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分子生物学试验技术
第五章分子生物学实验技术
实验21大鼠肝组织DNA的提取及其含量测定
【原理】DNA以核蛋白形式存在于细胞中,制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。
DNA的提取方法较多,根据实验用途可简可繁。
这里介绍一种经济简便不用蛋白酶K提取真核细胞DNA的方法。
在DNA抽提缓冲液中,加入SDS可破坏细胞膜、核膜,并使组织蛋白与DNA分离;加入EDTA可抑制DNase活性,减少DNA降解。
分离出来的DNA用酚/氯仿抽提除去蛋白质,接着用氯仿抽提以除去DNA溶液中微量酚的污染,最后用无水乙醇沉淀DNA。
260nm处DNA有最大吸收峰,利用该原理测DNA的A260,可计算其浓度。
【试剂】
1.生理盐水。
2.TE缓冲液(pH8.0)含10mmol/LTris-HCl(pH8.0),1mmol/LEDTA-Na2(pH8.0),以103.4Kpa高压蒸汽灭菌,4℃贮存。
3.10%SDS固体SDS10g,加双蒸水70ml于42℃水浴溶解,用双蒸水定容至100ml。
4.Tris-HCl饱和重蒸酚(pH8.0)将市售的苯酚置于65℃水浴中溶解,用空气冷凝管进行重蒸馏,当温度升高至183℃时开始收集于数个棕色瓶中(每瓶约200ml),贮存于-20℃可保存数年。
使用前取一瓶重蒸酚于室温放置一段时间后,移至65℃水浴融化(冰箱取出后勿立即放入65℃水浴中,以防玻璃炸裂)。
融化后加8-羟基喹啉至终浓度为0.1%(w/v),溶解混匀,此时溶液呈黄色,小心将酚倒入分液漏斗中。
加入等体积的1mmol/LTris-HCl(pH8.0),立即加盖,剧烈振荡并加入固体Tris摇匀(一般加1g固体Tris/100ml酚)。
静置分层后从分液漏斗中放出下层黄色酚相,弃上层。
将酚重新加至分液漏斗中,加入等体积的含0.2%β-巯基乙醇的0.1mol/LTris-HCl(pH8.0),剧烈振荡,直至酚相pH>7.8,将酚装入棕色试剂瓶中,加入0.1倍酚体积的含0.2%β-巯基乙醇的0.1mol/LTris-HCl(pH8.0)覆盖酚相,置4℃贮存备用。
由于酚重蒸和平衡费时,操作有一定危险,因此也可直接从试剂公司购买Tris-HCl饱和重蒸酚。
5.氯仿/异戊醇(24:
1,v:
v)均为分析纯。
6.10mol/L醋酸铵。
7.无水乙醇(AR)。
8.10mg/mlRNaseA称取RNaseA10mg溶于10mmol/LTris-HCl(pH7.5)、15mmol/LNaCl中,于100℃加热煮沸15min灭活DNase,缓慢冷却至室温,分装成小份保存于-20℃。
如为Sigma公司产品,一般则不需加热煮沸。
【操作步骤】
1.迅速处死大鼠,立即取出肝脏约1g,用冷生理盐水洗去附着的血液,滤纸吸干后放入玻璃匀浆器,加入5ml冷TE缓冲液制备匀浆。
2.取1ml匀浆液倒入小试管中,加入10%SDS溶液0.1ml,颠倒混匀后,室温10min,溶液变粘稠。
3.取饱和酚0.5ml,氯仿:
异戊醇(24:
1)0.5ml,混合后加入上述溶液中,充分混匀,室温放置10min,其间不断摇动保持溶液呈乳状,3000r/min离心10min。
4.小心取出上层水相至小试管中,加入等体积氯仿:
异戊醇(24:
1),混匀,3000r/min,离心5min。
5.小心取出上层水相转移到新试管,加入0.3倍水相体积的10mol/L醋酸铵,2.5倍水相体积的无水乙醇充分混匀,纤维状DNA即从溶液中析出。
6.用吸管小心取出纤维状DNA,转移到1.5ml离心管,3000r/min,离心5min,小心倒去溶液,用滤纸吸干。
7.加1ml蒸馏水和5μl浓度为10mg/ml的RNaseA溶解DNA沉淀,室温放置20min。
