原核诱导表达Word下载.docx
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买来的粉末状的IPTG一般全部配成1MIPTG。
1、无菌操作台紫外线照射,后通风。
2、用少量去离子水将IPTG溶解完全,并定容。
3、在无菌操作台中,用2µ
m的滤器将配好的IPTG滤入灭菌后的离心管中,过滤除菌,-20℃保存。
考前须知:
在用滤器将IPTG滤入离心管时,先用针头吸IPTG,然后将枪头拔掉,排出气体,滤头参加IPTG液,在使针管与滤器相连,保证整个装置无气体进入。
滤的过程中,手不能碰滤头。
〔四〕3×
SDS-PAGEloadingbuffer的配制:
3×
SDS-PAGEloadingbuffer
10ml
1MTris-Hcl(PH6.8)
SDS
BPB(溴酚蓝)
30mg
甘油〔丙三醇〕
3ml
去离子水
1.将除BPB以外的药品完全溶解。
SDS常温下很难溶解,可以在37℃水浴溶解。
完全溶解后,再参加BPB,进展溶解。
2.把溶好的buffer分装到的离心管中,1ml/管,常温放置。
3.使用前,每管参加30µ
L巯基乙醇。
巯基乙醇为危险品,参加的过程在通风橱中完成,并且带好手套。
〔五〕10×
PBS的配制:
PBS〔10×
PBS〕
1L
NaH2PO4.2H2O
Nacl
85g
Na2HPO4.12H2O
用去离子水将以上药品进展溶解。
〔溶解的非常慢,可能需要过夜〕
调PH值到,用的滤膜过滤。
常温保存。
工作时用的是1×
PBS。
〔六〕Tris-Hcl(PH8.8)的配制:
Tris-Hcl
250ml
Tris
g
1.用200ml去离子水将Tris溶解。
2.用浓盐酸调PH值到。
3.调好PH的Tris-Hcl定容到250ml。
4.的滤膜过滤,常温保存。
Tris的缓冲能力很强,调PH值时,费些时间,但不要调过。
〔七〕1MTris-Hcl(PH6.8)的配制:
1MTris-Hcl
2.用浓盐酸调PH值到
〔八〕30%丙烯酰胺的配制:
30%丙烯酰胺
丙烯酰胺
72.5ml
BIS甲叉丙烯酰胺
2.5ml
1.把药品用去离子水溶解后定容到250ml。
2.用滤纸过滤,放在棕色瓶子中,4℃保存。
两种药品有毒性,配制过程要带手套和口罩。
〔九〕10%SDS的配制:
1.1gSDS参加10ml去离子水进展溶解。
2.分装到离心管中,-20℃保存。
〔十〕10%过硫酸铵的配制:
1.1g过硫酸铵参加10ml去离子水进展溶解。
〔十一〕5×
SDS-PAGE电泳缓冲液的配制:
5×
SDS-PAGE电泳缓冲液
Glycine〔甘氨酸〕
94g
5g
将以上药品用去离子水溶解后定容到1L,常温保存。
SDS-PAGE电泳缓冲液。
〔十二〕考马斯亮蓝R-250染色液的配制:
考马斯亮蓝R-250染色液1L
1.往1g考马斯亮蓝R-250中参加250ml异丙醇,在磁力搅拌器上搅拌六小时以上。
2.参加650ml去离子水,磁力搅拌器搅拌过夜。
3.再参加100ml冰醋酸进展溶解,磁力搅拌器搅拌。
4.在通风橱内用滤纸进展过滤。
染色液只能反复用两次。
在磁力搅拌器上搅拌时,要把容器封口。
〔十三〕脱色液的配制:
脱色液
醋酸〔冰乙酸〕
100ml
乙醇〔无水乙醇〕
50ml
850ml
四.实验步骤:
〔一〕:
质粒的转化
1.使用无菌操作台之前先用75%的酒精擦拭,然后将灭菌的培养基以及所有要用到的器具放到超净台上,在开紫外照射30min左右。
操作之前,关掉紫外,翻开通风橱,将手用酒精擦拭后开场操作。
2.从-80℃的冰箱中取出表达菌〔BL21〕的感受态细胞〔每管100µ
L〕,在-80℃冰水中融化。
3.载体〔PET32a等〕与基因片段的连接后质粒1µ
L,缓慢的参加到100µ
