Gaussian与量子化学文档格式.docx
- 文档编号:21332145
- 上传时间:2023-01-29
- 格式:DOCX
- 页数:133
- 大小:175.54KB
Gaussian与量子化学文档格式.docx
《Gaussian与量子化学文档格式.docx》由会员分享,可在线阅读,更多相关《Gaussian与量子化学文档格式.docx(133页珍藏版)》请在冰豆网上搜索。
b.增加叠代次数optcyc=N
5.优化过渡态,若势能面太平缓,则不好找到。
iop(1/8=10)默认30(下一个结构和该结构的差别0.3Å
),可改成10。
如果每一步都要用到小的步长,应该加opt(notrustupdate)
6.在CI(组态)方法中
如QCISD(T),CCSD(T),CID方法中,省却最大循环50,若出错(L913错误)
解决方法:
#PQCISD(maxcyc=N)
注:
N≤512
7.优化过渡态
opt=TS(给出过渡态)
opt=qst2(给出反应物和产物)
opt=qst3(给出反应物和产物和过渡态)
a.
用G03时的出错
opt=ts必须加FC(forceconstant)
写法:
opt=(TS,calcFc)
or
opt=(TS,calchffc)计算HF力常数,对QCISD,CCSD等方法用;
opt=(TS,modRedundant)
(最好写这个)
b.如果计算采用QCISD计算(不好计算FC)
则写为QCISDopt=(TS,calcHFFC)(用HF计算FC)
8.无法写大的Scratch文件RWF
a.劈裂RWF文件
%rwf=loc1,size1,loc2,size2,……..,locN,-1
b.改变计算方法MP2=Direct可以少占硬盘空间
c.限制最大硬盘maxdisk=NGB,****MB,有些系统写2GB会出错,可以写2000MB
9.FOPT出错
原因是变量数与分子自由度数不相等。
可用POPT或直接用OPT
10.优化过渡态只能做一个STEP
原因是负本征数目不对添加iop(1/11)=1或者noeigentest
关于自旋污染的问题。
请大家指点一下!
!
我在HF6-311G下对苯基做了单电能计算,其结果为:
SCFDone:
E(UHF)=
-230.006838057
A.U.after
22cycles
Convg
=
0.4612D-04
-V/T=
1.9997
S**2
=
1.1977
Annihilationofthefirstspincontaminant:
S**2beforeannihilation
1.1977,
after
0.9087
我想请问一下,这里的自旋值是不是太大了,计算结果可不可信。
我看了关于这方面的帖子,上面这样说:
可以通过比较总自旋S的预期值和计算值验证自旋污染。
S应当等于s(s+1)。
对于有机分子,偏差不超过正确值10%的计算通常是可接受的。
那么这里的准确值指的到底是什么值,是输入文件里的自旋值么?
请高手指点一下。
谢谢了。
是太大了,你的体系多重度应该是2吧,那么正常的S**2应该是0.75,你的结果0.9087大了。
你可以加Iop(5/14=2)看看,或者用ROHF。
自旋污染太大,意味得到的体系波函数很不准确,那么变分得到的结果也会不准确.
对,在优化、频率和单点能下都会有自旋污染,我想请问的是:
是不是在优化计算时只要保证收敛,在频率计算时保证没有虚频,就不必考虑自旋污染在不在允许的范围里,优化的结构就是能量最低的。
厦门大学理论化学研究中心-理论化学论坛-免费资源版精华(V.20040311)
Software
Molden4.0forLinux
molden3.7
Hyperchem中文教程
gambuild1.3(编写Gamess的输入文件用的)
CHEMOFFICE各个模块的使用手册
G03说明书
G03帮助电子版
Linux常用实用技巧
G98manual
ChemOffice软件套使用手册
《G98W程序使用入门》
Redhat9.0安装,入门,定制指南(中文html版)
MOPAC2002InstallationInstructionsforLinux
MOPAC2000InstallationInstructionsforLinux
MOPAC7InstallationInstructionsforIRIX
MOPAC7InstallationInstructionsforLinux
GAMESSInstallationInstructionsforIRIX
GAMESSInstallationInstructionsforLinux
PortlandGroupF77InstallationInstructionsforLinux
ComputationalChemistryPre-CompiledBinariesforLinux
IntelFortranCompilerInstallationInstructionsforLinux
Gaussian98InstallationInstructionsforIRIX
Gaussian98InstallationInstructionsforLinux
InstallationofRedHatLinux7.2
InstallationofRedHatLinux6.2
TipsforUsingtheVIEditor
chemexcel和chemhandbook
Iop详解(pdf格式)
计算化学软件SPARTAN
介绍一个实用的化学绘图软件—Chemwindow
g98manual电子书