如DNA难于溶解,可置于56℃水浴20~30min,并不断摇动,直至溶解。
8.DNA的含量测定:
取0.5mlDNA样品和蒸馏水3.5ml至石英杯中,用蒸馏水调零,在752紫外分光光度计上测A260值和A280值。
【计算】
1.DNA浓度(μg/ml)=A260nm×50×4÷0.5
2.A260nm/A280nm比值
【注意事项】
1.剧烈振荡可使DNA断裂,因此操作中不能用电动振荡器混匀。
2.如要得到高纯度DNA,可加入蛋白酶K降解蛋白质。
3.根据DNA在260nm处有一吸收峰,而蛋白质在280nm处有一吸收峰的原理,可测定A260nm/A280nm比值检测DNA的纯度,该比值接近1.8~2.0表示蛋白质污染极少。
4.制备重蒸酚和平衡酚过程中应戴手套,防止灼烧皮肤。
附:
外周血细胞DNA的快速提取
【原理】从全血制备白细胞DNA可用非离子去污剂NP40和低盐缓冲液直接破裂血中红细胞和白细胞的细胞膜,释出血红蛋白及细胞核,通过离心获得白细胞的细胞核,向核悬液中加入SDS破裂核膜,并使DNA从核蛋白中解离,溶解在一定浓度的NaCl中,经乙醇沉淀即可得到DNA。
缓冲液中Mg2+的浓度对于获得完整的高分子量DNA十分重要,本实验低盐缓冲液中Mg2+浓度是4mmol/L,如超过10mmol/L可导致DNA的降解。
缓冲液中的EDTA可抑制DNA的降解。
【操作步骤】
1.取0.5ml外周血置于1.5mlEppendorf(EP)管中,EDTA-Na2抗凝(每管预先加入0.3mol/LEDTA-Na230μl),3000r/min离心5min,弃血浆,得沉淀部分。
2.加0.5ml低盐缓冲液(10mmol/LTris-HCl,pH7.6,10mmol/LKCl,4mmol/LMgCl2,2mmol/LEDTA),12.5μl的20%NP40,振荡破碎红细胞,5000r/min离心5min,弃上清。
3.用低盐缓冲液洗白细胞2次(每次5000r/min离心5min),弃上清。
4.加入250μl低盐缓冲液,20μl的10%SDS,混匀,50℃水浴温育10min。
5.加入100μl饱和NaCl(称取4g氯化钠,溶于10ml蒸馏水中即成),剧烈振荡2min,4℃,12000r/min离心10min。
6.吸上清于另一干净EP管中,加入1ml预冷的无水乙醇沉淀DNA,12000r/min离心2min,弃上清。
7.加1ml预冷的70%乙醇洗涤DNA2次,12000r/min离心2min,弃上清,将EP管倒置于滤纸上,室温干燥。
8.加250μlTE缓冲液溶解DNA,紫外定量,4℃冰箱保存备用。
【评价】本实验可在不到1h内快速提取高质量未降解的全血DNA。
实验提取的全血DNA贮存在室温或37℃温育24h与冻存在-70℃的DNA质量一样,但DNA反复冻融4次以上可导致部分降解。
本实验可用于提取少至10μl全血样品(可获得340ng左右DNA)或干燥的血液样品,因此本实验适用范围较广。
实验22碱裂解法从大肠杆菌中制备质粒DNA
从大肠杆菌细胞中分离质粒DNA的方法众多,其分离的依据可根据分子大小不同、碱基组成的差异以及质粒DNA的超螺旋共价闭合环状结构的特点进行。
目前常用的有碱裂解法(又称碱变性抽提法)、羟基磷灰石柱层析法、质粒DNA释放法、酸酚法、两相法以及溴化乙锭-氯化铯密度梯度离心法。
以上方法各有利弊。
但总结多数实验室的实践经验,认为碱裂解法效果良好,经济且收率较高,是一种使用最广泛的制备质粒DNA的方法,也是当今分子生物学研究中的常规方法。
制备的质粒DNA可用于酶切、连接、转化以及PCR等。
【原理】碱裂解分离质粒DNA是基于染色体DNA与质粒DNA的变性与复性的差异而达到分离的目的。
当细胞在NaOH和SDS溶液中裂解时,蛋白质与染色体DNA发生变性,加入醋酸钾中和液,进行离心后,它们随细胞碎片沉淀下来,而变性的质粒DNA又恢复到原来的构型留在上清中,再经酚/氯仿抽提乙醇沉淀等步骤获得质粒DNA。
