第10章 使用图形编辑器编辑方法和结果.docx
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第10章使用图形编辑器编辑方法和结果
第10章编辑方法和图形显示结果
本章将向您解释如何在GraphicMethodEditor图形方法编辑器中对一个典型色谱图执行操作,对一项分析创建一个最佳数据处理方法。
同样解释了如何对一个单一分析利用ReprocessResults再处理结果功能来优化结果。
学习如下内容:
页面:
用图形编辑应用程序优化数据分析OptimizingDataAnalysesWithGraphicEditingApplications2
编辑图形方法与再处理结果GraphicMethodEditingVersusReprocessingResults3
图形方法编辑器的使用UsingtheGraphicMethodEditor4
再处理结果的使用UsingReprocessResults10
更改显示选项ChangingDisplayOptions14
设定处理参数SettingProcessingParameters20
组分处理WorkingwithComponents34
显示和打印信息DisplayingandPrintingInformation49
用图形编辑应用程序优化数据分析OptimizingDataAnalysesWithGraphicEditingApplications
方法参数,例如积分域值、定时事件和组分保留时间决定了TotalChrom如何分析原始数据。
当这些参数变化时,您可能就戏剧性地影响了一次分析结果。
然而,当您首先在MethodEditor方法编辑器中创建一个方法时,估计要提供最好的数据分析的这些值是非常困难的。
有时候,在您核实结果之前,必须执行一次分析。
TotalChrom提供给您两种应用程序,您可以交替选择用来进行分析优化,都是图形显示的。
图形方法编辑器GraphicMethodEditor
在一次运行之后,通过查看和操作原始数据色谱显示,采用这个应用程序来测试和改变方法。
当以图形格式查看数据时,您可以确定TotalChrom是否正在正确检测色谱峰,基线位置是否合适,以及组分的期望保留时间和检索窗口能否准确识别色谱峰。
如果您发现这次分析不恰当或错误,您可以在查看色谱图的同时,对这些方法参数进行更改,立即就能看到更改后的效果。
再处理结果ReprocessResults
采用这个应用程序来更改一个结果文件和查看瞬时结果,是为了找到一个特定分析的最佳参数。
您可以采用ReprocessResults再处理结果对特定运行调整参数,甚至随后可以用您已经优化好的方法参数在GraphicMethodEditor图形方法编辑器中生成满意的分析结果。
ReprocessResults再处理结果和GraphicMethodEditor图形方法编辑器之间最主要的区别是利用ReprocessResults再处理结果命令,仅能改变结果文件而不是方法文件。
在结果再处理中您正在修改的这个“方法”它本身不是方法文件,而是TotalChrom生成它时镶嵌在结果文件中的一个拷贝。
图形方法编辑与再处理结果GraphicMethodEditingVersusReprocessingResults
要在GraphicMethodEditor图表方法编辑器中编辑一个方法,请您指定一个代表想要对其进行优化分析的一个色谱图的原始数据文件。
TotalChrom利用这个方法来处理数据和显示色谱图、展示积分结果和色谱峰确证。
您可以在方法的处理和校准部分改变这些参数,直到这些参数生成您想要的结果。
在这一点上,您可以在一个结果文件中保存这份原始数据的优化分析结果,并在相同的文件名或赋予一个新文件名来保存修饰过的方法。
利用GraphicMethodEditor图形方法编辑器,您也可以编辑用图形表示的仪器时间事件,但是这些事件对正在进行再处理的数据不会产生影响。
当您再处理结果时,TotalChrom会在您所选择的结果文件基础上画出一个色谱图,TotalChrom并分析原始数据文件来生成这个结果文件。
此外,您可以测试不同的参数来查看这些结果。
当生成原始数据最佳的分析结果时,您可以在结果文件中保存新的结果或者作为一个新文件来保存。
然而,结果再处理的目的是改善一次单个分析的结果。
当您在更改结果文件后关闭ReprocessResults再处理结果窗口时,由于您没有对这个方法本身所做的更改进行保存,TotalChrom会询问是否想保存修饰过的结果文件。