LBL21感受态中,冰置15min。
〔无菌操作〕
3.42℃下热激90s,随后在冰水中冰置5min。
4.涂板:
先将涂布棒用酒精棉球擦,然后用酒精灯火焰烧,放置等它凉却。
把处理后的感受态点在含有抗性的固体培养基〔氨苄或卡那等〕上。
用冷却的涂布棒进展涂布,左手把该盖拿起,小指轻轻转动培养基,右手来涂,涂到培养基外表快干。
5.放在37℃培养箱中,倒置培养过夜。
1.质粒的转化时,质粒是冻在-20℃的冰箱中,等它完全化了在进展吸取,往感受态中参加质粒时,一定要缓慢,因为感受态非常脆弱,防止感受态受伤。
2.质粒的转化时,热激的时间90s,一定要控制好时间。
3.质粒的转化时,涂布棒在涂布前,一定要晾凉涂布棒。
防止感受态被烫死,或固体培养基的损坏。
〔二〕:
挑菌与接菌:
1.无菌操作台紫外线照射,后通风。
将转化后的平板取出。
2.在无菌操作台中,把消毒后的螺口管〔一般一个基因取四个螺口管,进展平行实验〕取出,在酒精灯的外焰上灼烧螺口管管口。
3.灭菌后的LB培养基从冰箱中取出,在酒精灯的外焰上烧一下培养基瓶口。
吸取LB培养基〔一般mL〕参加螺口管中,后参加抗性〔氨苄霉素、卡那等〕。
氨苄霉素〔卡那〕:
LB培养基=1:
1000〔µ
L〕,抗性由载体决定。
4.镊子用酒精棉球擦拭,并在酒精灯的外焰上灼烧,将镊子晾凉。
用晾凉的镊子,夹取20µ
L小枪头,在转化后的平板上挑取单菌落,扔到培养基中。
5.接好菌的螺口管,进展摇菌。
37℃,180rpm。
摇到菌的对数期〔OD600值〕,时间大概2-3h。
可以模糊看到手即可。
〔注意不要摇过〕
6.用完的平板用封口膜封住,倒置放于4℃保存。
7.假设直接用菌液进展接菌,接菌比例为,菌液:
LB培养基=1:
100。
1.接菌吸培养基时,把放置培养基的三角瓶倾斜才吸取培养基,移液枪尽量不要插进三角瓶中。
2.接菌时一定要参加抗性,挑菌落时,要挑单个的菌落,且不要把培养基也扣起来。
3.摇菌不要过了它的对数期,2小时后随时注意其生长状态。
〔三〕小量保菌:
2.将摇到标准OD值的菌液进展小量保菌,先在酒精灯的外焰上灼烧螺口管管口。
3.保菌:
从灭菌的饭盒中取出4个的灭菌的离心管,参加50µ
L的灭菌后的80%的甘油,并分别参加相应的350µ
L菌液。
一个基因的四个平行实验菌都要进展保菌。
〔假设不保菌,实验不能进展重复,只能从头做〕
4.标清保菌的类别,名称,时间,如“BL21PET32aVAV1号2021.”,其中的1号是平行对照中它排几号。
5.混匀,-20℃保存。
1.在小量保菌中,一个基因的四个平行对照都要保菌,否那么得重新摸条件。
2.在小量保菌中,菌液与甘油一定要混匀在保存,否那么菌会被冻死。
〔四〕蛋白诱导表达条件摸索
2.小量保菌后的四个平行实验组,分别参加不同终浓度的IPTG,在不同的温度条件下进展诱导〔如下列图〕:
对照编号
IPTG终浓度
诱导温度
1号
1mmol/L
3h
37℃
2号
mmol/L
3号
30℃
4号
〔五〕小量收菌
1.将诱导完成的四个平行实验组菌液,分别取出1mL,对应装于4个不同的离心管中并做好标记。
剩余的平行实验组菌液放入4℃保存。
2.离心7000rpm,2min,使菌沉淀。
3.把上层培养基倒掉,用1ml1×
PBS把表达菌重悬,再次离心7000rpm,2min,使菌沉淀。
4.把上层1×
PBS倒掉,再次离心同步骤3。
5.用80µ
L1×
PBS把表达菌体重悬。
6.在四个平行的重悬液中,分别参加80µ
L3×
SDS-PAGEloadingbuffer。
〔把3×
SDS-PAGEloadingbuffer当成2×
SDS-PAGEloadingbuffer用〕
7.煮样8min。
〔翻开锅盖煮〕
8.离心13000rpm,10min。
吸上清。
9.进展SDS-PAGE电泳。
