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8.05.394.7
分子生物学常用溶液配制
2008-8-25热门指数:
3471
一、分子生物学常用贮存液的配制
1.30%丙烯酰胺溶液
【配制方法】将29g丙烯酰胺和1gN,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为60ml的水中。
加热至37℃溶解之,补加水至终体积为100ml。
用滤器(0.45μm孔径)过滤除菌,查证该溶液的pH值应不大于7.0,置棕色瓶中保存于室温。
【注意】丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可以通过皮肤吸收,其作用具累积性。
称量丙烯酰胺和亚甲双丙烯酰胺时应戴手套和面具。
可认为聚丙烯酰胺无毒,但也应谨慎操作,因为它还可能会含有少量未聚合材料。
一些价格较低的丙烯酰胺和双丙烯酰胺通常含有一些金属离子,在丙烯酰胺贮存液中加入大约0.2体积的单床混合树脂(MB-1Mallinckrodt),搅拌过夜,然后用Whatman1号滤纸过滤以纯化之。
在贮存期间,丙烯酰胺和双丙烯酰胺会缓慢转化成丙烯酰和双丙烯酸。
2.40%丙烯酰胺
【配制方法】把380g丙烯酰胺(DNA测序级)和20gN,N’-亚甲双丙烯酰胺溶于总体积为600ml的蒸馏水中。
继续按上述配制30%丙烯酰胺溶液的方法处理,但加热溶解后应以蒸馏水补足至终体积为1L。
【注意】见上述配制30%丙烯酰胺的说明,40%丙烯酰胺溶液用于DNA序列测定。
3.放线菌素D溶液
【配制方法】把20mg放线菌素D溶解于4ml100%乙醇中,1:
10稀释贮存液,用100%乙醇作空白对照读取OD440值。
放线菌素D(分子量为1255)纯品在水溶液中的摩尔消化系数为21,900,故而1mg/ml的放线菌素D溶液在440nm处的吸光值为0.182,放线菌素D的贮存液应放在包有箔片的试管中,保存于-20℃。
【注意】放线菌素D是致畸剂和致癌剂,配制该溶液时必须戴手套并在通风橱内操作,而不能在开放在实验桌面上进行,谨防吸入药粉或让其接触到眼睛或皮肤。
药厂提供的作治疗用途的放线菌素D制品常含有糖或盐等添加剂。
只要通过测量贮存液在440nm波长处的光吸收确定放线菌素D的浓度,这类制品便可用于抑制自身引导作用。
4.0.1mol/L腺苷三磷酸(ATP)溶液
【配制方法】在0.8ml水中溶解60mgATP,用0.1mol/LNaOH调至pH值至7.0,用蒸馏水定容1ml,分装成小份保存于-70℃
5.10mol/L乙酸酰溶液
【配制方法】把770g乙酸酰溶解于800ml水中,加水定容至1L后过滤除菌。
6.10%过硫酸铵溶液
【配制方法】把1g过硫酸铵溶解于终量为10ml的水溶液中,该溶液可在4℃保存数周。
7.BCIP溶液
【配制方法】把0.5g的5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸二钠盐(BCIP)溶解于10ml100%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃
8.2×
BES缓冲盐溶液
【配制方法】用总体积90ml的蒸馏水溶解1.07g盐溶液BES[N,N-双(2-羟乙基)-2-氨基乙磺酸]、1.6gNaCl和0.027gNa2HPO4,室温下用HCl调节该溶液的pH值至6.96、然后加入蒸馏水定容至100ml,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成小份,保存于-20℃。
9.1mol/LCaCl2溶液
【配制方法】在200ml蒸馏水中溶解54gCaCl2?
6H2O,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成10ml小份贮存于-20℃。
【注意】制备感受态细胞时,取出一小份解冻并用蒸馏水稀释至100ml,用Nalgene滤器(0.45μm孔径)过滤除菌,然后骤冷至0℃。
10.2.5mol/LCaCl2溶液
【配制方法】在20ml蒸馏水中溶解13.5gCaCl2?
