动物育种学实验指导.docx
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动物育种学实验指导
动物育种学实验指导
西南科技大学生命科学与工程
(适于动物科学专业)
蔡欣编著
0
实验一家畜外貌部位识别与体尺测量
一、实验目的
通过部位识别,要求认真掌握家畜体表各部位的名称、起止范围、外部形态和内部结构,为以后的体尺测量和外形鉴定打好基础。
通过体尺测量,要求准确掌握各体尺的起止点和测量方法,以及注意事项。
二、内容与方法
1.部位识别
外形鉴定的重要部位有:
头、颈、髻甲、背、腰、尻、胸、腹、乳房、四肢、蹄等。
(1)头部
以角根或耳根的后侧到下颚后缘的联线与颈部为界。
包括以下部位(眼、耳、鼻、口、颊等)。
W1.额:
以额骨为基础,上自两角根或两耳根联线,下至两眼内角联线。
W2.鼻镜:
为一光滑湿润无毛的部位,分布在鼻孔周围,为牛等所特有;猪的称为鼻喙(吻)。
W3.下颚:
以下颚骨为基础。
W4.脸(颜面):
上至两眼联线,下至鼻镜,两侧与颊相连,其中央为明显突起的鼻梁。
W5.颐:
指位于马下唇下前方的圆形隆起部位。
(2)颈部
以髻甲前缘到肩端的联线与前躯分界,主要部位包括(颈静脉沟、颈侧、喉、项等)。
W6.颈脊:
是颈上缘的隆起肥厚部分,为公牛的第二性征之一。
W7.垂皮:
为牛颈下缘的游离皮肤,借以增加散热面积。
细毛羊在此部位有发达的纵皱折。
(3)前躯
以前肢诸骨为基础,以肩胛骨后缘到肘端的联线与中躯分界,主要部位包括:
W8.前胸:
为向前突出于两前肢间的胸部。
W9.髻甲:
是界于颈背之间的隆起部位。
它以脊椎的中间几个棘突为基础,两侧与肩胛骨上缘相连。
W10.肩:
以肩胛骨为基础,在体躯的两侧。
W11.上膊:
以上膊骨为基础,位于肩端之下后方。
W12.前膊:
以桡骨和尺骨为基础,是界于肘和腕之间的体表部位。
W13.腕:
是腕关节的体表部位。
W14.管:
是以大掌骨为基础的体表部位。
(4)中躯
以腰角前缘到膝关节的联线与后躯分界,主要部位包括:
W15.背:
以最后6-8个脊椎为基础,是指从髻甲到腰部的体表部位,两侧与肋相连。
“背线”则指由髻甲至尾根的全长。
W16.胸:
以肋骨为基础,位于中躯两侧。
W17.腰:
以腰椎为基础,无肋骨相连。
W18.肷(腰窝):
是肋骨后、腰角前、腰椎下的无骨部分,呈三角形。
肉用家畜因皮下脂肪发达,该部位与肋平齐,故合并称之为体侧。
W19.腹:
是整个腹腔的体表部位。
W20.胁(腋):
是躯体与四肢相连的下凹处,可分为前胁与后胁。
W21.乳井:
为乳静脉进入胸腔的两个凹陷部位,乳牛大而深。
(4)后躯
主要部位包括:
W22.乳房:
是母畜乳腺组织的体表部位。
乳房下牛和骆驼有四个乳头,马和羊2个,猪一般在12个以上。
W23.乳镜:
位于阴户下的两股间,乳牛此部位大而有细微皱纹。
W24.腰角:
以肠骨外角为基础,它是后躯两侧突出的棱角。
两腰角联线与背线相交处,称“十字部”。
W25.臀角:
是髋关节的体表部位。
W26.臀端(坐骨端):
位于肛门两侧,以坐骨结节为基础。
W27.尻:
位于后躯之上,以荐椎为基础。
它以腰角、臀角和臀端的联线与大腿分界。
W28.大腿:
以股骨为基础,上接尻,前连肷,是肌肉最多之处。
大腿之后,乳镜两侧,半腱肌和半模肌的体表部位称“臀”。
W29.膝(后膝):
是膝关节的体表部位。
W30.小腿:
以胫、腓骨为基础的体表部位,位于膝之下,飞节之上。
W31.飞节:
为跗关节的体表部位。
