市级医院临床科研资源共享平台项目Word格式文档下载.docx
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收费价格(元)
课题组自
行支付
项目经费
支付
MLPA-微阵列芯片技术
150
300
用于基因突变的检测
aCGH佥测微小染色体异常
1000
检测染色体微小异常
FISH图像分析(多色分析)
500
600
染色体复杂异常的分析
染色体核型分析
250
100
染色体异常检测
5
流式分析/管
20
细胞分析
6
流式分选/小时
500/2way
1000/3-4way
细胞分选
临床药理学平台
SHDC12007702
临床药理学科研共享平台
平台建设单位:
曙光医院
蒋健马越鸣
上海市普安路185号邮政编码:
200021
高月球
电子信箱:
平台介绍:
曙光医院为卫生部首批中药临床药理基地,2006年通过了SFDA专家组的现场检查,至今承担了卫生部或国家食品药品监督管理局下达的新药临床试验任务200多项。
医院下设的临床药理科由药物临床研究评价研究室,I期临床试验研究室,药物代谢动力学实验室和数据管理中心组成。
是国家(教育部)重点学科中医内
科学、国家(教育部)重点学科中药学、国家(教育部)省部共建实验室、上海市优势学科中医内科学、上海市浦东新区新药临床试验研究平台的重要组成部分。
医院与中科院药物研究所药物代谢研究中心、上海中医药大学GLP实验室、
上海中医药大学临床药理研究中心有良好的合作关系,具备开展药物代谢研究的
软硬件条件和技术支撑。
建在浦东张江的I期病房符合国际一流标准,至今已完成I期药物临床试验36项,药代实验室已经具备血药浓度检测方法确证及检测等基本技术,完成药代和生物等效性试验31项。
医院承担的援非项目盐酸阿莫地喹生物等效性试验,是中国第一个接受WH(委托并监察的I期临床试验项目,已经通过WH啲验收。
表2-1临床药理学平台可供共享的设备
质谱仪
LC/MS-2010EV
血药浓度检测
高效液相色谱仪
LC-2010
液相色谱质谱联用仪
API4000
微型旋涡混合仪
XW-80A
混匀试剂
高速离心机
AnKeTGL-18C-C
离心
脉冲调制型超声波清洗器
AS10200A
清洗
7
超低温冰箱
SANYO
保存样品
8
分析天平
XS105
称量
表2-2临床药理学平台可供共享的技术项目及收费价格
序
号
药代动力学研究(1期)
(3个剂量+连续性给药)
协商确定
150000
检测药物浓度,分析体内经时过程,评价药动学特征
药代动力学研究(1期)(单剂量)
50000
新药人体生物利用度试验(1期)
80000
检测药物浓度,分析体内经时过程,进行生物等效性评价
治疗药物监测
200/样
检测治疗药物浓度,用药个体化
药代动力学研究
(人或动物,除外1期)
20000*
+150/样
药物检测方法建立和确证
20000
样本检测
150/样
生物利用度试验
9
(30000)
10
*为方法确证费用
病原学平台
项目批准号:
SHDC12007703
病原微生物与传染病防治临床科研资源共享平台平台建设单位:
公共卫生临床中心
袁正宏联系地址:
金山区漕廊公路2901号邮政编码:
201508
胡芸文
上海市公共卫生临床中心作为市政府2004年重大建设项目一号工程,建设目标是加强本市的公共卫生体系建设和传染病的临床诊治,构筑起一个可供国内外开放交流合作的公共卫生科研平台,为提升上海的公共卫生医疗与教学科研能力发挥作用。
下属科研中心设有6个实验平台,分别为:
分子生物学平台、药代动力学和蛋白质组学平台、免疫学平台、细胞生物学平台、高致病性病原微生物研究平台、实验动物平台。
采用科学研究与临床医技一体化的管理模式,两者互为补充、相互促进、资源共享、共同提高。
采用灵活多样的政策吸引国内外专家利用技术和设备平台共同开展传染性、感染性疾病病原学,病毒分离,免疫与病理,药物筛选与疫苗,临床诊断、治疗和预防等方面的研究,逐步建立“以我为主,广泛合作”的国际合作新模式。