6H2O,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮存于-20℃。
11.1mol/L二硫苏糖醇(DTT)溶液
【配制方法】用20ml0.01mol/L乙酸钠溶液(pH5.2)溶解3.09gDTT,过滤除菌后分装成1ml小份贮存于-20℃。
【注意】DTT或含有DTT的溶液不能进行高压处理。
12.脱氧核苷三磷酸(dNTP)溶液
【配制方法】把每一种dNTP溶解于水至浓度各为100mmol/L左右,用微量移液器吸取0.05mol/lTris碱分别调节每一dNTP溶液的pH值7.0(用pH试纸检测),把中和后的每种dNTP溶液各取一份作适当稀释,在下表中给出的波长下读取光密度计算出每种dNTP的实际浓度,然后用水稀释成终浓度为50mmol/L的dNTP,分装成小份贮存于-70℃。
碱基波长(nm)消化系数(ε)[L/(mol?
cm)]
A2591.54×
104
G2531.37×
C2719.10×
103
T2607.40×
比色杯光径为1cm时,吸光度=εM
13.0.5mol/lEDTA(pH8.0)溶液
【配制方法】在800ml水中加入186.1g二水乙二胺四乙酸二钠(EDTA-Na?
2H2O),在磁力搅拌器上剧烈搅拌,用NaOH调节溶液的pH值至8.0(约需20gNaOH颗粒)然后定容至1L,分装后高压灭菌备用。
【注意】EDTA二钠盐需加入NaOH将溶液的pH值调至接近8.0,才能完全溶解。
14.溴化乙锭(10mg/ml溶液)
【配制方法】在100ml水中加入1g溴化乙锭,磁力搅拌数小时以确保其完全溶解,然后用铝箔包裹容器或转移至棕色瓶中,保存于室温。
【注意】小心:
溴化乙锭是强诱变剂并有中度毒性,使用含有这种染料的溶液时务必戴上手套,称量染料时要戴面罩。
15.2×
HEPES缓冲盐溶液
【配制方法】用总量为90ml的蒸馏水溶解1.6gNaCl、0.074gKCl、0.027gNa2PO4?
2H2O、0.2g葡聚糖和1gHEPES,用0.5mol/lNaOH调节pH值至7.05,再用蒸馏水定容至100ml。
用0.22μm滤器过滤除菌,分装成5ml小份,贮存于-20℃。
16.IPTG溶液
【配制方法】IPTG为异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(分子量为238.3),在8ml蒸馏水中溶解2gIPTG后,用蒸馏水定容至10ml,用0.22μm滤器过滤除菌,分装成1ml小份贮存于-20℃。
17.1mol/L乙酸镁溶液
【配制方法】在800ml水中溶解214.46g四水乙酸镁,用水定容至1L过滤除菌。
18.1mol/LMgCl2溶液
【配制方法】在800ml水中溶解203.4gMgCl2?
6H2O,用水定容至1L,分装成小份并高压灭菌备用。
【注意】MgCl2极易潮解,应选购小瓶(如100g)试剂,启用新瓶后勿长期存放。
19.β-巯基乙醇(BME)溶液
【配制方法】一般得到的是14.4mol/L溶液,应装在棕色瓶中保存于4℃。
【注意】BME或含有BME的溶液不能高压处理。
20.NBT溶液
【配制方法】把0.5g氯化氮蓝四唑溶解于10ml70%的二甲基甲酰胺中,保存于4℃。
21.酚/氯仿溶液
【配制方法】把酚和氯仿等体积混合后用0.1mol/LTris?
HCl(pH7.6)抽提几次以平衡这混合物,置棕色玻璃瓶中,上面覆盖等体积的0.01mol/lTris?
