基因检测相关问题及问题详解.docx
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基因检测相关问题及问题详解.docx
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基因检测相关问题及问题详解
十个问题及答案
问题1:
基因检测有什么用途?
回答:
1.辅助临床诊断:
很多疾病表现出来的症状类似,临床上很难进行鉴别诊断,容易混淆。
若是通过基因检测,在基因层面找到致病原因,可以辅助临床医生鉴别诊断甚至纠正临床上的诊断。
举例:
某基因检测机构通过对一个临床疑似“先天性白障-小角膜综合症”的家系进行了基因检测,最后在基因层面发现他们家系患的其实是“玻璃体视网膜脉络膜病”而非“先天性白障-小角膜综合症”,帮其纠正了临床诊断。
又如:
糖尿病中有一型特殊类型的糖尿病为“单基因糖尿病”(由单个基因突变引起,为孟德尔遗传病)由于其基因存在缺陷,使得患者在代谢特征、临床表现和治疗方案等方面,都与1型或者2型糖尿病患者有着明显的区别。
但是,由于认识上的不足,单基因糖尿病常常被误认为1型或2型糖尿病。
英国一项流行病学的调查显示,有80%的青春晚期糖尿病(MODY)患者未被正确诊断。
在欧美国家的单基因糖尿病的研究中,发现有10%的1型糖尿病和2-5%的2型糖尿病其实是单基因糖尿病。
所以,通过对正常人群体,特别是有糖尿病家族史的人群,进行单基因糖尿病致病基因的筛查,可以尽早发现基因缺陷,从而把单基因糖尿病患者从1型或者2型糖尿病患者中区分出来。
2.携带者筛查:
最常见的是唐氏综合征的筛查。
传统的唐氏综合征筛查是利用血清学筛查进行的,检出率为65%-75%,容易漏检。
而无创产前基因检测则可以准确地筛查出唐氏综合征患儿,还包括对18三体综合征和13三体综合征的筛查。
此外,针对具有某些单基因遗传病(尤其是隐性遗传病)家族史的高危人群进行相关致病基因的筛查,可以及时发现该家族中致病基因的携带情况,进而分析后代患病的风险,为家属成员提供有效的遗传信息,防止缺陷基因向下一代遗传。
3指导治疗:
现在医生开药的遵循的是经过广泛测试后提供的剂量信息。
但所有的药物在测试过程中都是以群体作为样本的,因此药物剂量在对于大多数人是合适的。
但是由于每个人的基因不同,会导致正常剂量下的药物对一些人产生致命的作用。
导致原本挽救健康的药可能反而对健康造成伤害。
这样的现象就称为药物不良反应(adversedrugreactions,ADR)。
如药物warfarin是一种抗凝剂,是防止血液凝固的一种药物,病人服用这种药物可以大大减轻血栓形成的危险。
但是抗凝剂服用过多,血液便不容易凝固,会造成出血,甚至有生命危险。
在我们身体中有一种酶叫CYP2C9,它可以代谢这种抗凝剂,把它分解成小分子物质,使之失去抗凝血作用。
正常情况下warfarin发挥作用后被代谢,完成它的药物治疗作用,也并不对人身体造成危害。
但是,如果一个人CYP2C9发生突变,代谢功能降低,是弱代谢型(poormetabolizer),就意味着warfarin代谢过慢,在身体中不断积累,最终可能造成出血倾向。
基因检测的作用就在于此:
它可以先判定某人的CYP2C9是否发生了突变,并判定他属于哪种代谢类型,然后再根据代谢类型决定药物剂量。
如果是强代谢型,那就适当提高剂量;如果是弱代谢型,那就降低剂量并注意药物在血液中的含量。
这样就既保证了药物达到治疗效果,也不会出现ADR。
需要判定代谢类型决定药物剂量的例子还有很多,治疗抑郁症、糖尿病、哮喘、骨骼疏松等的药物都有不同基因参与代谢。
基因检测可以保证药物剂量的使用在合适围。
但实际情况是现在我们还很少在开药的时候把个人基因信息考虑进来,因此可能会造成对某些药物的不良反应。
问题2:
针对不同的情况,如何合理地选择基因检测?