本章的前两部分解释了如何打开和启动使用GraphicMethodEditor图形方法编辑器和ReprocessResults再处理结果应用程序。
这一章剩下的部分就会解释如何执行完成不同的任务。
除GraphicMethodEditor图形方法编辑器里的校准和组分任务之外,两种程序的执行步骤是一样的。
因此,这些常规任务被整合,采用这个GraphicMethodEditor图形方法编辑器的大多数图形作为一个典型实例。
图形方法编辑器的使用UsingtheGraphicMethodEditor
您可以从Navigator浏览器或MethodEditor方法编辑器里打开GraphicMethodEditor图形方法编辑器。
Ø打开图形方法编辑器:
1.执行下列操作之一:
∙在Navigator上,点击GraphicEdit图形编辑按钮,或从Build编辑菜单中选择GraphicEdit图形编辑命令。
∙在MethodEditor方法编辑器的Other其它菜单中选择GraphicEditor图形编辑器命令。
这个GraphicMethodEditor图形方法编辑器窗口打开,在前台会出现TotalChromFileOpenTotalChrom文件打开对话框,提示您选择一个原始数据文件。
2.定位并选择这个您想编辑的原始数据文件名称,选择Open打开。
TotalChrom采用在文件页眉中命名的方法来执行原始数据上的色谱峰检测、积分和组分确认。
然后TotalChrom显示色谱图。
除通过选择一次打开一个原始文件之外,您可以通过打开索引(IDX)文件来进入到被引用的一组相关原始文件中。
Ø利用一个索引文件来打开原始文件:
1.在TotalChromFileOpenTotalChrom文件打开对话框中,从FilesOfType文件类型列表中选择IDXFiles(*.idx)索引文件,然后选择一个索引文件。
在索引文件中的第一个原始文件被导入,分析,利用与这个原始文件相关的方法显示一张色谱图。
2.在选择的索引文件中从头到尾移动这些原始文件,利用File文件菜单中的PreviousDataFile前一个数据文件和NextDataFile下一个数据文件命令。
您从头到尾移动这些原始文件时,这个伴随第一个原始文件导入的方法不会改变,即使是采用的一个不同的方法来分析序列文件。
3.利用File文件菜单中的Open打开命令来导入一个不同的方法。
本章中的这些步骤假定您是在ConfigurationEditor配置编辑器中选择了AutoscalePlotsByDefault通过默认值自动缩放图形选项。
如果当您配置系统时,取消这个选项,无论何时打开一个新的数据文件,RescalePlot重新设定缩放绘图对话框都会出现。
更多关于如何利用这个对话框的信息,请见本章“ChangingthePlotDisplay更改绘图显示”。
了解图形方法编辑器窗口UnderstandingtheGraphicMethodEditorWindow
GraphicMethodEditor图形方法编辑器默认的是,在窗口的主工作区显示一张workingchromatogram工作色谱图,在工作色谱图之上是一张referencechromatogram参考色谱图。
通过在Display显示菜单中选择ReferenceChromatogram参考色谱图命令,您就可以切换参考色谱图的显示。
要想默认设定值为隐藏参考色谱图,请您在打开GraphicMethodEditor图形方法编辑器窗口之前,在ConfigurationEditor配置编辑器的PlotOptions绘图选项对话框中取消选择ShowReferenceChromatogram显示参考谱图。
主菜单FileMenu
允许您导入和打印其它方法和数据文件,指定一个报告格式文件,输入和检查有关一个方法的文档记录,复制和保存绘图图像用于其它应用程序中。
处理菜单ProcessMenu
允许您编辑仪器时间事件和基线时间事件;优化诸如噪音和色谱峰面积域值等参数;通过重新绘制基线来手动积分色谱图。
校准菜单CalibrationMenu
允许执行诸如从色谱峰列表中创建或合并组分列表的组分任务;改变组分信息和建立或编辑名称和时间组;显示和修订检索窗口;以及更新校准信息。
显示菜单DisplayMenu
您可以控制这个显示的特征性状,包括绘图比例,以及其它一些条目,如报告抬头、色谱峰报告、或参考色谱图等等是否在屏幕上显示。
其它菜单OtherMenu