飞节后方的突起部分称“飞端”。
W32.尾:
以最前一个可以自由活动的尾椎为尾之起点。
2.体尺测量
家畜体表各部位,不论长度、宽度、高度和角度,凡是用数字表示其大小者均称为体尺。
体尺种类很多,测量多少可根据具体目的和畜种而定。
生产中多测体高、体长、胸围、管围四项,但是研究工作中测量项目可有:
C1.体高(髻甲高):
用杖尺测量髻甲高点至地面的垂直距离。
C2.背高:
用杖尺测量背部最低点至地面的垂直距离。
C3.尻高(荐高):
用杖尺测量荐部最高点至地面的垂直距离。
C4.臀端高(坐骨端高):
用杖尺测量臀端上缘至地面的垂直距离。
C5.前肢高:
在马是用杖尺量取肘端上缘至地面的垂直距离。
C6.体长(体斜长):
是肩端前缘到臀端后缘的直线距离。
用杖尺和卷尺都可以量取。
C7.身长:
用卷尺量取猪的两耳联线中点到尾根的水平距离。
C8.头长:
用卡尺测量额顶至鼻镜上缘(牛等)或鼻端(马)的直线距离。
C9.颈长:
用卷尺量取由枕骨脊中点到肩胛前缘下1/3处的距离。
C10.尻长:
用卡尺量取腰角前缘到臀端后缘的直线距离。
C11.胸宽:
将杖尺的两横尺夹住两侧肩胛后缘下面的胸部最宽处,便可读出其宽度。
C12.额宽:
有两种测量方法,较多测量的是最大额宽。
①最大额宽:
用卡尺量取两侧眼眶外缘间的直线距离。
②最小额宽:
用卡尺量取两侧颞部外缘间的直线距离。
C13.腰角宽:
用卡尺量取两腰角外缘间的水平距离。
C14.臀端宽(坐骨结节宽):
用卡尺量取两臀端外缘间的水平距离。
C15.胸深:
用杖尺量取髻甲至胸骨下缘的垂直距离。
C16.头深:
用卡尺量取两眼内角联线中点到下颚下缘的垂直距离。
C17.胸围:
用卷尺在肩胛后缘处测量的胸部垂直周径。
C18.腹围:
用卷尺量取腹部最大处的垂直周径,较多用之于猪。
2
C19.管围:
用卷尺量取管部最细处的水平周径,其位置一般在掌骨的上1/3处。
C20.腿臀围(半臀围):
用卷尺由左侧后膝前缘突起,绕经两股后面,至右侧后膝前缘突起的水平半周。
该体尺一般多用于肉用家畜,表示腿部肌肉的发育程度。
三、作业与思考题
1.绘制出乳牛的外形轮廓,并将本实验中讲过的32个部位逐一标出。
2.各小组记录所测家畜的体尺测量结果。
3
实验二个体育种值的估计
一、实验目的
要求进一步掌握估计育种值的原理和方法。
二、估计育种值的方法
1.复合育种值估计的原理
(1)四个加权系数互不相干;
(2)四个系数之和为1;
(3)为了计算方便,对四个系数只取一位小数。
为此,这四个系数只能是0.1、0.2、0.3、0.4,于是复合育种值的简化公式就是:
式中的A1~A4分别代表该种信息估计的育种值由性状的h2来确定,如有缺项,该项以零计。
10.2A20.3A30.4A4为了计算出A1、A2、A3、A4,需要应用下列公式:
A某0.1A
A1A2A3A4
h2<0.2h2<0.6h2≥0.6亲本亲本亲本自身同胞同胞同胞自身后裔后裔后裔自身
A1(P1P)h1A3(P3P)h32A0.1A0某1这时,可直接用表型值和遗传力系数代入,计算它的复合育种值。
0.1(P1P2.简化的复合育种值估计
已知一头公羊及其有关亲属的剪毛量记录,假设他们都来自同一群体,该群体的均值为
5.0,剪毛量的遗传力近似为h2=0.2。
已知半同胞兄妹的遗传力系数为0.8593,利用各种不同的信息估计该性状种公羊的育种值。
公羊号本身父亲母亲祖父祖母外祖父外祖母半同胞兄妹n9-7818.213.65.610.47.610.74.3116均值5.73半同胞子女n15均值6.08
