单细胞空间转录组培训考核试题.docx
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单细胞空间转录组培训考核试题
单细胞&空间转录组培训考核试题
您的姓名:
[填空题]*
_________________________________
一、单选题
1.百迈客提供10x单细胞转录组测序服务产品数据量有()[单选题]*
A100G
B200G
C100G,200G(正确答案)
D150G
2.空间转录组载玻片上每个捕获区域有多少个spots?
[单选题]*
A3000
B5000(正确答案)
C7000
D9000
3.百迈客提供空间转录组测序数据量?
[单选题]*
A60G(正确答案)
B100G
C150G
D200G
4.10xgenomics单细胞技术中Gelbead上结合的哪个接头序列是用来标记不同细胞的()[单选题]*
ATruSeqRead1
B10xBarcode(正确答案)
CUniqueMolecularIdentifier(UMI)
Dpolyd(T)
5.10xgenomics单细胞转录组比对分析的是什么类型的序列()[单选题]*
A3’mRNA序列(正确答案)
B5’mRNA序列
C3’mRNA全长序列
D5’mRNA全长序列
6.10Xgenomics平台对于细胞大小的要求范围是多少?
[单选题]*
A10um以下
B20um以下
C30um以下
D40um以下(正确答案)
7.10Xgenomics中UMI是什么作用?
[单选题]*
A全长IlluminaTruSeqRead1测序引物
B用于区分细胞
C区分同不同的mRNA(正确答案)
D捕获mRNA分子
8.10Xgenomics单细胞转录组细胞聚类分群的依据是什么?
[单选题]*
A细胞大小
B细胞个数
C细胞marker基因表达(正确答案)
D细胞分化轨迹
9.百迈客单细胞全长转录组测序提供的数据量是?
[单选题]*
A100G
B200G
C300G
D三代200-300G,二代100G(正确答案)
10.百迈客单细胞全长转录组是基于什么平台?
[单选题]*
A10xgenomics+Nonapore+Illumina(正确答案)
B10xgenomics+PB
CSmart-seq+Nonapore
11.单细胞ATAC-seq是基于对对细胞进行分群?
[单选题]*
A基因表达
B细胞个数
C染色质开放性特征(正确答案)
D细胞大小
12.单细胞转录组拟时序核心分析的目的是?
[单选题]*
A探索细胞发育分化轨迹(正确答案)
B基因表达动态变化
C差异基因在不同cluster表达状况
D寻找marker基因
13.细胞周期热图分析的核心目的?
[单选题]*
A探索处于高分裂期的细胞cluster可能是病变细胞(正确答案)
B鉴定marker基因
C寻找差异表达基因
D观察细胞分化途径
14.空间转录组冷冻组织切片常规厚度一般是?
[单选题]*
A1um
B5um
C10um(正确答案)
D20um
15.空间转录组中Gelbead上结合的spatialBarcode序列作用是?
[单选题]*
A标记细胞
B捕获mRNA分子
C细胞分群
D标记每个spot进行空间定位(正确答案)
16.10x单细胞免疫组库检测富集扩增区域是?
[单选题]*
ATCR/BCRCDR3区域序列
BTCR/BCRCDR区域序列
CTCR/BCRV(D)J全长序列(正确答案)
D所有mRNA全长序列
17.目前10xGenomics空间转录组细胞水平分辨率为()[单选题]*
A单个细胞
B2-3个细胞
C1-10个细胞(正确答案)
D1-100个细胞
18.单细胞和单细胞核的技术原理核心区别是?
[单选题]*
A单细胞核需要抽核处理,单细胞转录组需要制备单细胞悬浮液(正确答案)
BGelbead
CChip芯片
D捕获mRNA方式
19.单细胞核转录组目前已发表文章篇数数量级别?
[单选题]*
A10篇
B100篇(正确答案)
C1000篇
D10000篇
20.10Xgenomics单细核转录组测序对细胞大小的要求范围是多少?
[单选题]*
A10um以下
B20um以下
C30um以下
D40um以下
E没有细胞粒径大小限制(正确答案)
二、多选题
21.下面哪些细胞类型一般不适合10x单细胞测序?
