DNDC 模型使用手册全部.docx
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DNDC模型使用手册全部
DNDC模型使用手册
(9.3版本)
新罕布什尔大学
地球海洋与空间研究所
2010年1月15日
致谢
我们感谢美国国家科学基金会(NSF)、美国航天与空间总署(NASA)、美国农业部(USDA)、环境保护署(EPA)、国家海洋与大气总署(NOAA)及国家大气研究中心(NCAR/UCAR)自1989年以来为发展DNDC模型所提供的持续支持。
世界许多国家的科研人员为该模型的发展做出了贡献,他们或为模型验证提供数据,还为模型添加新的功能。
这些研究者包括李长生(ChangshengLi美国)、斯苐夫·富罗京(SteveFrolking美国)、罗伯特·哈里斯(RobertHarriss美国)、里查德·泰瑞(RichardTerry美国)、麦克·凯雷(MichaelKeller美国)、帕提克·葛瑞尔(PatrickCrill美国)、安姬·卫紫(AntjeWeitz德国)、泰德·派克(TedPeck美国)、卫理·温岚德(WayneWendland美国)、大卫·金克森(DavidJenkinson英国)、王英平(YingpingWang澳大利亚)、庄亚辉(YahuiZhuang中国)、戴昭华(ZhaohuaDai中国)、罗尔·布兰特(RoelPlant荷兰)、周叶(YeZhou中国)、张宇(YuZhang中国)、林清华(QinghuaLin中国)、王晓科(XiaokeWang中国)、富罗里安·史坦格(FlorianStange德国)、克劳斯·布特巴赫-巴尔(KlausButterbach-Bahl德国)、汉斯·帕潘(HansPapen德国)、索菲亚·泽克美斯特-波坦斯顿(SophieZechmeister-Boltenstern奥地利)、郑循华(XunhuaZheng中国)、孙建中(JianzhongSun中国)、秦晓光(XiaoguangQin中国)、斯蒂夫·佳伟斯(SteveJarvis英国)、布朗尼·斯依德(BronwynSyed英国)、劳娜·布朗(LornaBrown英国)、雷·德斯佳丁(RayDesjardins加拿大)、沃特·斯密思(WardSmith加拿大)、布莱安·格兰特(BrianGrant加拿大)、罗·萨斯(RonSass美国)、黄燿(YaoHuang中国)、蔡祖聪(ZucongCai中国)、康国鼎(GuodingKang中国)、佳瑞亚·波佳瓦特(JariyaBoonjawat泰国)、鹤田治雄(HaruoTsuruta日本)、泽本卓治(TakujiSawamoto日本)、小林和彦(KazuhikoKobayashi日本)、邱建军(JianjunQiu中国)、拉福·柯斯(RalfKiese德国)、卡尔·特伦蒂(CarlTrettin美国)葛荪(SunGe美国)、徐成一(Cheng-IHsieh台湾)、雷纳德·莱姆克(Reynald.Lemke加拿大)、瑟雷德·萨喀(SurinderSaggar新西兰)、罗波·安德欧(RobbieAndrow新西兰)、阿温·缪斯(ArvinMosier美国)、卡罗斯·爱得阿多(CarlosEduardo巴西)、程根伟(GenweiCheng中国)、卡里·明科恩(CariMinkkinen芬兰)、雷诺·华兹曼(ReinerWassmann德国)、雷·斯玛喀甘(NuiSmakgahn泰国)、旭日(XuRi中国)、罗达·兰亭(RhodaLantin菲律宾)、罗伯特·雷(RobertRees英国)、中川阳子(YokoNakagawa日本)、丽达·法拉芭莎赞德(NedaFarahbakhshazad美国)、威廉·萨拉斯(WilliamSalas美国)、斯蒂夫·波斯(SteveBoles美国)、麓多门(TamonFumoto日本)、玛格达·克斯喀(MagdaKesik德国)、唐娜·基尔特拉普(DonnaGiltrap新西兰)、纳拉辛哈·萨帕里(NarasinhaShurpali芬兰)、赫曼舒·帕德克(HimanshuPathak印度)、加格蒂斯·巴布依日帕蒂(JagadeeshBabuYeluripati印度)、达安·巴赫德特(DaanBaheydt比利时)、斯蒂文·斯罗特尔(StevenSleutel比利时)、八木一行(KazuyukiYagi日本)、丹·杰伊斯(DanJaynes美国)、坦娜·泰娜斯(DanaDinners美国)、丹尼斯·麦克劳林(DennisMclaughlin美国)、克里斯蒂娜·托里特(ChristinaTonitto美国)、卡尔斯蒂·托普(KairstyTopp英国)、劳拉·克蒂娜斯(LauraCardenas英国)、泰德·迈克尔(ToddMitchell美国)、张凡(FanZhang中国)、周再兴(ZaixingZhou中国)、邓佳(JiaDeng中国)、朱波(BoZhu中国)、王立刚(LigangWang中国)、富兰克·密莱尔(FrankMitloehner美国)、乔基·木拉毛特(JojiMuramoto美国)、朱丽叶·库芭托瓦(Juliyakurbatova俄国)、安德烈·瓦尔金(AndrejVarlegin俄国)、娜塔丽娅·芭克娜(NatalyaBuchkina俄国)、陈德立(DeliChen澳大利亚)、李勇(YongLi澳大利亚)、鲁伊斯·巴登(LouiseBarton澳大利亚)、坦妮拉·克拉奇(DanielaKracher德国)、托德·富罗京(TodFrolking美国)、友瑞娜·可瓦克(YurinaKwack日本)。
我们感谢美国环保协会(EnvironmentalDefenseFund)为DNDC模型使用手册(9.3版本)的更新与中文本的翻译提供了财政方面的支持;“新英格兰中国文化中心”的吕瑞兰女士精心翻译了此手册,我们在此谨表谢意。
一.DNDC简述
1.导引
2.DNDC模型概述
二.DNDC的PC微软窗口版本
1.模型综述
2.硬件要求
3.模型安装
4.点位和区域的模拟
三.模型操作
1.点位模式
1.1输入参数
第1页:
气候
第2页:
土壤
第3页:
农田管理
第4页:
农作物
第5页:
耕作
第6页:
化肥施用
第7页:
有机肥料施用
第8页:
旱田灌溉
第9页:
水田淹灌
第10页:
塑膜技术
第11页:
放牧和割草
1.2.保存输入参数
1.3.点位尺度模拟
1.4.快速查看模拟结果
1.5.批量模拟
2.区域模式
2.1.地理信息系统数据库
2.2.气象数据库
2.3.作物和土壤数据库
2.4.区域模拟的初始化
2.4.实施区域模拟
四.模拟结果数据
1.点位模拟结果
2.区域模拟结果
五.不确定性分析
六.实例分析
1.美国爱荷华州的玉米生长
2.美国夏威夷的甘蔗生长
3.英国洛桑实验站冬小麦土壤有机碳150年动态
4.法国阿罗农田氧化亚氮排放
5.美国德克萨斯州水稻田甲烷排放:
七.相关文章目录
一.
DNDC简述
1.导引
DNDC模型是一个描述农业生态系统中碳和氮生物地球化学过程的计算机模拟模型。
本手册告诉使用者怎样用DNDC模型来模拟农业生态系统的农作物产量、土壤固碳作用、硝酸盐淋失以及碳和氮多种气体的排放。
本手册第一部分简要介绍与DNDC有关的科学背景知识;第二部分介绍如何安装模型;第三介绍如何分别在点位和区域尺度上输入参数及进行模拟;第四部分介绍模拟结果的内容;第五部分介绍如何对DNDC模拟的结果进行不确定性分析;第六部分提供了五个点位尺度的实例研究,具体展示如何一步步地输入模型模拟所需的输入参数;第七部分提供了迄今已发表的与DNDC相关的部分文章的目录,这些文章提供了更多的有关DNDC的科学背景及应用情况。
2.DNDC模型概述
DNDC是Denitrification-Decomposition(即“反硝化-分解作用”)的缩写。
反硝化和有机质分解是导致氮和碳从土壤丢失而转移入大气的主要生物地球化学过程。
DNDC模型是农业生态系统中一系列控制碳和氮迁移转化的生物化学及地球化学反应机制的计算机模拟表达。