通过多种形式的国内外合作交流,科研共享平台将发展成为集传染病实验室诊断、科学研究、平台服务和人才培训为一体的设备精良、技术先进、运转高效的开放式现代化实验室平台。
在传染病病原学和生物学特性、发病机制、诊断方法与技术、疫苗研究等方面形成特色,全面提高检验、检测及科研能力,为疾病预防控制、治疗、公共卫生监督、预防医学研究及突发事件应急处置等提供实验技术支持。
通过国际合作,科研共享平台力争成为世界卫生组织西亚太区传染病与公共卫生研究合作中心之一,努力成为在国际相关领域有重要影响的传染病与公共卫生研究平台。
表3-1病原学平台可供共享的设备
DNA测序仪
Megabace500
主要用于各种生物物种的全基因组测序,质粒克隆测序,
PCR产物直接测序,微卫星DNA基因型分析和单核苷酸多态性(SNP)基因型分析等。
流式细胞仪
FACSAria
主要应用于淋巴细胞亚群分析,多个细胞因子检测,胞内细胞因子检测,细胞周期及倍体分析,细胞凋亡等抗体标记物的细胞分析。
超速离心机
OptimaL-XP
Series
病毒及亚细胞组份分离;
蛋白梯度分离;
蛋白分离;
RNA梯度沉淀;
质粒DNA提纯等
共聚焦显微镜
FV1000
对细胞内蛋白、核酸进行荧光定位检测。
微生物鉴定系统
AGILENT
6890N
通过分析每个菌株的脂肪酸图谱来鉴定细菌及酵母
ABI质谱仪
岛津液相一
API3200
用于体内药物分析和药代动力学研究,组合化学大量样本分析,农药及降解产物分析及天然提取物分析。
二维液相
ProleomeLab
PF2D
目标蛋白快速分离。
离子肼质谱
EsquireHCT
用于小分子药物、多肽及大分子蛋白质、核酸等的分析
生物信息系统
Insightn
提供生物分子及有机小分子建模,功能分析工具,结构改造,动力学模拟等。
Luminex
Luminex100?
用于病原体高通量检测。
11
四级杆质谱
Agilent1100
LC/MSDSL
主要应用于药物开发、农药、兽药残留分析、有机化学、
配位化学研究等有机小分子领域;
小分子药物代谢分析,
也可应用于蛋白质组学(多肽、蛋白及其它生物活性物质)的定性、定量研究。
12
荧光显微镜
Axiovert200
用于观察基因表达,体外授精,显微镜解剖等。
13
小动物CT
Explore
Locus
用于动物模式之建立、干细胞的研究神经科学的研
究、心血管疾病的研究、肿瘤转移机制研究、新
药开发及药物载体研究、纳米生物医药材料研发、骨
质疏松及微骨结构的检测等。
14
蛋白多肽纯化系
统
BioLogic
DouFlowTM
用于全自动蛋白和肽的纯化。
15
小动物荧光影像分析系统
NightOWL
动物荧光扫描成像及分析和定量
表3-2病原学平台可供共享的技术项目及收费价格
课题组自行支付
项目经费支付
二维液相蛋白质
分离
48元/样品
32元/样品
蛋白质分离
二维电泳全套
3200
银染全套:
4400
考马斯亮蓝全
套:
4000
蛋白分离
蛋白质谱鉴定/样品
(NanoLC-MS/MS
200
2DE胶点:
SDS胶带:
800
蛋白鉴定
蛋白多肽纯化
1000元/样品
300元/样品
病毒及亚细胞组分离
(超速离心方法)
200元/样品
蛋白梯度分离;
蛋白分离;
RNA梯度沉淀;
质粒
DNA提纯等
ELISPOT检测
50元/样品
测定细胞毒T细胞和辅助性T细胞的数量和活性
细胞因子、细胞周期和凋亡分析
多抗制备
3300
抗体制备
单抗制备
12000
5000
500/2way,
细胞快速分选
DNA测序
15/样品
35/样品
DAN序列鉴定
细胞荧光观测及摄像服务
24元/次
40元/次
观察细胞内基因表达,细胞图片解析
共聚焦显微镜观察和分析
120元/样品
对细胞内蛋白、核酸进行荧光定位检测。
微生物鉴定
100元/样品
菌株的脂肪酸图谱分析和鉴定
药物浓度分析
180元/样品
400元/样品
药物开发、农药、兽药残留分析、有机化学、配位化学研究;
小分子药物代谢分析
16
荧光定量PCR检测
30元/小时
检测病毒载量及组织细胞基因表达水平