HCl(pH=7.6)液层,保存于4℃。
【注意】酚腐蚀性很强,并可引起严重灼伤,操作时应戴手套及防护镜,穿防护服。
所有操作均应在化学通风橱中进行。
与酚接触过的部位皮肤应用大量的水清洗,并用肥皂和水洗涤,忌用乙醇。
22.10mmol/L苯甲基磺酰氟(PMSF)溶液
【配制方法】用异丙醇溶解PMSF成1.74mg/ml(10mmol/L),分装成小份贮存于-20℃。
如有必要可配成浓度高达17.4mg/ml的贮存液(100mmol/L)。
【注意】PMSF严重损害呼吸道粘膜、眼睛及皮肤,吸入、吞进或通过皮肤吸收后有致命危险。
一旦眼睛或皮肤接触了PMSF,应立即用大量水冲洗之。
凡被PMSF污染的衣物应予丢弃。
PMSF在水溶液中不稳定。
应在使用前从贮存液中现用现加于裂解缓冲液中。
PMSF在水溶液中的活性丧失速率随pH值的升高而加快,且25℃的失活速率高于4℃。
pH值为8.0时,20μmmol/lPMSF水溶液的半寿期大约为85min,这表明将PMSF溶液调节为碱性(pH>
8.6)并在室温放置数小时后,可安全地予以丢弃。
23.磷酸盐缓冲溶液(PBS)溶液
【配制方法】在800ml蒸馏水中溶解8gNaCl、0.2gKCl、1.44gNa2HPO4和0.24gKH2PO4,用HCl调节溶液的pH值至7.4加水定容至1L,在15lbf/in2(1034×
105Pa)高压下蒸气灭菌20min。
保存于室温。
24.1mol/L乙酸钾(pH=7.5)溶液
【配制方法】将9.82g乙酸钾溶解于90ml纯水中,用2mol/L乙酸调节pH值至7.5后加入纯水定容到1L,保存于-20℃。
25.乙酸钾溶液(用于碱裂解)
【配制方法】在60ml5mol/L乙酸钾溶液中加入11.5ml冰乙酸和28.5ml水,即成钾浓度为3mol/L而乙酸根浓度为5mol/L的溶液。
26.3mol/L乙酸钠(pH5.2和pH7.0)溶液
【配制方法】在80ml水中溶解408.1g三水乙酸钠,用冰乙酸调节pH值至5.2或用稀乙酸调节pH值至7.0,加水定容到1L,分装后高压灭菌。
27.5mol/LNaCl溶液
【配制方法】在800ml水中溶解292.2gNaCl加水定容至1L,分装后高压灭菌。
28.10%十二烷基硫酸钠(SDS)溶液
【配制方法】在900ml水中溶解100g电泳级SDS,加热至68℃助溶,加入几滴浓盐酸调节溶液的pH值至7.2,加水定容至1L,分装备用。
【注意】SDS的微细晶粒易扩散,因此称量时要戴面罩,称量完毕后要清除残留在称量工作区和天平上的SDS,10%SDS溶液无须灭菌。
29.20×
SSC溶液
【配制方法】在800ml水中溶解175.3gNaCl和88.2g柠檬酸钠,加入数滴10mol/lNaOH溶液调节pH值至7.0,加水定容至1L,分装后高压灭菌。
30.20×
SSPE溶液
【配制方法】在800ml水中溶解17.5gNaCl、27.6gNaH2PO4?
