生物信息学BLAST实验报告.docx
- 文档编号:26644447
- 上传时间:2023-06-21
- 格式:DOCX
- 页数:7
- 大小:432.35KB
生物信息学BLAST实验报告.docx
《生物信息学BLAST实验报告.docx》由会员分享,可在线阅读,更多相关《生物信息学BLAST实验报告.docx(7页珍藏版)》请在冰豆网上搜索。
生物信息学BLAST实验报告
南方医科大学实验报告
姓名
学号
专业年级
基础学院生物信息学教研室
题目
BLAST
日期
实验者
一、实验目的
1,了解BLAST算法原理
2,掌握BLAST参数设定的意义
3,利用BLAST解决生物学问题,如寻找给定序列(DNA或者蛋白质)的同源序列。
二、实验器材
电脑
三、方法与步骤
给定人蛋白RBP4(NP_006735)或者用自己的序列。
1限定物种为人(Homosapiens),在参考序列数据库中搜索,列出结果(具体比对不列)。
1)进入BLAST主页
http:
//blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
2)限定物种为人Homosapiens
3)在参考序列数据库中搜索
4)CLICKBLAST
2分别限定物种为Musmusculus,Rattusnorvegicus,Drosophilamelanogaster,Bostaurus,Daniorerio,各列出E值最小的两条序列。
1)选择物种
3)输入序列,选择数据库和BALST程序,点击BLAST
4)E值最小的两个序列
5)其余物种依次重复
四、结果与讨论
限定物种为人(Homosapiens),在参考序列数据库中搜索,列出结果(具体比对不列)。
分别限定物种为Musmusculus,Rattusnorvegicus,Drosophilamelanogaster,Bostaurus,Daniorerio,各列出E值最小的两条序列。
Musmusculus
Rattusnorvegicus
Drosophilamelanogaster
Bostaurus
Daniorerio
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 生物 信息学 BLAST 实验 报告