spss教程第十三章Word格式文档下载.docx
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3、
对某一研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,控制另一因素后对研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,包括从总体上比较和不同水平之间进行两两比较。
例13.1某临床试验对20名第Ⅲ或第Ⅳ期黑色素瘤患者进行随访研究,截至研究期结束,记录的生存资料见表1。
试计算100周生存率。
12.815.624.0+26.4
29.2
30.8+
39.2
42.0
58.4+
72.0+
77.282.487.2+94.4+97.2+106.0+114.8+117.2+140.0+168.0+
注:
数据后跟符号“+”表示该数据为删失数据。
13.1.1
界面说明
图1
寿命表主对话框
【Time】框
选入生存时间变量。
【DisplayTimeIntervals】框
欲输出生存时间范围及组距。
在by前面的框内填入生存时间上限,本例填入200(此区间必须包括生存时间的最大值);
在by后面的框内填入生存时间的组距,本例填入20,以保证结果列出“100-”的组段。
【Status】框
选入生存状态变量,并定义终结事件的标记值。
选入变量“Status”后,【DefineEvent】钮被激活变黑,击该按钮,弹出定义终结事件标记值的对话框(图1)。
对二分类变量,一般以死亡、复发、恶化等表示终结事件。
本例以死亡为终结事件,其标记值为1,故在Singlevalue框内填入1。
击Continue钮。
若生存状态变量取值为一连续型变量,如反应变量为收缩压,则在下面的Rangeofvalues框中输入140through400,此处上限输入400是我随便输入的一个上限,目的是为了定义高血压患者,实际上恐怕没有人的血压能达到400,这样才能保证包括所有的高血压病例,具体情况具体分析。
图2
定义终结事件标记值的对话框
【Factor】框
定义第1层因素,即分组因素。
【ByFactor】框
定义第2层因素,即分层因素。
【Options】选项
击Options按钮,弹出选项对话框。
(图3)
图3
寿命表选项对话框
LifeTable(s):
输出寿命表,系统默认。
Plot:
统计图。
Survival:
累积生存函数曲线。
Hazard:
累积风险函数散点图。
Oneminussurvival:
生存函数被1减后的曲线。
Logsurvival:
对数累积生存函数曲线。
Density:
密度函数散点图。
CompareLevelsofFirstFactor:
对第1层因素不同水平的比较,即主对话框(图1)中的factor框中所选入的因素。
None:
不做比较。
系统默认。
Overall:
整体比较。
Pairwise:
两两比较。
本例因没有分组因素,故CompareLevelsofFirstFactor选项均不可选。
寿命表
Thissubfilecontains:
20observations
LifeTable
SurvivalVariable
TIME
survivaltime(week)
说明:
20例观察单位,生存变量为“Time”,变量标签为“survivaltime(week)”
Number
Cumul
Intrvl
Entrng
Wdrawn
Exposd
Of
Propn
Proba-
Start
this
During
to
Termnl
Termi-
Sur-
Surv
bility
Hazard
Time
Risk
Events
nating
viving
atEnd
Densty
Rate
------
.0
20.0
2.0
.1000
.9000
.0050
.0053
18.0
17.0
3.0
.1765
.8235
.7412
.0079
.0097
40.0
13.0
1.0
12.5
.0800
.9200
.6819
.0030
.0042
60.0
11.0
10.5
.0952
.9048
.6169
.0032
80.0
9.0
7.5
.1333
.8667
.5347
.0041
.0071
100.0
5.0
3.5
.0000
1.0000
120.0
140.0
1.5
160.0
.5
Themediansurvivaltimeforthesedatais160.00+
SEofSEof
IntrvlCumulProba-SEof
StartSur-bilityHazard
TimevivingDenstyRate
-------------------------
.0.0671.0034.0037
20.0.0999.0042.0056
40.0.1081.0029.0042
60.0.1157.0031.0050
80.0.1261.0039.0071