*
A神经元细胞(正确答案)
B巨噬细胞(正确答案)
C皮下脂肪细胞(正确答案)
D心肌细胞(正确答案)
E肾脏细胞(正确答案)
F骨骼肌纤维(正确答案)
G卵细胞(正确答案)
22.10Xgenomics单细胞转录组分析内容的核心是什么?
*
A划分细胞群体(正确答案)
B细胞群间基因表达差异检测(正确答案)
C鉴定marker基因(正确答案)
D鉴定细胞类型(正确答案)
E细胞轨迹分析(正确答案)
FGO/KEGG富集分析
23.百迈客目前10x单细胞转录组适用原则()*
A对于人、鼠样本可以提供组织解离单细胞悬浮液制备(正确答案)
B其他动物样本需要上门进行预实验进行解离和单细胞悬液制备(正确答案)
C植物样本需要老师提供原生质体悬浮液,现场制备单细胞悬浮液(正确答案)
D冷冻组织和细胞也可以适用于单细胞转录组测序
24.10x单细胞转录组测序对细胞悬浮液的要求()*
A细胞数量50万以上(正确答案)
B细胞活性高于90%(正确答案)
C细胞粒径小于40μm(正确答案)
D细胞浓度:
700~1200cell/μl;细胞体积:
>100微升(正确答案)
E细胞不能成团,少碎片,不存在逆转录抑制剂和非细胞的核酸分子(正确答案)
25.单细胞转录组测序数据量推荐正确的是?
*
A原代细胞、细胞系可推荐3000-5000个左右细胞(正确答案)
B肿瘤推荐3000-8000个细胞(正确答案)
C血液细胞或干细胞发育推荐1万个左右(正确答案)
D每个细胞测5-10万条reads(正确答案)
E每个样本可推荐100G或200G数据量(正确答案)
26.单核转录组测序更适合哪种类型样本?
*
A冻存样本(正确答案)
B脑、心、肾脏等复杂组织;(正确答案)
C难以解离组织样本;(正确答案)
D酶解离有偏好性样本;(正确答案)
27.10x单细胞核转录组技术的优势有()*
A减少解离偏差(正确答案)
B与冷冻样本兼容(正确答案)
C消除解离诱导的转录应激反应(正确答案)
D无惧细胞活性和细胞粒径大小(正确答案)
28.单细胞核测序mRNA相对单细胞较少说法正确的是?
*
A捕获到的基因总数减少了约20-40%,UMI总数减少了约20-60%,而较大一部分是线粒体基因。
(正确答案)
B不影响细胞分群,且标志物的表达得以维持。
(正确答案)
C样本类型不一样,检测灵敏度不一样。
(正确答案)
D外周血PBMC和单核细胞类型比例相似,单细胞核检测转录组数据可与细胞的读数相当。
(正确答案)
29.单细胞核转录组样本运输要求?
*
A组织样本液氮冷冻干冰运输;(正确答案)
B细胞样本经4℃(10min),-20℃(30min),-80℃(16-18h)梯度冻存直至液氮槽冷冻(正确答案)
C全血直接分离PBMC,PBMC冻存后干冰寄送(正确答案)
30.细胞核悬液质检标准?
*
A核总数一般不低于5*105个(正确答案)
B要求核浓度为700-1200nucleus/ul,体积大于200uL,(正确答案)
C结团率低于10%,细胞核膜完整,染色均一,无较大杂质(正确答案)
D提核后活性低于5%(正确答案)
31.目前10xGenomics空间转录组的不适合样品类型有?
*
AFFPE(正确答案)
B人鼠心脏组织
C骨骼组织(正确答案)
D皮肤组织(正确答案)
E植物幼嫩组织
F肝脏组织
32.10xGenomics空间转录组的优势?