在煮样时要翻开锅盖煮,防止小样进水,假设样进水,那么不能再用。
〔六〕SDS-PAGE胶的配制
1.别离胶的配制
〔1〕找出配套的胶板,用擦镜纸擦干净,并固定在配胶器上。
随后用去离子水试漏。
〔2〕假设胶板不漏水,就进展别离胶的配制。
依次将水、30%丙烯酰胺、Tris-Hcl〔〕、10%SDS、10%过硫酸铵加到干净的小烧杯中〔如下列图〕,混匀。
〔1mm的胶板,一般配一块胶用5ml。
所配的胶浓度一般为12%,但浓度也要视情况而定。
蛋白越小,胶的浓度越大。
〕
〔3〕将胶板中的水倒掉,并用滤纸吸干水分〔不要将滤纸塞到胶板底部〕。
〔4〕小烧杯中再参加TEMED,混匀。
〔TEMED可使胶凝固,所以最后加〕
〔5〕灌胶:
混匀的别离胶沿着胶板边缘轻轻灌下,防止产生气泡。
〔6〕用水将别离胶压平。
〔用水灌满,同时加水时要缓慢参加,防止把胶吹起〕
2.浓缩胶的配制
〔1〕待别离胶与水中间形成明显的横线,即别离胶凝固。
随后进展浓缩胶的配制,依次将水、30%丙烯酰胺、Tris-Hcl〔〕、10%SDS、10%过硫酸铵加到干净的小烧杯中〔如下列图〕
(2)将别离胶上层的水倒掉,并用滤纸吸干水分。
〔尽量不要把滤纸插入〕
〔3〕小烧杯中再参加TEMED,混匀。
〔4〕灌胶。
然后插入梳子。
〔5〕把制胶器倒过来,胶仍然不会往外流,或可以明显看出梳子中两个齿之间的胶面明显凹下去,说明浓缩胶凝固。
将凝固的胶板装入电泳槽内,并在电泳槽内参加SDS-PAGE电泳缓冲液,把胶浸泡一段时间,时间越长越好。
〔防止梳子与胶相连,或胶因湿度不够而萎缩〕
〔6〕点样时,再把梳子拔出来,拔时动作要轻,防止胶齿被拔断。
〔七〕未诱导和空载的制备
在诱导表达中,有两个重要的对照组,即空载诱导和未诱导。
1.未诱导的制备
〔1〕未诱导是我们所做一个基因除了四个平行实验外,再做的一个对照组菌,唯一不同的是它不进展诱导〔接菌步骤如上〕,在37℃下,进展摇菌,不加IPTG,摇起来即可。
〔和表达完的菌浓度差不多即可〕
〔2〕未诱导的菌进展小量处理,见上面的小量收菌。
2.空载诱导的制备
〔1〕空载的转化:
将不连基因片段的空载体质粒,转入表达菌〔和前面的试验用一个表达菌〕,如“BL21-PET32a-VAV质粒〞转入“BL21表达菌〞,其空载应当是“BL21-PET32a〞转入“BL21表达菌〞。
转化步骤同上。
〔2〕空载接一个菌〔实验组〕,并摇菌摇到对数期〔步骤同上〕。
〔3〕空载的诱导:
空载的诱导条件固定为温度37℃,时间3h.,IPTG终浓度为1mmol/L。
〔诱导步骤如上〕。
〔4〕空载的菌进展小量处理,见上面的小量收菌。
〔八〕蛋白诱导表达条件摸索的SDS-PAGE电泳
1.拔掉SDS胶上的梳子,并用小针调整齿的位置〔使它们都平行〕。
2.点样。
用20µ
L的小枪头,吸煮过的样品10µ
L,对准胶孔点样,注意不要把样品点在外面。
我们用的marker是低分子量蛋白marker。
一般的点样顺序是:
1
2
3
4
5
6
7
空载
未诱导
样品1号
样品2号
样品3号
样品4号
marker
3.开场电泳,电泳仪正负极接好,翻开电源。
浓缩胶:
电压low100V
别离胶:
电压high150V。
4.卸胶染色。
等胶内的所有的蓝色都跑出去,电泳停顿,一般时间为1小时45分。
把胶板从电泳仪上卸下,用刀片把胶板撬开,胶的浓缩胶局部割除,放入考马斯亮蓝R-250染色液中进展常温过夜染色。
5.脱色。
将过夜染色的SDS-PAGE胶放入脱色液中进展脱色,直到背景发白。
〔九〕四个平行实验组菌液的选择
1.将脱好的胶拿出进展观察,看四个平行实验组菌液是否进展了蛋白表达。
一般来说,未诱导没有过量的蛋白表达,而空载有一处蛋白的过量表达〔大小由表达载体决定〕,四个平行实验组也有一处蛋白的过量表达,它比空载表达的蛋白要大,大出的那一局部即我们的目的蛋白。
