设备参考技术参数.docx
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设备参考技术参数.docx
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设备参考技术参数
第一包:
参考数据库及样本管理设备
项目名称
数量
参数
人类遗传突变数据库
1
一、数据类型:
文献已经报道的与人类遗传疾病相关的遗传突变数据,包括近3年数据
二、技术参数:
突变数据量>190000条
基因数量>7000
HGVS>170000个
mRNA剪切突变>17000个
三、资质要求:
1、投标人需从事高通量测序相关业务不低于5年,需自主拥有不少于5台二代测序平台并提供平台证明材料;
2、具有多组学平台和联合分析能力;
3、具有ISO9001质量管理体系认证证书;
4、具有优良项目工作环境,如风淋系统;
5、近5年投标人的服务对象在高影响因子期刊上以第一作者(或通讯作者)发表论著,并提供支撑材料。
肿瘤组学数据库
1
一、数据类型:
恶性肿瘤病人组织和体液样本的组学数据以及病人临床预后等表型信息。
二、技术参数:
1、宏转录组数据要求:
1)每个样品分别建库测序,采用宏转录组的建库方式;
2)样品每个产生不低于10G的cleandata;
3)Q20>90,Q30≥80%;
4)碱基类型分布均匀且无分离现象;
5)信息分析要求:
原始数据统计,序列拼接组装,基因预测,物种分类学注释,功能注释等;
6)项目完成周期不超过60个工作日。
2、宏蛋白组数据要求:
1)鉴定的蛋白质数目需在500-1000之间,通常情况下,差异蛋白质数目占总蛋白质数目的5%-15%,谱图3W-20W,谱图利用率20%-50%;
2)信息分析要求:
蛋白质表达差异分析、差异蛋白功能注释;
3)项目完成周期不超过40个工作日。
3、宏代谢组数据要求:
1)数据来源:
非靶向代谢组学,LC-MS法测定;
2)分析要求:
多元统计分析(PCA分析,偏最小二乘法-判别分析,正交偏最小二乘法-判别分析)、差异代谢物筛选、代谢通路分析.
三、资质要求:
1、投标人需从事高通量测序相关业务不低于5年,需自主拥有不少于5台二代测序平台并提供平台证明材料;
2、具有多组学平台和联合分析能力;
3、具有ISO9001质量管理体系认证证书;
4、具有优良项目工作环境,如风淋系统;
5、近5年投标人的服务对象在高影响因子期刊上以第一作者(或通讯作者)发表论著,并提供支撑材料。
人类复杂疾病相关的微生物组学数据库
1
一、数据类型:
人类复杂疾病相关的人体样本如粪便,血液,皮肤和唾液等微生物组的组学数据。
二、技术参数:
1、每个样品分别建库测序,采用宏转录组的建库方式;
2、唾液样品每个产生不低于10G的cleandata;
3、Q20>90,Q30≥80%;
4、碱基类型分布均匀且无分离现象;
5、信息分析要求:
原始数据统计,序列拼接组装,基因预测,物种分类学注释,功能注释等;
6、项目完成周期不超过60个工作日。
三、配置参数:
1、投标人需从事高通量测序相关业务不低于5年,需自主拥有不少于5台二代测序平台并提供平台证明材料;
2、具有多组学平台和联合分析能力;
3、具有ISO9001质量管理体系认证证书;
4、具有优良项目工作环境,如风淋系统;
5、近5年投标人的服务对象在高影响因子期刊上以第一作者(或通讯作者)发表论著,并提供支撑材料。
小分子化合物数据库
1
一、技术参数:
1.小分子化合物数量2000万个以上;
2.包含3000种以上具有生物活性的化合物;
3.可用于高通量筛选(HTS)和高内涵筛选(HCS);
4.包含的子化合物库大于20个,可用于GPCR、激酶、抗癌、表观遗传学、干细胞等研究领域;
5.靶点要求涵盖PI3K、NMDA、InfluenzaVirus、EGFR、CXCR等;
6.能够提供独有的临床阶段化合物库和最新的在研临床小分子化合物
样本存储和管理设备
1
一、技术参数:
1.压缩机功率(W):
1HP×2
2.箱内温度(℃):
-10~-86
3.外部尺寸(W×D×H)(mm):
1000×890×1960
4.内部尺寸(W×D×H)(mm):
760×630×1300
5.有效容积(L):
626,立式
6.搁架/内门(板):
3/2
7.单位存储数量:
20
二、配置参数:
包含20个五层四列,130*130*52mm的生物样本存储归类装置
第二包:
高性能并行计算和大数据分析系统参考技术参数
项目名称
数量
配置和参数
管理节点
1
国产品牌;
2U机架式服务器,配置安装导轨
配置2颗IntelXeonProcessorE5-2609V48C/8T1.7GHz20M6.4GT/s85W;
配置2根16GB/DDR4/2133/MHz/ECC/REG/2RANK;不少于24DIMM内存插槽,支持2133MHzDDR4的RDIMM内存.