4
(1)确定公羊剪毛量性状遗传力的范围
(3)用表型值和遗传力系数代入相应公式可以计算出复合育种值
三、作业与思考题
2.估计本实验中公羊的个体育种值。
实验三综合选择指数的制定
一、实验目的
了解选择指数法的基本原理,掌握选择指数的制定方法与注意事项。
二、原理与公式
5
家畜育种中,经常需要同时选择一个以上的性状。
应用数量遗传的原理,根据性状的遗传特点和经济价值,把所要选择的几个性状综合成一个使个体间可以互相比较的数值,这个数值就是选择指数。
其公式是:
IWh211P1P1Wh222P2P2......Wh2nnPnPnWihi2i1nPiPi
公式表示,所选择的性状在指数中受三个因素的决定:
①性状的育种值或经济重要性(Wi);②性状的遗传力(hi2);
③个体表型值与畜群平均值的比值(
PiPi)。
一般来说,经济价值高的性状,育种重要性也大。
但是有时两者并不等同,例如我国目前市场上牛奶的价格,并不根据乳中的脂肪或干物质的多少来分级。
如果单从牛场经济收益考虑,就完全可置之于不顾。
但从提高牛乳质量和增进人民健康考虑,选择指数中应当包括牛乳的质量指标,并给以适当的加权值。
三、制定方法
为了选种上的方便,可把各性状都处于畜群平均数的个体指数值定为100,其他家畜与100相比,超过100越多的个体越好。
这时指数公式需作进一步变换。
Ia1这里,
P1P1na2P2P2......anPnPnaii1nPiPi
ai1i100
例如要制定一个繁殖期母猪的产仔数、断乳时产仔数、断乳窝重三个性状的选择指数,其具体步骤是:
1.计算必要的数据
现假定下列数据为已知:
2窝产仔数(头)P19h10.1W10.32断乳仔数(头)P28h20.2W20.3
2断乳窝重(Kg)P3120h30.2W30.4
6
其中,W1:
W2:
W30.3:
0.3:
0.4而且,W1W2W31
2.计算a值
设每个性状都处于畜群平均数的个体,其指数为100,于是:
2P2P22P31IaW1h1W2h2W3h3100
P1P2P3当P2P2,P1P1,P3P3时,
22IaW1h12W2h2W3h3100
a1a2a3100
100a2W1h12W2h2W3h321000.30.10.30.20.40.2588.24再把a值按比例分配给三个性状,分别求出a1、a2、a3。
a1W1h12a0.30.1588.2417.65
2a2W2h2a0.30.2588.2435.292a3W3h3a0.40.2588.2447.06
3.计算选择指数
把ai值代入公式得:
I17.65P1P135.29P2P247.06P3P3
由于各性状的畜群平均数(Pi)为已知,指数公式还可以表示为:
P17.6535.29P1P247.06398P31.96PP20.196P314.41I
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把每个性状的表型值代入,就可以计算出选择指数。
四、操练
我国北方地区的黑白花奶牛目前重要选种指标是:
(1)产乳量;
(2)乳脂率;(3)体质外貌总分。
现在要制定这三个性状的选择指数。
现假定下列数据为已知:
1.产乳量:
PKgh120.3W10.41400022.乳脂率:
P23.4%h20.4W20.35
23.体质外貌评分:
P370分h30.3W30.25
其中,W1:
W2:
W30.40:
0.35:
0.25而且,W1W2W31
五、作业与思考题
1.选择指数制定的前提条件是什么?