可以在当前导入的方法下,执行关闭GraphicMethodEditor图形方法编辑器和打开MethodEditor方法编辑器,和允许启动可供选择的LC(液相色谱)分析应用程序。
状态条StatusBar
状态条在窗口的顶端显示。
这个区域显示了原始数据文件名,鼠标匹配点的X和Y轴的数值,和在这个色谱图中有多少个点。
另外,状态条还显示用于当前选择的命令的Help帮助命令和您是否已经对文件进行了修饰。
在图形方法编辑器中导入文件LoadingFilesintheGraphicMethodEditor
在GraphicMethodEditor图形方法编辑器中,基本用下面这两种类型文件工作:
原始数据文件和方法文件。
您也可以指定一种用于打印输出的报告格式。
在您导入一个原始数据文件之后,在状态条里会出现导入的文件名,而用来处理数据的方法名称会出现在标题条里。
您可以实现下列之一:
∙通过打开一个新方法文件,更改用于处理当前原始数据文件的方法
∙采用同样的方法来评估不同原始数据文件
∙将这个方法或结果数据保存为一个新文件,原样离开当前文件。
要维持当前视窗和保持相同的缩放参数,请在导入一个原始数据文件之前,选择File文件菜单的PreserveView保持视窗命令。
Ø导入一个原始数据文件:
1.从File文件菜单选择NewDataFile新数据文件命令来打开TotalChromFileOpenTotalChrom文件打开对话框。
2.定位和选择您想要打开的原始数据文件。
您可以选择一个索引文件来代替如第10章第4页开始的“UsingtheGraphicMethodEditor图形方法编辑器的使用”下描述的内容。
3.选择LoadDataFileMethod导入数据文件方法检查框来导入与这个新数据文件相匹配的方法。
如果您没有选择这个,TotalChrom就会采用当前在GraphicMethodEditor图形方法编辑器中导入的方法。
4.选择Open打开。
TotalChrom执行色谱峰检测、积分和组分确认,然后显示您选择的文件相关的色谱图。
Ø导入一个不同的方法文件:
1.从File文件菜单中选择Open打开命令来打开TotalChromFileOpenTotalChrom文件打开对话框。
2.定位和选择您想要打开的方法文件,选择Open打开命令。
标题条会改变为显示您选择的这个方法文件名。
Ø指定一个新报告格式文件:
1.从File文件菜单中选择NewReportFormat新报告格式命令来打开TotalChromFileOpenTotalChrom文件打开对话框。
2.定位和选择一个报告格式文件,选择Open打开。
您指定的这个报告格式文件主要决定TotalChrom用来输出哪种打印格式。
这个报告格式的一些方面,如数据栏的类型和顺序,当您在色谱图上显示报告信息时,将影响PeakReport色谱峰报告如何显现。
关于如何利用GraphicMethodEditor图形方法编辑器中报告特征的更多信息,参见下列部分:
本章的“DisplayingandPrintingInformation显示和打印信息”和“PrintingaReportorReplot打印一份报告或重制图形”。
在图形方法编辑器中保存文件SavingFilesinGraphicMethodEditor
当在GraphicMethodEditor图形方法编辑器中工作时,您可以保存一个修饰过的方法,还可以在一个结果文件中保存原始数据最优化的分析结果。
∙要保存一个方法,请在File文件菜单中选择Save保存命令来对这个方法进行原名保存,或者选择SaveAs另存为来重命名保存。
∙要保存一个结果文件,或者选择SaveResultFileAs另保存结果文件为命令来重命名保存,或选择SaveResultFileWithTimeStamp按时间标记来保存结果文件命令来在保存结果文件时对原始文件名添加一个时间标记。
这个命令提供了一种编年式保存功能。
如果您在GraphicMethodEditor图形方法编辑器中使用的这个方法已经通过激活审核,然后审核同样激活用于从中创建的结果文件,那么在您保存这个结果文件时,AuditTrail审核索引对话框将被显示。
再处理结果的运用UsingReprocessResults
要进行一次单一运行数据的再处理,从而改善一个单一分析的结果,利用ReprocessResults再处理结果应用程序。
这些命令中的大多数命令与GraphicMethodEditor图形方法编辑器中的那些命令是相同的,这些参数改变后会立即用于处理数据,您可以看见参数改变之后对结果的影响。