DNDC由两大部分组成。
第一部分包括土壤气候、农作物生长和土壤有机质分解三个子模型,利用生态驱动因子(即气候、土壤、植被以及人类活动)来模拟土壤环境条件(即土壤温度、水分、酸碱度、氧化还原电位以及相关化学底物浓度梯度)。
第二部分包括硝化作用、反硝化作用以及发酵作用三个子模型,模拟土壤环境条件对微生物活动的影响,计算植物-土壤系统中二氧化碳(CO2),甲烷(CH4),氨(NH3),氧化亚氮(N2O),一氧化氮(NO)以及氮气(N2)的排放。
DNDC中所采用的函数来自物理学、化学和生物学的经典法则或实验室研究所产生的经验方程。
DNDC是一座架在基本生态驱动因子和碳氮生物地球化学循环之间的桥梁(图1)。
图1.DNDC模型的结构
在DNDC模型中,土壤碳存在于四个主要碳库中:
即植物凋落物、微生物、活性腐殖质和惰性腐殖质。
上述每一碳库又包含两到三个亚库。
每一亚库有一特定分解速率;每个亚库中有机碳(SOC)的分解速度是由该库的库容、土壤温度和湿度、土壤粘土含量及土壤可给态氮量所决定。
当在一个库中的土壤SOC发生分解时,被分解的SOC的一部分以二氧化碳的形式从土壤丢失而进入大气,另一部分转移入该土壤其他碳库。
在此过程中,溶解态的有机碳(DOC)会产生出来,这部分碳或被土壤微生物再利用,或随水淋失。
SOC总是与有机氮(SON)共存;当SOC分解时,SON或转化到另一有机物库,或被矿化为铵离子(NH4+)。
游离态铵与吸附在粘土表面的可交换铵之间保持动态化学平衡。
土壤水相中铵和氨保持化学平衡。
溶解态氨可转换为氨气而从土壤挥发出去;此氨挥发过程受土壤氨量及土壤环境要素(即温度、水分及酸碱度)控制。
当下雨或灌溉时,土壤中的硝酸根离子(NO3-)会溶解入淋溶水而渗透到深层土壤或地层中。
为模拟微生物参与的氧化还原反应(即硝化作用、反硝化作用、甲烷生成及甲烷氧化作用),模型中使用了一个虚拟的“厌氧气球”来模拟氧化和还原反应在一个土壤中不同微区同时发生的动态过程。
例如,根据模拟的土壤氧气或其它氧化物含量,DNDC依靠能斯特公式(NernstEquation)计算土壤的总体氧化还原电位(Eh);然后依据Eh值将土壤划分为相对好氧与相对厌氧两部分。
在好氧部分,硝化作用发生;在厌氧部分,反硝化作用。
硝化或反硝化作用的速率由米邵公式(Michaelis-MentenEquation)计算,该公式计算在双营养物料浓度驱动下的微生物生长。
当土壤Eh值变小,这个厌氧气球胀大,更多的营养物质(即DOC、铵或硝酸根)将分配到气球内部(即厌氧微区),从而加强了反硝化作用。
当土壤Eh值变大时,厌氧气球缩小,较多营养物质被重新分配到好氧的微环境,硝化作用从而被加速。
如果厌氧气球很大,由硝化或反硝化作用所产生的气体(如NO和N2O)都要在厌氧环境中扩散较长路径,从而可能被更多地还原成氮气(N2)。
如果土壤长期(几天到几个月)被水浸没,土壤中氧化物会消耗殆尽,土壤氧化还原电位将进一步降低,导致厌氧分解或发酵作用发生,此时即有硫化氢(H2S)和甲烷(CH4)气体产生。
植物生长对土壤中水、碳和氮的动态有重大影响,从而控制土壤一系列生物地球化学过程。
DNDC模拟作物生长时,需要该作物的生理及物候学参数,这组参数包括作物最大生产量、生长积温、生物量在根、茎、叶及籽粒间的分配、根、茎、叶及籽粒中的碳氮含量比值(C/N)、作物需水量、作物固氮能力等。
DNDC提供了约50种主要作物的生理及物候学参数的默认值,这些默认值大部分来自北美的观测,不一定适合於其他地区。
使用者需对这些参数进行检验或修正,以使DNDC可较准确地模拟作物生长。
使用者如果有自己在作物生长方面的观测数据(如生长期生物量、产量、CO2排放量等),可用自己的实地观测数据来检查模拟的植物生长动态或产量。
如有偏差,应对作物相应参数进行修正,直到作物生长得到正确模拟。
这一校验过程是有趣的,有助于你去了解自己的作物;大部分使用者经过几次练习,即可熟练掌握此技术。