配置3块600GB/SAS/10000RPM/2.5寸/企业级;支持8个3.5”/2.5”SATA/SAS/SSD硬盘,可内置两个2.5”SATA/SAS/SSD硬盘,最大支持存储容量52TB。
支持SATARAID0、1、10、5,
配置一张LR282A2/8口/SAS6GB/512MB/半高/SFF8087/PCLE2.0*8;可选缓存掉电保护;
1张Mellanox/56GB/40GB/单口IB卡/主要用于56GB交换网络/HCA卡
1张16Gb/PCI-E双口/光纤HBA卡;
配置指纹安全加密认证系统,开机密码保护,提高服务器管理安全性保护级别;
DVD/RW/SATA薄、2U550W1+1 冗余电源;
提供6个PCI-E扩展插槽(3PCI-E3.0x8,1PCI-E3.0x4(in*8),1PCI-E3.0x16,1PCI-E2.0x4(in*8))
2端口Inteli210千兆网卡支持I/OAT、负载均衡、链路汇聚、绑定冗余等特性,可选配外接千兆及万兆网卡
集成ASPEEDAST2400
支持前置LCD屏,动态显示LOGO、固定资产号、操作系统、IP、电源,整机温度、RAID级别和硬盘运行状态等
支持基于国际标准IPMI2.0协议基础设计的PLNM服务器管理功能,通常的功能和监控功能包括服务器关键硬件组件监控、散热风扇速度、温度、指引灯诊断、电压
标配远程管理控制端口,可实现与操作系统无关的远程对服务器的完全控制,功能包括:
1、虚拟电源可远程开机、重启、关机;
2、更新Firmware;支持远程故障现象重现;
3、虚拟控制台可远程监控图形界面,可远程从本地软盘和光盘或其影像启动安装、操作Windows,Linux等软件(虚拟软驱、虚拟光驱、虚拟目录和虚拟U盘);
4:
主板集成iBMC,可实现远程iKVM;
WindowsServer2008R2SP1
WindowsServer2012R2
RedHat*EnterpriseAdvancedServer6.5
SuseLinuxEnterpriseServer11SP3
中标麒麟高级服务器操作系统V6.0Update5
Ubuntu14.04
VMwareESXi5.5
原厂商3年有限保修及上门服务,原厂5年7*24小时电话支持服务
提供原厂售后服务承诺函和对此项目的授权函原件;提供国家节能认证证书;
普通计算节点
2
国产品牌
2U机架式服务器,四节点,配置安装导轨
配置8颗IntelXeonProcessorE5-2697AV416C/32T2.6GHz40M9.6GT/s145W;
配置32根32GB/DDR4/2133MHz/ECC/REG/2RANK每个节点至少16DIMM插槽,每台至少64DIMM插槽;支持2400MHzDDR4的RDIMM内存。
每个节点支持至少3个3.5”/2.5”SATA/SAS/SSD硬盘,最大支持存储容量24TB。
可选支持RAID0、1、10、5、50、6、60等,可选RAID1GB/2G/4GCache,可选缓存掉电保护
每个节点提供至少1个PCI-E16扩展槽,支持半高设备扩展
集成2个Inteli350千兆GE网口;配置4个56GBFDRInfiniBand接口。
USB接口光驱、软驱仿真U盘
标配2000W(1+1)钛金冗余电源,96%的效率,220VAC,支持270V高压直流。
如需支持-48V
支持IPMI2.0,对外提供4个1000MbpsRJ45管理网口,集成iKVM,支持远程管理
标配远程管理控制端口,可实现与操作系统无关的远程对服务器的完全控制,功能包括:
1、虚拟电源可远程开机、重启、关机;
2、更新Firmware;支持远程故障现象重现;
3、虚拟控制台可远程监控图形界面,可远程从本地软盘和光盘或其影像启动安装、操作Windows,Linux等软件(虚拟软驱、虚拟光驱、虚拟目录和虚拟U盘);
4:
主板集成iBMC,可实现远程iKVM;
WindowsServer2008R2SP1
WindowsServer2012R2
RedHat*EnterpriseAdvancedServer6.5
SuseLinuxEnterpriseServer11SP3
中标麒麟高级服务器操作系统V6.0Update5
Ubuntu14.04
VMwareESXi5.5
原厂商3年有限保修及上门服务,原厂5年7*24小时电话支持服务
提供原厂售后服务承诺函和对此项目的授权函原件;提供国家节能认证证书;
胖节点带GPU运算
1
国产品牌
标准2U机架式服务器,配置安装导轨;
配置2颗IntelXeonProcessorE5-2697AV416C/32T2.6GHz40M9.6GT/s145W
配置16根32GB/DDR4/2133MHz/ECC/REG/2RANK;内存插槽数不少于24DIMM;
配置2块Intel/SSD/DC/S3500/Series/(300GB/2.5in/SATA/6Gb/s/20nm/MLC);
默认支持8个2.5”SATA/SAS/SSD硬盘,最大支持存储容量16TB,配置支持4个NVMESSD,后置2个2.5”SATA/SAS/SSD硬盘
支持3种硬盘可选配置
•可选8个3.5”/2.5”SAS/SATA/SSD硬盘,最高存储容量48TB;
•可选16个2.5”SAS/SATA/SSD硬盘,最高存储容量32TB;
•可选24个2.5”SAS/SATA/SSD硬盘,最高存储容量为48TB;
配置1块NVIDIA/TESLA/K80/4992C/24GB/KEPLER/GP;
配置1张Mellanox/56GB/40GB/单口IB卡/主要用于56GB交换网络/HCA卡
提供8个PCI-E3.0扩展插槽,4*全高PCI-E3.0x8(in*16),2*全高PCI-E3.0x8,1*半高PCI-E3.0x8,1*半高PCI-E3.0x4(in*8);可选2*全高PCI-E3.0x16,2*全高PCI-E3.0x8,1*半高PCI-E3.0x8,1*半高PCI-E3.0x4(in*8)。
可选支持2GPU协同工作;
2端口Inteli350千兆网卡支持I/OAT、负载均衡、链路汇聚、绑定冗余等特性,可选配千兆及万兆网卡模块;6个热插拔冗余风扇
集成MatroxG200e
配置1100W(1+1)白金冗余AC电源模块;可改配750W金牌DC冗余电源模块
支持IPMI2.0,对外提供1个100/1000MbpsRJ45管理网口,可选iKVM远程管理模块
标配远程管理控制端口,可实现与操作系统无关的远程对服务器的完全控制,功能包括:
1、虚拟电源可远程开机、重启、关机;
2、更新Firmware;支持远程故障现象重现;
3、虚拟控制台可远程监控图形界面,可远程从本地软盘和光盘或其影像启动安装、操作Windows,Linux等软件(虚拟软驱、虚拟光驱、虚拟目录和虚拟U盘);(须加key)
4:
主板集成iBMC,可实现远程iKVM;
前面板上配备有液晶屏,可显示默认或定制信息,包括IP地址、服务器名称、支持服务编号等。
如果系统发生故障,该液晶屏上将显示关于故障的具体信息;
WindowsServer2008R2SP1
WindowsServer2012R2
