生物化学歌诀综合汇总整编版Word格式.docx
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DNA双螺旋结构:
DNA,双螺旋,正反向,互补链。
A对T,GC连,配对时,靠氢键,,十碱基,转一圈,螺距34点中间。
碱基力和氢键,维持螺旋结构坚。
(AT2,GC3是指之间二个氢键GC间三个.螺距34点中间即3.4)
DNA双螺旋结构的特点:
右双螺旋,反向平行
碱基互补,氢键维系
主链在外,碱基在内
DNA的双螺旋结构的数据记忆:
01234
01是10对碱基。
2是螺旋直径2nm
3,4是碱基平面的距离0.34nm。
RNA和DNA的对比如下:
两种核酸有异同,腺鸟胞磷能共用。
RNA中为核糖,DNA中含有胸。
29.倒L型的tRNA三维结构中,TψC臂、氨基酸臂在倒L的横着的短段;
二氢尿嘧啶臂、反密码子臂在倒L的竖着的长段。
可以这样记忆:
俩字数少的在短的那段,字数多的在长的那段。
注意:
不要缩写!
比如二氢尿嘧啶臂不要缩写成DHU臂。
否则就该和TψC臂分不开了。
竟K大,非V小
反竟KV都变少
酶的竞争性抑制作用
按事物发生的条件、发展、结果分层次记忆:
1.“竞争”需要双方——底物与抑制剂之间;
2.为什么能发生“竞争”——二者结构相似;
3.“竞争的焦点”——酶的活性中心;
4.“抑制剂占据酶活性中心”——酶活性受抑。
糖醛酸,合成维生素C的酶
古龙唐僧(的)内子(爱)养画眉(古洛糖酸内酯氧化酶)
生化-酶的化学修饰-天行健
口诀:
正逆方向不同酶;
磷酸化否共价键;
多个底物效率高。
内容:
正逆两个方向是由不同的酶分别催化的;
磷酸化和去磷酸化是常见形式,出现共价键的变化;
一个酶分子可催化多个作用物,效率很高,有放大效应。
生化-蛋白质,酶变性-天行健
构象改变理化变;
溶解降低粘度增;
蛋白水解色增强。
空间构象改变,一级结构未改变,理化性质改变;
溶解度降低,粘度增加;
易被蛋白水解酶水解,增色效应。
生化酶学,维生素辅酶有点容易忘,又常考.
鄙夷拳击踢屁屁
硫胺素焦磷酸酯TPP(踢屁屁),维生素B1(鄙夷),转移醛基(拳击)
嫌贫爱富反辛酸
CoA(爱富)硫辛酸(辛酸),泛酸(反+酸),转移酰基(嫌)
古壁时而完归赵
钴胺素(古),维生素B12(壁时而),转移烷基(完)
六一夺权转为安
磷酸吡哆醛(夺权),维生素B6的一种(六一),转氨酶(转为安)
一夜两声叹
一夜即一碳单位和四氢叶酸,两声即二氧化碳和生物素
维生素PP和NAD(辅酶一),维生素B2和FAD/FMN(辅酶二),均为氧化脱氢酶辅酶,递氢,太常遇到,应该不会记错吧
维生素A总结
V.A视黄醇或醛,多种异构分顺反。
萝卜蔬菜多益善,因其含有V.A原。
主要影响暗视觉,缺乏夜盲看不见,
还使上皮不健全,得上干眼易感染。
促进发育抗氧化,氧压低时更明显。
维生素B6
B6兄弟三,吡哆醛、醇、胺。
他们的磷酸物,脱羧又转氨。
15.磷酸甘油穿梭系统和苹果酸-天门冬氨酸穿梭系统,都是字数少的进线粒体,字数多的出来。
少的进,多的出。
三羧酸循环
乙酰草酰成柠檬,柠檬又成α-酮
琥酰琥酸延胡索,苹果落在草丛中。
β-氧化
β-氧化是重点,氧化对象是脂酰,脱氢加水再脱氢,
硫解切掉两个碳,产物乙酰COA,最后进入三循环。
17.β-氧化的四步:
脱氢、水化、脱氢、硫解。
而脂肪酸的合成的四步,正好是β-氧化四步倒过来!
