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胞吐(作用)(exocytosis):
确定要分泌的物质被包裹在脂囊泡内,该囊泡与质膜融合,然后将物质释放到细胞外空间的过程。
胞吞(作用)(endocytosis):
物质被质膜吞入并以膜衍生出的脂囊泡形式(物质在囊泡内)并被带入到细胞内的过程。
饱和脂肪酸(saturatedfattyacid):
不含有-C=C-双键的脂肪酸。
被动转运(passivetransport):
也称之易化扩散(facilitateddiffusion)。
是一种转运方式,通过该方式溶质特异结合于一个转运蛋白,然后被转运过膜,但转运是沿着浓度梯度下降方向进行,所以被动转运不需要能量支持。
苯酮尿症(phenylketonuria):
是由于苯丙氨酸羟化酶缺乏引起苯丙酮酸堆积的代谢遗传病。
缺乏苯丙氨酸羟化酶,苯丙氨酸只能靠转氨生成苯丙酮酸,病人尿中排出大量苯丙酮酸。
苯丙酮酸堆积对神经有毒害,智力发育出现障碍。
比活(specificactivity):
每分钟每毫克酶蛋白在25℃下转化的底物的微摩尔数(μm)。
比活是酶纯度的测量。
必需氨基酸(essentialaminoacids):
指人(或其它脊椎动物)自己不能合成,需要从饮食中获得的氨基酸,例如赖氨酸、苏氨酸等氨基酸。
必需脂肪酸(ossentialfattyacids):
维持哺乳动物正常生长所需的,而动物又不能合成的脂肪酸,例如亚油酸和亚麻酸。
编码链(codingstrand):
双链DNA中,不能进行转录的那条DNA链,该链的核苷酸序列与转录生成的RNA的序列一致(在RNA中是以U取代了DNA中的T)。
变旋(mutarotation):
一个吡喃糖、呋喃糖或糖苷伴随着它们的α-和β-异构形式的平衡而发生的比旋度变化。
标准还原电位(E°
ˊ)(standardreductionpotential):
25℃和pH7.0条件下一个还原剂和它的氧化形式在1M浓度下表现出的电动势。
标准自由能变化(ΔG°
)(standardfree-energychange):
在一系列标准条件(温度:
298K;
压力:
1个大气压;
所有溶质的浓度都是1M)下发生的反应的自由能变化。
ΔG°
ˊ表示pH7.0条件下的标准自由能变化。
别构酶(allostericenzyme):
一种其活性受到结合在活性部位以外部位的其它分子调节的酶。
别构调节剂(allostericmodulator):
也称之别构效应物(allostericeffector)。
结合在别构酶的调节部位,调节该酶催化活性的生物分子,别构调节剂可以是激活剂,也可以是抑制剂。
别构效应(allostericeffect):
又称之变构效应。
是寡聚蛋白与配基结合改变蛋白质的构象,导致蛋白质生物活性改变的现象。
别嘌呤醇(allopurinol):
是结构上(嘌呤环上第7位是C,第8位是N)类似于次黄嘌呤的化合物,对黄嘌呤氧化酶有很强抑制作用,常用来治疗痛风。
波尔效应(Bohreffect):
CO2浓度的增加降低细胞内的pH,引起红细胞内血红蛋白的氧亲和力下降的现象。
补救途径(salvagepathway):
与从头合成途径不同,生物分子的合成,例如核苷酸可以由该类分子降解形成的中间代谢物,如碱基等来合成,该途径是一个再循环途径。
不饱和脂肪酸(unsaturatedfattyacid):
至少含有一个-C=C-双键的脂肪酸。
C
cAMP(cyclicAMP):
3ˊ,5ˊ-环腺苷酸,细胞内的第二信使,由于某些激素或其它分子信号刺激激活腺苷酸环化酶催化ATP环化形成的。
C4途径(C4pathway):
一些植物中固定碳的途径,其特点是通过使CO2浓缩减少光呼吸。
在该途径中,在叶肉细胞CO2被整合到C4酸中,然后C4酸在维管束鞘细胞被脱羧,释放出的CO2被Calvin循环利用。
操纵基因(operator):
与特定阻遏蛋白相互作用调控一个基因或一组基因表达的DNA区。
操纵子(operons):
是由一个或多个相关基因以及调控它们转录的操纵基因和启动子序列组成的基因表达单位。
层析(chromatography):
按照在移动相(可以是气体或液体)和固定相(可以是液体或固体)之间的分配比例将混合成分分开的技术。
