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[5].轻轻在顶层加入几毫升覆盖物(无水乙醇、去离子水或正丁醇),以阻止空气氧对凝胶聚合的抑制作用。
[6].凝胶充分聚合。
时间约30~60min,聚合后在覆盖层和凝胶的界面间有一清晰的折光线。
[7].倒掉覆盖层,用无离子水洗凝胶上部数次,尽可能用吸水纸吸干凝胶顶端的残存的液体。
[8].按表2配制浓缩胶,并注入分离胶上端。
插入梳子。
插入梳子子应小心避免梳子顶端留有气泡。
[9].浓缩胶充分聚合,时间30~60min。
[10].浓缩胶聚合好后,将制胶装置从基座上取下,放入电泳槽。
[11].上下槽均加入新鲜Tris-甘氨酸电泳缓冲液(至少负极槽使用新鲜电泳缓冲液)。
[12].小心拔出梳子,若孔间隔离凝胶条倾斜,用小号注射器针头扶正。
[13].用电泳缓冲液冲洗梳孔。
b上样与电泳
将蛋白样品解冻后直接上样到SDS-PAGE胶加样孔内即可。
按照一定顺序在加样孔中加入样品,根据SDS-PAGE电泳玻璃板间隙厚度不同,选择加入样品量,一般0.75mm间隙15孔的上样量<
10μl/孔,1mm间隙10孔的上样量<
20μl/孔。
上样量根据实际经验自己掌握。
1.上样前将胶板下的气泡赶走。
2.所有蛋白样品调至等浓度后上样,最外两泳道易跑歪,尽量不用,Marker加在最边上的加样孔中。
3.电泳时通常推荐在上层胶时使用低电压恒压电泳,电压设定为50V左右,而在溴酚蓝进入分离胶时使用高电压恒压电泳,电压设定为120V左右。
电泳过程中最好设置定时时间,以免电泳过头。
4.在目的蛋白泳动至距胶下缘1cm以上结束。
或者可以根据预染蛋白质分子量标准的电泳情况,预计目的蛋白已经被适当分离后即可停止电泳。
3.转膜(槽转印)
卸下电泳装置,用绿色的塑料片轻轻撬开玻璃板,用塑料铲或者干净的刀片小心切去浓缩胶,保留分离胶,在分离胶左上切角(以区分胶的上下)
为避免污染,请佩戴手套接触凝胶、印迹膜和滤纸
1.相对于每一张凝胶,需要按尺寸裁剪出一张PVDF膜(5.5cm×
8.5cm)、两张滤纸(6.5cm×
10cm)。
将切好的PVDF膜浸入甲醇中不少于15min才可以使用。
2.在加有转移液的搪瓷盘里放入转印夹、两块纤维衬垫、滤纸(2张超厚滤纸或者6张普通滤纸)和浸泡过的PVDF膜。
3.打开转印夹将黑色的一面浸入转膜缓冲液中,从下往上依次放入纤维衬垫、滤纸、分离胶、PVDF膜、滤纸、海绵。
整个过程在转膜缓冲液中进行。
在铺每一层时都要用玻璃棒轻轻赶走气泡,尤其是胶和膜之间一定不能留有气泡。
4.将转印夹合好,放到转印槽中,要使转印夹的黑面对着转印槽的黑面,转印夹的红面对着转印槽的红面。
转印槽通电后会产热,在转印槽有较大空隙的一边放入冰盒(事先置于-80℃)用来降温。
将整个电泳槽放入一个大的容器中(大的塑料泡沫盒子最好),在这个容器中盛满冰。
接通电源,设定转膜电流为300mA,转印30min~60min(目的蛋白的分子量越大,需要的转膜时间越长)。
5.关闭电源,取出膜,然后用ddH2O漂洗1~2min。
注意膜上要做好标记。
4.封闭及杂交
1.将膜放在塑料盒子,加入适量封闭液,于37℃恒温振荡器上放置1h,或4℃过夜。
必要时可先用丽春红染色(2%乙酸,0.5%丽春红的水溶液)观察蛋白条带,再用去离子水和TTBS将丽春红洗脱后封闭,如用蛋白marker则可省略此步骤。
2.参考一抗说明书,按照适当比例用封闭液稀释一抗。
将膜转入干净密闭的塑料小盒中,加入用封闭液稀释的一抗,于37℃或室温孵育反应1h或者4℃过夜。
3.一抗孵育结束后,小心地倾倒出一抗杂交液,用PBST或者TTBS漂洗后再浸洗3次,每次10~15min。
4.参考二抗的说明书,按照适当比例用封闭液稀释二抗,加入稀释好的二抗,继续在37℃或室温孵育反应30min~60min。
5.二抗孵育结束后,用PBST或TTBS漂洗膜后再浸洗三次,每次10~15min。
如果结果背景较高可以适当延长洗涤时间并增加洗涤次数。
5.ECL化学发光,显影,定影