RedHat*EnterpriseAdvancedServer6.5
SuseLinuxEnterpriseServer11SP3
中标麒麟高级服务器操作系统V6.0Update5
Ubuntu14.04
VMwareESXi5.5
原厂商3年有限保修及上门服务,原厂5年7*24小时电话支持服务
提供原厂售后服务承诺函和对此项目的授权函;提供国家节能认证证书;
存储节点
1
国产品牌,服务器存储统一品牌,存储容量≥192T
3U16盘位,标准19寸机柜,免工具导轨;
NAS/SAN统一存储,支持FC-SAN、IP-SAN、SAS接口统一存储,满足客户混合存储网络需求,存储与扩展柜,硬盘采用12GSAS连接
存储支持服务器虚拟化,利用存储多余的计算资源,虚拟服务器,在存储上安装操作系统和客户应用程序,减少客户服务器需求
支持存储两地双活功能,(非远程卷复制功能),服务器对A、B两地的存储支持双写操作,保证写到A、B两地存储的数据是完全一致的,当A、B两地任何一台存储故障、火灾、掉电时候,系统能自动实现秒级切换
服务器,存储统一品牌,以便于管理和维护
高性能的冗余双控全闪存阵列;专业的冗余存储控制器架构,每控制器含独立的IO处理器,支持Active-Active模式,支持任何一个控制器故障,不影响系统运行,保证数据不丢失,实测热插拔控制器实现“0数据丢掉,0秒业务中断”。
,
面向极端的高IOPS业务,存储系统需满足100万IOPS的性能要求
磁盘阵列控制器,硬盘,电源,风扇均可进行热插拔;配置冗余电源,风扇、控制器
支持独立的内存系统,非操作系统共享,专用于存储IO处理;配置64G缓存,最大支持512G;
配置超级电容或锂电池+Flash,当外部电源断电时,将缓存数据写入到闪存中永久存储,确保数据安全;配置超级电容时支持高温、高压、高寒,抗暴等极端环境下,保证缓存数据不丢失;
标配4个千兆iSCSI;系统自带的主机接口模块在8GFC,16GFC,10GSFP+,10GFCoE环境下,可以通过软件自定义光传输协议,实现10G,8G,16G自由选择和定义;
最大支持
16*8GFC
8*16GFC
8*6G/12GSAS
16*10GSFP+/RJ45
本次配置4个千兆iSCSI,4个16GFC;
支持不少于4*4*12GMiniSAS扩展接口;
支持的平台:
WINDOWS、Linux及主流的UNIX(AIX,HP-UNIX、Solaris),VMWare/Hyper-V等
最大支持2048个主机
最大支持4096个分区
最大支持640块硬盘,支持SATA/SAS/SSD硬盘;
配置32块6TB/SAS/12GB/128M/7200RPM/3.5寸/企业级
配置1个GSJ6316-R扩展箱/3U/16盘位3.5寸盘/四IO扩展通道/冗余电源/冗余风扇
支持SAS接口,SATA接口SSD硬盘
支持73G/146G/300G/450G/600G15000转SAS6G硬盘
支持500G/1T/2T/3T/4T/6T/8T7200转企业级SATA硬盘
支持SATA/SAS接口的MLC、EMLC、SLC固态硬盘
支持加密硬盘,硬盘拔出之后,外面服务器无法正常读写内容
支持SATA/SAS/SSD硬盘同时混插使用;
支持硬盘在磁盘主机以及扩展柜内随意拔插,更换位置
支持对任意一块硬盘进行克隆
支持本地RAID热备盘,机框热备盘,全局热备盘
支持RAID级别:
RAID0,1,4,5,50及各种RAID级别混合;支持全局热备盘及单一RAID组热备盘
