RNA转录后的加工与修饰.docx
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RNA转录后的加工与修饰
RNA转录后的加工与修
饰
Documentserialnumber[UU89WT-UU98YT-UU8CB-UUUT-UUT108]
第二节RNA转录后的加工与修饰
不论原核或真核生物的rRNAs都是以更为复杂的初级转录本形式被合成的,然后再加工成为成熟的RNA分子。
然而绝大多数原核生物转录和翻译是同时进行的,随着mRNA开始的DNA上合成,核蛋白体即附着在mRNA上并以其为模板进行蛋白质的合成,因此原核细胞的mRNA并无特殊的转录后加工过程,相反,真核生物转录和翻译在时间和空间上是分天的,刚转录出来的mRNA是分子很大的前体,即核内不均一RNA。
hnRNA分子中大约只有10%的部分转变成成熟的mRNA,其余部分将在转录后的加工过程中被降解掉。
(一)mRNA的加工修饰
原核生物中转录生成的mRNA为多顺反子,即儿个结构基因,利用共同的启动子和共同终止信号经转录生成一条mRNA,所以此mRNA分子编码儿种不同的蛋白质。
例如乳糖操纵子上的Z、Y及A基因,转录生成的mRNA可翻译生成三种酶,即半乳糖昔酶,透过酶和乙酰基转移酶。
原核生物中没有核模,所以转录与翻译是连续进行的,往往转录还未完成,翻译已经开始了,因此原核生物中转录生成的mRNA没有特殊的转录后加工修饰过程。
真核生物转录生成的mRNA为单顺反子,即一个mRNA分子只为一种蛋白质分子编码。
真核生物mRNA的加工修饰,主要包括对5'端和3'端的修饰以及对中间部分进行剪接。
1.在5'端加帽
成熟的真核生物mRNA,其结构的5'端都有一个m7G-PPNmN结构,该结构被称为甲基鸟昔的帽子。
如图17-9所示。
鸟昔通过5'-5'焦磷酸键与初级转录物的5'端相连。
当鸟昔上第7位碳原子被甲基化形成m7G-PPNmN时,此时形成的帽子被称为“帽0”,如果附m7G-PPNmN外,这个核糖的第“2”号碳上也甲基化,形成m7G-PPNm,称为“帽1”,如果5'末端N1和N2中的两个核糖均甲基化,成为m7G-PPNmPNm2,称为
“帽2”。
从真核生物帽子结构形成的复杂可以看出,生物进化程度越高,其帽子结构越复杂。
图17-9Post-transcriptionalmodificationofmRNashowingthe
7~methy1guanosinecapandpoly-Atail.
真核生物mRNA5'端帽子结构的重要性在于它是mRNa做为翻译起始的必要的结构,对核糖体对mRNA的识别提供了信号,这种帽子结构还可能增加mRNA的稳定性,保护mRNa免遭5'外切核酸酶的攻击。
2.在3'端加尾
大多数的真核mRNA都有3'端的多聚尾巴(A),多聚(A)尾巴大约为200bpo
多聚(A)屠巴不是由DNA编码的,而是转录后在核内加上去的。
受polyA聚合酶催化,该酶能识别,mRNa的游离3'-0H端,并加上约200个A残基。
多核昔酸+nATP—"必成“以■多核甘酸<A)n+oPPi
近年来己知,在大多数真核基因的3'—端有一个AATAA序列,这个序列是mRNa3'-端加polyA尾的信号。
靠核酸酶在此信号下游10-15碱基外切断磷酸二酯键,在polyA聚合酶催化下,在3'-0H±逐一引入100-200个A碱基。
关于polyA尾巴的功能问题尽管经过极其广泛的探索,但还不完全清楚。
有人推测polyA可能与mRNA从细胞核转送到细胞质有关,但是相当数量,的没有polyA屠巴的mRNA如组蛋白mRNA,也照样通过核膜进入细胞质。
还有人认为这种结构对真核mRNA的翻译效率具有某种作用,并能稳定mRNA结构,保持一定的生物半衰期。
前体(hnRNA)的拼接
原核生物的结构基因是连续编码序列,而真核生物基因往往是断裂基因,即编码一个蛋白质分子的核昔酸丿宇列被多个插入片断所隔开,一个真核生物结构基因中内含子的数量,往往与这个基因的大小有关,例如胰岛素是一个很小的蛋白质,它结构基因只有两个内含子,而有些很大的蛋白质,它的结构基因中可以有儿十个内含子。
经过复杂的过程后,切去内元,将有编码意义的核昔酸片段(Extron外元也叫外显子)连接起来(图17-10)。
(a)Iniivns
Primirytranscript.・・・八“
于cap|Edu[IExonfIEjtonJAAAAAA(A)n
Splicing
®mRNA
5Fp[Exon]Exxm]ExonlAAAAAA(A)n
Tnuslation|
Protein
图17-10Primarypolymeraselltranscriptofaeukaryotegene