(1)将A和B两种试剂等量(常用各500μl)在5ml离心管中等体积混合;
打开X-光片夹,铺上保鲜膜,将NC膜面朝上放于保鲜膜上,滴加此混合液1-3min后(见到荧光),用保鲜膜包好。
(2)将1×
显影液,自来水和定影液分别到入盘中;
在红灯下
✧取出X-光片,用切纸刀剪裁适当大小(比膜的长和宽均需大1cm);
把X-光片放在膜上,一旦放上,便不能移动,关上X-光片夹,开始计时;
根据信号的强弱适当调整曝光时间,一般为1min到5min,也可选择不同时间多次压片,以达最佳效果;
✧曝光完成后,打开X-光片夹,取出X-光片,迅速浸入显影液中显影,待出现明显条带后,即刻终止显影。
显影时间一般为1~2min(20~25℃),温度过低时(低于16℃)需适当延长显影时间;
✧显影结束后,先用自来水洗一下X-光片,然后再放到定影液中进行定影(这样可以延长定影液使用时间,从而节约定影液)。
定影时间一般为5~10min,以胶片透明为止;
6.凝胶图象分析:
将胶片进行扫描或拍照,用凝胶图象处理系统分析目标带的分子量和净光密度值。
附录:
各种溶液和试剂的配置
SDS聚丙烯酰胺凝胶的分离范围(表1)
不同体积SDS-PAGE浓缩胶的配方(表2)
不同浓度不同体积SDS-PAGE分离胶的配方(表3)
[1].30%聚丙烯酰胺单体贮液:
14.55g丙稀酰胺+0.45gN,N-甲叉双丙稀酰胺,先用40ml双蒸水溶解,搅拌,直到溶液变成透明,再用双蒸水稀释至50ml,0.45μm滤膜过滤。
用棕色瓶储存于4℃。
1.丙烯酰胺具有很强的神经毒性,并可通过皮肤吸收,其作用具有积累性,配制时应戴手套等。
聚丙烯酰胺无毒,但也应谨慎操作,因为有可能含有少量的未聚合成分。
(参照《分子克隆》二版P924)
[2].分离胶缓冲液:
1.5MTris-HCl,pH8.8。
配制方法:
9.08gTris溶解在40ml双蒸水中,用4mol/L盐酸调节pH值8.8,再用双蒸水加至50ml。
4℃保存。
[3].浓缩胶缓冲液:
1.0MTris-HCl,pH6.8。
6.06gTris溶解在40ml双蒸水中,用4mol/L盐酸调节pH值6.8,再用双蒸水加至50ml。
[4].10%SDS(十二烷基硫酸钠)(电泳级):
10gSDS,用双蒸水溶解并定容至100ml,室温保存。
[5].10%过硫酸铵(AP):
0.1g过硫酸铵溶解于1ml双蒸水中。
过硫酸铵会缓慢分解,应每周新鲜配制。
[6].TEMED(N,N,N′,N′-四甲基乙二胺):
原液使用。
应使用电泳级TEMED。
[7].5×
Tris-甘氨酸电泳缓冲液:
125mMTris,1.25M甘氨酸,0.1%(m/v)SDS,pH8.3。
配制方法:
在900ml去离子水中溶解15.1gTris碱和94g甘氨酸(电泳级)(pH8.0),然后加入50ml10%SDS(电泳级),用去离子水补至1000ml。
[8].Tris-甘氨酸电泳缓冲液:
25mMtris,250mM甘氨酸,0.1%(m/v)SDS,pH8.3。
[9].1×
SDS样品缓冲液:
50mMTris-Cl(pH6.8),100mMDTT,2%(m/v)SDS,0.1%(m/v)溴酚蓝,10%(v/v)甘油。
不含DTT的1×
SDS样品缓冲液可在室温保存。
DTT配成1M的贮存液,临用前加入。
5ml配制方法
1.称量下列试剂置于10ml塑料离心管中。
1MTris•Cl(pH6.8)
1.25ml
SDS(电泳级)
0.5g
溴酚蓝(BPB)
25mg
甘油
2.5ml
2.加去离子水溶解后定容至5ml。
3.小份(500ul/份)分装后于室温保存。
4.使用前将25ul的2-ME加到每小份中。
5.加入2-ME的LoadingBuffer可在室温下保存一个月左右。
[10].2×
SDS上样缓冲液:
100mMTris-HCl(pH6.8),200mMDTT,4%(m/v)SDS,0.2%溴酚蓝,20%甘油。
[11].5×
250mMTris-HCl(pH6.8),500mMDTT,10%(m/v)SDS,0.5%(m/v)溴酚蓝,50%(v/v)甘油。