质粒DNA的存在形式有3种:
①共价闭环DNA,常以超螺旋形式存在;②开环DNA,此种质粒DNA两条链中有一条发生一处或多处断裂;③线性DNA,因质粒DNA的两条链在同一处断裂而造成。
在电泳时同一质粒DNA的3种形式泳动速度:
超螺旋>线性>开环。
【试剂】
1.菌种含pBR322或其他质粒DNA的大肠杆菌工程菌如HB101,DH5α,JM109等,如实验后需直接酶切制备的质粒DNA,可选用科研工作中用EcoRⅠ非定向克隆构建的重组质粒DNA转化的大肠杆菌。
2.LB液体培养基称取胰蛋白胨3.0g,酵母提取物1.5g,NaCl3.0g,加双蒸水200ml溶解,用5mol/LNaOH调至pH7.4,定容至300ml,转移至三角烧瓶中,以103.4Kpa高压灭菌20min。
3.10mg/ml氨苄青霉素(Amp)溶液在无菌条件下配制,-20℃贮存备用。
4.含Amp的LB固体培养基每100mlLB培养液在临高压灭菌前加入1.5g琼脂,以103.4KPa高压灭菌20min,溶液尚未完全冷却时,即应取出培养基,并轻轻摇动以使琼脂均匀分布于整个培养基中。
必须小心,此时培养基溶液可能过热,旋动液体会发生暴沸。
应使培养基降温至50℃(用手背碰一下瓶壁不致烫手),方可加入Amp,按每100ml培养基加10mg/mlAmp溶液1ml,使其终浓度为100μg/ml,然后在超净台上铺平板,90mm直径的培养皿约需25ml培养基。
5.Tris-HCl饱和酚(pH8.0)与TE缓冲液同实验21。
6.溶液Ⅰ含50mmol/L葡萄糖,10mmol/EDTA-Na2,25mmol/LTris-HCl(pH8.0),临用前加溶菌酶至2mg/ml。
7.溶液Ⅱ含200mmol/LNaOH,10g/LSDS,临用前用两种溶液的贮存液配制。
8.溶液Ⅲ5mol/L醋酸钾溶液60ml(称取29.4g醋酸钾定容至60ml),冰醋酸11.5ml和双蒸水28.5ml混合而成。
9.10mg/mlRNaseA同实验21。
10.50×TAE电泳缓冲液取Tris24.2g,冰醋酸5.7ml,0.25mol/LEDTA(pH8.0)20ml,加蒸馏水至100ml。
1×TAE为配制琼脂糖凝胶及其电泳的应用缓冲液。
11.溴酚蓝指示剂溶液(6×上样缓冲液)称取溴酚蓝100mg,加双蒸水5ml,在室温下过夜,待溶解后再称取蔗糖25g,加双蒸水溶解后移入溴酚蓝溶液中,摇匀后定容至50ml,加入NaOH1滴,调至蓝色。
12.1mg/ml溴化乙锭(EB)戴手套谨慎称取EB20mg于棕色试剂瓶中,加20ml双蒸水,溶解后贮于4℃备用,配制琼脂糖凝胶时每100ml凝胶加50μlEB。
13.DNA分子量标准根据需要购买,一般浓度为0.5μg/μl。
13.其他试剂氯仿、异丙醇、无水乙醇、琼脂糖、异戊醇。
【操作步骤】
1.用接种环挑取1环冷冻保存的含质粒DNA大肠杆菌工程菌,划线接种于含有Amp的LB固体培养基平板上,37℃倒置培养约12h(过夜)。
2.用接种针或消毒牙签挑取单菌落于盛有2mlLB液体培养基(含100μg/mlAmp)的试管中,37℃摇荡培养过夜。
3.将菌液收集在1.5ml的EP管中,10000r/min离心2min,弃上清,将离心管倒置于一纸巾上,以使所有液体流出。
4.在沉淀中加入溶液Ⅰ100μl,涡旋混匀,静置5min。
5.加入新鲜配制的溶液Ⅱ200μl,颠倒数次,轻轻混匀,冰浴5~10min(溶液变透明,粘稠)。
6.加入溶液Ⅲ150μl,颠倒混匀,冰浴5~10min(溶液出现白色沉淀)。
7.12000r/min离心2min,将上清转移至另一EP管中。
8.加等体积酚抽提1次,12000r/min离心2min,取上层水相转移至另一EP管。
9.加等体积氯仿/异戊醇(24:
1,v/v)抽提1次,12000r/min离心2min,取上层水相转移至另一EP管。
10.加入2倍体积无水乙醇振荡混匀,于室温放置2min沉淀DNA。
12000r/min,离心5min,弃乙醇。
11.用70%乙醇洗涤沉淀,12000r/min,离心5min,弃乙醇,室温下静置使乙醇挥发或真空干燥。
12.用50μl含RNaseA的TE缓冲液溶解DNA沉淀,振荡,室温放置20min。
13.制备琼脂糖凝胶按照被分离DNA的大小,决定凝胶中琼脂糖的百分含量,见表5-1。
表5-1琼脂糖凝胶浓度与分辨DNA大小范围的关系
凝胶中的琼脂糖含量[%(w/v)]线性DNA分子的有效分离范围(kb)
0.35~60
0.61~20
0.70.8~10
0.90.5~7
1.20.4~6
1.50.2~3
2.00.1~2
称取0.8g琼脂糖倒入三角瓶中,加入1×TAE缓冲液100ml,置微波炉或水浴加热至完全熔化,取出摇匀,稍冷却后加50μlEB染色液,摇匀。
14.灌胶
(1)取洁净的电泳内槽(又称托盘),用橡皮膏或透明胶带将内槽的两端边缘封好(一定要封严,不能留缝隙)。
(2)将内槽放置于一水平台面,并插好所需齿数和厚度的样品梳子。
(3)将冷却至60℃左右的琼脂糖凝胶液,缓慢倒入内槽,直至所需厚度,注意不要形成气泡,特别是梳子下,如有气泡可用牙签挑破。
(4)待胶凝固后,小心取出梳子,撕去橡皮膏或透明胶带,将带凝胶的内槽放入电泳槽中,注意凝胶点样端要靠近负极。
(5)加入1×TAE缓冲液至电泳槽,缓冲液刚没过凝胶表面即可。
15.加样剪取适当大小的蜡膜(Parafilm膜),取6×上样缓冲液1μl点于膜上数点,取5μl质粒DNA和2μlDNA分子标准(约1μg)分别与上样缓冲液混匀,将其分别加入凝胶的点样孔(记录点样顺序及点样量)。
16.电泳接通电源槽与电泳仪的电源(检查正负极,DNA片段是从负极向正极移动)。
DNA的迁移率与电压成正比,电压不超过5V/cm凝胶长度。
当溴酚蓝染料移动至凝胶前沿1~2cm处,切断电源,停止电泳。
17.观察结果取出内槽,在紫外分析仪的玻璃平板上小心推出凝胶,通过防护屏或戴防护眼镜观察紫外灯透射的结果,DNA存在处应显出桔红色荧光条带,一般可观察到2种或3种质粒形式。
【注意事项】
1.应先在实验前2天划线接种细菌,实验前1天晚上进行单菌落液体培养,并注意无菌操作。
2.加入溶液Ⅰ时可用力振荡,而加入溶液Ⅱ5min后,如溶液不变粘稠(用移液嘴沾吸没有丝状物出现),则应终止实验。
检查使用的试剂是否正确,加量是否正确。
3.溶液Ⅰ中的溶菌酶宜临用前加入。
溶液Ⅱ也应临用前用母液配制。
4.琼脂糖凝胶的配制可安排在真空干燥和RNaseA处理的实验间隙,为便于电泳后直接可观察结果,EB可在琼脂糖加热熔化至灌胶前加入。
因此整个电泳过程均应戴手套操作。
5.EB是DNA的诱变剂,亦是极强的致癌物,配制和使用过程中要小心,操作时一定要戴手套,用过的手套要及时把手套顺手翻过来,让污染有EB的面朝里,有EB的废液和器皿要分别处理好。
附:
一步法提取质粒DNA
小规模快速制备质粒DNA是筛选大批重组质粒的阳性克隆的一个不可缺少的步骤,常规经典的方法是碱裂解法。
通过该方法制备出来的质粒DNA既可进行琼脂糖凝胶电泳,也可进行限制性酶切分析。
但该方法在一次筛选数十个克隆时就显得操作步骤烦琐,费时较多。
这里介绍一种经本人改良的简便快速的质粒DNA制备方法[见:
刘新光,刘文,梁念慈.一种快速可靠的小量制备质粒DNA的方法.基础医学与临床,1998,18(5):
396],可作为今后科研中大量筛选时使用。
本方法较经典的碱裂解法省去了碱裂解和乙醇沉淀与洗涤步骤,直接用酚/氯仿一步抽提,十分简单实用。
【操作步骤】
1.收获1.5ml过夜培养菌液于1.5mlEP管中,在12000r/min离心10s。