H2O和7.4gEDTA,用NaOH溶液调节pH值至7.4(约需6.5ml10ml/LNaOH),加水定容至1L,分装后高压灭菌。
31.100%三氯乙酸溶液
【配制方法】在装有500gTCA的瓶中加入227ml水,形成的溶液含有100%(M/V)TCA。
32.1mol/LTris溶液
【配制方法】在800ml水中溶解121.91gTris碱,加入浓HCl调节pH值至所需值。
pHHCl7.470ml7.660ml8.042ml
应使溶液冷至室温后方可最后调定pH值,加水定容至1L,分装后高压灭菌。
【注意】如1mol/L溶液呈现黄色,应予丢弃并置备质量更好的Tris。
尽管多种类型的电极均不能准确测量Tris溶液的pH值,但仍可向大多数厂商购得合适的电极。
Tris溶液的pH值因温度而异,温度每升高1℃,pH值大约降低0.03个单位。
例如:
0.05mol/L的溶液在5℃、25℃、和37℃时的pH值分别为9.5、8.9和8.6。
33.Tris缓冲盐溶液(TBS)(25mmol/lTris)
【配制方法】在800ml蒸馏水中溶解8gNaCl、0.2gKCl和3gTris碱,加入0.015g酚并用HCl调至pH值至7.4,用蒸馏水定容至1L,分装后在151bf/in2(1.034×
105Pa)高压下蒸汽灭菌20min,于室温保存。
34.X-gal溶液
【配制方法】X-gal为5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D半乳糖苷。
用二甲基甲酰胺溶解X-gal配制成的20mg/ml的贮存液。
保存于一玻璃管或聚丙烯管中,装有X-gal溶液的试管须用铝箔封裹以防因受光照而被破坏,并应贮存于-20℃。
X-gal溶液无须过滤除菌。
二、常用抗生素溶液
抗生素贮存液a工作浓度
浓度保存条件严紧型质粒松弛型质粒
氨苄青霉素50mg/ml(溶于水)-20℃20μg/ml60μg/ml
羧苄青霉素50mg/ml(溶于水)-20℃20μg/ml60μg/ml
氯霉素34mg/ml(溶于乙醇)-20℃25μg/ml170μg/ml
卡那霉素10mg/ml(溶于水)-20℃10μg/ml50μg/ml
链霉素10mg/ml(溶于水)-20℃10μg/ml50μg/ml
四环素b5mg/ml(溶于乙醇)-20℃10μg/ml50μg/ml
a:
以乙醇为溶剂的抗生素溶液无须除菌处理。
所有抗生素溶液均应放于不透光的容器保存。
b:
镁离子是四环素的拮抗剂,四环素抗性菌的筛选应使用不含镁盐的培养基(如LB培养基)。
三、常用的电泳缓冲液
缓冲液使用液浓贮存液(每升)
Tris-乙酸(TAE)1×
:
0.04mol/LTris-乙酸50×
242gTris碱
0.001mol/LEDTA57.1ml冰乙酸
100ml0.5mol/LEDTA(pH8.0)
Tris-磷酸(TPE)1×
:
0.09mol/LTris-磷酸10×
10gTris碱
0.002mol/LEDTA15.5ml85%磷酸(1.679g/ml)
40ml0.5mol/LEDTA(pH8.0)
Tris-硼酸(TBE)a0.5×
0.045mol/LTris-硼酸5×
54gTris碱
0.001mol/LEDTA27.5硼酸
20ml0.5mol/LEDTA(pH8.0)
碱性缓冲液b1×
50mmol/LNaOH1×
5ml10mol/LNaOH
1mmol/LEDTA2ml0.5mmol/LEDTA(pH8.0)
Tris-甘氨酸c1×
25mmol/LTris5×
15.1gTris
250mmol/L甘氨酸94g苷氨酸(电泳级)(pH8.3)
0.1%SDS50ml10%SDS(电泳级)
实验室常用技术参数资料
(二)
2003-11-1热门指数:
6468
二、常用缓冲液
1.分子克隆常用缓冲液
2.磷酸缓冲液
(1)25℃下0.1mol/L磷酸钾缓冲液的配制※
pH1mol/LK2HPO4(ml)1mol/LKH2PO4(ml)
5.88.591.5
6.013.286.8
6.219.280.8
6.427.872.2
6.638.161.9
6.849.750.3
7.061.538.5
7.271.728.3
7.480.219.8
7.686.613.4
7.890.89.2
8.094.06.2
(2)25℃下0.1mol/L磷酸钠缓冲液的配制※
pH1mol/LNa2HPO4(ml)1mol/LNaH2PO4(ml)
5.87.992.1
6.012.088.0
6.217.882.2
6.425.574.5
6.635.264.8
6.846.353.7
7.057.742.3
7.268.431.6
7.477.422.6
7.684.515.5
7.889.610.4
8.093.26.8
※:
用蒸馏水将混合的两种1mol/L贮存液稀释至1000ml,根据Henderson-Hasselbalch方程计算其pH值:
pH=pK’+1g([质子受体]/[质子供体])
在此,pK’=6.86(25℃)。
3.电泳缓冲液
测序凝胶加样缓冲液
98%去离子甲酰胺
10mol/LEDTA(pH8.0)
0.025%二甲苯青FF
0.025%溴酚蓝
甲酰胺:
许多批号的试剂级甲酰胺,其纯度符合使用要求,无须再进行处理。
不过,一旦略呈黄色,则应用在磁力搅拌器上将甲酰胺与DowexXG8混合床树脂共同搅拌1小时进行去离子处理,并用Whatman1号滤纸过滤2次,去离子甲酰胺分装成小份,充氮存于-70℃。
常用的电泳缓冲液
说明:
①TBE溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存5×
溶液,出现沉淀后则予以废弃。
以片都以1×
TBE作为使用液(即1:
5稀释浓贮液)进行琼脂糖凝胶电泳。
但0.5×
的使用液已具备足够的缓冲容量。
目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以1:
10稀释的贮存液作为使用液。
进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小,故通过缓冲液的电流量通常较大,需要使用1×
TBE以提供足够的缓冲容量。
②碱性电泳缓冲液应现用现配。
③Tris-甘氨酸缓冲液用SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。
2×
SDS凝胶加样缓冲液:
100mmol/LTris?
