分子生物学(全套课件396P).pptx
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分子生物学(MolecularBiology),第一章绪论,本章重点分子生物学发展史中的重大事件:
分子生物学相关的诺贝尔奖基因组、蛋白质组、代谢组的概念,第一章绪论本章内容第一节分子生物学发展简史第二节分子生物学的概念第三节分子生物学的研究内容第四节分子生物学的发展前景,第一节分子生物学发展简史,一、创世说上帝先创造了世间万物,而后创造出第一个男人亚当,并把他的肋骨取了一根下来,做成女人,取名为夏娃,人类由此得以繁衍生息。
JeshuabenJoseph,二、进化论1859年达尔文出版了震动当时学术界的物种起源一书,书中用大量资料证明了形形色色的生物都不是上帝创造的,而是在遗传、变异、生存斗争和自然选择中,由简单到复杂、低等到高等不断发展变化的。
第一节分子生物学发展简史,24November1859,第一节分子生物学发展简史,CharlesRobertDarwin1809-1882,
(一)达尔文查尔斯罗伯特达尔文,英国生物学家,生物进化论的奠基人。
他以博物学家的身份,参加了英国派遣,的环球航行,做了五年的科学考察。
在动植物和地质方面进行了大量的观察和采集,经过综合探讨,形成了生物进化的概念。
1859年出版了震动当时学术界的物种起源。
“谈到名声、荣誉、快乐、财富这些东西,如果同友情相比,它们都是尘土。
”,
(二)拉马克,第一节分子生物学发展简史,拉马克是法国博物学家,生物学伟大的奠基人之一。
他最先提出生物进化的学说,是进化论的倡导者和先驱。
他还是一个分类学家,林奈(Carlvonlinne)的继承人。
主要著作有法国全境植物志、无脊椎动物的系统、动物学哲学等。
Jean-BaptisteLamarck,17441829,第一节分子生物学发展简史,又对于其他细胞共同组成的整体的生命起作用;3.新细胞是从老细胞中产生。
三、细胞学说细胞是有机体,一切动植物都是细胞发育而来,并由细胞和细胞产物所构成;细胞是一个相对独立的单位,既有他自己的生命,Schwann,18101882,Schleiden18041881,第一节分子生物学发展简史,
(一)列文虎克安东尼列文虎克荷兰,显微镜学家、微生物学的开拓者。
由于勤奋及本人特有的天赋,他磨制的透镜远远超过同时代人。
他的放大透镜以及简单的显微镜形式很多,透镜的材料有玻璃宝石、钻石等。
其一生磨制了400多个透镜,有一架简单的透镜,其放大率竟达270倍。
主要成就:
首次发现,AntonivanLeeuwenhoek16321723,微生物,最早纪录肌纤维、微血管中血流。
第一节分子生物学发展简史,
(二)罗伯特胡克英国博物学家,发明家。
在物理学研究方面,他提出了描述材料弹性的基本定律-胡克定律,在机械制造方面,,RobertHooke16351703,他设计制造了真空泵,显微镜和望远镜,并将自己用显微镜观察所得写成显微术一书,细胞一词即由他命名。
在新技术发明方面,他发明的很多设备至今仍然在使用。
除去科学技术,胡克还在城市设计和建筑方面有着重要的贡献。
四、经典遗传学
(一)孟德尔学说分离定律。
决定相对性状的一对等位基因同时存在于杂种一代的个体中,但仍维持它们各自的个体性,在配子形成时互相分开,分别进入一个配子细胞中去。
第一节分子生物学发展简史,四、经典遗传学
(一)孟德尔学说2.自由组合定律。
控制不同性状的遗传因子的分离和组合是互不干扰的;在形成配子时,决定同一性状的成对遗传因子彼此分离,决定不同性状的遗传因子自由组合。
第一节分子生物学发展简史,
(一)孟德尔学说3.孟德尔孟德尔,出生于奥地利布隆,后来当了神父,是遗传学的奠基人,被誉为现代遗传学之父。
他的豌豆杂交实验共进行了8年,结果整理成论文在植物杂交试验发表,提出了分离规律及自由组合规律。
GregorMendel1822-1884,第一节分子生物学发展简史,