showing(a)intronsaftercappingandadditionofpolyA
tail,(b)ExcisionofintronstoformthematuremRNAiscalled
splicing・
真核生物的结构的基因中具有可表达活性的外显子,也含有无表达
活性的内含子,但内含子序列下是无意义的,越來越多的实验证明有许
多基因中的内含子参与基因表达调控,在转录时,外显子及内含子均转录到hnRNA中。
在细胞核中hnRNA进行剪接作用,首先在核酸内切酶作用下剪切掉内含子;然后在连接酶作用下,将外显子各部分连接起来,而变为成熟的mRNA,这就是剪接作用,也有少数基因的hnRNA不需进行剪接作用,例如a-干扰素基因,图17-11以卵清蛋白基因为例,介绍一个典型的转录及加工过程。
1234
fCT飞HI
剪按中间体
剪接去除2个内含子
图17-11卵清蛋白基因转录及加工过程
图中外显示以1、2、3、4……表示,内含子以A、B、C、D…表示
mRNA的拼接,需要在拼接部位有供拼接识别的保守性强的一致顺
序,通过对100多种真核细胞基因的分析,发现外元和内元拼接部位部
分碱基顺序有一定的规律(见表17-4)o
表17-4含有内元的转录产物其拼接处的碱基顺序
基因区域
Exon
Intron
Exon
卵清蛋白内元2
UAAGGUGA
ACAGGUUG
卵清蛋白内元3
UCAGGUAC
UCAGUCUG
B-珠蛋白内元1
GCAGGUUG
UCAGGCUG
B-珠蛋白内元2
CAGGGUGA
ACAGUCUC
Ig入内含子1
UCAGGUCA
GCAGGGGC
SV40病毒早期T抗原
UAAGGUAA
UUAGAUUC
表中划线的碱基对拼接识别有重要作用,如将兔的B-珠蛋白的拼接部位的GT改为AT后,拼接反应即受到影响。
mRNA前体拼机制
masurvmRNAtotedcwnsequenos)
图17-12TheRNAsplicingsplicingiscatalyzedbya
spliceosomeformedfromtheassemblyofUl,U2,U5,andsn
RNPs(shownasgreencircles)plusothercomponents(not
shown)・Afterassemblyofthespliceosome,thereactionoccures
intwospeps:
instepIthebranch-pointAnucleotideinthe
intronsequence,whichislocatedcolsetothe3’splice
site,attacksthe5’splicesiteandcleavesit;thecut5’endof
theintronsequencetherebybecomescovalentlylinkedtothisA
nucleotide,formingthebranchednucleotideshowninFigure
step2the3’一OHendofthefirstexonsequence,whichwas
createdinthefirststep,addstothebeginningofthesecond
exonsequence,cleqvingtheRNAmoleculeatthe3'splice
site:
thetwoexonsequencesaretherebyjoinedtoeachother
andtheintronsequenceisreleasedadasplicingreactions
occurimthenucleusandgengeratemRNamoleculesfromprimary
RNAtranscripts(mRNAprecursormolecules)・
mRNA拼接反应需要有核内小分子RNA参与它们与蛋白质形成的复合物称为小核糖核蛋白颗粒,SnRNA分别被命名为Ul,U2,U3,U4,U5,和U6RNAoSnRNA中的U2RNA由与内元右端拼接部位附近的UACUAA顺序高度互补,形成一个环状结构,由特定的酶来识别切除该环状结构,完成拼接过程,如图17-12所示。
1OH
Exon1pGUAAGpExon2
二■—-—寸
PnniafyRNAtranscript
mRNAExcisedintror
图17-13MechanimofmRNathat,forclarity,theprocessisshownintwostages:
energyisnotrequiredfortheprocesssincetransesterificationreactionsareinvolved.