可以在现存结果文件中保存这些结果,或者将它们存储为一个新文件。
当您保存这些结果时,您不必更改方法中的参数。
Ø打开再处理结果窗口:
1.在Navigator浏览器里,点击Results结果按钮或从Reprocess再处理菜单中选择Results结果命令。
这个ReprocessResults再处理结果窗口就被打开了。
TotalChromFileOpenTotalChrom文件打开对话框在前台显示,提示您选择一个结果文件。
2.定位和选择这个您想要编辑的结果文件,选择Open打开命令。
TotalChrom打开与选择的结果文件相匹配的原始数据文件,利用结果文件中嵌入的方法的备份来处理。
然而,显示的这些结果信息与选择的结果文件中的一样。
通过打开一个已经引用了这些结果文件的索引(IDX)文件,您可以访问一组相关的结果文件,来代替选择一次打开一个来打开这些结果文件。
Ø利用一个索引文件来打开结果文件:
1.在TotalChromFileOpenTotalChrom文件打开对话框里,从FilesOfType文件类型列表中选择IDX文件(*.idx),然后选择一个索引文件。
TotalChrom打开与这个索引文件中第一个结果文件相匹配的原始数据文件,利用在这个结果文件中嵌入的方法的备份来进行文件处理。
2.要在选择的索引文件中从头到尾移动这些结果文件,利用File文件菜单中的PreviousFile前一个文件和NextFile下一个文件命令。
了解再处理结果窗口UnderstandingtheReprocessResultsWindow
ReprocessResults再处理结果窗口的主工作区,在默认情况下显示的是一张workingchromatogram正在运行的色谱图,其上面是一张referencechromatogram参考色谱图。
通过在Display显示菜单中选择ReferenceChromatogram参考色谱图命令,您就可以来回切换显示参考色谱图。
要把隐藏这个参考色谱图作为默认设定,请在打开ReprocessResults再处理结果窗口之前,在ConfigurationEditor配置编辑器的PlotOptions绘图选项对话框中,取消选择ShowReferenceChromatogram显示参考色谱图。
这个ReprocessResults再处理结果窗口包含下列菜单和命令:
文件菜单FileMenu
允许您导入、保存结果文件;打印报告、绘图或方法参数;输入和查看有关一个结果文件的文档记录;以及拷贝和保存绘图图像以便用于其它应用程序。
处理菜单ProcessMenu
允许您编辑仪器时间事件和基线时间事件;优化诸如噪音和色谱峰面积域值之类的处理参数;以及通过重绘基线来进行手动积分色谱峰。
组分菜单ComponentsMenu
允许您手动确认色谱峰,和显示检索窗口。
显示菜单DisplayMenu
允许您控制显示特征,包含绘图缩放比例和在屏幕上是否显示报告页眉、色谱峰报告或参考色谱图等。
其它菜单OtherMenu
关闭ReprocessResults再处理结果,打开可选用的LC(液相色谱)分析应用程序。
状态条StatusBar
窗口顶部的状态条里显示了原始数据文件名称;光标点X和Y轴对应的坐标;色谱图中点的数目;当前选择命令的有关Help帮助;和您是否已经对这个方法进行了修正。
在再处理结果中导入文件LoadingFilesinReprocessResults
在ReprocessResults再处理结果中,您通常利用结果文件工作。
然而,您也可以选择选择另一个报告格式文件用来报告和重画曲线。
TotalChrom利用选择的报告格式文件确定打印输出的格式。
TotalChrom同样利用这个格式的一些方面来在色谱图上显示PeakReport色谱峰报告信息。
当您打开这个结果文件时,为了绘制色谱图,TotalChrom也打开相应的原始数据文件。
尽管您可以在ReprocessResults再处理结果中修正方法参数,但是仅可修正结果文件中嵌入的方法的一个备份,而不是方法本身。
如果您保存这些在ReprocessResults再处理结果中对一个结果文件所做的更改,新的文件将包含已经修正的方法参数。
要维持当前视窗和当前缩放参数,请在选择Open打开命令之前从File文件菜单中选择PreserveView保持视窗命令。
Ø在再处理结果窗口打开一个新结果文件:
1.从File文件菜单选择Open打开命令来打开FileOpen文件打开对话框。
2.定位并选择这个您想要打开的结果文件,然后选择Open打开。