回答:
1.基因检测主要有婚前检测,产前检测,遗传疾病预测与疾病用药指导,我说的比较简洁,有不对的地方请大家补充。
婚前检测:
可以在基因层面检测是否有遗传性疾病(如脆性X综合征),是否有不孕不育(如Y染色体微缺失)。
产前检测:
分为两种,1)孕前。
母体用药指导(如叶酸服用量),筛查流产原因。
2)孕中。
检测胎儿基因(耳聋基因等),优生优育(唐氏儿阻断)。
遗传病筛查:
筛查家族性遗传病,如亨廷顿舞蹈症等罕见病,癌症易患人群等。
疾病用药指导:
结直肠癌的化疗获益,乳腺癌的复发风险,心血管病的用药指导等等。
其实要说到有没有必要,每个人都需要,小到婴儿大到老人,有一定的经济基础做个检测并不是坏事,只有好处,每个人对自己的身体其实很有必要清楚知道,很有必要有一本属于自己身体的说明书!
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1.其实要说到有没有必要,每个人都需要,小到婴儿大到老人,有一定的经济基础做个检测并不是坏事,只有好处,每个人对自己的身体其实很有必要清楚知道,很有必要有一本属于自己身体的说明书!
3.基因检测目前有两个大方向的应用,一针对人类单基因病的诊断性遗传检测;第二预测性遗传检测,主要包括迟发性单基因病的检测,复杂疾病(高血压,糖尿病,精神疾病和肿瘤等)的风险预测,个体用药指导方面等。
以下对基因检测的主要应用畴进行说明:
(1)诊断性检测:
用于对特定遗传病受累个体畸形临床辅助确诊,如血友病、杜氏肌营养不良(DMD)、地中海贫血等疾病。
此时主要用于选择受累个体的患病原因,因此精准的检测技术以及专业的遗传咨询是至关重要的。
(2)症状前检测:
针对特定疾病的高风险个体,家庭以及高风险人群,主要以预测其未来健康为目的进行的一种检测。
如迟发型单基因病Huntington病,一些预防及治疗效果良好的肿瘤等。
这项检测,虽然阴性结果可以消除受检者的焦虑,但是阳性结果会给其带来很大的心理负担,因此需要有专业的遗传咨询团队为其提供恰当的解释和有效的预防治疗手段。
(3)携带者筛查:
所检测的对象为染色体隐性和X-连锁隐性遗传病的杂合子个体。
如已经生育过遗传病患儿的双亲;两广地区高发的地中海贫血基因的携带者筛查等。
携带者筛查一部分面向的是广大群体,因此基因检测的成本和价格要处于可接受的程度,同时,由于缺乏认识,遗传病携带者有时会遭遇到歧视的情况,因此在实施检测前和检测后需提供详细的遗传咨询服务。
(4)产前检测:
是针对一些特定疾病高风险的家庭以生育健康宝宝为目的进行的基因检测(目前这项只有部分疾病开展到了临床)。
包括侵入性和非侵入性的产前诊断(可查阅相关的无创胎儿产前胎儿染非整倍性染色体异常筛查知识)。
如侵入性的羊膜腔穿刺,通过羊水可以检测胎儿的常见的染色体病(21-三体综合征,18-三体,13-三体等),单基因病如地中海贫血、血友病、神经肌肉和代谢病等。
这是涉及胎儿命运的检测,因此检测前后的遗传咨询服务很重要。
(5)药物遗传基因检测:
同一药物,在基因型是超快代谢的患者使用时,药效明显降低;而在慢代谢患者使用时,毒副作用又可能增加;只有在快代谢的人群中应用,才能产生预期疗效。
因此对接受药物治疗前的一些人的检测,指导医生根据个人的遗传背景提供合适的药物及药物剂量。
如铂类药物是目前临床上最常用的肿瘤化疗药物之一,谷胱甘肽转硫酶类能够促进铂类药物的排泄因而降低抗癌药物的毒性作用,因此,不同的谷胱甘肽转移酶的基因型人群其对铂类药物的毒副作用不同,基因检测能有效指导用药。
药物遗传检测,是个体化医疗的一个极具前景的方面。
(6)植入前检测:
针对的对象主要是发育早期的胚胎,用于检测一些重要的、具有高风险的疾病(如Marfan综合征,血友病,杜氏肌营养不良等)。
由于这项检测针对的是单个细胞,因此,对于检测技术的要求非常高。
也需要通过遗传咨询来帮助规避一些伦理上的风险。
问题3:
乳腺癌基因检测准确吗?
安吉丽娜朱莉的医生说她有87%的患癌几率是怎么算出来的?