100.0.1261.0000.0000
120.0.1261.0000.0000
140.0.1261.0000.0000
160.0.1261.0000.0000
∙IntrvlStartTime:
生存时间的组段下限。
∙NumberEntrngthisIntrvl:
进入该组段的观察例数。
∙NumberWdrawnDuringIntrval:
该组段的删失例数。
∙NumberExposedtoRisk:
暴露于危险因素的例数,即有效观察例数。
∙NumberofTermnlEvents:
终结事件的例数,即死亡例数。
∙PropnTerminating:
终结事件比例,即死亡比例。
∙PropnSurviving:
生存比例。
∙CumulPropnSurvatEnd:
至本组段上限的累积生存率。
∙ProbabilityDensty:
概率密度。
∙HazardRate:
风险率。
∙SEofCumulSurviving:
累积生存率的标准误。
∙SEofProbabilityDensty:
概率密度的标准误。
∙SEofHazardRate:
风险率的标准误。
∙Themediansurvivaltimeforthesedatais160.00+:
本例的中位生存时间为“160.00+”,从下图的累积生存函数曲线看,曲线与生存率等于0.5的横线不相交,故中位生存时间无法估计。
∙本例的100周生存率为53.47%。
2、累积生存函数曲线:
图4。
图4
累积生存函数曲线
13.2
Kaplan-Meier过程
Kaplan-Meier法用于:
1、估计某研究因素不同水平的中位生存时间。
比较该研究因素不同水平的生存时间有无差异。
控制一分层因素后对研究因素不同水平的生存时间比较(此时将按分层因素的不同水平对研究因素对生存时间的影响分别进行分析)。
怎么样,有点拗口吧?
例13.23种疗法治疗66例白血病患者的缓解时间(天)
A疗法
4,5,9,10,11,12,13,28,28,28,29,31,32,37,41,41,57,62,74,100,139,20+,258+,269,
B疗法
8,10,10,12,14,20,48,70,75,99,103,162,169,195,220,161+,199+,217+,245+
C疗法
8,10,11,23,25,28,28,31,31,40,48,89,124,143,12+,159+,190+,196+,197+,205+,219+
13.2.1
图5
Kaplan-Meier法主对话框
选入生存状态变量。
选入分组变量。
【Strata】框
选入分层变量。
【LablesCases】框
给个体标记。
【CompareFactor】选项
击CompareFactor按钮,弹出选项对话框。
(图6)
图6
分组因素水平间比较对话框
●
TestStatistics:
检验统计量。
Logrank:
检验生存分布是否相同,各时间点权重一样。
Breslow:
检验生存分布是否相同,以各时间点的观察例数为权重。
Tarone-Ware:
检验生存分布是否相同,以各时间点的观察例数的平方根为权重。
Lineartrendforfactorlevels:
分组因素水平间的线性趋势检验。
Pooledoverstrata:
水平间的整体比较。
Foreachstratum:
按分层变量,对每一层进行分组因素各水平间的整体比较。
Pairwiseoverstrata:
分组因素各水平间的两两比较。
Pairwiseforeachstratum:
按分层变量,对每一层进行分组因素各水平间的两两比较。
【Save】选项
击Save按钮,弹出SaveNewVariables(保存新变量)对话框(图7)。
图7
保存新变量对话框
累积生存率估计。
Standarderrorofsurvival:
累积生存率估计的标准误。
累积风险函数估计。
Cumulativeevents:
终结事件的累积频数。
在各水平内,按生存时间和生存状态排序。
击Options按钮,弹出选项对话框(图8)。
图8
K-M法选项对话框
Statistics:
统计量。
Survivaltable(s):
生存分析表。
Meanandmediansurvival:
平均生存时间和中位生存时间及其标准误和可信区间。
Quartiles:
生存时间的第25百分位数、中位生存时间、第75百分位数。
Plot:
操作如下:
1.
Analyze==>
Survival==>
LifeTables
2.
Time框:
选入remissiontime
3.
Status框:
选入status;
击defineevents钮,在singlevalue框右边的空格中输入1
4.
Factor框:
选入group;
5.
Comparefactors列表框:
选择Logrank、Breslow、Tarone-Ware
Lineartrendforfactorlevels:
选Pooledoverstrata或Pairwiseoverstrata
6.