完全LD(逻辑驱动器)、LV(逻辑卷)在线容量扩展,支持在线RAID级别变更
配置快照、卷镜像、卷复制功能
配置自动精简配置;可以保障客户划分大的分区空间大于实际空间
配置缓存加速,通过SSD缓存加速功能提升机械硬盘的IOPS
支持4级分级存储,针对不同的业务模型,配置不同的分级,提高系统的性能
支持针对不同的业务,支持缓存分区,避免偶发业务冲击重要业务
支持异地数据远程复制容灾
集中式的WEB管理、命令行管理
原厂商3年有限保修及上门服务,原厂5年7*24小时电话支持服务
提供原厂售后服务承诺函和对此项目的授权函;提供国家节能认证证书;
网络设备
1
千兆三层以太网交换机/48千兆电口
IB交换机
1
Mellanox/MSX6025F/36口/56Gb/IB交换机,2米IB线15根
集群软件
1
概述:
拥有软件著作权的商业版本集群管理软件
提供:
高性能计算平台支持软件产品登记证书、软件企业认定证书和IOS9001认证
采用模块化设计,包含集群管理、作业调度、web门户、计费、报表等功能;各模块可单独安装自由组合,并可设置各模块的用户访问权限。
软件界面必须拥有中文和英文界面,支持浏览器自适应并提供一键切换
提供本次项目所有节点授权
在国内设有研发机构,能根据用户的需求或使用习惯进行定制化开发
操作系统:
支持基于最新版的64位企业级Linux内核操作系统
集群管理:
提供云服务器配置中心管理平台软件著作权登记证书;
可通过WEB界面实现集群系统的统一管理
支持通过web界面统一管理系统用户,支持LDAP或NIS后台,支持与外部LDAP服务器或WindowsAD域控集成
支持用户分级授权管理,系统管理员和普通用户提供不同权限的访问,支持用户(组)的磁盘配额和资源使用限额管理,控制用户权限
集中管理集群系统的配置文件。
允许在界面上对单机或批量节点进行操作,包括:
远程开机、关机、重启、删除节点、允许节点提交作业、拒绝节点提交作业、执行并行命令等操作。
提供远程批量开关机管理,提供“拒绝提交作业”选项,避免管理员关机瞬间有作业已经运行在该节点上的可能性;
支持集群节点角色管理和转换。
集成SSH和VNC图形访问功能。
在WEB界面集成图形化的文件管理,支持文件的:
浏览、新建、在线编辑、压缩、解压、上传、下载等操作。
可集中管理系统的IP、主机名等信息。
支持管理节点高可用(HA)。
支持用户登录控制,禁止绕开作业调度系统提交作业
集群监控:
提供云服务器在线监控平台系统软件著作权登记证书;可直观的集群物理拓扑视图,支持以机柜为基础的集群物理拓扑方式,显示节点的闲忙状态和节点温度
从集群节点性能视图中用户可通过图形方式,监控当前节点各部件的状态,包括CPU平均使用率、内存使用率、磁盘剩余量等
从集群总体网络视图中用户可以一目了然的查看集群整体网络运行情况,包括总体网络吞吐率、单节点网络吞吐率等,支持以太网和InfiniBand网络;支持并行文件系统的监控:
如Lustre文件系统的空间、使用率和流量等信息;
支持以拓扑图展现方式监控集群网络拓扑和交换机端口信息、流量信息
支持告警设置:
可设置CPU温度、CPU使用率、内存使用率、硬盘使用率、1/5/15分钟平均负载、网络接收/发送字节数等参数的报警阈值
作业报表及计费:
提供日志管理系统软件和云服务器充值计费管理平台软件著作权登记证书;针对集群提供计算资源(包括CPU利用率、内存、存储资源、网络资源等)的统计报表,提供小时报、日报、月报和年报表。
采用主流的作业调度软件
提供WEB门户,要求提供基于WEB界面的:
调度系统设置、队列设置、权限设置、作业提交、报表功能