缩合、还原、脱水、还原。
辅酶不同。
生化-三羧酸循环
记忆方法:
天龙八部。
宁异戊同,二虎言平。
一同平虎,两虎一能。
记忆前提:
要熟悉每种物质的全名,如果名字都不知道,就不要考研了。
解释:
1,顺乌头酸这一步没有太大意义,很多书都将这一物质省略,所以,口诀也没有考虑。
三羧酸循环从乙酰CoA与草酰乙酸结
合开始,一共经过八个反应步骤,再回到草酰乙酸,我号称天龙八步,记住的话,你可以一步一步,写出来,因为前一步的产物就是下
一步的原料,忘了一个环节,整个都可能记不起来。
2,最初原料:
乙酰CoA与草酰乙酸大家应该都知道,所以从第二步起,
宁异戊同:
柠檬酸,异柠檬酸,a-酮戊二酸。
现在大家都要讲究个性,干什么都要别具一格,就叫做宁可异,也不要与人相同( 为了
记忆,酮戊倒过来成了戊酮)
3,二虎言平 (琥珀酰,琥珀酸,延胡索酸,苹果酸):
二虎相斗,必有一伤。
现在世界的主题是:
和平和发展。
为了人类的将来,
共赢才是真理。
所以,二虎相斗到最后,言平。
苹果酸后就回到了原料之一:
草酰乙酸。
4,除了能记住反应步骤外,还要记住哪里产H,生成co2那里生成能量。
一同平虎:
异柠檬酸,a-酮戊二酸,苹果酸脱氢反应生成3个NADH+H+,琥珀酸脱氢生成1个FADH2。
山上出现一只吃人的老虎,所以
大家一同(上山)平虎。
另外,一同不光脱H,还脱了个CO2。
5,二虎一能:
两只老虎对阵,你说中间好大的能量呀。
产生一个高能磷酸键。
三羧酸循环亦称柠檬酸循环、Krebs循环。
可以说是生物化学最重要的知识点,也是大家必须掌握和很难掌握的(至少可以说你能记住几个月?
?
)
循环的第一步是乙酰CoA(2C)与草酰乙酸(4C)缩合成柠檬酸(6C),柠檬酸经一系列反应重新生成草酰乙酸,完成一轮循环。
主要事件顺序为:
(1)乙酰CoA与草酰乙酸结合,生成六碳的柠檬酸,放出CoA。
柠檬酸合成酶。
(2)柠檬酸先失去一个H2O而成顺乌头酸,再结合一个H2O转化为异柠檬酸。
顺乌头酸酶(省略)
(3)异柠檬酸发生脱氢、脱羧反应,生成5碳的a-酮戊二酸,放出一个CO2,生成一个NADH+H+。
异柠檬酸脱氢酶
(4)a-酮戊二酸发生脱氢、脱羧反应,并和CoA结合,生成含高能硫键的4碳琥珀酰CoA,放出一个CO2,生成一个NADH+H+。
酮戊二酸
脱氢酶
(5)碳琥珀酰CoA脱去CoA和高能硫键,放出的能通过GTP转入ATP琥珀酰辅酶A合成酶
(6)琥珀酸脱氢生成延胡索酸,生成1分子FADH2,琥珀酸脱氢酶
(7)延胡索酸和水化合而成苹果酸。
延胡索酸酶
(8)苹果酸氧化脱氢,生成草酸乙酸,生成1分子NADH+H+。
苹果酸脱氢酶
小结:
一次循环,消耗一个2碳的乙酰CoA,共释放2分子CO2,8个H,其中四个来自乙酰CoA,另四个来自H2O,3个NADH+H+,1FADH2。
此外,还生成一分子ATP。
生化-琥珀酰COA的去路-天行健
氧化供能异生糖;
酮体氧化血红素。
琥珀酰COA-琥珀酸-延胡索酸-苹果酸-草酰乙酸-磷酸烯醇式丙酮酸--糖异生
琥珀酰COA+甘氨酸+Fe2+-----血红素
琥珀酰COA+乙酰乙酸(琥珀酰COA转硫酶)-乙酰乙酰COA+琥珀酸(HMGCOA合成酶)
-HMGCOA(HMGCOA裂解酶)--乙酰乙酸
生化-乙酰COA羧化酶调节-天行健
脂酸合成锰离子;
胰岛高糖去磷酸;
乙酰辅酶柠檬酸。
生化效应:
脂酸合成,锰离子是激活剂。
调节:
胰岛素,高糖饮食,去磷酸化共价修饰可使酶活性增强;
柠檬酸,异柠檬酸,乙酰COA通过变构调节使酶活性增强
生化中“一碳单位代谢”的记忆
一碳单位的代谢经常考,内容容易理解,但也容易忘记。
其实本节内容,只需记住一句话,考试时解题足矣!