(二)染色体遗传学说摩尔根用果蝇做了大量试验,提出了遗传因子位于染色体上,并称这些因子为基因。
染色体存在于细胞核中,在细胞期(细胞不分裂的时期),它以染色质的状态存在;在细胞分裂时,成为短粗的杆状结构,称为染色体(因为它染色较深)。
第一节分子生物学发展简史,中的作用,赢得了诺贝尔生理学或医学奖。
第一节分子生物学发展简史,
(二)染色体遗传学说托马斯亨特摩尔根美国进化生物学家,遗传学家和胚胎学家。
发现了染色体的遗传机制,创立染色体遗传理论,是现代实验生物学奠基人。
于1933年由于发现染色体在遗传ThomasHuntMorgan,18661945,第一节分子生物学发展简史,诺贝尔生理学或医学奖。
五、经典生物化学
(一)蛋白质和核酸的发现阿尔布雷希特科塞尔,德国生化学家。
他发现了腺嘌呤和鸟嘌呤、硫胺酸。
介绍了氨基酸的蛋白质的基本结构的概念他因细胞化学的研究(特别是蛋白质和核酸)获得1910年的LudwigKarlMartinLeonhardAlbrechtKossel,18531927,第一节分子生物学发展简史,SeveroOchoadeAlbornoz19051993,ArthurKornberg1918-2007,五、经典生物化学
(二)核糖核酸和脱氧核糖核酸的生物合成机制“发现核糖核酸和脱氧核糖核酸的生物合成机制”1959年,诺贝尔生理学或医学奖。
六、分子生物学的诞生
(一)DNA是细菌的遗传物质,第一节分子生物学发展简史,肺炎双球菌转化实验,OswaldAvery1877-1955,FrederickGriffith18771941,第一节分子生物学发展简史,于鸟嘌呤的摩尔含量。
六、分子生物学的诞生
(二)Chargaff法则1950年,Chargaff提出了DNA碱基组成的共同规律,即胸腺嘧啶的摩尔含量总是等于腺嘌呤的摩尔含量,胞嘧啶的摩尔含量总是等ErwinChargaff,1905-2002,六、分子生物学的诞生(三)DNA双螺旋“发现核酸的分子结构及其对生物中信息传递的重要性”,第一节分子生物学发展简史,FrederickWilkins1916-2004,1962年的诺贝尔生理学或医学奖,19162004,1928,六、分子生物学的诞生(三)DNA双螺旋,第一节分子生物学发展简史,RosalindElsieFranklin1920-1958,罗莎琳爱尔西富兰克林,是一位英国物理化学家与晶体学家。
她所拍摄的DNA晶体衍射图片“照片51号”,以及关于此物质的相关数据,是詹姆斯沃森与佛朗西斯克里克解出DNA结构的关键线索。
第一节分子生物学发展简史,Jacob1920-,Monod19101976,AndrMichelLwoff19021994,七、分子生物学的发展
(一)基因的表达调控“在酶和病毒合成的遗传控制中的发现”,共同获得了1965年的诺贝尔生理学或医学奖,乳糖操纵子,第一节分子生物学发展简史,七、分子生物学的发展
(二)蛋白质的合成机制,RobertW.Holley1922-1993“tRNA”,Nirenberg19272010,HarGobindKhorana19222011,破解遗传密码,“破解遗传密码并阐释其在蛋白质合成中的作用”共同获得1968年诺贝尔生理学或医学奖,第一节分子生物学发展简史,七、分子生物学的发展(三)反转录的发现“发现肿瘤病毒和细胞的遗传物质之间的相互作用”,RenatoDulbecco19142012,DavidBaltimore1938,1975年获诺贝尔生理学或HowardMartinTemin医学奖19341994,第一节分子生物学发展简史,七、分子生物学的发展(四)发现限制性内切酶,WernerArber1929-,“发现限制性内切酶及其在分子遗传学方面的应用”1978年,共同获得诺贝尔生理学或医学奖。
HamiltonOthanelSmith1931,DanielNathans19281999,第一节分子生物学发展简史,FrederickSanger19182013,WalterGilbert1932-,八、分子生物学的深入发展