17
呼吸道病毒高通
量检测(luminex)
800元/样品
呼吸道病原体高通量筛查(8-10种同
时检测)
18
病原体核酸鉴定
20元/样品
DNA检测:
60
元/样品
RNA检测:
80
检测+测序鉴
定:
200元/样
品
呼吸道、神经系统和消化系统病原体(包括细菌、病毒、支原体和衣原体等)的核酸鉴定,核酸序列分析
19
病毒的分离培养
600元/样品
呼吸道、神经系统和消化系统病毒的分离培养(仅限可在P2级生物安全实验室进行培养的病原体)
病毒的血清学检
测
30元/样品
呼吸道和神经系统病毒抗体检测(麻疹、乙脑和出血热等)
21
小动物荧光影像分析
80元/样品
动物冷光荧光影像研究
22
小动物活体成像分析
动物活体成像研究
23
小动物多脏器超
声检查
12元/样品
18元/样品
小动物多脏器的实时两维超声图象米集,测量和分析
24
动物尿液成分检
6元/样品
10元/样品
葡萄糖、蛋白质、胆红素、尿胆原、PH值、潜血、酮体等12项指标检测
25
小动物无创血压
测试
9元/样品
小动物无创血压测量
26
动物血液生化检测
21元/样品
动物血液生化指标检测
27
动物血液血球计数
动物血液细胞计数和分类
28
病理切片图像分
析
8元/样品
病理图像处理和分析
29
普通级动物饲养群体维护
1000元/月
普通动物实验
30
SPF级动物饲养群体维护
2000元/月
清洁级动物实验
31
P1级动物饲养群体维护
4000元/月
生物安全一级的病原微生物感染动物实验
32
感染动物模型制
备
12000元/项
目
生物安全二级的病原微生物感染动物实验(饲养、维护和攻毒)
基因组学平台
SHDC12007704项目名称:
肿瘤功能基因组学和分子形态科研资源共享平台建设平台建设单位:
第一人民医院项目负责人:
彭志海、黄倩联系地址:
上海市武进路85号邮政编码:
200080联系人:
李啸华平台介绍:
上海市第一人民医院建有博士后、博士、硕士研究生培养站、点分别为12、
19和29个。
医院长期致力于胃肠道肿瘤、肝脏移植和腹部大脏器联合移植的临床和基础研究。
从1999年起,着眼于肿瘤功能基因组学研究,对中国人群在全基因组水平筛选胃肠道肿瘤相关基因,同时探索新的肿瘤标记物。
已完成散发性结直肠癌、散发性胃癌全基因组杂合缺失扫描、精细定位研究,以及散发性结直肠癌基因芯片扫描、候选基因筛选工作,目前正在对筛选基因开展全面验证工作,同时对胃癌开展基因芯片扫描,候选相关基因筛选工作。
相关工作已连续获得“863”重
点项目子项目、3项国家自然科学基金、上海市百人计划一期、二期项目、上海市科委重点项目、上海市医学领军人才、上海市自然科学基金等国家市级项目资助。
并获2006年上海市科技进步奖一等奖等一系列奖项,同时部分科研成果被《ClinicalCancerResearch》等SCI期刊收录。
目前已建立Westernblot、real-timePCR、MSP、Pyrosequencing技术、逆转录PCR基因转染、动物实验、流式细胞技术等技术平台,熟练应用AppliedBiosystems3730、3130基因分析仪、PyroMarkID定量遗传分析系统、Eppendorfreal-timePCR系统等大型仪器设备,并形成一支具有良好团队精神和较强科研攻关能力的人才梯队。
与上海交通大学Bio-X生命科学研究中心、卫生部纳米生物技术重点实验室、卫生部肝胆肠外科研究中心、中南大学生物医学工程研究院、Texas大学MDAnderson癌症研究中心等国内外知名研究机构开展多年的合作,共同完成多项课题。
表4—1基因组学平台可供共享的设备
基因分析仪
3130XL
遗传位点扫描、SNP筛选和验证、测序、LOH扫描、微卫星稳定检测、
SSCP
定量遗传分析系统
PyroMarkTMid
基因型等位频率分析、SNP位点分
析、甲基化检测
BD,ESCSVANTAGESE型
荧光细胞定量与分选、凋亡检测
微生物鉴定及药敏系统
梅里埃,VITEK2型
微生物鉴定、药敏试验