HCl(6.8)
200mmol/L二硫苏糖醇(DTT)
4%SDS(电泳级)
0.2%溴酚蓝
20%甘油
不含DTT的2×
SDS凝胶加样缓冲液可保存于室温,应在临用前取1mol/L贮存液现加于上述缓冲液中。
4.凝胶加样缓冲液
缓冲液类型6×
缓冲液贮存温度
Ⅰ0.25%溴酚蓝
4℃
0.25%二甲苯青FF
40%(W/V)蔗糖水溶液
Ⅱ0.25溴酚蓝
室温
15%聚蔗糖(Ficoll400)
Ⅲ0.25%溴酚蓝
30%甘油水溶液
Ⅳ0.25%溴酚蓝
碱性加样缓冲液:
300mmol/LNaOH
6mmol/LEDTA
Ⅴ18%聚蔗糖(Ficoll400)
0.15%溴甲酚绿
使用以上凝胶加样缓冲液的目的有三:
增大样品密度;
以确保DNA均匀进入样品孔内;
使样品呈现颜色,从而使加样操作更为便利,含有在电块中能以可预知速率向阳极泳动的染料。
溴酚蓝在琼脂糖中移动的速率约为二甲苯青FF的2.2倍,而与琼脂糖浓度无关。
以0.5×
TBF作电泳液时,溴酚蓝在琼脂糖中的泳动速率约与长300bp的双链线状DNA相同,而二甲苯青FF的泳动则与长4kb的双链线状DNA相同。
在琼脂糖浓度为0.5%~1.4%的范围内,这些对应关系受凝胶浓度变化的影响并不显著。
选用哪一种加样染料纯属个人喜恶。
但是,对于碱性凝胶应当使用溴甲酚绿作为示踪染料,因为在碱性pH条件下其显色较溴酚更蓝为鲜明。
5.各种pH值的Tris缓冲液的配制
各种pH值的Tris缓冲液的配制
所需pH值(25℃)0.1mol/LHCl的体积
7.145.7
7.244.7
7.343.4
7.442.0
7.540.3
7.638.5
7.736.6
7.834.5
7.932.0
8.029.2
8.126.2
8.222.9
8.319.9
8.417.2
8.514.7
8.612.4
8.710.3
8.88.5
8.97.0
某一特定pH值的0.05mol/LTris缓冲液的配制:
将50ml0.1mol/LTris碱溶液与上表所示相应体积(单位:
ml)的0.1ml/LHCl混合,加水将体积调至100ml
(2)温度对50mmol/LTris?
HCl液pH值的影响
4℃25℃37℃
8.17.57.2
8.27.67.3
8.37.77.4
8.47.87.5
8.57.97.6
8.68.07.7
8.78.17.8
8.88.27.9
8.98.38.0
9.08.48.1
9.18.58.2
9.28.68.3
9.38.78.4
9.48.88.5
(6)常
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