VisualizationToolsSummary
LINUX中以.开头的系统重要文件
origin7.0的教程
Gamess_manual
linux常用命令
VI常用技巧
Linux下批处理作业的shell
GaussianTutorials--Websites
G98W程序使用入门
数据分析、科技绘图的必备工具--MicrocalOrigin
Gopenmol
ReferenceManager9.0使用介绍
origin7.0的中文教程
一个简单的变分过渡态(VTST)程序
Gaussian03_Online_Manual.exe(电子书)
swisspdbviewer教程的国内站点
molden.ppt
molden的使用详解
ChemOfficeUltra2004
band的说明和介绍
materialstudio的帮助翻译
一个免费的读.pdg的软件,无需安装超星阅览器
moldyuser'
sManual
NBOtutor
moldenmanual.pdf
X-window
numericrecipesfortran77code
带核外电子排布的元素周期表(电子版)
ADF2003
MOLDEN的manual
WORD版的G98程序员手册
Dmol3userguide
单位换算
HyperChem基本操作
usingG98
Gaussian98programmermanual
poltraie程序
AsmallprogrambasedonRRKMtheory
WebsitewithaJavaappletforgeneratingnanotubesandnanocones
CanonicalTSTprogram
Gaussview的使用手册
Gaussian03简介
grep的使用详解
AnswerstoCommonQuestionsaboutGaussView
Hypercamera,可以抓屏,作动画
BooksandReports
《MolecularSymmetryandGroupTheory》
红外与拉曼光谱入门
高等物化的课件
南京大学《化学信息学》网上课程
《AShortSummaryofQuantumChemistry》
《ElectronicStructureofMatter–WaveFunctionsandDensityFunctionals》
《ElectronTransferReactionsinChemistryTheoryandExperiment》
《ComputationalChemistryUsingthePC》
《量子化学》讲义pdf
推荐几本量化方面经典书
《ExploringChemistrywithElectronicStructureMethods》
《ModernStructuralChemistry》
一个初步介绍激发态的ppt
《molcas分子激发态研究》
如何撰写科技论文_邓航军.ppt
《QUANTUMCHEMISTRYINTHE21stCENTURY》
SomeExamplesaboutMolecularSymmetry
《耦合簇理论的方法综述》
《化学反应中的电子——基本原理》
几本DFT英文书籍上传(AChemist'
sGuidetoDensityFunctionalTheory)
什么是SCI和JCR?
Glossaryoftermsusedintheoreticalorganicchemistry
《IntroductiontoComputationalChemistry》ppt
《Cl+H2的动力学研究》ppt
《AngularMomentum入门教程》
基于结构的药物分子设计.ppt
分子力学.ppt
《相对论量子化学》
《MolecularModeling》
《IntroductoryQuantumMechanics2》
《IntroductoryQuantumMechanics1》
《MolecularsimulationIII》
《QuantumChemicalModels》
《QuantumChemistryandReactionDynamics》
《Anintroductiontoquantumchemistry》
《计算化学》
oniom.ppt--KeijiMorokuma
ReviewsinComputationalChemistry
《ModernMethodsandAlgorithmsofQuantumChemistry》
第八届全国量子化学学术会议的所有报告
《MolecularStructure》
Howtowriteathesis?
--TobyWalsh
Acronyms&
Definitions
《对称性、轨道和光谱》
AnatomyofanArticle-Thestructureunderlyingscientificpapers.ppt
ConceptualDensityFunctionalTheory
2002年外文期刊SCI影响因子表
几篇计算化学方面的综述
《量子化学--基本原理与从头计算法》
MD讲义PPT版
fortran90中文书
《FORTRAN90程序设计》
结构化学(ppt)课件
Gaussian之热化学
如何构建Z矩阵
北大的高等无机化学的讲义
ClassicalfailuresofHFtheory
如何在Nature杂志上发表文章
《物理公式集》
关于并行的问题
机器测试数据
《分子几何构型优化的初步比较》
分子激发态计算的理论方法一览
SpinContamination
无机化学丛书中的第十三卷
Hartree-Fock理论
《SGI?