您可以选择一个索引文件来代替,相关描述内容见本章有关部分“UsingReprocessResults利用再处理结果”。
TotalChrom打开选择的结果文件和相应的原始数据文件。
TotalChrom利用在这个结果文件中嵌入的方法参数来执行色谱峰检测、积分和组分确认、以及最终显示处理过的色谱图。
Ø指定一个新报告格式文件:
1.从File文件菜单选择NewReportFormat新报告格式命令。
2.定位并选择一个报告格式文件,选择Open打开。
要学习如何运用Reprocess再处理报告功能,参见本章的“DisplayingandPrintingInformation显示和打印信息”和“PrintingaReportorReplot打印一个报告或重画曲线”。
在再处理结果中保存文件SavingFilesinReprocessResults
当在ReprocessResults再处理结果中执行工作时,您可以通过File文件菜单中下列三个命令来保存修饰过的结果数据:
∙要用修饰后的结果来重写覆盖原始结果文件,选择Save保存。
∙要在一个新文件中用原始文件名加上一个时间标记来保存这个修饰过的结果,选择命令SaveWithTimeStamp用时间标记保存。
这个命令提供了一种编年式保存的功能。
∙要重命名这个修饰过的结果文件,选择SaveAs另存为。
如果一个在一个结果文件中被引用的方法已经审核激活,然后审核也同样用于从中激活创建的结果文件,当您保存这个结果文件时,AuditTrail审核索引对话框将会显示。
更改显示选项ChangingDisplayOptions
Display显示菜单命令允许您更改有关色谱图数据如何显示的选项,和GraphicMethodEditor图形方法编辑器和ReprocessResults再处理结果窗口的其它属性一样。
您可以:
∙在色谱图上显示报告信息来检查这个色谱峰报告或报告页眉,请选择另外一个报告格式文件,或打印一个报告。
∙采用原始数据点或成束点来显示这个色谱图。
∙显示或隐藏这个参考色谱图。
∙如果您已经放大了色谱图的话,可以显示整个色谱图。
∙通过输入特定值来重定义绘图缩放比例。
∙通过放大这个参考色谱图来将两个色谱图同时放大。
下面的部分将向您解释如何执行每一个任务。
更多关于如何利用这些报告命令的信息,见本章的“DisplayingandPrintingInformation显示和打印信息”相关内容。
更改绘图显示ChangingthePlotDisplay
您可以选择以原始数据点、原始和聚束数据点、或以线段来显示色谱图。
Ø更改绘图的显示:
∙从Display显示菜单选择RawPoints原始数据点、RawPointsWithBunching聚束原始数据点、或Lines线段。
更改绘图缩放比例ChangingthePlotScale
Display显示菜单中的RescalePlot重定缩放比例绘图命令允许您更改这些在主窗口见到的影响运行(色谱数据)的某一部分参数。
这些参数包含时间起点和终点、偏移和总标度值。
Ø编辑缩放比例参数:
1.在Display显示菜单中选择RescalePlot重定比例绘图命令。
2.在StartTime起点时间文本框里,输入您想用于绘图窗口起点的时间。
起点时间必须与数据开始采集的延迟时间一样,或比其再大(早)一点。
同时这个时间也必须小于色谱图的总运行时间。
3.在EndTime终点文本框里,输入您想作为绘图窗口终点的时间。
这个终点必须晚于起点时间,也要小于色谱图的总运行时间。
4.在Offset偏移量文本框中,输入您想在绘图窗口底部出现的Offset偏移量值。
为了组分名称有足够的空间,绘图实际总是出现在窗口底部之上。
5.在FullScale总标度文本框上,输入一个值来指定绘图窗口的高度。
在绘图窗口的顶部给定的这个毫伏电压值,等于总标度加上偏移量值。
一个数据点有一个与偏移量和总标度的总和相当的电压值,这个值绘制在窗口的顶部。
与这个偏移电压对当的值的一个数据点绘制在窗口的底部。
6.选择OK来用新值重新绘画曲线图。
Ø在默认缩放比例下重画曲线:
∙从Display显示菜单选择EntireChromatogram完整色谱图选项。
TotalChrom基于文件中最大和最小数据值的基础
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- 第10章 使用图形编辑器编辑方法和结果 10 使用 图形 编辑器 编辑 方法 结果
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