回答:
1.茱莉进行的这项检测,BRCA1突变,和乳腺癌的关系是非常清楚的,检测也非常容易。
只是在美国目前受专利保护,所以测起来很贵。
她所携带的BRCA1突变简单地说是破坏了BRCA1基因修复DNA双链损伤的能力。
带有这种突变的人患乳腺癌的概率大大升高,平均约为普通人的五倍(普通女性约为12%,BRCA1/2突变女性约为60%。
这些概率都是所谓的Lifetimerisk,也就是说一个人在有生之年被诊断出这种疾病的概率。
2.只要检查的机构合格,基因检测技术肯定是可以信赖的。
BRCA1基因和乳腺癌、卵巢癌的高相关性,是上世纪90年代的一大发现。
乳腺癌是遗传+环境多因素致病的恶性肿瘤,但是BRCA1和BRCA2基因,是和乳腺癌高相关的,尤其是和家族遗传性的乳腺癌高相关。
BRCA1是一种抑癌基因,和原癌基因一样,每个人都有,编码在17号染色体。
原癌基因和抑癌基因,通俗点讲就是,原癌基因让细胞不停的分裂,抑癌基因阻止细胞分裂,两者达到平衡。
当原癌基因突变,造成细胞不受调控的疯长,或者抑癌基因突变失活,不能抑制细胞分裂的时候,就得癌了。
前面说了,乳腺癌是遗传+环境多因素致病的,所以,BRCA1基因突变和乳腺癌是不能划等号的。
BRCA1突变=乳腺癌,就意味着得了乳腺癌的人都有BRCA1突变,BRCA1突变的人都得乳腺癌,事实上显然不是那么回事儿。
即使是家族遗传性的乳腺癌,也大部分不存在BRCA1的突变;反过来,BRCA1突变的人,则大部分都会得癌。
那么就有了第二个问题,这个87%是怎么来的?
先说说什么是发病率,发病率就是某段时期,某地区得了这种毛病的人占全体人口的比例。
比方说某年某市有300个新发病的乳腺癌,该市这一年的平均人口数是30000人,那么这个市乳腺癌的发病率就是1%。
那么BRCA1突变患者乳腺癌的发病率呢,就是找到BRCA1突变的人,然后看看这些人里有多少得了乳腺癌。
这其实就是用样本代替总体的统计方法。
一般认为这个发病率在50%-85%。
有一篇1994年发表在《柳叶刀》上的文献,研究了33个乳腺癌遗传的家族,得到BRCA1突变患者,到70岁乳腺癌的累积发病率为87%:
至于发现BRCA1突变的下一步处理,一般有三种:
加强监测、预防性用药和预防性手术。
预防性用药有一些相关的副作用。
预防性手术,获益和风险评估现在还没定论,毕竟突变不等于得癌,这还是没有得病而做手术,其实就是对以后得癌的顾虑和手术的顾虑之间的权衡。
不过对于35-40岁以上,已经无哺乳要求的女性,可能还是有所帮助的,手术后,乳腺癌患病率明显下降,文献报道下降90%。
特别是加做乳房重建手术,对于女性切除乳房后的心理影响也得到很大缓解。
3.这种预测概率一般来自于一些文章,文章主要的容是观察病例和对照的基因型,统计基因型和表型的相关性。
如果每一次这样的相关性观测(每篇文章)可以叫做一个证据,那么把证据放一起综合评估,可以得到更加客观的结果,有些文章就是这种综合评估的文章。
综合评估需要一些更加专业的统计学工作,这些工作可以引申为算法。
问题4:
基因检测有哪些方法?
回答:
1.据我所知,有测序法,荧光PCR法,目前听到过一种新的名称叫PCR层析微粒法
2.