ComputationalChemistryApplicationsPerformanceReport》
《AnIntroductiontotheElectronicStructureofAtomsandMolecules》
《AnAccurateBarrierforTheHydrogenExchangeReactionfromValenceBondTheory》.ppt
价键理论与方法的教学pdf
基组教学文档《AnIntroductiontoBasisSets》
为您的论文进入美国SCI、Ei导航_朱诚.doc
如何撰写科技论文_李干佐.ppt
论文写作_马佳光.ppt
PhysicalPropertiesofSWNTs
科研之Howto……系列
《ElectronicStructureAnInterplayofTheoryandExperiment》
一些群论的教程
VibrationalAnalysisinGaussian
ThermochemistryinGaussian
MOLECULARSPECTROSCOPYTheory.ppt
大家为什么不直接找作者要原文呢?
google提供了很强大的pdf文件搜索功能
google从入门到精通
wugs老师的现代化学前沿讲座
《PotentialEnergySurfaces,EnergyMinimizationMethods,andTransitionState》
《分子拓扑结构入门教程》
AtomsandMolecules.chm
《Fortran常用算法程序集》及已编译好的常用算法库文件
Resources
ExcitingMolecularSimulationGroups
SoftwareandHardwareCompanies
Websitesrelatedtocomputationalchemistrysoftware
化学中的常用计算机软件与资源
myfavorites
我个人收集的化学资源网站
电子书籍下载网址大全
化学信息网站
一个很好的化学资源分类网站
websiteforChemsoft1
websiteforChemsoft2
websiteforChemsoft3
AgoodwebsiteforDLchemsoft
国内唯一的一个免费对外开放的量化计算网站
SomeComputationalChemistryLinks
<
量子化学软件中文网>
>
一些化学词典
柯泰德線上英文論文編修訓練服務
ChemicalSoftwares
免费学术资源
Chemicalresources
MolecularElectronicsandBiocomputingInformationNetwork资源
CRC中键长部分
兰氏化学手册(第十三版中文版)
分子模拟网络资源大全(FromBhushanK.Bonde)
一个查晶体学参数的好地方
介绍一些有用的FTP
晶体结构专业网
SIMPLIFIEDINTRODUCTIONTOABINITIO
BASISSETS
INTRODUCTION
Somestraightforwardreviewsonbasissetsareavailable:
(Ahlrich&
Taylor,1981),(Andzelmetal.,1984),(Dunning&
Hay,1977),(Feller&
Davidson,1986),(Feller&
Davidson,1990),(Poirieretal.,1985).
Historically,thequantumcalculationsformoleculeswereperformedasLCAOMO,i.e.LinearCombinationofAtomicOrbitals-MolecularOrbitals.Thismeansthatmolecularorbitalsareformedasalinearcombinationofatomicorbitals:
where
isthei-thmolecularorbital,
arethecoefficientsoflinearcombination,
isthe
-thatomicorbital,andnisthenumberofatomicorbitals.
Strictlyspeaking,AtomicOrbitals(AO)aresolutionsoftheHartree-Fockequationsfortheatom,i.e.awavefunctionsforasingleelectronintheatom.Anythingelseisnotreallyanatomicorbital.Somethingsaresimilarthough,andthereisalotofconfusionintheterminologyused.Lateron,thetermatomicorbitalwasreplacedby"
basisfunction"
or"
contraction,"
whenappropriate.Early,theSlaterTypeOrbitals(STO'
s)wereusedasbasisfunctionsduetotheirsimilaritytoatomicorbitalsofthehydrogenatom.Theyaredescribedbythefunctiondependingonsphericalcoordinates:
whereNisanormalizationconstant,
iscalled"
exponent"
.Ther,
and
aresphericalcoordinates,and
istheangularmomentumpart(functiondescribing"
shape"
).Then,l,andmarequantumnumbers:
principal,angularmomentum,andmagnetic;
respectively.
Unfortunately,functionsofthiskindarenotsuitableforfastcalculationsofnecessarytwo-electronintegrals.Thatiswhy,theGaussianTypeOrbitals(GTOs)wereintroduced.YoucanapproximatetheshapeoftheSTOfunctionbysummingupanumberofGTOswithdifferentexponentsandcoefficients.Evenifyouuse4or5GTO'
storepresentSTO,youwillstillcalculateyourintegralsmuchfasterthaniforiginalSTOsareused.TheGTO(calledalsocartesiangaussian)isexpressedas:
.Thex,y,andzarecartesiancoordinates.Thel,m,andnARENOTQUANTUMNUMBERSbutsimplyintegralexponentsatcartesiancoordinates.
.
CallinggaussiansGTOsisprobablyamisnomer,sincetheyarenotreallyorbitals.Theyaresimplerfunctions.Inrecen
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- Gaussian 量子 化学