——“施舍一根竹竿,让你去参加四清运动!
”。
什么意思?
①一碳单位的来源——“施(丝)舍(色)一根竹(组)竿(甘)”。
②一碳单位——“一根”。
③一碳单位的运载体——让你去参加“四清”(四氢叶酸)运动(运动→运送→运载体)。
好了,十几年来,考来考去,就这么一句话!
丙酮酸脱氢酶系辅酶一句话记忆:
赴美(COA)交流(TPP)时留心(硫辛酸)一下黄(FAD+)
色的尼(NAD+)龙线
生化-丙酮酸彻底氧化过程-天行健整理
3*5=15
3次脱羧
5次脱氢
生成15ATP
5次脱氢:
丙酮酸脱氢酶,异戊柠檬酸脱氢酶,A-酮戊二酸脱氢酶
琥珀酸脱氢酶,苹果酸脱氢酶
3次脱羧:
15ATP:
丙酮酸脱氢酶(NADH=3ATP)+12ATP(三羧酸循环)
归纳ATP生成数:
12+递增序列(3)
12-15-18-21
乙酰COA:
12ATP;
丙酮酸:
15ATP;
乳酸(丙氨酸):
18ATP;
甘油:
21,22ATP;
乳酸:
乳酸脱氢酶可生成1NADH=3ATP;
甘油--3磷酸甘油(-1ATP)--磷酸二羟丙酮--3磷酸甘油醛(+3ATP或2ATP)
--1,3-二磷酸甘油酸(+1ATP)--3-磷酸甘油酸--2-磷酸甘油酸
--磷酸烯醇式丙酮酸(+1ATP)--丙酮酸
生化-磷脂分类及俗名-幽兰菡筝
磷脂体内分布广,
甘油磷脂鞘磷脂。
磷(脂)酰门内俗名多,
胆碱又称卵磷脂。
乙醇胺升官称作脑
二鳞酰甘油来做心
此外还有丝氨酸
肌醇甘油来作伴
18.磷脂的合成代谢:
原核生物和哺乳动物不同。
哺乳动物以CDP-胆碱、CDP-乙醇胺为活性中间体。
动物有胆量(胆碱)喝酒(乙醇胺)。
不同磷脂之间的相互转变:
喝酒最重要!
喝酒是中心!
以磷脂酰乙醇胺为中心,可以被取代为磷脂酰丝氨酸、也可以被3次甲基化为磷脂酰胆碱。
酮体
酮体一家兄弟三,丙酮还有乙乙酸,
再加β-羟丁酸,生成部位是在肝,
肝脏生酮肝不用,体小易溶往外送,
容易摄入组织中,氧化分解把能功。
生化-酮体生成和胆固醇合成的调节-天行健
酮体生成的调节:
饥饿脂解胰高素;
(饥饿,脂肪动员加强,胰高血糖素)生成增加;
(饱食,脂肪动员减少,胰岛素)生成减少;
胆固醇合成调节:
三高:
高糖,高饱,高脂肪饮食;
合成增加;
三低:
饥饿,禁食(18乙酰COA,36ATP,16NADPH减少)
生化-最后生成多少个ATP?