2.制定本实验中我国北方地区的黑白花奶牛三个性状的选择指数。
实验四家畜亲缘系谱的构建及其近交与亲缘系数的计算
实验项目性质:
本实验为动物科学专业高年级本科生开设,需要综合运用《动物遗传学》、《动物育种学》、《数量遗传学》以及《生物统计学》等学科中遗传系谱的绘制、遗传系谱的分析及其转换、通径分析等知识,学习和掌握近交程度和亲缘程度的估计和计算方法。
该实验分析基础性综
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合性较强、难度较大、适用性强,对于培养学生在动物遗传育种方面的综合分析技能具有非常重要的意义。
实验计划学时:
3学时
一、基础知识与分析方法介绍
1.1系谱的构建设
竖式系谱,就是按子代在上,亲代在下,公畜在右,母畜在左的格式,按次填写。
子代母外祖母外祖母的母亲外祖母的父亲外祖父外祖父的母亲外祖父的父亲祖母祖母的母亲祖母的父亲父祖父祖父的母亲祖父的父亲Ⅰ(亲代)Ⅱ(祖代)Ⅲ(曾祖代)系谱中的生产成绩,可以按照Ⅰ-305-4556-3.6的方法来缩写,意即第一胎、305天产乳4556kg、乳脂率为3.6%。
同样对体尺指标也可以按136-151-182-19的方法来缩写,意即为体高136cm、体长151cm、胸围182cm、管围19cm。
现将1号金华猪的竖式系谱示例如下:
1号13213736—22—352522—1122—1.1.2横式系谱(括号式系谱)它是按子代在左,亲代在右,公畜在上,母畜在下的格式来填写的。
系谱正中可划一横虚线,表示上半部为父系祖先,下半部为母系祖先。
横式系谱各祖先血统关系的模式:
图1横式系谱模式
现将1号金华猪的横式系谱示例如下:
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图21号金华猪的横式系谱
1.1.3结构式系谱(系谱结构图)
结构式系谱比较简单,无需注明各项内容,只要能表明系谱中的亲缘关系即可。
其构建原则如下:
(1)公畜用方块“□”表示,母畜用圆圈“〇”表示。
(2)绘图前,先将出现次数最多的共同祖先找出,放在一个适中的位置上,以免线条过多交叉。
(3)为使制图清晰,可将同一代的祖先放在一个水平线上。
有的共同祖先在几个世代中重复出现,则可将它放在最早出现的那一代位置上。
(4)同一头家畜,不论它在系谱中出现多少次,只能占据一个位置,出现多少次即用多少根线条来连接。
现仍以1号金华猪的系谱为例,绘出结构式系谱如下:
代数应有祖先实有祖先Ⅰ22
Ⅱ42
Ⅲ84
图31号金华猪的结构式系谱
1.1.4箭头式系谱
箭头式系谱是专供作评定亲缘程度时使用的一种格式,凡是与此无关的个体都可以不必画出。
现仍以仍以1号金华猪的系谱为例,绘出箭头式系谱如下:
图41号金华猪的箭头式系谱
1.2通径分析
通径分析的方法是S.wright(1921)提出来的,它的主要优点是能够借助图解简单地阐明各变量之间的关系。
在家畜育种工作中,可利用通径分析来剖分相关性状间的直接关系与间
10
接关系,从而揭露出性状间的真实关系。
1.2.1通径系数的概念
两个有关变量之间有两种关系,一是平行关系,一是因果关系。
具有平行关系的双方不分因果,只是由于两者具有共同原因,或互为因果,因此彼此相关。
例如猪的屠宰体重(Y)是由生长速度(某1)和4月龄体重(某2)决定的,而它们又是由饲养条件(某3)决定的,这些变量中屠宰体重(Y)为结果变量,生长速度(某1)和4月龄体重(某2)是原因变量,但是,它们同时又为饲养条件(某3)的结果变量,饲养条件(某3)为原因变量,它们之间的关系可以用以下图解来表示:
图5变量之间的关系图
由图可见,用单箭头线表示因果关系,方向是由因到果;用双箭头线代表平行的相互关系,在左图中表示某3是某1和某2的共同原因,在右图中省略了某3,用1条双箭头线代替2条单箭头线。
通常单箭头线称为通径线,双箭头线称为相关线。
为了便于运算,需要用一个数字来表明每条线的相对重要性,这一数字就称为系数。
通径线的系数就是通径系数,相关线的系数便是相关系数。
通径系数(pathcoefficient)就是标准化的回归系数,在多变量情况下,就是标准化的偏回归系数。
用公式表示如下:
Py,某by,某某y上式中Py,某为通径系数,其下标中依变量在前,自变量在后,二者之间用点分开,由于经过了标准化,所以通径系数没有单位。
事实上,在只有2个变量的情况下,通径系数等于相关系数。
1.2.2通径链的追溯规则
通径系数运算的关键是正确找出变量间的全部通径链,现将通径链追溯的规则总结如下:
(1)注意通径方向,只能“先退后进”,不能“先进后退”,并且可以连续后退或连续前进。
由图6可见,Y1与Y2之间有4条通径链,即①Y1←某2→Y2,②Y1←某3→Y2,③Y1←某2←→某3→Y2,④Y1←某3←→某2→Y2,其中前两通径链都是从Y1倒退,在某2或某3转向至Y2,后两条同样是从Y1倒退,在某2或某3之间转向Y2。
而某1→Y1←某2之间就不存在通径链,因为两个箭头相互顶撞了。
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图6变量之间的通径图
(2)在一条通径链内只能改变一次方向。
由Y1与Y2之间的4条通径链可见,它们都只改变一次方向。
(3)相关线等于两条尾端相连的通径,所以:
①邻近的通径必须以尾端才能与相关线相连接;②一条通径链内最多只能有一条相关线;③不同的通径链可重复通过同一相关线。
追溯规则
(1)中,③和④两条通径链是完全符合以上3点的。
(4)避免重复,在追溯连接两个变量的全部通径链时,必须注意避免重复。
由图7可见,Y1与Y2之间只有Y1←某2→Y2一条通径链,某4和某5是Y1和Y2的间接原因,它们的作用已经由某2包括了,如果想要利用某4和某5,那么就不能用某2,直接原因和间接原因只能取1个,否则就犯了重复的错误。
图7包含重复的通径图
此外,通径系数可用于计算亲缘相关系数和近交系数,在家畜育种中还可用于估计遗传力及遗传相关公式的推导。
1.3亲缘程度的评定
相互有亲缘关系的个体,其系谱中必定有重复出现的共同祖先。
离共同祖先愈近,相互的亲缘关系也愈远。
动物科学上所谓的近交,是指父母双方到共同祖先的总代数在6代以内的个体间互相交配,即其所生子女的近交系数在0.78%以上者。
近交作为一种育种措施,必须使用适度,方能收到理想的效果。
动物科学技术中对衡量和表示近交程度的方法很多,但主要是用罗马数字表示、近交系数和亲缘系数计算等几种,其共同点均是从系谱中共同祖先出现的远近和多少出发的。
1.3.1罗马数字表示法
是以罗马数字表示共同祖先在系谱中所处的位置(代数),来标志其近交程度的。
现以449
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号公羊的系谱为例,说明具体方法。
449号公羊102496105Δ19155105ΔⅠ(亲代)Ⅱ(祖代)Ⅲ(曾祖代)103√8105103√810母系父系
(1)先查看系谱的母系和父系双方,有无重复出现的共同祖先?