2.假设平行实验组中无过量蛋白表达,尤其是37℃,1mmol/L,3h无过量蛋白表达,那么说明蛋白无表达。
3.假设平行实验组中有过量蛋白表达,但它的大小与空载的大小一样。
这说明蛋白进展了漏表达。
4.假设蛋白表达正常,那么选择诱导温度最低,IPTG浓度最低的实验组〔30℃,0.1mmol/L,3h〕,进展下面的小量超声实验。
〔十〕表达菌的小量超声实验
1.把以上做的四个平行实验组菌液从4℃中拿出。
2.将最有条件的实验菌全部收集在的小离心管中。
〔其他平行实验组的菌进展灭菌〕
3.离心7000rpm,2min,使菌沉淀。
4.把上层培养基倒掉,用1ml1×
5.把上层1×
6.用500µ
PBS把表达菌重悬。
7.将菌液放入小玻璃管中,准备进展超声。
8.将超声仪翻开预热20min,并准备冰盒。
9.将呈菌液的小玻璃管放入冰盒进展超声,超声效率为30—50HZ,超声3s,停5s。
直到菌液超澄清〔透明呈现鸡蛋清色〕。
10.将超开的菌液进展离心,13000rpm,10min。
11.离心产物上清取出100µ
L,参加100µ
L3×
12.上清倒掉,沉淀用1ml1×
PBS把表达菌重悬,再次离心13000rpm,10min。
13.重复11步。
14.上清倒掉,用100µ
L将沉淀悬起,参加100µ
15.上清和沉淀都进展煮样,开锅盖,8min。
16.离心13000rpm,10min。
17.进展SDS电泳。
1.小样超声时,要超彻底,一般超4—5分钟即澄清。
假设仍然不澄清,那么可能是包涵体。
超的过程中不要超糊。
2.在洗超声离心物的沉淀时,要洗干净。
〔十一〕破菌超声的SDS-PAGE电泳
1.配胶、点样、电泳的步骤如上。
破菌超声的点样顺序一般为:
全菌
破菌上清
破菌沉淀
未诱导,空载,全菌为摸索表达条件时所用的样品。
注:
我们破的几号菌,就上几号的全菌样。
2.假设破菌上清表达的蛋白与全菌的蛋白分子量一致〔目的蛋白〕,且破菌沉淀中没有,这说明蛋白可溶;
假设破菌沉淀中有目的蛋白,而破菌上清中没有,说明蛋白为包涵体。
〔十二〕目的蛋白的大量表达〔1L〕
1.配制培养基1L,每大瓶500ml,高压灭菌4℃保存。
2.一级接菌:
摸索完条件的表达菌进展接菌3管,每管5ml。
抗性:
培养基=1:
1000,菌液:
〔菌液为针对可溶条件的小量保菌液〕步骤如上。
37℃,120rpm,过夜摇菌。
3.标准保菌:
100µ
L灭菌甘油参加700µ
L过夜菌。
混匀,-20℃保存。
〔写好名称日期,如上,放入表达菌的库中〕
3.二级接菌:
对大瓶进展接菌,抗性:
1000,菌液:
即每瓶5ml。
4.摇菌:
37℃,180rpm,摇到对数期,摇到菌的对数期〔OD600值〕,时间大概2-3h。
可以模糊的看到手即可。
〔注意在摇过程中随时观察状态,不要摇过〕
5.诱导:
依据摸索好的条件进展诱导。
〔十三〕大量诱导的收菌:
1.50ml离心管灭菌烘干,待用。
2.找出两个50ml离心管,管盖和管壁上做标记,并称重。
3.6个50ml离心管〔包括称重的两个〕,倒入菌液〔40—45ml〕。
配平,离心7000rpm,10min。
4.倒掉上清,用1×
PBS把菌重悬,离心7000rpm,10min。
5.重复4。
6.倒掉上清,称菌体的重量。
7.悬菌。
1g菌体参加35ml的纯化时用的上样缓冲液悬起。
-20℃保存。
〔十四〕大量表达菌的超声
1.把表达菌从-20℃拿出,在流水中融化。
2.把完全融化的表达菌,放入小烧杯中准备超声。
3.将超声仪翻开预热20min,并准备冰盒。
4.将呈菌液的小烧杯放入冰盒进展超声,超声效率为30—50HZ,超声3s,停5s。
直到菌液超澄清,呈现鸡蛋清色。