-阿呆
乙酰COA,丙酮酸,乳酸,甘油经三羧酸循环和氧化磷酸化后,最后生成多少个ATP
12,15,乳酸17或18,20或22
婴儿穿的衣服顶呱呱(12,乙酰辅酶A)
(露出)一副病痛的酸相(15,丙酮酸)
(用)一把仪器做乳酸(18或17,乳酸)
双胞胎的耳朵涂甘油防冻(2220甘油)
生化-肝在脂类代谢中的作用-天行健
酮体生成B氧化;
极低合成低降解;
胆醇合成转移酶。
肝内脂肪酸的B氧化,酮体生成,但不能利用酮体;
合成极低密度脂蛋白,降解低密度脂蛋白;
合成胆固醇,合成和分泌LCAT(卵磷酸胆固醇酰基转移酶)。
22.谷草转氨酶在心肌中含量最高,谷丙转氨酶在肝细胞中含量最高。
心里长草!
感谢mummy提供
生化-嘌呤环的元素组成――孔方兄
竹竿立中央,谷子地上长
二氧化碳天上漂
一碳在两旁
生化-嘌呤核苷酸合成的原料-幽兰
天甘在上,谷天为底
一碳单位在两旁
二氧化碳顶头上
嘌呤核苷酸合成的原料,及各原料大体位置
比较通俗,就没解释
生化-嘧啶化学式组成-幽兰
嘧啶有三UCT三种嘧啶的化学式相似、差不多
UC头上氨代酮从U到C,是“头上”的氨基(U)取代酮基(C)
氨基转移谷酰胺体内氨基的转移、提供是依靠谷胺酰胺
氮杂丝酸可阻断谷胺酰胺的阻断剂是氮杂丝氨酸
UT五位加甲基从U到T,是五位上加一个甲基(所以五氟尿嘧啶是胸腺嘧啶的竞争抑制剂)
一碳单位做供体甲基的供体是一碳单位
四氢叶酸当司机体内由四氢叶酸来转运一碳单位
甲氨蝶呤也竞争甲氨蝶呤为竞争性抑制剂
生化-嘧啶核苷酸合成原料-幽兰
嘧啶合成先成环
再接核糖与磷酸
左是谷胺二氧碳
右中全是天冬氨
嘧啶核苷酸合成原料,及各自大体位置来源
意思比较浅显,无需解释
25.嘌呤环中各原子来源:
1-9:
天甲谷甘甘二甘甲谷;
嘧啶:
1-6:
天二氨天天天。
生化--嘌呤嘧啶的元素来源--海栀韵伊
嘌呤合成的元素来源:
甘氨酸中间站,谷氮坐两边。
左上天冬氨,头顶二氧化碳。
嘧啶合成的元素来源:
天冬氨酸左边站,谷酰直往左上窜,剩余废物二氧化碳。
生化-嘌呤核苷酸分子组成-幽兰
一天二碳三谷氨
四五七是甘氨酸
第六位是CO2
八九位上同二三
嘌呤核苷酸的分子组成,,对着分子式看就能看明白
24.嘌呤分解的终产物,不同生物是不一样的。
[人鸟虫],[哺乳],[硬骨鱼],[鱼、两栖],[甲壳、海洋无脊椎],分别是尿酸、尿囊素、尿囊酸、尿素、氨。
“酸素酸素氨”
26.IMP转变为AMP需要GTP、Asp;
IMP转变为GMP需要ATP、Gln或氨。
AGA、GAG。
27.嘧啶从头合成的六个酶,在真核生物中,前三个组成复合物CAD,后两个组成复合物。
3+2,康师傅苏打夹心~~
生化-质粒载体-天行健
环状双链克隆点;
自我复制抗药性。
存在于细菌染色体处的小型环状双链,分子本身有克隆位点;
有自我复制功能,有些带有抗药性基因,对某些抗生素或重金属的抗性。
生化-核糖体亚基-幽兰原创
口诀:
原核生物三五七
真核生物各加一
生化-真核生物TATA盒-天行健整理
准确频率起始点;
转录因子聚合酶;
TFIID和RNA-II。
位于转录起点上,控制转录的准确性和频率;
TATA盒是基本转录因子TFIID的结合位点;
TFIID是结合RNA聚合酶-II必不可少的。
生化-起始终止密码子-幽兰
起始密码AUG起始密码:
AUG,联想"
哎(A)哟(U)急(G)了,开始(起始)吧
起始密码是AUG
终止密码U举棋
终止密码有三个分别是UAA、UGA、UAG,都是U开头的
AGGA排排坐
如上,终止密码子都是以U开头.后面就是A和G的排列组合,那么有AG,GA,AA,GG.
