NCBI序列提交方法.docx
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NCBI序列提交方法.docx
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NCBI序列提交方法
NCBI序列提交方法
NCBI提交序列有两大类方式,一个是批量提交一个是单个序列提交。
下面说的就是单个序列提交方式,这是最新的提交方式,由于NCBI更新很快,也许过段时间又不一样了,主要是按钮位置可能会变。
首先要注册一个自己的NCBI账号:
点击此处注册
然后登陆账号:
在已登陆状态下点击Submit
:
点击图中标记处选择GengBank:
点击GO:
选择:
Banklt:
建议认真阅读填写要求等:
点击SignintouseBanklt
点击NewSub,下面是你提交的记录,即使你提交过程中中断了,也可以Continue!
以下是具体提交过程:
一..填写基本信息
二.
1.图中1是作者名字,可以添加作者名,First和LastName,填了就可以,其他可以不填。
2.图中2是填是否出版,有三个选项:
未出版,正在出版,已经出版。
需要注意的是,如果选则未出版,需要在Title中注明,否则无法提交。
3.可以添加作者,然后Continue即可。
三.这是选择是用生么测序方法后的的序列
1.现在我们用的一次只能测一条序列的都是Sanger测序,下面的454等都代表仪器型号,是我们现在说的高通量测序,简单的书不同型号灵敏度不同。
2.这是选择你测序是一个反应还是几个反应,就是你这条序列是一个测序结果就出来了,还是几个测序结果拼在一起得到的结果,一代测序一个反应最可信的测序范围是50-750bp,根据实际选择,然后继续。
四.填写序列信息:
1.选择什么时候公布你的序列信息,你可以选怎立刻,也可以选择在以后的某一时间,如果你选择了时间,那么即使你已经上传序列,有了序列号,在时间未到的时候你也是找不到的。
2.选择你的序列是不是16SrRNA基因是细菌上编码rRNA相对应的DNA序列,可能有一个专门的库,所以一般选择NO
3.选择你的序列类型,1.我选了cDNA,然后选择是什么类型:
是线性,我们一般的都是线状的,还是环状一般想线粒体,叶绿体或者各种质粒都是现状的。
4.然后填写你上传了多少个序列,黏贴序列,注意序列一定要是FASTA格式。
你也可以选择上传文档,这个自己学。
然后继续两次继续。
五.填写你上传序列所属物种。
然后即使继续。
六.选择你要你的序列式原始序列,就是你自己测序的序列,还是为已有序列做注释。
然后继续。
七.序列信息
1.填写你基因所属细胞器
2.填写你对基因的注释,可以添加选项,根据自己实际情况添加。
3.最下面可以添加你的PCR引物,然后继续,会让你检查,你检查后继续即可。
八.信息补充
1.填加序列信息,可以上传文件,也可以选项填写,建议用选项。
2.选择你的信息,可以添加,然后继续
在上图中选择添加选项,会让你填写模板是正链还是负链,如果是部分序列,是哪一端,产物是指你把序列通过BlastP比对后的到的序列号(qualifiers)和相似度(Value),然后Accept。
跳转后然后继续。
九.最后会让你最终检查你的信息和再次确认你有没有要求,如果没有问题,就Finish。
我是随便找的序列,不能提交的所以没法显示提交后给你的基因ID。
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