生物芯片扫描分析系统
PACKARD,4000型
生物芯片扫描
real-timePCR系统
EppendofMastercycler
eprealplex
real-timePCR
药物浓度分析仪
雅培,AXSYM型
倒置荧光显微镜
CarlZEISS,Axiouret
S100
活体细胞成像
正置荧光显微镜
CarlZEISS,AXIOPLAN2
石蜡,冰冻切片免疫组化
体视显微镜
CarlZEISS,SV11
动物活体成像,定性
全自动酶免分析系统
雅培,8389型
蛋白定量
倒置显微镜
Nikon,TE-2000
细胞培养
程序冷冻仪
SY-LAB
组织、细胞冷冻
切片机
Leica,RM2235
移植病理、原位杂交、组织化学
包埋机
LEICA,EG1150型
原位杂交、组织化学
SSCP电泳系统
Pharmacia,GenePhor
候选基因验证
紫外与可见分析装置
复日,FR-200
凝胶成像
深低温冰箱
三洋
移植标本建库
表4-2基因组学平台可供共享的技术项目及收费价格
SNPGenotyping
150/标本
50/标本
SNP基因分型
测序
10/碱基
2/碱基
甲基化检测
检测启动子甲基化
凋亡检测
40/标本
10/标本
LOH分型
80/标本
20/标本
Real-timePCR(含RNA抽
取)
200/标本
30/标本
RNA拷贝数检测
RT-PCR(含RNA抽取)
功能RNA佥测
普通PCR(含DNA抽取)
DNA扩增
免疫组化(含切片处理,50张起)
抗体抗原蛋白质检测
Westernblot(含蛋白抽
蛋白检测
血药浓度测定
移植病理(含切片处理)
100/标本
移植病理
基因突变检测
小动物成像
FISH
250/标本
荧光原位杂交,检测基因定性、疋量、整合、表达
临床免疫学平台
SHDC12007705
风湿自身免疫性疾病临床转化型研究综合技术平台建设平台建设单位:
仁济医院项目负责人:
陈顺乐
上海市山东中路145号邮政编码:
200001
黄新芳
上海交通大学医学院附属仁济医院建有上海市风湿疾病研究所。
医院下属的
风湿病学科是上海市医学领先专业重点学科,上海市教委重点学科,上海市卫生
局临床医学中心,具有20年研究红斑狼疮、类风湿性关节炎、骨关节炎等风湿性疾病的丰富临床经验和扎实的实验基础,是国内最早开展风湿病学研究的主要基地之一。
拥有一批在风湿病学领域颇具影响力的专家、教授。
学科“SLE系列
研究”曾获国家、市、部级科技进步奖,并获各类科研基金共946万,在系统性
红斑狼疮等风湿性疾病领域的研究水平已达到国际先进水平。
在建的共享平台下设主要自身免疫性疾病临床标本库和临床数据库平台,利
用基因组、转录组、蛋白组等研究策略解析风湿病发病机制的组学技术平台,常
见自身免疫性疾病动物模型及细胞免疫学研究平台,疾病诊断和治疗的医学转化
型研究平台,建有的SLE遗传资源管理数据库为目前亚太地区规模最大的SLE
遗传资源库。
已建立的技术有:
基因芯片技术、实时定量RT-PCR焦磷酸测序
技术、DNA自动测序法、等位基因分型、基因芯片聚类分析技术,ETDT
genehunter、FBAT遗传分析技术及流式细胞技术等。
与国外多家知名研究机构建立了良好的合作关系,并聘任国外知名专家担任平台顾问。
表5-1临床免疫学平台可供共享的设备
测序仪
ABI3730
DNA测序,SNPlex
FACSCalibur
检测细胞表面,胞内标志
实时定量PCR仪
ABI7900
实时定量PCRSNP
悬浮芯片系统
Bioplex
检测各种细胞因子,抗体
焦磷酸测序仪
PSQ96AM
DNA短片段测序,甲基化检测
自动移液工作站
epMotion5075
高通量单次,连续分液,各孔板间对比稀释
基因芯片
ScanArray5000
各种易感基因的筛选,检测
多功能成像系统
VersaDoc
各种凝胶成像,2-D电泳图象分析
荧
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- 医院 临床 科研 资源共享 平台 项目