(一)DNA测序“对核酸中DNA碱基序列的确定方法”,PaulBerg1926-,1980年,共同获得诺贝尔化学奖,第一节分子生物学发展简史,八、分子生物学的深入发展
(二)跳跃基因“发现可移动的遗传元素”1983年,获得诺贝尔生理学和医学奖。
BarbaraMcClintock1902-1992,第一节分子生物学发展简史,八、分子生物学的深入发展(三)癌基因“发现逆转录病毒致癌基因的细胞来源”,1989年,获颁诺贝尔生理学或医学奖。
HaroldElliotVarmus1939,J.MichaelBishop1936-,第一节分子生物学发展简史,八、分子生物学的深入发展(四)核酶“发现了RNA的催化性质”1989年诺贝尔化学奖获得者,SidneyAltman1939-,ThomasRobertCech1947-,第一节分子生物学发展简史,八、分子生物学的深入发展(五)PCR、基因定点突变,KaryBanksMullis1944-PCR,“发展了以DNA,“发展了以,DNA为基础的,化学研究方法,为基础的化学研对建立寡聚核苷究方法,开发了酸为基础的定点聚合酶链锁反应,突变及其对蛋白质研究的发展的(PCR)”基础贡献”1993年诺贝尔化学奖获得者,Michaelsmith1932-定点突变,第一节分子生物学发展简史,SirRichardJohnRoberts1943-,八、分子生物学的深入发展(六)断裂基因“发现断裂基因”1993年获若贝尔生理学医学奖。
PhillipAllenSharp1944,第一节分子生物学发展简史,StanleyPrusiner1942-,八、分子生物学的深入发展(七)朊病毒“发现朊病毒传染的一种新的生物学原理”,1997年诺贝尔生理学或医学奖,第一节分子生物学发展简史,八、分子生物学的深入发展(八)RNA干扰“发现了RNA干扰双链RNA引发的沉默现象”,AndrewFire1959,2006年诺贝尔生理学或医学奖,CraigC.Mello1960-,第一节分子生物学发展简史,八、分子生物学的深入发展(九)转录,“对真核转录的分子基础的研究”2006年获诺贝尔化学奖得主RogerDavidKornberg1947,第一节分子生物学发展简史,八、分子生物学的深入发展(十)端粒及端粒酶,“发现端粒和端粒酶如何保护染色体”2009年诺贝尔生理学或医学奖JackSzostak1952-,第二节分子生物学的概念,八、分子生物学的深入发展(十一)核糖体研究“核糖体的结构和功能”,2009年共同获得诺贝尔化学奖,VenkatramanRamakrishnan1952,ThomasSteitz1940,AdaYonath1939,第二节分子生物学的概念,八、分子生物学的深入发展(十二)剪接体结构解析解析了真核细胞剪接体复合物的高分辨率空间三维结构,并就剪接体对前体信使RNA执行剪接的基本工作机理进行了阐述。
被著名结构生物学家、美国斯隆-凯特琳癌症研究中心教授丁绍帕特尔用“里程碑式”一词形容,8月21日,施一公作为通讯作者,清华大学生命学院博士后闫创业、医学院博士研究生杭婧和万蕊雪,作为共同第一作者,在国际顶级期刊科学上同时发表两篇“背靠背”论文。
“诺贝尔奖级的发现”,第二节分子生物学的概念,施一公1967,八、分子生物学的深入发展(十二)剪接体结构解析1967年,施一公出生在河南郑州小郭庄。
1984年,保送至清华大学生物科学与技术系,提前一年毕业1995年,获美国约翰霍普金斯大学医学院分子生物物理博士学位1998年2008年,历任美国普林斯顿大学分子生物学系助理教授、副教授、终身教授2008年,全职回到清华大学工作,任清华大学生命科学学院院长,教授、博导。
2013年,当选为美国艺术与科学学院院士,美国国家科学院外籍院士,2013年,当选中国科学院院士2015年,施一公拟出任清华大学副校长。