〔一般超20-30min,注意不要吵时间太长,使菌超糊〕
5.将超开的菌液进展离心,13000rpm,10min。
6.将上清收集在灭菌的50ml离心管中,进展纯化。
五.促进原核表达的蛋白可溶的方法:
一般来说,人们认为包涵体的形成是因为新生多肽链不能在正确位置形成二硫键,二硫键错配,进而错误折叠的结果。
而IPTG浓度越低,温度越低,一般蛋白的可溶性越大,因为这样的条件下,可以减慢蛋白的形成,减少蛋白的二硫键错配,从而促进蛋白的可溶。
1.使蛋白可溶的条件并不是固定的,一般来说,以上条件就可是蛋白可溶〔有时2/4条件可以把IPTG浓度提的高一点〕。
但如果仍不可溶的话,可以试一下,常温,过夜诱导。
这种条件是IPTG使用量的最小浓度,可以使包涵体局部可溶。
2.180rpm摇菌摇对数时,不要摇过。
对数期时,是表达菌产蛋白的最正确时期。
表达菌浓度太大,对菌中蛋白的可溶性影响会很大。
所以在摇菌到2h后,一定密切关注菌的浓度,随时用分光光度计测OD600值。
这就意味着在接菌时,多接一些菌〔由实际情况而定〕。
3.蛋白的可溶与表达菌也有关系。
菌株内源的蛋白酶过多,可能会造成外源表达产物的不稳定,所以一些蛋白酶缺陷型菌株往往成为理想的起始表达菌株。
堪称经典的BL21系列就是lon和ompT蛋白酶缺陷型,也是我们非常熟悉的表达菌株。
大名鼎鼎的BL21(DE3)融源菌那么是添加T7聚合酶基因,为T7表达系统而设计。
BL21(DE3)即我们做表达是常用的表达菌。
真核细胞偏爱的密码子和原核系统有不同,因此,在用原核系统表达真核基因的时候,真核基因中的一些密码子对于原核细胞来说可能是稀有密码子,从而导致表达效率和表达水平很低。
改造基因是比拟麻烦的做法,Rosetta2系列就是更好的选择――这种携带pRARE2质粒的BL21衍生菌,补充大肠杆菌缺乏的七种〔AUA,AGG,AGA,CUA,CCC,GGA及CGG〕稀有密码子对应的tRNA,提高外源基因、尤其是真核基因在原核系统中的表达水平。
〔已经携带有氯霉素抗性质粒〕
当要表达的蛋白质需要形成二硫键以形成正确的折叠时,可以选择K-12衍生菌Origami2系列,thioredoxinreductase(trxB)和glutathionereductase(gor)两条主要复原途径双突变菌株,显著提高细胞质中二硫键形成几率,促进蛋白可溶性及活性表达。
〔卡那霉素敏感〕
Rosetta-gami™2那么是综合上述两类菌株的优点,既补充7种稀有密码子,又能够促进二硫键的形成,帮助表达需要借助二硫键形成正确折叠构象的真核蛋白。
OrigamiB是衍生自lacZY突变的BL21菌株,这个突变能根据IPTG的浓度准确调节表达产物,使得表达产物量呈现IPTG浓度依赖性。
〔四环素敏感〕
在决定试用这些名字乖僻的菌株时,有几个小Tips是要注意的,一个是不同菌株有时已经携带某个质粒或者已经具有某种抗生素抗性,要注意自己的表达质粒是否能与之兼容。
比方Rosetta2已经携带有氯霉素抗性质粒,不能再用氯霉素筛选等等。
现象
可能原因
改良方案
建议菌株
无蛋白表达
E.coli的密码子偏移性
补充稀有密码子的tRNA;
将稀有密码子突变为普通大肠杆菌密码子
Rosetta2
Rosetta-gami2
Rosetta-gamiB
RosettaBlue
出现截短蛋白
包涵体
二硫键形成困难
降低宿主胞质的复原性;
利用促进二硫键形成的各种载体标签
Origami2
表达过快,表达量过高
控制优化表达水平:
降温,IPTG浓度优化
Tuner
蛋白无活性
蛋白错误折叠
细胞死亡,生长极困难
毒性蛋白
更严格的本底表达控制
pLysS菌株
无克隆生长
过高本底表达
更严格的
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