Option列表框:
Statistics:
选Survivaltable(s)、Meanandmedian、Survival
Plots:
选Survival
单击OK钮
13.2.2结果说明
1、生存分析表
SurvivalAnalysisforTIMEremissiontime(days)
对生存时间变量Time进行分析,其变量标签是remissiontime(days)。
FactorGROUP=A疗法
TimeStatusCumulativeStandardCumulativeNumber
SurvivalErrorEventsRemaining
4恶化.9600.0392124
5恶化.9200.0543223
9恶化.8800.0650322
10恶化.8400.0733421
11恶化.8000.0800520
12恶化.7600.0854619
13恶化.7200.0898718
20删失717
23恶化.6776.0940816
28恶化915
28恶化1014
28恶化.5506.10101113
29恶化.5082.10171212
31恶化.4659.10171311
32恶化.4235.10091410
37恶化.3812.0993159
41恶化168
41恶化.2965.0936177
57恶化.2541.0893186
62恶化.2118.0838195
74恶化.1694.0770204
100恶化.1271.0684213
139恶化.0847.0572222
258删失221
269删失220
NumberofCases:
25Censored:
3(12.00%)Events:
22
SurvivalTimeStandardError95%ConfidenceInterval
Mean:
5715(28,86)
(Limitedto269)
Median:
313(25,37)
∙
限于篇幅原因,此处仅列出A治疗组的结果。
∙Time:
观察时间。
∙Status:
生存状态。
CumulativeSurvival:
累积生存率。
StandardError:
累积生存率的标准差。
CumulativeEvents:
累计死亡数。
Numberremaining:
组中剩余人数,即在时间Time的暴露人数。
2、生存时间估计
FactorGROUP=A疗法
SurvivalTimeStandardError95%ConfidenceInterval
Mean:
FactorGROUP=B疗法
11220(72,152)
(Limitedto245)
9924(52,146)
FactorGROUP=C疗法
9519(58,132)
(Limitedto219)
4011(18,62)
TotalNumberNumberPercent
EventsCensoredCensored
GROUPA疗法2522312.00
GROUPB疗法1915421.05
GROUPC疗法2215731.82
Overall66521421.21
Mean是生存时间的算术均数。
∙“Limitto269”表示A疗法组的最长生存时间为219天。
Median为中位生存时间,即生存率为50%所对应的生存时间。
A、B、C疗法的中位生存时间分别为31、99、40。
∙A、B、C疗法组中位生存时间的95%可信区间分别为(25,37)、(52,146)、(18,62)。
A、B、C疗法的删失例数分别为3、4、7,删失率分别为12%、21.05%、31.82%。
3、水平间的整体比较
TestStatisticsforEqualityofSurvivalDistributionsforGROUP
StatisticdfSignificance
LogRank4.312.1158
Breslow3.672.1595
Tarone-Ware4.352.1137
3种疗法的生存时间差异无显著性意义,3个检验统计量的P值均大于0.1。
在实际分析中,当各组的总体水平比较无统计学意义时,不宜再进行两两比较,此处仅是为了演示一下。
4、水平间的两两比较
LogRankStatisticand(Significance)
Factor12
23.65
(.0561)
32.84.03
(.0917)(.8677)
BreslowStatisticand(Significance)
23.23
(.0722)
31.77.07
(.1832)(.7967)
Tarone-WareStatisticand(Significance)
23.85
(.0498)
32.26.07
(.1324)(.7981)
3种检验方法两两比较差异均无显著性意义。
括号外数值为检验统计量,括号内数值为P值。
4、
生存曲线
第十四章活着--Survival菜单详解(下)
13.3
CoxRegression过程
上面给大家介绍的是两种生存分析方法,但它们只能研究一至两个因素对生存时间的影响,当对生存时间的影响因素有多个时,它们就无能为力了,下面我给大家介绍CoxRegression过程,这是一种专门用于生存时间的多变量分析的统计方法。
CoxRegression过程主要用于:
1、用以描述多个变量对生存时间的影响。
此时可控制一个或几个因素,考察其他因素对生存时间的影响,及各因素之间的交互作用。
例13.340名肺癌患者的生存资料(详见胡克震主编的《医学随访统计方法》1993,77页)
生存时间
状态
生活能力评分
年龄
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