第二节分子生物学的概念,一、广义在分子水平上理解生物学现象的一门学科。
二、狭义在分子水平上研究基因结构和功能的一门学科,-RobertF.Weaver,第三节分子生物学的研究内容,一、结构分子生物学二、基因表达调控三、基因工程四、组学,一、结构分子生物学,以生物大分子特定空间结构、结构的特定运动与生物学功能的关系为基础,来阐明生命现象及其应用的科学。
二、基因表达调控,从DNA到蛋白质的过程(包括转录和翻译)叫基因表达,对这个过程的调节即为基因表达调控。
三、基因工程,基因工程又称DNA重组技术,是以分子遗传学为理论基础,以分子生物学和微生物学的现代方法为手段,将不同来源的基因按预先设计的蓝图,在体外构建杂种DNA分子,然后导入活细胞,以改变生物原有的遗传特性、获得新品种、生产新产品。
四、组学,
(一)基因组学基因组学(genomics)用于概括涉及基因作图、测序和整个基因组功能分析的遗传学分支。
基因组(genome)是一个细胞或者生物体所携带的一套完整的单倍体序列,包括全套基因和间隔序列。
四、组学,
(二)转录组学转录组(transcriptomics),是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。
转录组即一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和。
四、组学,(三)蛋白质组学蛋白质组(Proteome)即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。
蛋白质组学指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。
四、组学,(四)代谢组学代谢组学(metabolomics)是对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式。
第四节分子生物学的发展前景,一、对生命现象的认识从单基因水平向全基因组整体水平发展“现在有那么一群叫做分子生物学家的人,他们的文章无视整体的植物与动物,也很少言及生理学。
对于这些人来说,实验资料大部分来自所谓凝胶-”,MaddoxJ.(editorof“Nature”)Nature1992(335):
201,第四节分子生物学的发展前景,一、对生命现象的认识从单基因水平向全基因组整体水平发展:
系统生物学(systembiology)研究生物系统组成成分的构成与相互关系的结构、动态与发生,以系统论和实验、计算方法整合研究为特征的生物学。
第四节分子生物学的发展前景,二、现代生命科学研究的理论与技术从较长期的积累走向应用“在涉及胚胎干细胞和哺乳动物DNA重组方面”突破性发现,这些发现导致了一种通常被人们称为“基因打靶”的强大技术。
2007年诺贝尔生理学或医学奖,MarioCapecchi,MartinJohnEvans,OliverSmithies,第四节分子生物学的发展前景,RobertGeoffreyEdwards1925-2013,二、现代生命科学研究的理论与技术从较长期的积累走向应用“因为在试管婴儿方面的研究获奖”32年有400万试管婴儿诞生2010年诺贝尔生理学或医学奖。
结语,分子生物学已经渗透到生物学的几乎所有领域分子生物学已经成为生命科学领域的带头学科分子生物学,分子结构生物学分子发育生物学分子神经生物学分子育种学分子肿瘤学,分子细胞生物学分子免疫学分子病毒学分子生理学分子考古学,分子遗传学分子数量遗传学分子生态学分子进化学.,结语推动现代生命科学的三架马车分子生物学免疫学细胞生物学,现代生物学研究的三大主题分子生物学细胞生物学神经生物学,结语,作业,题目:
给我影响最深的一项诺贝尔奖。
(不少于800字)文体不限时间:
截止9月22日12:
00分值:
5分;抄袭0分提交方式:
网络教学平台,第二章,基因与染色体,本章内容,第一节DNA第二节基因第三节染色体,第一节DNA,一、DNA的结构