(1)基因芯片技术,可以大规模对基因组特定位点多态性以及基因表达等进行检测。
基本原理是基于碱基互补配对,根据预先放置的探针与靶DNA结合情况得到的信息对靶DNA进行解读。
(2)用于目标区域基因拷贝数的低通量检测技术,包括MLPA(多重连接探针扩增技术,multiplexligation-dependentprobeamplification),FISH(fluorescenceinsituhybridization,非放射性原位荧光杂交技术),DigitalPCR(数字PCR技术)。
(3)低通量目标序列以及SNP位点检测技术,SNP位点的检测也是目前疾病风险预测、先天营养吸收、先天饮酒能力等检测主要目标。
低通量的目标序列以及SNP位点检测技术主要包括TaqmanPCR技术,基于毛细管电泳的SNPlex技术(单个反应可以检测48个SNPs,来自ABI公司),SNaPshot(通常可以用于10到30个SNP位点检测),SNPstream技术。
3.基因检测的方法不胜枚举,基本的步骤是样本的获取(包括血液、唾液、组织样本等)——处理(如DNA的提取与纯化、文库构建等)——序列测定——序列分析——结果解读——报告撰写。
广泛应用的核酸序列测定方法是直接测序法,目前最先进而且被广泛使用的方法…显示全部
基因检测的方法不胜枚举,基本的步骤是样本的获取(包括血液、唾液、组织样本等)——处理(如DNA的提取与纯化、文库构建等)——序列测定——序列分析——结果解读——报告撰写。
广泛应用的核酸序列测定方法是直接测序法,目前最先进而且被广泛使用的方法和仪器有第一代的Sanger测序法,第二代的高通量测序法(如美国Illumina公司的Hiseq测序仪和华大基因子公司CompleteGenomics开发的测序方法)等。
目前也已出现被称为第三代测序技术的方法,如单分子实时DNA测序法。
问题5:
现在有哪些基因检测对普通人来说是有价值有意义的?
回答:
1.靶向用药无创产前筛查干细胞治疗
2.对于成人的检测,感觉意义不是太大,等等吧,过几年估计会好很多,这块很受关注。
当然,对于孕妇,对于小孩,有些检测还是很靠谱的。
比如市面上比较成熟的无创产前DNA检测,对于年龄较大的孕妇很有用,唐筛不用做反正是高危,做个无创产筛方便很多,当然有的人说不如做羊水穿刺准确率更高啊,可要知道羊穿多危险啊想想就瘆的慌是不是。
。
。
再就是小孩子的耳聋基因检测我觉的很有必要,其实有很多小孩要是知道不能打青霉素也不至于一针致聋啊,要是知道这个小孩有一耳光致聋的基因,严加保护,能避免很多不必要的伤害。
这个东西不能一竿子打死,新生事物,我们多加保护哈,呵护它的成长。
3.有直接指导意义的遗传检测
这类检测主要包括运动、营养代谢以及药物敏感性等。
对于健康人来说,这方便的信息可以比较简单的就利用起来,用于优化生活方式,改善身体条件。
在医疗方面,规避一些有强烈副作用的药物也是很有必要的。
对部分备孕的人来说,测一下单基因病是否携带,尤其是是否刚好是同一种病的携带着,对生育健康也有一定指导意义。
这些都是能直接根据基因检测结果直接对健康管理行为作出指导的。
问题6:
基因检测方面的后续服务会如何发展?
回答:
1.基因检测帮助人们获取自己某方面的基因数组,了解自身的个体化特征,为生命健康发展提供一个基本依据,好比人体说明书。
因此,基因检测的服务涉及到人一生一系列健康生活的指导,包括运动减肥,饮食用药等等。
而就像体检科一样,体检检查出什么毛病了还要到其他门诊科室挂号治病。
基因检测作为大健康行业领域的一部份,检测结果只是提供一份健康数据,后续服务应该跟大健康行业领域相关机构共同合作完成。
2.基因检测就像身体的一本无字天书,虽然现在已经可以做基因全组测序,但是成本太高了,普通人群还是很难接受的,而市面上大多数基因检测机构并没有进行基因全组检测,只是截取一部分基因位点进行大数据验证对比,全组基因就像一个座旷世宝藏等着被发现被打开…显示全部
基因检测就像身体的一本无字天书,虽然现在已经可以做基因全组测序,但是成本太高了,普通人群还是很难接受的,而市面上大多数基因检测机构并没有进行基因全组检测,只是截取一部分基因位点进行大数据验证对比,全组基因就像一个座旷世宝藏等着被发现被打开,目前国大多数机构都是从事疾病这块的基因预测,对于运动、营养、美容,这些领域从事研究的基因检测机构屈指可数,其次很多机构提供基因检测服务,也能出报告,但是不能针对报告给出解决方案,这是目前最大的问题和难题。
333333.33明年毕业,选择了类似的行业,个人觉得这是(精准医学)个性化医疗发展的必然趋势,短期内在部分疾病(比如癌症)治疗方面会有大的发展,长远来看在多种疾病的个性化治疗方面应该还有很长的路要走,后续服务的话应该会提供一些私人健康指导,类似于家庭医生…显示全部
