尿酸氧化酶UrateWord格式.docx
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(2)尿酸酶的酸碱稳定性测定
超声破碎(3)温度对尿酸酶稳定性的影响
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盐析
DEAE离子交换
↓
SDS-PAGE
实验一尿酸氧化酶粗酶提取
一.实验目的
学习可溶性表达蛋白质的初步分离纯化
二.实验原理
细菌工程菌胞表达主要分为两种形式,一种是在强启动子条件下的高效表达,由于蛋白的过度表达,使蛋白不能及时有效折叠而发生无规则卷曲,以固体颗粒的形式堆积于胞间质中,这就是所说的包涵体。
另外一种是间质的可溶性表达,即可以发生正常折叠,具有生物活性。
一般情况下,细菌只要被正常破壁就可以通过离心的形式将包涵体和可溶性表达的蛋白分离开。
用一定功率的超声波处理细胞悬液,使细胞急剧震荡破裂,此法多适用于微生物材料。
盐析一般是指溶液中加入无机盐类而使某种物质溶解度降低而析出的过程。
蛋白质在水溶液中的溶解度是由蛋白质周围亲水基团与水形成水化膜的程度,以及蛋白质分子带有电荷的情况决定的。
当用中性盐加入蛋白质溶液,中性盐对水分子的亲和力大于蛋白质,于是蛋白质分子周围的水化膜层减弱乃至消失。
同时,中性盐加入蛋白质溶液后,由于离子强度发生改变,蛋白质表面电荷大量被中和,更加导致蛋白溶解度降低,使蛋白质分子之间聚集而沉淀。
三.实验用品
1器材:
超声破碎仪,离心机
2试剂:
超声缓冲液:
0.1mol/L,pH8.5Tris-Gly(6.057gTris,8.0449gGly,定容至500ml,定容前调pH至8.5。
)
四.实验方法
发酵菌液4000rpm×
25min离心,收集湿菌体,每1g菌体加入15ml超声缓冲液。
超声机粉碎破壁,功率300w,工作时间5s,间隔时间5s,共90个循环。
取悬于超声缓冲液的菌体,10000g×
10min离心,上清加(NH4)2SO4至40%浓度,静置1h,12000g×
15min离心,沉淀用3ml0.1mol/L的pH8.4Tris-Gly悬溶;
上清加(NH4)2SO4至70%浓度,静置1h,12000g×
15min离心,沉淀保留。
五.实验结果
1.量得发酵菌液体积
2.量得发酵所得湿菌体重量
3.超声破碎离心后测上清OD280,体积及留样1ml
实验二尿酸氧化酶柱纯化
学习根据蛋白质所带电荷,选择离子交换树脂进行蛋白质的分离纯化。
离子交换层析中,基质是由带有电荷的树脂或纤维素组成。
带有正电荷的称之阴离子交换树脂;
而带有负电荷的称之阳离子树脂。
离子交换层析可以用于蛋白质的分离纯化。
由于蛋白质也有等电点,当蛋白质处于不同的pH条件下,其带电状况也不同。
阴离子交换基质结合带有负电荷的蛋白质,所以这类蛋白质被留在柱子上,然后通过提高洗脱液中的盐浓度等措施,将吸附在柱子上的蛋白质洗脱下来。
结合较弱的蛋白质首先被洗脱下来。
反之阳离子交换基质结合带有正电荷的蛋白质,结合的蛋白可以通过逐步增加洗脱液中的盐浓度或是提高洗脱液的pH值洗脱下来。
Sepharose是表示以琼脂糖为基质的胶,SepharoseFastFlow分的DEAE,CM,Q,SP就是在Sepharose分别偶联上 二乙基氨乙基,羧甲基,三甲胺基,磺丙基,作为弱阴,弱阳,强阴,强阳四种离子交换填料。
1.器材:
填料:
DEAE-SepharoseF.F.;
核酸蛋白仪;
紫外分光光度计;
梯度混合仪;
分步收集器
2.试剂:
透析液:
20mmol/L,pH8.5的硼酸盐缓冲液,即2.5747g硼砂与2.0407g硼酸溶于3000ml蒸馏水。
平衡液:
20mmol/L硼酸盐缓冲液,pH8.5。
离子交换洗脱液:
0.5mol/LNaCl,20mmol/L硼酸盐缓冲液;
2mol/LNaCl,20mmol/L硼酸盐缓冲液(pH均为8.5)。
三.实验方法
将硫酸铵纯化后沉淀用20ml,pH8.5,20mmol/L硼酸盐缓冲溶解,并透析过夜。
透析后测量体积,测OD280及留样1ml。
配制20mmol/L硼酸盐缓冲液500ml,分别调节其pH为8.5。
采用上述溶液平衡层析柱,上样后以0~0.5mol/LNaCl,20mmol/L硼酸盐溶液进行梯度洗脱,再以2mol/LNaCl进行柱再生,流速2ml/min,收集尿酸酶活力峰。
四.实验结果
1.记录透析后体积,OD280
2.测收集的尿酸酶活力峰的紫外吸收值,并绘制尿酸酶的洗脱曲线。
实验三尿酸氧化酶的鉴定
学习通过SDS-PAGE鉴定蛋白质分子量及纯度
聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺(简称Acr)和交联剂N,N’—亚甲基双丙烯酰胺(简称Bis)在催化剂作用下,聚合交联而成的具有网状立体结构的凝胶,并以此为支持物进行电泳。
聚丙烯酰胺凝胶电泳可根据不同蛋白质分子所带电荷的差异及分子大小的不同所产生的不同迁移率将蛋白质分离成若干条区带,如果分离纯化的样品中只含有同一种蛋白质,蛋白质样品电泳后,就应只分离出一条区带。
SDS是一种阴离子表面活性剂能打断蛋白质的氢键和疏水键,并按一定的比例和蛋白质分子结合成复合物,使蛋白质带负电荷的量远远超过其本身原有的电荷,掩盖了各种蛋白分子间天然的电荷差异。
因此,各种蛋白质-SDS复合物在电泳时的迁移率,不再受原有电荷和分子形状的影响,而只是棒长的函数。
这种电泳方法称为SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(简称SDS—PAGE)。
由于SDS-PAGE可设法将电泳时蛋白质电荷差异这一因素除去或减小到可以略而不计的程度,因此常用来鉴定蛋白质分离样品的纯化程度,如果被鉴定的蛋白质样品很纯,只含有一种具三级结构的蛋白质或含有相同分子量亚基的具四级结构的蛋白质,那么SDS—PAGE后,就只出现一条蛋白质区带。
聚丙烯酰胺储液:
29g丙稀酰胺,1g甲叉双丙烯酰胺溶于80ml蒸馏水,定容至100ml。
Tris缓冲溶液(1mmol/L,pH6.8,积层胶):
于800ml水中溶解121.1gTris碱,用浓HCl调pH至6.8,最后加水定容至1L。
Tris缓冲溶液(1.5mmol/L,pH8.8,分离胶):
于800ml水中溶解181.7gTris碱,用浓HCl调pH至8.8,最后加水定容至1L。
5×
Tris-甘氨酸电泳缓冲液:
在900ml蒸馏水中溶解15.1gTris和94g甘氨酸,然后加入50ml10%(m/v)电泳级SDS的贮存液,用去离子水补至1000ml。
6×
上样缓冲液:
7ml4×
Tris-HCl(pH6.8,0.28mol/L),3.0ml甘油,
1gSDS,0.93gDTT(或两倍摩尔浓度的巯基乙醇),1.2mg溴酚蓝。
考马斯亮蓝染色液:
90ml的甲醇:
水(1:
1,V/V)和10ml冰乙酸混
合液中溶解0.25g考马斯亮蓝R250,过滤。
脱色液:
45ml甲醇、45ml水和10ml冰乙酸。
四.实验方法
取待测样液适量,加入6×
上样缓冲液,混匀,沸水浴加热5min,用于上样。
分离胶浓度为12%,浓缩胶浓度为5%,电压80V,电泳完毕后,剥胶,考马斯亮蓝R250染色,脱色至本底透明后摄片。
根据电泳结果判断尿酸酶亚基分子质量及纯度。
实验四尿酸氧化酶的活力测定
通过尿酸氧化酶活力测定方法的学习,了解一类酶的活力测定方法。
酶的活力表现为催化某一反应的速度,反应速度越大,酶的活力也越大,酶催化的反应速度可以用单位时间底物的消耗量或产物的积累量来表示。
由于酶的催化作用和周围环境的关系十分密切,环境的温度、pH、离子强度等都对酶的活力有很大的影响,因此测定酶活力时应该使这些条件保持恒定。
酶活力的大小常以每mg酶蛋白每分钟所分解的底物量(或生成的产物量)μmol数表示之。
测定酶活性的方法很多,常因反应的底物和产物的性质不同可选用不同的方法,应用最广泛的是比色法或分光光度法。
凡反应系统中的化合物在紫外区或可见光区有吸收峰的都可以用这种方法进行测定。
如果酶催化的是一需氧反应,如氧化酶,则可用测压法或氧电极法。
如果催化的反应系统中需要ATP或产生ATP,如一些激酶;
或是有NAD存在,如一些脱氢酶和氧化还原酶;
或者反应产生H2O2,如一些氧化酶,这些酶的活性可以用生物发光或化学发光方法进行测定。
总之,测定酶活性的方法很多,应根据具体情况选择合适的方法。
三.实验用品
底物液:
0.001%尿酸(缓冲体系为0.1mol/L,pH8.5硼酸缓冲液)
四.实验方法
酶活测定反应体系均为0.1mol/L,pH8.5硼酸缓冲液,以0.001%尿酸为底物,25℃反应5min,每隔30s测一次293nm处吸光值。
酶活单位定义为每分钟催化1μmol底物转化为产物所需的酶量。
绘制尿酸酶各步骤纯化后的活力回收表。
实验五尿酸氧化酶性质研究
对尿酸酶的主要性质进行研究,探讨影响尿酸酶活力的各种因素及尿酸酶的最佳保存条件。
酶促反应动力学(kineticsofenzyme-catalyzedreactions):
酶反应动力学主要研究酶催化的反应速度以及影响反应速度的各种因素。