(一)一级结构概念:
核苷酸的排列顺序连接键:
3,5-磷酸二酯键骨架:
磷酸+戊糖方向性:
53,
(二)二级结构,DNA的双螺旋结构模型两条多核苷酸单链组成沿同一根轴平行盘绕方向相反一条53,另一条35右手双螺旋螺旋结构上有大沟和小沟,1.DNA的双螺旋结构模型,
(二)二级结构,嘌呤和嘧啶位于螺旋内侧磷酸和脱氧核糖位于螺旋外侧以3,5-磷酸二酯键连接碱基环平面与螺旋轴垂直,糖基环平面与螺旋轴平行,1.DNA的双螺旋结构模型,
(二)二级结构,螺旋横截面的直径约为2nm相邻碱基平面之间的距离为0.34nm每10bp形成一个螺旋螺矩为3.4nm,2.DNA双螺旋结构稳定性因素碱基堆积力碱基堆积力是使DNA结构稳定的主要因素。
氢键稳定性与GC含量成正比相反电荷的稳定作用,
(二)二级结构,3.DNA二级结构的多样性,
(二)二级结构,类型碱基倾角,每圈bp数,0-119-209,碱基间距(nm)0.340.230.38,101112,螺距(nm)3.32-3.42.46-2.534.56,螺旋直径(nm)2.0-2.372.551.8-1.84,B-DNAA-DNAZ-DNA,B-DNA:
相对湿度为92%时的DNA钠盐纤维A-DNA:
相对湿度为75%以下时的DNA纤维Z-DNA:
左手螺旋,3.DNA二级结构的多样性,
(二)二级结构,1.定义:
指闭合环状双链DNA在空间螺旋,并缠过自身中轴的结构。
(三)超螺旋结构,(三)超螺旋结构,2.参数连接数(L):
两股多聚核苷酸链相互缠绕在一起的总环数。
缠绕数(T):
双螺旋中两股单链相互缠绕的圈数。
(等于螺旋数)扭曲数(W):
双螺旋沿超螺旋轴相互缠绕的圈数。
(等于超螺旋数)L=T+W,3.拓扑异构酶
(1)定义:
能够调控DNA分子超螺旋水平的酶称为拓扑异构酶。
(三)超螺旋结构,3.拓扑异构酶
(2)类型:
TopI,TopII,(三)超螺旋结构,3.拓扑异构酶
(2)类型:
TopI,TopII,(三)超螺旋结构,
(一)DNA变性1.定义:
DNA分子中有序的双螺旋解离成无序单链的过程称DNA变性。
二、DNA的变性与复性,
(一)DNA变性,2.增色效应指变性后DNA溶液的紫外吸收作用增强的效应。
3.Tm值(熔解温度)DNA双螺旋结构解开一半链时的温度。
与链长和G/C含量成正比。
(一)DNA变性,
(二)复性(renaturation),1.定义指变性的DNA分子中两条彼此分开的多核苷酸链间碱基重新配对,形成双螺旋的过程。
2.分子杂交指两条不同来源的核酸单链,因存在着碱基配对关系,从而通过氢键连接生成新的双链的过程。
(二)复性(renaturation),3.Southern印迹定义:
利用分子杂交原理检测样品中特异DNA的一种分子生物学技术。
步骤:
(七步)降解、电泳、变性、转膜、杂交、洗涤、显影,
(二)复性(renaturation),4.Northern印迹法定义:
利用分子杂交原理检测样品中特异RNA的一种分子生物学技术。
步骤:
(五步)电泳、转膜、杂交、洗涤、显影,
(二)复性(renaturation),第二节基因,一、概念
(一)经典遗传学观点:
基因能自我复制;基因是交换的最小单位;基因是一个突变单位;基因是一个功能单位。
一、概念
(二)分子遗传学观点:
1.“一个基因一个酶”假说1941年,Beadle和Tatum对根据红色链孢霉的大量研究提出的。
第二节基因,Beadle,Tatum,一、基因的概念,
(二)分子遗传学观点:
2.顺反子(Cistron)定义:
通过顺反测验所定义的一个遗传单位,通常与基因是同义词。
第二节基因,(1955,S.Benzer),Benzer,二、基因的分类1.结构基因与调控基因结构基因:
编码非调控因子的任何RNA或蛋白质的基因。
调控基因:
编码的产物具有调控其他基因表达的基因。
第二节基因,二、基因的分类2.管家基因与奢侈基因管家基因:
维持细胞基本功能所需的组成性基因,它们在一个生物的所有细胞中都能表达。
奢侈基因:
编码了特定组织和细胞所需的产物。
第二节基因,3.断裂基因在编码序列中间插入无编码作用的碱基序列,这类基因被称为断裂基因。
二、基因的分类,第二节基因,二、基因的分类4.重叠基因是指两个或两个以上的基因共有一段DNA序列。
二、基因的分类5.假基因与有功能的基因在核苷酸顺序组成上非常相似,却不具有正常基因的功能。
第二节基因,6.跳跃基因是一段可以从原位上单独复制或断裂下来,环化后插入另一位点的基因。
二、基因的分类,三、基因簇与基因家族,
(一)基因簇定义:
定位在一起的一组相关基因。
(二)基因家族定义:
由单个祖先基因复制或变异而产生的具有相似生化功能的一系列基因。
三、基因簇与基因家族,四、重复,
(一)单拷贝序列在一个基因组中只有1个或2-3个拷贝。
不同生物基因组中单拷贝序列所占的比例是不同的。
原核生物中一般只含有单拷贝序列。
(二)中度重复序列中度重复序列中的重复次数为101105左右重复单位平均长度约300bp左右。
中度重复序列一般是不编码的序列,它们都要被其他组分所隔断。
四、重复,(三)高度重复序列高度重复序列在基因组中存在大量拷贝的序列,一般重复次数在106以上。
通常这些序列的长度为6200bp,如卫星DNA。
这些重复序列大部分集中在异染色质区,特别是在着丝粒和端粒附近。
四、重复,第三节染色体,染色体的特点易被碱性染料染成深色;是遗传物质深度压缩形成的聚合体;跟染色质是同一物质的不同形态。
染色体是遗传物质深度压缩形成的聚合体,一、原核生物的染色体,原核生物染色体由一条双股环状DNA分子组成,附着在横隔中介体或细菌膜上。
细菌染色体无组蛋白包绕。
二、真核生物的染色体,
(一)常染色质和异染色质细胞间期的染色质可分两类:
细胞核中呈松散状、染色较浅而具转录活性的称为常染色质。
浓缩、而且染色较深、很少进行转录的染色质称为异染色质。
(二)着丝粒染色体上负责在有丝分裂和减数分裂时分离的区域称为着丝粒。
二、真核生物的染色体,(三)端粒它位于染色体的末端,封闭了染色体的末端部分。
端粒是保持DNA稳定性的重要特征。
每个端粒由一系列短的随机重复序列组成,端粒重复是靠端粒酶来合成的。
二、真核生物的染色体,核小体是组成真核细胞染色体的基本结构单位,是由组蛋白和大约200bp的DNA组成的直径约10nm的球形小体。
三、核小体,
(一)DNA核小体DNA可分成两部分:
核心DNA,长度固定为146bp;连接DNA,组成剩余的重复片段。
长度大小不一。
三、核小体,
(二)组蛋白八聚体由“核心组蛋白”H2A、H2B、H3及H4这四种组蛋白各两个组成,并且集合成为八聚体的核小体核心颗粒。
三、核小体,(三)组蛋白H3、H4是已知最保守的蛋白质,在所有真核生物中都具有相同功能。
H2A、H2B在物种间具有较大差别。
组蛋白H1在不同组织和物种间有一定差异。
三、核小体,组蛋白属于碱性蛋白质,含精氨酸和赖氨酸等碱性氨基酸特别多,二者加起来约为所有氨基酸残基的1/4。
组蛋白修饰是指组蛋白在相关酶作用下发生甲基化、乙酰化、磷酸化、腺苷酸化、泛素化、ADP核糖基化等修饰的过程。
(三)组蛋白,四、基因组,
(一)基因组的概念基因组指单倍体细胞中包括编码序列和非编码序列在内的全部DNA分子。
基因组的大小与其遗传复杂性不呈明显的正相关。
(二)C值矛盾,(三)原核生物与真核生物基因组,(四)中心法则,Crick提出DNA通过复制把遗传信息由亲代传递给子代,通过转录将遗传信息传递到RNA分子,后者指导蛋白质的生物合成,以执行各种生命功能,使后代表现出与亲代相似的遗传性状。
第三章,DNA复制,本章重点,DNA复制的原则。
DNA复制相关的酶。
原核生物DNA复制的过程。
本章难点1.端粒合成的过程。
第三章DNA复制第一节复制的原则第二节复制的方式第三
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