查格夫法则(Chargaff'
srules):
所有DNA中腺嘌呤与胸腺嘧啶的摩尔含量相等,(A=T),鸟嘌呤和胞嘧啶的摩尔含量相等(G=C),即嘌呤的总含量与嘧啶的总含量相等(A+G=T+C)。
DNA的碱基组成具有种的特异性,但没有组织和器官的特异性。
另外生长发育阶段、营养状态和环境的改变都不影响DNA的碱基组成。
超二级结构(super-secondarystructure):
也称之基元(motif)。
在蛋白质中,特别是球蛋白中,经常可以看到由若干相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,形成的有规则、在空间上能辨认的二级结构组合体。
重组DNA技术(recombinationDNAtechnology):
也称之基因工程(genomicengineering)。
利用限制性内切酶和载体,按照预先设计的要求,将一种生物的某种目的基因和载体DNA重组后转人另一生物细胞中进行复制、转录和表达的技术。
初速度(initialvelocity):
酶促反应最初阶段底物转化为产物的速度,这一阶段产物的浓度非常低,其逆反应可以忽略不计。
从头合成(denovosynthesis):
生物体内用简单的前体物质合成生物分子的途径,例如核苷酸的从头合成。
催化常数(catalyticnumber)(Kcat):
也称之转换数(turnovernumber)。
一个动力学常数,是在底物浓度处于饱和状态下,一个酶(或一个酶活性部位)催化一个反应有多快的测量。
催化常数等于最大反应速度除以总的酶浓度(Vmax/[E]total),或者是每摩尔酶活性部位每秒钟转化为产物的底物的摩尔数。
错配修复(mismatchrepair):
在含有错配碱基的DNA分子中使正常核苷酸序列恢复的修复方式。
这种修复方式的特点是:
识别出正确的链,切除掉不正确链的部分,然后通过DNA聚合酶和DNA连接酶的作用合成正确配对的双链DNA。
D
大沟(majorgroove)和小沟(minorgroove):
绕B-DNA双螺旋表面上出现的螺旋槽(沟),宽的沟称之大沟,窄沟称之小沟。
大沟、小沟都是由于碱基对堆积和糖-磷酸骨架扭转造成的。
单链结合蛋白(SSB,single-strandbindingprotein):
一种与单链DNA结合紧密的蛋白质,它的结合可以防止复制叉处的单链DNA本身重新折叠回双链区。
单糖(monosaccharide):
由三个或更多碳原子组成的具有经验公式(CH2O)n的简单糖。
蛋白聚糖(proteoglycans):
由杂多糖与一个多肽链组成的杂化的大分子,多糖是分子的主要成分。
蛋白质变性(denaturation):
生物大分子的天然构象遭到破坏导致其生物活性丧失的现象。
蛋白质在受到光照、热、有机溶剂以及一些变性剂的作用时,次级键受到破坏,导致天然构象的破坏,使蛋白质的生物活性丧失。
蛋白质二级结构(proteinsecondarystructure):
在蛋白质分子中的局部区域内氨基酸残基的有规则的排列,常见的二级结构有α-螺旋和β-折叠。
二级结构是通过骨架上的羰基和酰胺基团之间形成的氢键维持的。
蛋白质三级结构(proteintertiarystructure):
蛋白质分子处于它的天然折叠状态的三维构象。
三级结构是在二级结构的基础上进一步盘绕、折叠形成的。
三级结构主要是靠氨基酸侧链之间的疏水相互作用、氢键范德华力和盐键(静电作用力)维持的。
蛋白质四级结构(quaternarystructure):
多亚基蛋白质的三维结构。
实际上是具有三级结构的多肽链(亚基)以适当方式聚合所呈现出的三维结构。
蛋白质一级结构(primarystructure):
指蛋白质中共价连接的氨基酸残基的排列顺序。
等电点(pI,isoelectricpoint):
使分子处于兼性分子状态,在电场中不迁移(分子的净电荷为零)的pH值。
等电聚焦电泳(IFE,isoelectricfocusingelectrophoresis):
利用特殊的一种缓冲液(两性电解质)在聚丙烯酰胺凝胶内制造一个pH梯度,电泳时每种蛋白质就将迁移到它的等电点(pI)处,即梯度中的某一pH时,就不再带有净的正或负电荷了。