在探讨各种因素对酶促反应速度的影响时,通常测定其初始速度来代表酶促反应速度,即底物转化量<
5%时的反应速度。
1.底物浓度对反应速度的影响:
⑴底物对酶促反应的饱和现象:
由实验观察到,在酶浓度不变时,不同的底物浓度与反应速度的关系为一矩形双曲线,即当底物浓度较低时,反应速度的增加与底物浓度的增加成正比(一级反应);
此后,随底物浓度的增加,反应速度的增加量逐渐减少(混合级反应);
最后,当底物浓度增加到一定量时,反应速度达到一最大值,不再随底物浓度的增加而增加(零级反应)。
⑵米氏方程及米氏常数:
根据上述实验结果,Michaelis&
Menten于1913年推导出了上述矩形双曲线的数学表达式,即米氏方程:
ν=Vmax[S]/(Km+[S])。
其中,Vmax为最大反应速度,Km为米氏常数。
⑶Km和Vmax的意义:
①当ν=Vmax/2时,Km=[S]。
因此,Km等于酶促反应速度达最大值一半时的底物浓度。
②当k-1>
>
k+2时,Km=k-1/k+1=Ks。
因此,Km可以反映酶与底物亲和力的大小,即Km值越小,则酶与底物的亲和力越大;
反之,则越小。
③Km可用于判断反应级数:
当[S]<
0.01Km时,ν=(Vmax/Km)[S],反应为一级反应,即反应速度与底物浓度成正比;
当[S]>
100Km时,ν=Vmax,反应为零级反应,即反应速度与底物浓度无关;
当0.01Km<
[S]<
100Km时,反应处于零级反应和一级反应之间,为混合级反应。
④Km是酶的特征性常数:
在一定条件下,某种酶的Km值是恒定的,因而可以通过测定不同酶(特别是一组同工酶)的Km值,来判断是否为不同的酶。
⑤Km可用来判断酶的最适底物:
当酶有几种不同的底物存在时,Km值最小者,为该酶的最适底物。
⑥Km可用来确定酶活性测定时所需的底物浓度:
当[S]=10Km时,ν=91%Vmax,为最合适的测定酶活性所需的底物浓度。
⑦Vmax可用于酶的转换数的计算:
当酶的总浓度和最大速度已知时,可计算出酶的转换数,即单位时间每个酶分子催化底物转变为产物的分子数。
⑷Km和Vmax的测定:
主要采用Lineweaver-Burk双倒数作图法和Hanes作图法。
2.酶浓度对反应速度的影响:
当反应系统中底物的浓度足够大时,酶促反应速度与酶浓度成正比,即ν=k[E]。
3.温度对反应速度的影响:
一般来说,酶促反应速度随温度的增高而加快,但当温度增加达到某一点后,由于酶蛋白的热变性作用,反应速度迅速下降。
酶促反应速度随温度升高而达到一最大值时的温度就称为酶的最适温度。
酶的最适温度与实验条件有关,因而它不是酶的特征性常数。
低温时由于活化分子数目减少,反应速度降低,但温度升高后,酶活性又可恢复。
4.pH对反应速度的影响:
观察pH对酶促反应速度的影响,通常为一钟形曲线,即pH过高或过低均可导致酶催化活性的下降。
酶催化活性最高时溶液的pH值就称为酶的最适pH。
人体大多数酶的最适pH在6.5~8.0之间。
酶的最适pH不是酶的特征性常数。
乙酸、乙酸钠、磷酸氢二钠、磷酸二氢钠、甘氨酸、氢氧化钠、氯化钾、氢氧化钠、尿素,次黄嘌呤,EDTA均为试剂纯
四.实验方法(选做)
1.尿酸酶的动力学参数的测定:
利用尿酸为底物,直接测定其催化尿酸的性质。
测试指标包括:
Vmax,Km,Kcat。
在pH8.5,0.1mol/L硼酸盐缓冲液中配制下列各浓度底物液:
0.000125%、0.00025%、0.0005%、0.001%、0.002%的尿酸溶液。
于25℃取3ml底物液,加10μl酶液测定反应速度。
米氏常数的测定用Lineweaver-Burk作图法。
2.尿酸酶的酸碱稳定性测定:
配制0.1mol/LNaAc-HAc(pH3.6~5.2),0.1mol/LNa2HPO4-NaH2PO4缓冲液(pH6.0~6.8),0.1mol/LNa2B4O7-H3BO3缓冲液(pH7.6~8.4),0.1mol/LGly-NaOH缓冲液(pH9.2~10.0),每200μl缓冲液中加20μl的酶液,4℃放置24h,用200mmol/L磷酸盐缓冲液调pH至8.5。
取100μl测酶活,底物液为3ml0.0001%的尿酸溶液。
3.温度对尿酸酶稳定性的影响:
取一定量酶液分别置于4~80℃水浴30min后,取出放置室温,使其冷却至25℃,取10μl测酶活,底物液为3ml0.0001%的尿酸溶液。
五.实验结果
根据所测结果,绘制尿酸酶稳定性曲线,确定其最适储存条件。
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