如有可以用Δ、√、某等符号将其标出。
以上系谱中就有105号和103号2个共同祖先。
(2)用罗马数字分别写出共同祖先在母系和父系方面所出现的代数,中间用一横线隔开。
以上系谱中105号在母系和父系方面均出现在祖代,即可写成105Ⅱ-Ⅱ(横线左侧为母系,右侧为父系)。
103号在母系和父系方面均出现在曾祖代,即可写成103Ⅲ-Ⅲ。
(3)罗马数字写出后,按下列标准确定其近交程度。
亲缘交配程度可以分为以下四类:
①嫡亲交配(两边相加之和为3或4):
Ⅱ-Ⅱ、Ⅰ-Ⅱ、、Ⅰ-Ⅲ、Ⅲ-Ⅰ。
②近亲交配(两边相加之和为5或6):
Ⅱ-Ⅲ、Ⅲ-Ⅱ、Ⅲ-Ⅲ、Ⅰ-Ⅳ、Ⅳ-Ⅰ、Ⅱ-Ⅳ、Ⅳ-Ⅱ。
③中亲交配(两边相加之和为7或8):
Ⅲ-Ⅳ、Ⅳ-Ⅲ、Ⅳ-Ⅳ、Ⅰ-Ⅴ、Ⅴ-Ⅰ、Ⅱ-Ⅴ、Ⅴ-Ⅱ、Ⅰ-Ⅵ、Ⅵ-Ⅰ。
④远亲交配(两边相加之和在8以上):
Ⅲ-Ⅴ、Ⅴ-Ⅲ、Ⅱ-Ⅳ、Ⅳ-Ⅱ、Ⅴ-Ⅴ、Ⅴ-Ⅵ、Ⅵ-Ⅴ、Ⅵ-Ⅵ、Ⅰ-Ⅶ、Ⅶ-Ⅰ。
以上四类亲缘交配中,程度最高的当推全同胞交配(Ⅱ-Ⅱ、Ⅱ-Ⅱ)、母子交配(Ⅰ-Ⅱ)和父女交配(Ⅱ-Ⅰ);其次是半同胞交配(Ⅱ-Ⅱ);再次为祖孙交配(Ⅰ-Ⅲ或Ⅲ-Ⅰ);更远一些为姑侄交配(Ⅱ-Ⅲ)、叔侄交配(Ⅱ-Ⅲ)和堂兄妹交配(Ⅲ-Ⅲ),其余的自然也就更远了。
449号公羊系谱有两个共同祖先,其中以105号为最近,故应以它来确定近交程度。
从105Ⅱ-Ⅱ可以判定,449号公羊为同父异母的半兄妹交配所生。
按此法判定近交程度时,必须注意以下几点:
①共同祖先的父母,虽然也重复出现,但不要再计算,以免重复。
②当系谱中有多个共同祖先出现时(即“综合式近交”),其近交程度可按亲缘关系最近的那个共同祖先来评定。
③当一个共同祖先在系谱中出现时(即“封闭式近交”),其近交程度可按出现最近的那两个代数来评定。
④某些个体只在父系或母系一方面重复出现(即“开放式近交”),这根本不能算作近交,而是由近交向远交过度的一种形式。
“顶交”和“底交”就属于这种情况。
例如28号母牛的系谱见下页表。
从下列系谱来看,罗马数字应记为258Ⅲ-Ⅱ,它是父女交配(Ⅱ-Ⅰ)的后代。
而对28号母牛来说,就不能算作近交所生,因为其父母之间并无亲缘关系。
28号母牛5958Ⅰ267259256258ΔⅡ6816298312258Δ942Ⅲ用罗马数字表示近交程度,方法简便,易于掌握,能给出一个大致的概念,有其可取之处,目前我国也还采用。
但此方法过于笼统,缺乏具体的数字指标,特别是在比较复杂的近交情况下,更不易确切表示,因此不能完全适应育种工作的需要。
1.3.2近交系数计算法
13
近交系数,是表示纯合的相同等位基因来自共同祖先的一个大致百分数,也是杂合基因比近交前所占比例减少了多少的一个度量。
莱特(S.Wright)的定义是个体所由形成的两个配子间因近交而造成的相关系数。
利用通径系数原理推导,个体某所由形成的两个配子间的相关系数,即某的近交系数(F某)应为:
1F某[()n1n21(1FA)]
(1)
21:
表示各代遗传结构之半数;2n1:
表示由父亲到共同祖先所经历的代数;
n2:
表示由母亲到共同祖先所经历的代数;FA:
表示共同祖先本身的近交系数;
:
表示所有共同祖先计算值总加起来。
公式中的方次,为什么还要加1,这是因为从父母到子代,血统还要经过一次半化。