为方便使用者,DNDC提供一个名为“作物创造者”(CropCreator)的工具;打开此工具,使用者可以容易地修改作物参数。
对土壤参数也可以进行类似修改。
农作物对氮的需求量是根据每日作物生长量及作物碳氮比值来计算的。
作物的实际氮吸收量受制於土壤中氮和水的可供给能力。
庄稼收割后所有根都留在土壤中,一部分或全部地面上作物秸秆残留在地里;这些茬留在地面上,直到下次耕地时,才被翻进土中。
这些秸秆一旦与土壤混合,即被DNDC根据其碳/氮比值分配到土壤的三个凋落物库,即非常易分解、易分解和难分解的凋落物库。
这些凋落物的混入,是土壤有机质的主要来源,使植物与土壤结合成一个相互反馈的生物地球化学系统。
DNDC的运行依靠四个基本生态因子驱动,即气候、土壤、植被和管理。
因此,要实现一个成功的模拟,获得这四个因子的充分并准确的数据是至关重要的。
本手册将通过输入界面介绍和实例分析,向使用者详述如何进行参数输入。
二.
DNDC的PC微软窗口版本
1.模型综述
DNDC模型可模拟在点位和区域尺度上农业生态系统中碳和氮的生物地球化学过程。
对于点位的模拟,使用者可通过模型的输入界面手动操作输进所有必须的输入参数。
对于区域上的模拟,DNDC需要从一个事先设置好的数据库中读取所有输入参数;该数据库包含了模拟区域中的所有多边形或坐标格点的气候、土壤、植被和经营管理方面的信息。
DNDC用VisualC++6.0语言写成,在微软Windows环境下运行。
2.硬件要求
运转DNDC模型需要一部有微软Windows配置的计算机。
最低的储存是64M。
计算机处理速度为350MHz或更高,需要SVGA或更高级的图像插卡。
一个一百年的模拟所产生的结果文件需要硬盘空间约为0.5MB.
3.模型安装
你应随此手册得到一个DVD光盘,其中录有DNDC模型及所有支持文件。
如果没有此光盘,你可进入DNDC网址http//www.dndc.sr.unh.edu,从中下载一个压缩文件包,此文件包中包含DNDC模型及所有相关数据文件。
解文件包后,双击“Install”(安装)文件名,计算机将自动把DNDC及相关文件安装在你的计算机的C盘中。
在C盘的DNDC文件夹中包含最新版本的DNDC(即DNDC93)以及支持模型运转所需的数据。
在C:
\DNDC\Library\目录内,有随DNDC而来的农作物和土壤默认值资料数据。
在C:
\DNDC\Database\目录内,有一名为Shangrila(香格里拉)的子文件夹,内含一套完整的区域数据文件。
这些香格里拉数据文件是作为一个例子提供的;审阅此组文件,你将了解区域模拟所必需的输入数据的文件种类、内容及格式。
只要依照香格里拉文件的格式填写自己的数据,使用者能容易地创建自己的区域数据库。
在完成上述安装后,你就可以运转DNDC了。
让我们到C:
\DNDC\目录下点击DNDC93.exe,一起来启动这个模型。
4.点位和区域的模拟
当模型启动后,主菜单显示在屏幕上(图2)。
图2.DNDC模型的主菜单
点位模拟模式
点击主菜单的【点位】/【输入】(或Site边的Input)键,开始对一个点位的模拟提供输入参数。
输入程序包括对三部分参数的提供,其内容为
(1)气象信息、
(2)土壤信息和(3)农田管理信息。
农田管理信息页内又包含8个子页,让使用者去确定农作物的种类与轮作、耕作、化肥施用、有机肥施用、旱地灌溉、水田淹灌、塑膜技术、放牧与割草。
在输入过程中,你可回到前面任何一页进行修改。
但你要记住,当你完成一页的输入或修改后,一定要点击该页上的【接受】键;否则,计算机不会记住你输入或修改过的数据。
当你把所有页中要求的参数全部输入后,请点击在主菜单下边的【OK】键,告诉计算机输入程序已完成。
通过点击【OK】键,所有输入的数据将自动转换成DNDC的内部输入文件,这些文件储存在C:
\DNDC\Result\Input目录下;此时DNDC已全部就绪,准备对该点位执行模拟。
此时你若点击【模拟】键,DNDC即开始执行这一模拟。
你可能会有点好奇:
点击【模拟】后,DNDC将做些什么事呢?