唯独GGTrp
前面三个(AGGAAA)都是有的,唯独没有UGG,UGG是色氨酸(Trp)的密码
生化-摆动,终止密码子--孔方兄
①动现象
tRNAICU(ICU是重症监护病房)
mRNACUACUGAG后面都是CU打头的,多一个A,一个G,加起来刚好是最后一个AG.所以考试碰到这样的题目直接把表划出来对着找就OK了.
②起始密码子的记忆前面有朋友写了是:
AUG,唉哟急!
于是我也想了一个.
终止密码子的记忆:
想尿尿?
没鸡鸡!
首先要知道无论是起始密码子还是终止密码子都是没有C的,终止密码子都是以U开头.后面就是A和G的排列组合,那么有AG,GA,AA,GG.前面三个都是有的,唯独没有UGG这种终止密码子.所以想尿尿?
(U),没鸡鸡(GG).虽然锉了点,男同胞应该可以将就着看了,不雅但是能记住就够了.反正我是刚记住.
③核蛋白体组成
⑴小亚基是10到20之间的,原核16,真核18.
⑵大亚基原核5S,23S,真核是2,5,8的排列组合5,5.8,28.
或者一路看下来.真核:
5,5.8,18,28
28.摆动学说第二条:
可以先画A-U-G-C(哎哟急了AUG是起始密码子),意思是说挨着的就可以配对。
然后I和A\U\C可配对。
注意I只存在于反密码中,摆动发生在密码子第三位,前俩是沃森克里克配对。
生化-摆动现象
从我开始AUC【我(I)对应AUC】
AC配对很正常【A对U、C对G】
UG配对多UG【U对AG正常外多了个G】【G对CU正常外多了个U】
密码子和反密码的摆动--igacu09贺银城书234页按照这个顺序记忆i对应的正好是后三个为acug对应的是后两个cua对应的是最后一个u
还有些偏浑的和个人经历有关的就不在这写了网上看到的安又琪可以帮助记忆右室肥大有奇脉安又琪还有哮喘病呢(其实他没有为了大家好记忆她才有的)
生物化学DNA复制相关内容
原核生物:
DNApolⅠ:
具有校读,填补,双向外切酶活性的单链大分子,可延长20个核苷酸.⑴小片断:
5,3外切活性.⑵大片断(klenow):
3,5外切活性,也是实验的工具酶.
DNApolⅢ:
具有10个亚基α(5,3聚合活性),ε(3,5外切),β(辨认引物,起滑动作用),θ(维持二聚体结构)的催化核苷酸聚合的不对称二聚体.
DNApolⅡ:
双向外切活性.
总结:
Ⅰ,Ⅱ有双向活性,Ⅲ有5,3聚合和3,5外切活性
维持拓扑构想有三:
解螺旋酶(DnaB),DNA拓扑异构酶(切开,封闭,其中Ⅱ起主要作用),单链DNA结合蛋白(不断和DNA结合分离,保持单链完整).
DnaA辨认起始点.DnaC帮助DnaB.
