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亚硝酸细菌的分类主要根据细菌形态的表型特征、细胞内细胞质膜的分布及它们16SRNA序列的同源性。
1984-1989年的《伯杰氏细菌系统分类学》把硝化细菌分为九个属:
硝化杆菌属、硝化刺菌属、硝化球菌属、硝化螺菌属、亚硝化单胞菌属、亚硝化螺菌属、亚硝化球菌属、亚硝化叶菌属和亚硝化弧菌属等。
而目前则倾向于把亚硝酸细菌分为两个单一细胞起源的群体,它们分别属于变形菌纲的B亚纲和Y亚纲。
在对这两个亚纲的亚硝酸细菌作进一步的分类时,不同的学者还有些细微的差别。
Votek等认为除了海洋亚硝酸球菌属于变形菌丫亚纲外,其它的亚硝酸细菌即亚硝酸单泡菌和亚硝酸螺旋菌两个种群属于变形菌B亚纲。
其中亚硝酸单泡菌包括欧洲亚硝酸单泡菌和亚硝酸运动球菌,亚硝酸螺旋菌包括亚硝酸螺旋菌属、亚硝酸颤菌属和亚硝酸叶菌属⑵。
这种分
类方法可用图1表示。
//亚碼化MR虞AT厲
亚确比螺巌暫亚硒化叶画買
、亚甬化*曹嵐
图1Votek亚硝酸细菌分类法
Philips等认为海洋亚硝化球菌和N.halophilus属于变形菌丫亚纲,其它的亚硝酸细菌属于变形菌B亚纲,包括亚硝化单泡菌属和亚硝化螺旋菌属⑷。
Juretschko同样认为海洋亚硝化球菌和属于变形菌Y亚纲,但是他认为于变形菌B亚纲亚硝酸细菌应包括四个属,即亚硝化单胞菌属、亚硝化螺菌属、亚硝化叶菌属和亚硝化弧菌属,而且后三个属彼此关系密切⑸。
除了亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)外,其它能把氨氧化成亚硝酸的细菌属包括亚硝化螺菌属(Nitrosospira)、亚硝化球菌属
(Nitrosococcus)、亚硝化弧菌属(Nitrosovibrio)、亚硝化叶菌属(Nitrosolobus)、亚硝化胶团菌属(Nitrosogloea)、亚硝化囊菌属(Nitrosocystis)。
土壤生境中常见的是亚硝化单胞菌属、亚硝化球菌属、亚硝化叶菌属、亚硝化螺菌属。
海洋生境中常见的是亚硝化单胞菌属、亚硝化球菌属、亚硝化螺菌属。
盐湖生境中则有亚硝化单胞菌属叭
亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)
在亚硝化单胞菌属中,是最早被分离并描述的种。
除此以外,已确定的种还有8个,随着研究的深入,新种还会继续增加。
亚硝化单胞菌属菌株呈杆状或椭球状。
菌体单生,很少成链。
菌体游离或包埋在黏液内。
细胞有内膜,呈扁平泡囊,分布于四周。
革兰氏染色阴性,好氧生长。
生长温度范围5-30°
C,最适生长温度30°
C左右。
生长pH值范围最适生长Ph值范围。
能量(主要指ATP)和还原力[主要指NAD(P)H,]来源于氨的氧化。
许多菌株产生腺酶,能够利用尿素。
以CO:
为碳源,进行自养生长;
细胞拥有竣酶体(carboxysome),内含Calvin循环中固定CO:
的关键酶一一二磷酸核酮糖竣化酶。
也能以CO:
或有机物作为碳源,进行混养(混合营养)生长,但不能以有机物作为碳源,进行
异氧生长。
细胞产生丰富的细胞色素,使细胞悬液呈黄色或红色。
强光照和高氧分压可抑制生长。
亚硝化球菌属(Nitrosococcus)
Nitrosococcus包含、和三个种。
菌体呈球状至椭球状,可以是单球菌、双球菌和四联球菌,常包埋于黏液内而形成菌胶团。
细胞有内膜,呈扁平泡囊,分布于四周或堆积于中央。
革兰氏染色阴性。
依靠丛生鞭毛或单生鞭毛运动。
好氧生长。
C,最适生长温度30°
生长pH范围,最适生长Ph范围。
能量和还原力来源于氨的氧化。
一些菌株产生服酶,能够利用尿素,能自养生长,也能混养生长,但不能异样生长。
细胞内含有丰富的细胞色素,使细胞悬液呈黄色或红色。
亚硝化螺菌属(Nitrosospira)
Nitrosospira只有一个种。
菌体呈螺旋状,有3-20圈。
细胞没有内膜,也没有竣酶体。
生长温度范围20-35°
Co生长pH范围。
能量和还原力来源于氨的氧化。
严格自养生长。
细胞内含细胞色素,但不含其他色素。
亚硝化叶菌属(Nitrosolobus)
Nitrosolobus只有一个种。
菌体形态多样,裂片形细胞被内陷的细胞膜分隔,每个细胞有1-4个中心小室,其外面有5-20个膜结合的小室环绕。
以缢缩的方式分裂。
能量和还原力来源于氨的氧化。
主要自养生长,也能混养生长,但不能异样生长。
最适生长温度25-30°