这里向你简单介绍一下。
在点击【模拟】后,DNDC首先从储存在C:
\DNDC\Result\Input\目录下的输入文件中读取所有输入参数,从而得到该模拟点位的气象、土壤和农田管理的所有信息。
然后DNDC开始对第一年进行逐日模拟。
在一日模拟中,DNDC首先模拟土壤温度、湿度和氧化还原电位;然后模拟植物生长;而后模拟土壤有机质分解;最后模拟土壤微生物驱动的硝化、反硝化和发酵过程。
根据每天的气象数据、土壤物理性状及作物生长,土壤各层的温度、湿度、水分迁移及氧化还原电位首先被算出。
然后,DNDC根据生长积温计算植物日潜在生长量、水分的需求量、氮的需求量;根据土壤的实有水量及氮量,DNDC计算水胁迫和氮胁迫,从而计算作物对水和氮的实际吸收,由此算出作物实际生长量。
根据作物参数,DNDC将每日作物生长量分配到根、茎、叶及籽粒中。
土壤有机质分解过程的模拟是基于各层土壤中的有机质含量、土壤气候及土壤中可给态氮的含量。
DNDC根据土壤氧化还原电位及基质(如DOC,NH4+,NO3-,NO,N2O)浓度计算硝化和反硝化过程,并确定含氮气体的排放。
在农田淹灌的情况下,DNDC追踪土壤硝酸盐、亚硝酸盐、高价锰(Mn+4)、高价铁(Fe3+)以及硫酸盐的浓度变化来追踪土壤的氧化还原电位演化。
在氧化还原电位低於一个特定阈值时,发酵作用的子模型将被启动去计算甲烷(CH4)的产量。
在输入程序的过程中,如果你要求记录每日模拟结果,DNDC将会记录每日的植物生长情况、土壤温湿变化、水分迁移、土壤中碳汇和碳通量、土壤中氮汇和氮通量、硝酸盐的淋溶流失以及各种气体的排放通量。
按照以上所述顺序,DNDC对该农业生态系统实施逐日模拟,直到这年的最后一天。
在一年模拟结束时,DNDC会产生一个年度报告,总结该全年度碳、氮和水在该农业生态系统中的收支平衡。
若实施多年模拟,DNDC会在一年模拟结束后,自动开始下一年的模拟。
模拟将会一年又一年连续不断地进行下去,直到全部模拟完成。
所有模拟产生的每天和每年的结果都贮存在”C:
\DNDC\Result\Record\Site\”目录下的文件中。
区域模拟模式
使用DNDC实施区域模拟,你必须事先获取整个区域所有格点所需的输入数据,并将它们存储在特定的数据库中。
此数据库包括两种类型的数据文件:
地理信息系统(GIS)数据和通用资料数据。
地理信息系统数据涵盖待模拟区域的所有多边形或格点,其内容包括各格点的地理位置、气象数据文件名、土壤性质、种植系统及农田管理方面的信息。
通用资料数据文件则储存通用数据,如植物生理/物候学参数、土壤水热性能参数及气象数据。
我们鼓励使用者去浏览一下与存放在“香格里拉”文件夹中的所有数据,这样你就会熟悉整个数据库的结构、内容及格式,有助于将来建立自己的区域数据库。
如果你的区域数据库已建立起来,你就可以进行区域模拟了。
有关区域数据库建立与模拟结果的详情细节将在后面有关章节中论及。
三.模型操作
在C:
\DNDC\目录下,点击DNDC93.exe,模型启动。
一开始,你会看到一个主菜单(图2)。
在此主菜单上,你可选择进行点位或区域模拟。
1.点位模式
在点位模式下操作,大部分数据通过手工方式由输入界面各页输入。
让我们现在开始吧!