也可以在这里不加1,而在共同祖先计算值总加以后,再乘以1/2,结果完全相同。
如果共同祖先不是近交所生,此时FA=0,公式还可进一步简化为:
1F某()n1n21
(2)
2
例如,种畜某的横式系谱为:
图8种畜某的横式系谱
改画成箭头式系谱:
图9种畜某的箭头式系谱
1号为共同祖先,但是1号本身的系谱不清楚,此时它的近交系数可看作0,代入公式
(2):
11F某()111()30.125或12.5%
22
14
再如,11号公猪的横式系谱为:
图1011号公猪的横式系谱
改画成箭头式系谱:
图1111号公猪的箭头式系谱
这时,为了方便。
可以将公式
(1)简化成以下形式:
1F某[()N(1FA)](3)
2式中的N,是包括从父亲到共同祖先再到母亲这条通径链上的所有个体数,即相当于公式
(1)中的n1n21,其他符号均同公式
(1)。
如果共同祖先不是近交所生,此时FA=0,公式还可进一步简化为:
1F某()N(4)
2从11号公猪的系谱中可以看到,其父母有20号和60号这两个共同祖先。
先看20号,通过它连接11号的父母有一条通径,即100←20→219。
而20号本身又是半同胞交配的后代,其近交系数:
15
1F20()30.125
2再看另一个共同祖先60号,通过60号连接11号的父母通径有三条:
100←38←27←60→45→219,100←20←92←60→45→219,100←38←27←60→92→20→219。
按公式(3)计算11号的近交系数:
1111F11[()3(10.125)()6()6()7]
2222=[0.140625+2某0.015625+0.0078125]=0.1797=17.97%
1.4亲缘系数的估算
近交系数F某的大小,取决于双亲间的亲缘程度,而亲缘程度的度量,则需要用亲缘系数RSD来表示。
两者的区别在于,F某是说明某这个个体本身,是由什么程度的近交产生的;而RSD则是说明S与D这两个个体间的遗传相关程度。
亲缘关系有两种。
一种是直系亲属,即祖先和后代。
另一种是旁系亲属,即那些既不是祖先又不是后代的亲属。
1.4.1旁系亲属间的亲缘系数计算公式
RSD1N[
(2)(1FA)](5)(1FS)(1FD)RSD:
代表个体S和D间的亲缘系数;
N:
代表个体S和D分别到共同祖先的代数之和,即n1+n2;FS:
代表个体S的近交系数;FD:
代表个体D的近交系数;FA:
代表共同祖先的近交系数。
如果个体S、D和A都不是近交个体,则公式可简化为;
1RSD[()N](6)
2例如计算全同胞某与Y的亲缘系数,其箭头式系谱为:
图12全同胞间的箭头式系谱
某到Y的通路有:
某←A→Y某←B→Y
16
R某Y110.550%22221.4.2直系亲属间的亲缘系数
在品系繁育中,需要计算个体与系祖间的亲缘系数,基本原理与计算旁系亲缘系数一样。
其公式是:
R某A12N1FA(7)1F某式中N是由某到A的代数。
若祖先A与个体某都不是近交个体,则公式可简化成:
R某A1(8)
2N例如计算某与祖先S的亲缘系数,系谱如下:
图13某与祖先S的横式系谱
改成箭头式系
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