支持常用高性能计算软件的应用模板,支持用户通过界面自定义应用模板,可拖拽式编辑。
支持WEB界面的作业查询、删除、挂起和释放等操作,可以根据作业ID,作业名,用户名,状态,和队列排序
提供主流的调度策略:
公平竞争,QoS、抢占,轮循,回填,资源预留等
支持任务配额管理:
可为用户/组配置最大作业数、最大处理器数、内存和硬盘等限制
支持CPU/GPU/MIC统一调度,支持异构机群作业调度
支持多种作业提交方式:
支持命令行、WEB界面、应用软件集成界面、作业脚本和可执行文件等。
支持WEB门户和应用模板的二次开发。
集群系统软件:
并行命令软件;作业调度系统(Maui/Torque);
编译开发环境:
GNUC/C++编译器;GNUFortran77/90编译器;GNUDebugger;
并行环境:
OpenMPI(支持Infiniband和万兆以太网的MPI环境);MVAPICH(支持万兆以太网的MPI环境);MPICH/LAM-MPI(支持万兆以太网的MPI环境);PVM;LAPACK/ScaLAPACK;BLAS、GOTO、Atlas,FFTW;
Intel集群工具:
Intel®C++Compiler;Intel®FortranCompiler;Intel®MathKernelLibrary;Intel®MPILibrary
机柜
2
施耐德AR2400,2个8口AP6201ch
工业空调
2
室外机:
RNQ205AAY;室内机:
FNVQ205AAKD。
每台铜管需30米左右。
技术参数:
FNVQ205AAKD技术参数和功能:
12KW、5P工业空调。
电源:
380V,50HZ,三相;制冷量:
12.3KW;制热量:
14.0KW,送风量:
29立方米/分钟;运转音:
≤48分贝;标准机外静压:
20帕;压缩机:
涡旋式;室内外机最大配管长:
50m;
停电再起动功能:
遇到停电的场合,无论多久,一旦电力恢复,空调机即以停电前模式恢复运转;电压变动对应机能:
+10%到―22%范围内正常运转,但电压低于-22%时,空调机会自动保护停机。
当电压恢复到-22%以上时,自动恢复运转;室外机耐腐蚀处理:
耐腐蚀处理热交换翅片,抵御酸雨,盐分的侵蚀,延长机器寿命;长配管设计:
冷媒配管最长可达50米,最大高低差可达30米;全年制冷:
室外温度即使降到-5度,也能制冷;长效过滤网:
采用长效过滤网设计,只需每年清洗一次,大大减少无人机房维护量(尘埃浓度基准:
0.15mg/㎡);该类型空调的特点为:
它通过改造,可实现空调的远程控制与操作,通过RS232C/485标准数字接口实现对空调的遥信,遥测和遥控。
而大金空调的顶尖品质和性能确保空调设备能够长期可靠运行;监控功能:
1)远距离监测,可监视每台空调的运转状态及设定温度等;2)远距离控制,可远距离开、关机,可远距离控制设定状态及设定温度;3)故障自动报警,当远程机房空调发生故障时,会自动向监控中心报警,显示故障代码,使故障解决更有效及时;4)主备机切换功能,可设定主备机的定时切换,可设定故障时主备机自动切换;5)遥控器直接设定,可用于空调遥控器设定通讯方式(RS232或RS485)信息通报形式,调制调解器,定时发报时刻,空调机地址;6)易于编程的通讯协议,采用信息产业部的通信协议格式,使系统编程更方便。
UPS电源
1
机架式模块化UPS,主机最大容量为60KVA,此次配置容量30KVA,电池配置满载延时半小时,配
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