*
A全组织解析(正确答案)
B高分辨率(正确答案)
C操作简单(正确答案)
D多维度分析(正确答案)
E完善数据分析(正确答案)
F经验丰富(正确答案)
33.10xgenomics空间转录组测序送样要求*
A每块组织样本不宜过大(长宽高约0.8cm)(正确答案)
B客户需要同时制作多份样本(至少2份,建议3份)(正确答案)
C置于干冰环境寄送(推荐用量约5kg/日),-80°C冰箱保存。
(正确答案)
D样本需要进行异戊烷冻存和OCT包埋预处理(正确答案)
34.10Xgenomics目前应用比较多的产品类型有哪些?
*
A单细胞转录组测序(正确答案)
B单细胞免疫组库(正确答案)
C单细胞ATAC-seq(正确答案)
D单细胞表面蛋白检测
35.10Xgenomics单细胞转录组测序后验证实验有哪些?
*
AqPCR验证marker基因表达(bulk&分选的亚群);(正确答案)
B免疫荧光定位验证时空分布;(正确答案)
C流式分选特定亚群KO/OE细胞验证功能;(正确答案)
Dsmart-seq2单细胞转录组小细胞量验证表达;(正确答案)
Emarker基因临床相关性分析,比如预后(正确答案)
36.10Xgenomics单细胞转录组测序关于生物学重复说法对的?
*
A需要生物学重复,尤其是个体差异性大的临床样本;(正确答案)
B根据目前发表的文献,很少不做重复的;(正确答案)
C多个生物学重复也会增加最终获得的有效单细胞数据个数;(正确答案)
D不需要生物重复
37.百迈客10x单细胞转录组测序产品优势?
*
A经验丰富:
累计制备100余种组织类型、3000+例的单细胞样本;(正确答案)
B成功案例:
目前具有一篇高分成功案例(正确答案)
C单细胞产品全面:
10x单细胞转录组、单细胞免疫组库、单细胞核转录组、空间转录组、单细胞全长转录组、单细胞ATAC-seq;(正确答案)
D强大生信分析:
强大的生信团队不仅提供基本分析,还提供细胞分化轨迹分析等多种高级分析;(正确答案)
E全套服务:
提供单细胞分离捕获、反转录建库、测序、标准分析和高级分析全套单细胞转录组测序服务,满足个性化分析。
(正确答案)
F优质售后:
单细胞产品图表免费服务到文章发表(项目金额10万元以上,需要开发流程的分析单独评估收费)(正确答案)
G可以提供上门组织解离、单细胞悬液制备服务(正确答案)
38.组织样本单细胞悬液制备方法有哪些?
*
A机械法:
网搓法、研磨法(正确答案)
B酶解法:
胰蛋白酶类、胶原酶、溶菌酶、弹性蛋白酶(正确答案)
C化学处理方法:
0.2%EDTA-酶,将组织细胞间起粘连作用的钙镁离子置换出来,从而使细胞分散开来;(正确答案)
39.单细胞全长转录组测序技术优势有哪些?
*
A细胞获取通量高:
理论上一张芯片可混上万个cell;(正确答案)
B长度长:
可精准鉴定可变剪接、融合基因、基因家族、SNV等基因变异;(正确答案)
C获取数据量多:
50Mreads/prometgION芯片,获取reads数多,同时进行单细胞转录本3’端测序和全长转录组测序,获得超高数据量100G(二代)+200-300G(三代);(正确答案)
D性价比高:
一次测序,两套数据,可挖掘细胞类型特异性Isoforms和细胞类型间Isoforms比较。
(正确答案)
40.相较于传统免疫组库检测方法,单细胞免疫组库技术上有哪些优势?
*
A富集V(D)J区域全长序列,检测信息更全;(正确答案)
B精准匹配两个BCR/TCR链对(正确答案)
CTCR/BCR同时检测(正确答案)
D一次分析上千个单细胞TCRα/β和BCR重链和轻链信息和基因表达(正确答案)
E同时获得单细胞免疫组库和5’转录组表达信息(正确答案)
41.空间转录组使用异戊烷的作用*
A防止组织样本在液氮中迅速冻结,形成冰晶;(正确答案)
B防止RNA降解(正确答案)
C防止组织形态受损(正确答案)
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