3.明年毕业,选择了类似的行业,个人觉得这是(精准医学)个性化医疗发展的必然趋势,短期在部分疾病(比如癌症)治疗方面会有大的发展,长远来看在多种疾病的个性化治疗方面应该还有很长的路要走,后续服务的话应该会提供一些私人健康指导,类似于家庭医生,不管怎样,我都坚信生物时代即将到来。
44444大家都在看能检测什么疾病,我觉得这真是极好的。
。
只是看了个裘德洛的电影叫《千钧一发》,讲未来的人都在出生前对基因进行更改的一个大背景,于是一个自然出身的人受到各种歧视的奋斗故事我对于基因检测能想到的,就是歧视问题了有人说歧视的问题交给法…显示全部
4这么跟你说吧,基因检测后面就像平常去医院验血一样,只不过基因检测能给你带来更丰富更深层次的信息量,用途就广多了,疾病的预防,诊断,治疗和保健等等都可以涉及到,当然,再发展下去就是个体化器官移植,个性化或者定制生育方向了。
基因能给你带来无限…显示全部
4.这么跟你说吧,基因检测后面就像平常去医院验血一样,只不过基因检测能给你带来更丰富更深层次的信息量,用途就广多了,疾病的预防,诊断,治疗和保健等等都可以涉及到,当然,再发展下去就是个体化器官移植,个性化或者定制生育方向了。
基因能给你带来无限的想象力,只是每一步都需要技术的革新与人类自我认识自我管理的进步。
5.5
这是个亟待回答的好问题但也很大。
假设问题问的是针对相对健康人群的基因检测服务,服务目的是帮助用户了解自身的基因组成,服务形式可以是直接面向终端消费者也可以是由医生提供给有需要的人群。
个人觉得基因检测后创业者至少有三件事可以做:
保健,防病和…显示全部
5.这是个亟待回答的好问题但也很大。
假设问题问的是针对相对健康人群的基因检测服务,服务目的是帮助用户了解自身的基因组成,服务形式可以是直接面向终端消费者也可以是由医生提供给有需要的人群。
个人觉得基因检测后创业者至少有三件事可以做:
保健,防病和优生。
觉得这块潜在市场最大而且政府的监管力度不会像其他两块(防病和优生)那么大,所以应该最容易有革新。
主要考虑饮食-三餐,保健品和营养建议。
考虑了用户基因的一日三餐和保健品服用理论上应该更健康有效。
虽然基因营养学(Nutrigenomics)还不广为人知,但随着人类基因组的完成,基因营养学也在稳步发展,十几年中基因研究已使我们对乳糖耐受,酒精反应,味觉敏感度,咖啡因代谢,维生素(包括维生素A,B-2,B-6,B-12,C,D,E等)水平,饮食习惯等重要营养因素的理解有了长足进步。
最近已有研究显示基于基因检测的营养建议比起标准营养建议更有效。
这里防病既是指不疾病预防也指得慢性病后的疾病控制以避免病情恶化。
这是远比饮食更复杂的问题,涉及饮食,锻炼,生活习惯等。
问题7:
无创产前基因检测(NIPT)是什么?
与一般产前诊断有什么区别?
回答:
1.无创产前基因检测是利用新一代高通量测序检测胎儿染色体异常的新一代产前检测技术。
通过采集孕妇外周血,对母体外周血血浆中的游离DNA片段(包括胎儿游离DNA)进行测序,结合生物信息分析,计算胎儿患染色体非整倍体的风险。
此技术能同时检测21-三体、18三体及13-三体,还可发现其他染色体非整倍体及染色体缺失/重复。
这项技术的关键是无创,就是对胎儿没有创伤,这是相对于传统介入性检测的一个概念。
这项技术可以减少不必要的穿刺,缓解产前诊断实验室压力;减少因穿刺而导致的流产;减少孕妇焦虑;减少漏诊,避免医疗纠纷;检测孕周为12-24周,单胎、双胎、试管婴儿妊娠孕妇均可检测;结果不受孕妇年龄、种族及是否患有糖尿病等妊娠相关疾病影响。
但是这项技术也有它的局限性:
目前不能检测易位导致的染色体异常;不能检测罗伯逊易位型和嵌合体型唐氏综合征;不能检测基因遗传疾病;不能筛查开放性神经管缺陷;不能预测晚期妊娠并发症;如检测为高风险需考虑后续进行产前诊断。
同时需明确,无创产前基因检测属于筛查畴,而产前诊断属于诊断畴,虽然拥有和产前诊断相似的准确度,但是仍然无法替代产前诊断。
产前诊断是指在胎儿出生前诊断胎儿是否患有某种遗传性或先天性疾病的一种手段,对于预防和控制新生儿发病率具有重要的临床意义。
目前,产前诊断主要以创伤性诊断方法为主,包括孕早期的绒毛穿刺,孕中期的羊水穿刺和孕晚期的脐带穿刺等。
中华人民国卫生行业标准Ws322.1-2010规订介人性产前诊断手术包括绒毛取材术、羊膜腔穿刺术和经皮脐血管穿刺术,分别应在孕10周~13周+6、孕16周~22周+6和孕18周之后进行。
产前诊断的“金标准”是对侵入性检测获得的胎儿标本行染色体核型分析。
技术成熟,准确率99%。
不足的是0.5%-1%的流产风险和0.5%-1%的胎儿致畸风险以及细胞培养失败的可能。
所以临床上主要用于高危人群(年龄高危和血清学筛查高危)的产前诊断。
2.