真核生物mRNA前体在剪接过程中,还可以形成套索样的结构,在内含子序列中常有一个分支部位的腺昔酸残基,它的2'-0H可以自动攻击内含子5'端与外显子1连接的磷酸二酯键,切开了外噗子1,而腺昔酸原来已有3',5'--磷酸二酯键相连的两个相邻的核昔酸残基,加上此3',5'-磷酸二酯键连接后,在腺昔酸处出现了一个套索,已被切下的外显子1的3'-0H攻击内含子3'末端与外显子2之间的3',5'-磷酸二酯键,键断裂后,内含子以套索的形式被节下来,此时外显子1和外显子2可以连接起来(图17-13)o
不论拼接过程如何,拼接必须极为精确,否则会导致遗传信息传递障碍,合成的蛋白质可能丧失其正常的功能。
我国南方广大地区是B-地中海贫血的高发区,这是由于B-珠蛋白链的合成受到部分或完全抑制所引起的一种血红蛋白病。
实验表明B-珠蛋白基因元1中核昔酸的点突变改变了正常拼接部位的碱基顺序,结果造成错误部位的拼接。
加工成熟的mRNA虽能翻译,但产物不是正常的B-珠蛋白,结果引起血红蛋白级结构和功能的改变。
(二)rRNA转录后加工
原核生物rRNA转录后加工,包括以下儿方面:
①rRNA前体被大肠杆菌RNaselH,RNaseE等剪切成一定链长的rRNA分子;②rRNA在修饰酶催化下进行碱基修饰;③rRNA与蛋白质结合形成核糖体的大、小亚基(见图17-14)
图17-14大肠杆菌rRNA前体的加工
真核生物rRNA前体比原核生物大,哺乳动物的初级转录产物为
45s,低等真核生物的rRNA前体为38s,真核生物5sRNA前体独立于其他
三种rRNA的基因转录(图17-15)。
图17-15真核生物rRNA前体的加匸
真核生物rRNA前体中含有插入顺序,rRNA前体要形成成熟的
rRNA,需要经过拼接反应。
例如,四膜虫的rRNA前体的拼接是一种无酶催化的白动拼接过程。
四膜虫基因组内,26srRNA编码的区域内有413bp的插入顺序。
该插放序列可以不消耗能量从rRNA前体中被除掉。
用SDS煮沸和用蛋白酶外理等破坏酶活性办法,都不能破坏拼接活性,但反应中Mg2+和鸟瞟吟核甘酸是必在的。
用32P-GTP进行追踪实验表明,起始过程是GTP在插入顺序5'端发生亲核反应,同时GMP与5'端切点的切除段形成磷酸二酯键并使原RNA断开。
第二步是5'切点的外元3'-OH与3'切点的外元5'-P共价连接,获得成熟的rRNA,被切除部分最后
环化,形成一个环状结构,同时从5'端去掉一个15核昔酸□卒片。
剩余
部分连接成399核甘酸的环状产物,再经过儿步,最后切下一个19个核
昔酸的线性内含子序列即L-19,它具有催化活性,上面的剪接作用,是
开环
y—r+$
L19RNA
由内含子本身的催化性质决定的(图17-16)o
y
外显子I外显子2
.】5
+—■G
d亠O414W
开环]
5'T
图17-16四膜虫rRNA前体的白我剪接
这种rRNA的自身剪接反应给人们一个提示:
即RNA分子也有酶的催化活性。
这向酶的化学本质是蛋白质这一传统概念提出了挑战。
这种有酶催化活性的RNA分子命名为Ribozymeo和各自分别发现RNA具有催化作用,他们的发现对于了解生命进行过程有重要意义。
很可能在原始生命中,RNA所催化的断裂一连接反应是最早出现的催化过程。
为此,他们共同获得了1989年Nobel化学奖。
从大多数Ribozymw的结构中发现一些特征,例如:
锤头状结构的RNA分子有13个保守的核昔酸序列,如果它们中的碱基改变会使这种催化活性失去作用。
根据这种特片,科学家们在体外没计并人工合成这种
RNA分子,用于抗肿瘤及抗病毒的实验中(图17-17)o
图17-17锤头结构模式图
(三)tRNA转录后的加工修饰
原核生物和真核生物刚转录生成的tRNA前体一般无生物活性,需要
进行①剪切和拼接②碱基修饰③3'-0H连接-ACC结构(图17-18)o
图17-18tRNA前体的加工
©tRNA前体在tRNA剪切酶的作用下,切成一定在小的tRNA分子。
大肠杆菌RNaseP可特异剪切tRNA前体的5'旁顺序,因此,该酶被称为tRNA5'成熟酶。
除了RNaseP外,tRNA前体的剪切尚需要一个3'-核酸内切酶,这可将tRNA前体3'端的一段核昔酸序列切下来。
此外RNaseD是tRNA3'端成熟酶。
近年来的研究表明大肠杆菌RNaseP是一种非常特殊的酶分子,它是由RNA和蛋白质组成,最近发现RNAaseP分子中的RNA部分在某些条件下,可以单独地催化tRNA前体的加工成熟,这个发现和四膜虫tRNA能自我拼接被认为是近十年来生化领域内最令人鼓舞的发现之一。
说明RNA分子确具有酶的催化活性。
经过剪切后的tRNA分子还要在拼接酶作用下,将成熟tRNA分子所需的片段拼起来。
2成熟的tRNA分子中有许多的稀有碱基,因此tRNA在甲基转移酶催化下,某些瞟吟生成甲基瞟吟如A-mA,G-mA。
有些尿咗噪还原为双氢尿喀曉。
尿喀陀核甘转变不假尿陀咙核苜。
某些腺昔酸脱氨基为成为次黄卩票吟核昔酸(I)
33'末端加上CCA:
在核昔酸转移酶作用下,3'—末端除去个别碱基后,换上tRNA分子统一的CCA-OH末端,完成tRNA分子中的氨基酸臂结构。
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