不含DTT的5×
[12].预染蛋白质分子量标准物(marker)
[13].考马斯亮蓝凝胶染色液:
将0.25g考马斯亮蓝(CoomassieBrilliantBlue)R-250溶解在90ml甲醇:
水(1:
1,v/v)和10ml冰乙酸中,用滤纸过滤,室温保存。
[14].1mol/LDTT(20ml)
1.称取3.09gDTT,加入到50ml塑料离心管中。
2.加20ml的0.01MNaOAc(pH5.2),溶解后使用0.22μm滤器过滤除菌。
3.分装后-20℃保存。
(参照《分子克隆》二版P884)
[15].3M醋酸钠(NaOAc)(100ml)
1.称取40.8gNaOAc•3H2O置于100~200ml烧杯中,加入约40ml的去离子水后搅拌溶解。
2.加冰醋酸调节pH值至5.2。
3.定容至100ml,高压灭菌后室温保存。
0.01MNaOAc(pH5.2)参照此配方配制。
[16].10×
转膜缓冲液
甘氨酸(MW75.07)151.1g
Tris(MW121.14)30.3g
蒸馏水至1000ml
溶解后室温保存,用时稀释10倍,并加入甲醇至20%。
通常取80ml母液,加560ml蒸馏水,最加160ml甲醇,配制成800ml即可。
(先加甲醇易产生沉淀)
[17].10×
TBS缓冲液
Tris(MW121.14)24.2g
NaCl80.0g
(浓盐酸调pH至7.6),溶解后室温保存。
[18].1×
TBST缓冲液
10×
TBS缓冲液100ml
蒸馏水900ml
Tween-201ml
因Tween-20较粘稠,应缓慢吸取并可把枪头剪掉一块,即可防止产生气泡。
溶解后室温保存。
[19].封闭液/抗体稀释液(5%脱脂牛奶)
1×
TBST缓冲液95-100ml
脱脂奶粉5g
溶解后4℃保存,可于一周内使用。
[20].丽春红储存液(10×
)
丽春红2g
三氯乙酸
30g
磺基水杨酸
加水至100ml。
用1份上述储存液加9份去离子水即成丽春红使用液,使用后应予废弃。
[21].显影液与定影液
表1SDS聚丙烯酰胺凝胶的有效分离范围
双丙烯酰胺:
丙烯酰胺为1:
29浓度(%)
线性分离范围(KD)
15
12-43
10
16-48
7.5
36-94
5.0
57-212
表2不同体积SDS-PAGE浓缩胶的配方
表3不同浓度不同体积SDS-PAGE分离胶的配方
1.分离胶的配方
溶液成分
不同体积(ml)凝胶液中各成分所需体积(ml)
5
10
15
20
25
30
40
50
6%
水
2.6
5.3
7.9
10.6
13.2
15.9
21.2
26.5
30%丙烯酰胺溶液
1.0
2.0
3
4
6
8
1.5mol/LTris(pH8.8)
1.3
2.5
3.8
6.3
7.5
12.5
10%SDS
0.05
0.1
0.15
0.2
0.25
0.3
0.4
0.5
10%过硫酸氨
TEMED
0.004
0.008
0.012
0.016
0.02
0.024
0.032
0.04
8%
2.3
4.6
6.9
9.3
11.5
13.9
18.5
23.2
2.7
6.7
10.7
13.3
0.003
0.006
0.009
0.015
0.018
0.03
10%
1.9
5.9
9.9
11.9
19.8
1.7
3.3
8.3
16.7
0.002
0.01
12%
1.6
4.9
6.6
8.2
16.5
2
12
16
15%
1.1
3.4
5.7
9.2
2.配制Tris-甘氨酸SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶电泳5%积层胶(浓缩胶)所用溶液
1
0.68
1.4
2.1
4.1
5.5
6.8
0.17
0.33
0.67
0.83
1.0mol/LTris(pH6.8)
0.13
0.38
0.63
0.75
1.25
0.06
0.08
0.001
0.005
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