NIPT,简称无创产前检测,其实是应用于孕期产检的一项技术,这几年随着发展逐步走到大家的视野中,尤其是生过孩子的孕妈妈,多多少少都会听说过无创产前这几个字,今年连梁咏琪都来代言NIPT了,不过到底什么是NIPT,大部分人还是说不清楚是怎么一回事。
NIPT技术的产生,其检测基础是建立在孕妈妈外周血中存在着胎儿游离的DNA这一科学发现上的。
早在1997年,科学家就在已经在孕妇的血液中发现了胎儿游离DNA片段。
那时候科学家也用过很多办法,试图利用这一科学发现。
但是苦于技术的限制-----本来胎儿的DNA就是游离片段,片段如此的小(大约100多bp的平均大小,而人的基因组是3000000000bp以上,大家自行体会一下差距)人的基因组中还有大量重复序列,在当时的技术下,无法准确而稳定的通过母亲的外周血检测胎儿的基因组。
而用现在新的高通量测序技术,使得这个检测成为可能。
由于高通量测序仪的高通量(对我就是这么啰嗦,来打我啊),使得通过孕妈妈的外周血中的胎儿游离DNA检测胎儿的基因组异常技术上可以稳定实现,这是NIPT技术的理论基础。
回到我们的问题上来,NIPT是什么?
答:
通过采集孕妇外周血提取游离DNA,采用新一代高通量测序技术并结合生物信息分析,得出胎儿发生染色体非整倍体的风险率。
问题8:
目前个人基因测序的成本大约是多少?
回答:
1.看测多少吧,部分区域还是全外显子,或者全基因组,仅几十个基因的目标区域测序而言,试剂成本不上到两千的都不一定靠得住。
话说其实都是在给illumina打工啊!
上游试剂和仪器太贵了……算上测序仪和试剂,单独的测序成本大概在1000美元左右,而对外的售价是在1500-1800美元。
2.美国有个公司veritasgenetics,今年九月刚推出了一个亏本的个人基因组测序产品,测序加分析再加咨询全套才999美元。
可以说是业最低。
但只提供给参与它PGP项目(哈佛大学的个人基因组计划)志愿者,志愿者得允许对外公开个人的基因信息和健康信息。
拟招募10万人,现已有1.6万人参与。
现阶段,基因测序基本都是在专门的公司、机构进行的,因为这项业务的规模效应很明显,各个医院和体检中心分别开展不划算且结果相对不那么准确。
各个医院和体检中心一般会有与之合作的专门从事基因测序服务的公司。
3.基因测序的成本取决于你希望得到的测序数据的总量。
基因检测实际上有三种思路。
第一种是只关心基因组上的某些区域(已知这些区域的序列与疾病强相关、且只关心这种疾病的发病风险),这时候用的方法多半是经目标区域富集之后测序。
这种方法需要的测序量很小,平均到每个样品成本在数百人民币的级别。
第二种是关心基因组上的多个位点/区域(已知这些位点/区域的序列与疾病相关、关心多种疾病的发病风险),这时候常用的方法是基因芯片检测。
这种方法需要的测序量与想检测的位点个数直接相关。
平均到每个样品成本在几百到千元人民币的级别。
第三种就是全基因组测序了。
能获得更完整的基因组序列信息,提高对疾病风险估计的准确性,同时如果以后研究有了新进展的话可以不用再行测序即可获得更新的结果报告(涵盖更多疾病类型或结果准确性提升)。
这种方法的成本可低至两三千美金,但较低的测序量会影响结果的准确性。
之前听novogene的朋友说过一次,他们对外的个人基因全序列测序大概是4~5w。
公司内
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