2.弃去培养液并尽量吸干(使用微量台式真空泵较方便),加入50μlTE缓冲液(pH8.0),用涡旋混合器振荡以悬浮细胞。
3.用1ml玻璃刻量吸量管吸取酚/氯仿(1:
1)混合液1ml,每个EP管加入50μl,在涡旋混合器上振荡10s后,以12000r/min离心5min。
4.小心取出40μl上清至另一个1.5mlEP管中,加入RNaseA至终浓度50μg/ml,室温放置5min。
5.取5μl质粒溶液(与1μl6×上样缓冲液混合)进行0.6%~1%琼脂糖凝胶电泳,并以空载体DNA作对照,根据电泳结果即可判断有无外源DNA插入。
6.取适当量可能含重组载体的质粒溶液进行限制性酶切分析。
实验23PCR扩增目的DNA
【原理】聚合酶链式反应(polymerasechainreaction,PCR)类似于DNA的天然复制过程,是一种体外扩增特异性DNA的技术。
PCR是在模板DNA、两条寡核苷酸引物和4种脱氧核苷三磷酸(dNTP)存在的条件下,耐热的TaqDNA聚合酶催化的酶促反应。
PCR反应的特异性取决于引物和模板DNA结合的特异性。
反应分3步:
①变性:
通过加热使DNA双螺旋的氢键断裂,双链解离形成单链DNA。
②退火:
当温度突然降低时,由于模板分子结构较引物要复杂得多,而且反应体系中引物DNA量大大多于模板DNA,使引物和其互补的模板在局部形成杂交链,而模板DNA双链之间互补的机会较少。
③延伸:
TaqDNA聚合酶催化以引物为起始点的DNA链延伸反应,以上3步为一个循环,每一循环的产物可以作为下一个循环的模板,数小时之后,介于两个引物之间的特异性DNA片段可大量复制,数量可达2×106~7拷贝。
本实验不设计特定引物,各实验室可充分利用科研用不完的引物开展本实验。
一旦一对引物序列确定,PCR扩增长度也就确定。
【试剂】
1.TaqDNA聚合酶国产或进口酶,浓度为5U/μl,均配有相应的缓冲液和MgCl2。
2.10×扩增缓冲液含500mmol/LKCl,100mmol/LTris-HCl(pH9.0于室温),1%TritonX-100。
3.25mmol/LMgCl2此为应用液浓度的10倍,配套供应。
4.dNTP为4种脱氧核苷三磷酸的混合液,有商品出售,一般浓度为各2.5或10mmol/L。
5.上游引物或下游引物引物的正确设计是PCR反应成功扩增的一个关键条件,必须遵循一定的原则,最好在引物设计时有计算机辅助分析。
设计好后国内有关公司可代理合成,按要求用灭菌三蒸水或去离子水溶解配制成25μmol/L,分装,-20℃冻存备用。
6.DNA模板实验21提取的大鼠组织DNA或人白细胞基因组DNA(配成约1μg/μl浓度);或纯化的重组质粒DNA(配成2ng/μl)。
7.灭菌轻矿物油或石蜡油:
视PCR仪器的型号决定是否需要。
8.琼脂糖凝胶电泳所需试剂(琼脂糖、电泳缓冲液和上样缓冲液):
见实验22。
9.DNA分子量标准:
国产或进口产品,可根据扩增带的大小选择。
【操作步骤】
1.按以下顺序,用微量移液器将各成分分别加入在0.2ml或0.5ml灭菌薄壁离心管中。
试剂
加样量
最终浓度
10×扩增缓冲液
5μl
1×扩增缓冲液
25mmol/LMgCl2
5μl
2.5mmol/L
2.5或10mmol/LdNTP
4或1μl
0.2mmol/LdNTP
25μmol/L上游引物
1μl
25pmol(0.5μmol/L)
25μmol/L下游引物
1μl
25pmol(0.5μmol/L)
基因组DNA或质粒DNA
5μl
5μg或10ng
TaqDNA聚合酶
0.2μl
1U
灭菌三蒸水
29μl或32μl
反应总体积
50μl
加盖,用手指轻弹离心管底部,使溶液混匀,在台式离心机中离心2秒以集中溶液于管底,加灭菌轻矿物油或石蜡油50μl封住溶液表面,防止溶液的蒸发(如是2400,9600或9700型PCR仪则不需加)。