Co最适生长pHo亚硝化弧菌属(Nitrosmdbrio)
Nitrosmdbrio只有一个种。
菌体细长弧状,细胞没有内膜,竣酶体不明显。
严格好氧生长。
最适生长Ph范围。
能量和还原力来源于氨的氧化。
主要自养生长,也能混养生长,但不能异样生长。
表1各种氨氧化细菌的特征
1^1
属as)肖tIE(N
\)/
<
{it
(N
属ra)sp累s哪o匕s供o肖r
t可(N
形态
状形多
鞭毛
生周
细胞内膜排列方式
分
慎
内
无
膜内无
菌体大小
时代时间/h
12
8
24
储存物
细胞色
红淡至淡
红淡至黄淡
素,色素
PH值范围
温度范ffl代
1:
为最适温度范围;
2:
为最低温度范围。
3亚硝化反应过程与机理
亚硝化作用则是硝化作用从NHr或NH3到NO;
的反应过程,是氮素循环的重要环节,由氨氧化细菌(NHs-oxidizers,又被称为初级硝化细®
primarynitrifiers)、亚硝化细菌(ammonia-oxidizingbacteria)來完成。
生化氧化叫
NH;
++2HCCV~业斶酸菌»
NOJ+2H2C03+(240-
350kJ/mol)
(1)
亚硝酸菌10N0J+8H:
C03+3C5H7NO2+
生化合成:
13NH;
+23HCO,
19H:
0
(2)
则第一阶段的总反应式(包括氧化和合成)为:
55NH「+760,+109g菌CHNO:
+54N0J+1O4H2CO3+
+57H:
0(3)
氨氧化细菌是一类化能自养型细菌,氨是其进行H养生长的唯一能源。
从热力学观点来看,亚硝化细菌利用的基质为低级能源。
相对于呼吸链上的电子载体而言,氨氧化的氧化还原电位值Eo/(NO;
/NHr)=340mV,氧化磷酸化效率很低,所能产生的ATP非常有限。
亚硝化细菌中不存在基质水平磷酸化,它们依靠氧化磷酸化来贮存能量。
在25°
C,pH7的条件下,NH3氧化为NOJ的吉布斯自由能为kj・(molN)-1,即使全部转化为ATP,最多仅产生molATP・(molNH;
)-打NHs氧化所释放的电子只能传递给呼吸链上较低端的物质,因此NH3的氧化反应不可能直接耦联到呼吸链上第一个成分烟酰胺腺瞟吟二核昔酸(nicotineamidedinucleotide,NAD)的还原反应,能量不得不用于使电子跃迁到这一较高能级,即用于所谓的逆电子流过程中。
这些因素使得亚硝化细菌生长很缓慢,世代期为8〜36h,经过7〜10d的培养菌落很微小,大多直径在100urn左右。
利用相同数量的能量,亚硝化单胞菌所产生的细胞物质仅为异养菌的1%〜4%,这是因为需要消耗ATP和还原力来还原C0严。
但从生化水平上看,硝化作用远非如此简单,它涉及多种酶催化的代谢途径,并伴随着复杂的物质和能量转化。
在亚硝化细菌的作用下,氨转变为亚硝酸的氧化过程中,氮原子价
从-3变至+3,电子的移动达6个,故必然会有中间产物,但中间产物究竟
有儿个,现仍不大清楚现己证明,其中一种中间体是疑胺(NH:
0H),认
为由疑胺进一步氧化成亚硝酸必需经过两个阶段,即疑胺脱氢形成像硝酰(NOH)那样的氧化态中间体,然后在酶的作用下由硝酰转变成亚硝酸。
而亚硝酸在硝化细菌的作用下可直接氧化成NO「⑼。
亚硝化作用涉及多种酶催化的代谢途径,即为:
NH3氨单加氧酶NH2OH疑胺氧还酶
NO疑胺氧还酶「NO;
ork
氨氧化为疑胺的生化反应可表示为⑺:
NH3+NH2OHAG=+17kJ/mol
(4)
+2H'
+2JH:
0AG=-137kJ/mol
(5)
NH3+0:
+2[H]酶NH:
OH+H:
0AG=-
120kJ/mol(6)
根据化学反应的自由能变化判断,在标准状态下,氨的疑化反应不易进行(4)式;
需要氧的还原反应(5)式来拉动。
只有当两个反应耦合时(6)式氨的氧化才能顺利进行。
疑胺氧化成亚硝酸盐被认为是一个分两步进行的反应,中间产物可能是与酶结合的HNO,也可能是N0。
疑胺氧化为亚硝酸盐的生化反应可表示为力:
NH:
OH+5H:
HNO:
+4戌+4J
AG二+23kJ/
mol
NHzOH+疑胺氧还酶~HNO:
+2H*+2JAG二-114kJ/mol
首先在氨单加氧酶(AMO)的催化下将氨氧化成疑氨,再经疑氨氧化还原酶(HAO)的催化下将疑氨氧化成亚硝酸,进而由硝化细菌的亚硝酸盐氧化还原酶催化形成硝酸他。
heme
HAO
Cm552个
图2亚硝化菌的氨氧化机制
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