmustcontainatleastalinewith:

MPD_SECRETWORD=

Onewaytosafelycreatethisfileistodothefollowing:

cd$HOME

touch.mpd.conf

chmod600.mpd.conf

andthenuseaneditortoinsertalinelike

MPD_SECRETWORD=mr45-j9z

intothefile.（Ofcourseusesomeothersecretwordthanmr45-j9z.）

就按提示操作，输入命令：

cd$HOME

to