2.视预实验的条件,按以下参数在PCR仪上进行扩增25~35个循环。
一般PCR反应的参数为:
94℃变性1min;55℃退火1min;72℃延伸1min;其中第1个循环94℃变性5min℃,最后一个循环72℃延伸10min。
3.取5μlPCR产物进行0.8%琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察有否有预定大小的DNA片段。
【注意事项】由于PCR具有超敏感性的特点,极微量的污染便可导致假阳性结果。
污染可能来自样品污染、扩增试剂仪器污染和扩增产物交叉污染等。
其主要预防措施有:
1.工作区隔离分样品处理区和PCR扩增分析区。
2.试剂取样及分装要用绝对安全无污染的器皿;对于大包装的试剂用前应分成小包装。
3.注意实验操作①操作时要戴手套,如有污染要及时更换;②离心管每次开盖前要离心片刻,开盖要小心,防止液体溅出;③常用预混试剂应先加试剂,后加DNA模板;④吸每种试剂均要换移液嘴(tip),在临床检测实验室中吸试剂用的移液器还要与吸DNA模板的移液器要分开。
4.在临床检测时每次PCR均同时设阳性对照、阴性对照和弱阳性对照。
5.污染处理①稀酸处理法:
常用稀酸处理含有扩增产物的离心管,琼脂糖凝胶和电泳槽及电泳托盘等;②紫外线照射PCR工作室,特别是电泳槽、电泳托盘、离心机、冰盒、移液器等。
实验24DNA限制性图谱的绘制
-------DNA的限制性内切酶酶切分析
【原理】限制性内切酶(restrictionendonuclease,RE)是由细菌自己产生的能识别双链DNA分子中的特定碱基顺序,并以内切方式水解核酸中的磷酸二酯键的核酸水解酶。
它可分为三种类型:
Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ型,Ⅱ型酶就是通常所指的RE,能识别双链DNA的特异顺序,并在这个顺序内进行切割。
它是基因工程中剪切DNA分子的常用工具酶,被誉为分子生物学家的手术刀。
临床上某些遗传病是由于基因的缺失或插入或突变所致,可造成RE酶切位点的改变,故当用一定的RE切割时,其切开的片段(分子量)大小与正常人发生差异,即DNA限制性图谱发生改变,据此可达到基因诊断的目的。
本实验选用价格低廉、酶切效果好的EcoRⅠ(识别位点G↓AATTC)对λDNA进行酶切,观察RE的特定切割作用及其限制性图谱,理论上可产生分子量分别为21226bp,7421bp,5804bp,5604bp,4878bp和3530bp片段。
或选用实验22制备的EcoRⅠ非定向克隆构建的重组质粒DNA作为EcoRⅠ酶切底物,产生载体与插入片段2个片段。
【试剂】
1.λDNA、实验21制备的基因组DNA或实验22制备的EcoRⅠ非定向克隆构建的重组质粒DNA。
2.DNA分子量标准。
3.限制性内切酶EcoRⅠ及其缓冲液(只需购买国内试剂公司的产品即可,每种RE均配有2种缓冲液,在配套的缓冲液中该RE均可获得100%酶切活性)。
4.电泳缓冲液、琼脂糖、溴酚蓝指示剂及EB同实验22。
【操作步骤】
1.将下列试剂缓冲液2μl,λDNA(5μg)或基因组DNA(5μg)或质粒DNA样品(1μg),EcoRⅠ5~10U加至0.5mlEP管中,加双蒸水至20μl,加盖,混匀后稍离心,37℃水浴反应1h。
2.取5μl酶切后的样品,0.5~1μg未酶切λDNA或基因组DNA或质粒DNA,DNA分子量标准(均要与上样缓冲液混合)进行0.8%的琼脂糖凝胶电泳(EB已预先加入琼脂糖凝胶中),在紫外检测仪上观察结果。
3.在镜头前加一块红色滤光片,使用100º黑白胶卷,利用透射紫外光作光源,光圈2.8,曝光0.5~2s,调准焦距,可拍摄质量较好的凝胶照片。
有条件则使用DNA一次成像仪。
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