底物水平磷酸化(substratephosphorylation):
ADP或某些其它的核苷-5ˊ-二磷酸的磷酸化是通过来自一个非核苷酸底物的磷酰基的转移实现的。
这种磷酸化与电子传递链无关。
第二信使(secondmessenger):
响应外部信号(第一信使),例如激素而在细胞内合成的效应分子,例如cAMP、肌醇三磷酸或二酰基甘油等。
第二信使再去调节靶酶,引起细胞内各种效应。
淀粉(starch):
一类可作为植物中贮存多糖的葡萄糖残基的同聚物。
由两种形式的淀粉:
一种是直链淀粉,是没有分支的只是通过α-(1→4)糖苷键连接的葡萄糖残基聚合物。
另一种是支链淀粉,是含有分支的α-(1→4)糖苷键连接的葡萄糖残基聚合物,支链在分支点处通过α-(1→6)糖苷键与主链相连。
DNA变性(DNAdenaturation):
DNA双链解链分离成两条单链的现象。
DNA超螺旋(DNAsupercoiling):
DNA本身的卷曲,一般是DNA双螺旋的弯曲、欠旋(负超螺旋)或过旋(正超螺旋)的结果。
DNA聚合酶(DNApolymerase):
以DNA为模板催化核苷酸残基加到已存在的聚核苷酸的3ˊ末端反应的酶。
某些DNA聚合酶具有外切核酸酶的活性,可用来校正新合成的核苷酸序列。
DNA双螺旋(DNAdoublehelix):
一种核酸的构象,在该构象中,两条反向平行的多核苷酸链围绕彼此缠绕形成一个右手的双螺旋结构。
碱基位于双螺旋内侧,磷酸与糖基在外侧,通过磷酸二酯键相连,形成核酸的骨架。
碱基平面与假想的中心轴垂直,糖环平面则与轴平行。
两条链皆为右手螺旋。
双螺旋的直径为2nm,碱基堆积距离为0.34nm,两核苷酸之间的夹角是36°
,每对螺旋由10对碱基组成,碱基按A-T,G-C配对互补,彼此以氢键相连系。
维持DNA双螺旋结构稳定的力主要是碱基堆积力。
双螺旋表面有两条宽窄、深浅不一的一个大沟和一个小沟。
读码框(readingframe):
代表一个氨基酸序列的mRNA分子的非重叠密码序列。
一个mRNA的读码框是由转录起始位置(通常是AUG密码)确定的。
多糖(polysaccharide):
20个以上的单糖通过糖苷键连接形成的聚合物。
多糖链可以是线性的或带有分支的。
E
Edman降解(Edmandegradation):
从多肽链游离的N末端测定氨基酸残基的序列的过程。
N末端氨基酸残基被苯异硫氰酸酯修饰,然后从多肽链上切下修饰的残基,再经层析鉴定,余下的多肽链(少了一个残基)被回收再进行下一轮降解循环。
二硫键(disulfidebond):
通过两个(半胱氨酸)巯基的氧化形成的共价键。
二硫键在稳定某些蛋白的三维结构上起着重要的作用。
F
发酵(fermentation):
营养分子(例如葡萄糖)产能的厌氧降解,在乙醇发酵中,丙酮酸转化为乙醇和CO2。
翻译(translation):
在蛋白质合成期间将存在于mRNA上代表一个多肽链的核苷酸残基序列转换为多肽链氨基酸残基序列的过程。
翻译起始复合体(translationinitiationcomplex):
由核糖体亚基、一个mRNA模板、一个起始的tRNA分子和起始因子组成并组装在蛋白质合成起始点的复合体。
反竞争性抑制作用(uncompetitiveinhibition):
抑制剂只与酶-底物复合物结合,而不与游离酶结合的一种酶促反应抑制作用。
这种抑制作用使得Vmax,Km都变小,但Vmax/Km比值不变。
反馈抑制(feedbackinhibition):
催化一个代谢途径中前面反应的酶受到同一途径的终产物抑制的现象。
反密码子(anticodon):
tRNA分子的反密码环上的三联体核苷酸残基序列。
在翻译期间,反密码与mRNA中的互补密码结合。
反向重复序列(invertedrepeatsequence):
在同一多核苷酸链内的相反方向上存在的重复的核苷酸序列。
在双链DNA中反向重复可能引起十字形结构的形成。
范德华力(vanderWaalsforce):
中性原子之间通过瞬间静电相互作用产生的一种弱的分子之间的力。
当两个原子之间的距离为它们的范德华半径之和时,范德华引力最强。
强的范德华排斥作用可以防止原子相互靠近。
非必需氨基酸(nonessentialaminoacids):