引物酶是dnaG的基因产物.是一种RNA聚合酶.
引发体=引物酶+DnaB+DnaC+模板DNA.引发体无DnaA是因为DnaA辨认之后促使B,C结合到DNA上,A即被释放.
滚环复制见于低等生物和染色体外的DNA,不需要引物.
真核生物
共五种DNA-pol.
α和δ延长作用,其中α随从,δ领头
ε校读.修复
β其它无作用时才起作用
γ在线粒体内叫mtDNA,易突变,与衰老有关.
质粒是染色体外的DNA,是基因工程的常用载体.
RNA引物由RNA水解酶水解,由DNA-pol加上.
端粒酶:
是一种RNA-蛋白质.它RNA部分与DNA识别,部分作为模板逆转录生成端粒,多是TTAGGG的重复.而不依赖与DNA作为模板.
杂项:
⑴紫外线→嘧啶二聚体.
⑵5-溴尿嘧啶→A-G,
⑶羟胺类→T-C,
⑷亚硝酸盐→C-U,
⑸烷化剂:
G→甲基化G,
⑹镰刀贫血:
谷→缬,
⑺地中海贫血:
Hb的β→δ,重排.
⑻膀胱癌:
C-rasH点突变,甘→谷,
⑼切除修复(UrvA和B辨认结合损伤部位,urvC切除):
色性干皮病XP缺陷(DNApolⅠ和连接酶),
⑽重组修复:
RecA重组蛋白
⑾SOS修复:
uvr,rec,lexA,DNA-polⅡ参与修复,修复存活的DNA多有突变.
逆转录:
需Zn,引物为病毒本身的tRNA.
生化--游离胆红素和结合胆红素记忆
游离和结合胆红素的区别<
这有点勉强)不过,还是让大家锚锚吧!
游离胆红素比喻(谈恋爱的青年,未结合成夫妻);
结合胆红素比喻成(结合的夫妻)
恋爱的青年彼此包容性小(水容性小,脂容性大),不易排除相互的缺点(在肾脏不易排除),不能时时刻刻在一起(不能与葡萄糖醛酸结合),只能慢慢理解相互的缺点(重氮反应慢),热火中的恋爱容易发毒誓(脑的毒性大),比如我今生今世和你在一起等等的甜言蜜语;
可是结婚后,正好相反
8.Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型限制酶的特点:
他们三个是否需要ATP,是否对DNA进行甲基化修饰、是否识别特异序列,可以这样记忆:
Ⅱ型是常用的:
不需ATP、不甲基化修饰、识别特异序列,Ⅰ、Ⅱ完全相反,Ⅲ都是“是”。
6.三链DNA是两条嘧啶链夹一条嘌呤链,而不是两条嘌呤链夹一条嘧啶链,可以记忆为:
两个单环的夹一个双环的,“环的数目平衡了”,呵呵,类似的也可以记住组氨酸的结构:
“键的数目平衡了”
9.蛇毒磷酸二酯酶切割3'
-OH末端,产生5'
单核苷酸;
脾磷酸二酯酶切割5'
-OH末端,产生3'
单核苷酸。
蛇35,脾53,脾53是分子警察p53~也就不易混淆了。
10.Lk=Tw+Wr究竟是Lk不变还是Tw不变,容易混。
可以记忆为“两个不变”,这是分情况的,环形DNA不剪链则Lk不变;
剪链后,使其接近每螺旋10.5bp的B型DNA结构,也就是紧张度不变,则Tw不变。
这就是“两个不变”。
16.光合单位PSⅠ和PSⅡ的存在部位。
PSⅠ存在于非堆叠区;
PSⅡ存在于堆叠区。
可以简化为Ⅱ叠----二爹!
呵呵。
19.鞘氨醇的结构,可以这样大略记忆,按照谐音,鞘氨醇可以理解为羟、氨、醇,所以鞘氨醇的1、2、3号碳原子分别连接羟基、氨基、羟基。
20.胆固醇各个碳原子的来源:
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