1.1.输入参数
点击主菜单的【点位】/【输入】键,你会看到新的一页,它是“气候”页(图3)。
第1页:
气候
这是点位模拟输入程序的第一页。
在此页中,你需要输入待模拟点位的地理位置和有关气候参数。
图3.地理和气候信息输入
输入项目
解释
点位名称
一个字符串(不要留空白)
纬度
点位纬度(十进位)
模拟年数
一个整数
记录每日模拟结果
令DNDC记录每日模拟结果
选取气象数据文件
点击此键可以浏览并选择所需的气象文件,用“上移“和“下移“两键来调整你所选的气象文件的顺序。
双击一个气象文件名,可将它从目录中剔除。
使用一年文件模拟多年
选择此项可使用一年气象文件来模拟所有各年。
从一事先备好的文件中读取气候文件名称
点击此项,使你能从事先准备的一个文件中顺序读取所有需要的气象文件名字。
其格式如下:
选择你的气象文件的格式
挑选一种格式与你的气象文件相一致
降雨中氮平均浓度(mgN/Lorppm)
降雨中氮的(溶解的硝酸盐和铵)年平均浓度,单位mgN/L或ppm。
空气中氨平均浓度(ugN/m^3)(0.06)
大气中氨气的平均浓度(默认值为0.06ugN/m3)。
该浓度影响对植物叶片对氨气的吸收,即氮的干沉降。
大气CO2平均浓度(ppm)(350)
大气二氧化碳平均浓度。
该值影响植物光合作用(默认值为350ppm).
大气CO2浓度年增长速率(ppm/年)
对于多年的模拟,通过设立此项可自动调整大气中逐年二氧化碳的浓度变化。
需用的气象数据文件必须事先准备好。
文件都应是单纯的文本文件(即ASC11)。
每一年应有一个单独的文件。
DNDC接收五种不同的格式的气象数据。
格式1
第一列是文件名,第一纵行是儒略日(Julianday),第二纵行是空气日平均温度(°C),第三纵行是日降雨量(厘米)。
格式2
第一列是文件名,第一纵行是儒略日(Julianday),第二纵行是空气日最高温度(°C),第二纵行是空气日最低温度(°C),第四纵行是日降雨量(厘米)。
格式3
第一列是文件名,第一纵行是儒略日(Julianday),第二纵行是空气日最高温度(°C),第二纵行是空气日最低温度(°C),第四纵行是日降雨量(厘米),第五纵行是太阳辐射(百万焦耳/平方米/日)。
格式4
第一列是文件名,第一纵行是儒略日(Julianday),第二纵行是空气日最高温度(°C),第二纵行是空气日最低温度(°C),第四纵行是日降雨量(厘米),第五纵行是日平均风速(米/秒)。
格式5
第一列是文件名,第一纵行是儒略日(Julianday),第二纵行是空气日最高温度(°C),第二纵行是空气日最低温度(°C),第四纵行是日降雨量(厘米),第五纵行是日平均风速(米/秒),第六是太阳辐射(百万焦耳/平方米/日)。
在此页中,DNDC为氨(NH3)和二氧化碳(CO2)的大气背景浓度提供了默认值,你可使用此值或对它们进行修改。
当你完成此页上所有输入项目后,点击【接受】键,所有输入的信息将移入计算机的内存。
在移入过程中,DNDC会检查气象文件中是否有错误;若有错误,DNDC将作出提示。
第2页:
土壤
点击在输入界面页上方的【土壤】键,打开土壤参数页(图4),准备输入土壤参数。
图4.土壤数据输入
输入项目
解释
土地利用类型
选择当前土地利用类型。
选项为:
旱作农田、水稻田、湿润草地/牧场、干旱草地/牧场、湿地。
质地类型
根据土壤质地类型或粘土成分含量来选择一种土壤类型。
共有12种类型,包括沙土、肥沙土、淤泥肥土、肥土、沙粘肥土、淤泥粘肥土、粘肥土、沙粘土、淤泥粘土和有机土。
容重(g/cm3)
上层土壤(0-10cm)的密度
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