指人(或其它脊椎动物)自己能由简单的前体合成的,不需要由饮食供给的氨基酸,例如甘氨酸、丙氨酸等氨基酸。
非竞争性抑制作用(noncompetitiveinhibition):
抑制剂不仅与游离酶结合,也可以与酶-底物复合物结合的一种酶促反应抑制作用。
这种抑制使得Vmax变小,但Km不变。
分解代谢反应(catabolicreaction):
降解复杂分子为生物体提供小的构件分子和能量的代谢反应。
辅基(prostheticgroup):
是与酶蛋白共价结合的金属离子或一类有机化合物,用透析法不能除去。
辅基在整个酶促反应过程中始终与酶的特定部位结合。
辅酶(coenzyme):
某些酶在发挥催化作用时所需要的一类辅助因子,其成分中往往含有维生素。
辅酶A(coenzymeA):
一种含有泛酸的辅酶,在某些酶促反应中作为酰基的载体。
辅助色素(accessorypigments):
在植物和光合细菌中象类胡萝卜素、叶黄素和藻胆(色)素那样吸收可见光的色素,这类色素是对叶绿素捕获光能的补充。
复性(renaturation):
在一定的条件下,变性的生物大分子恢复成具有生物活性的天然构象的现象。
复制叉(replicationforks):
Y字型结构,在复制叉处作为模板的双链DNA解旋,同时合成新的DNA链。
复制体(replisome):
种多蛋白复合体,包含DNA聚合酶、引发酶、解旋酶、单链结合蛋白和其它辅助因子。
复制体位于每个复制叉处执行着细菌染色体DNA复制的聚合反应。
G
冈崎片段(Okazakifragments):
相对比较短的DNA链(大约1000核苷酸残基),是在DNA的滞后链的不连续合成期间生成的片段,这是ReijiOkazaki在DNA合成实验中添加放射性的脱氧核苷酸前体观察到的。
高能化合物(highenergycompound):
在标准条件下水解时自由能大幅度减少的化合物。
一般是指水解释放的能量能驱动ADP磷酸化合成ATP的化合物。
高压液相层析(HPLC,high-pressureliquidchromatography):
使用颗粒极细的介质,在高压下分离蛋白质或其它分子混合物的层析技术。
G蛋白(Gproteins):
在细胞内信号传导途径中起着重要作用的GTP结合蛋白质,由α、β、γ三个不同亚基组成。
与激素受体结合的配体诱导GTP与G蛋白结合的GDP进行交换,结果激活位于信号传导途径中下游的腺苷酸环化酶。
G蛋白将胞外的第一信使肾上腺素等激素和胞内的腺苷酸环化酶催化的腺苷酸环化生成的第二信使cAMP联系起来。
G蛋白具有内源GTP酶活性。
共价催化(covalentcatalysis):
一个底物或底物的一部分与催化剂形成共价键,然后被转移给第二个底物。
许多酶催化的基团转移反应都是通过共价催化方式进行的。
构象(conformation):
指一个分子中,不改变共价键结构,仅单键周围的原子旋转所产生的原子的空间排布。
一种构象改变为另一种构象时,不要求共价键的断裂和重新形成。
构象改变不会改变分子的光学活性。
构型(configuration):
一个有机分子中各个原子特有的固定的空间排列。
这种排列不经过共价键的断裂和重新形成是不会改变的。
构型的改变往往使分子的光学活性发生变化。
寡糖(oligoccharide):
由2个~20个单糖残基通过糖苷键连接形成的聚合物。
光反应(lightreactions):
合色素将光能转变成化学能并形成ATP和NADPH的过程。
光合磷酸化(photophosphorylation):
在叶绿体ATP合成酶催化下依赖于光的由ADP和Pi合成ATP的过程。
光合作用(photosynthesis):
绿色植物或光合细菌利用光能将CO2转化成有机化合物的过程。
光呼吸(photorespiration):
植物依赖光摄取氧进行磷酸乙醇酸代谢的过程。
光呼吸之所以发生是由于O2可以与CO2竞争核酮糖-1,5-二磷酸羧化氧化酶的活性部位。
滚环复制(rolling-circlereplication):
复制环状DNA的一种模式,在该模式中,DNA聚合酶结合在一个缺口链的3ˊ端,绕环合成与模板链互补的DNA,每一轮都是新合成的DNA取代前一轮合成的DNA。
H
核苷(nucleoside):
是由嘌呤或嘧啶碱基通过共价键与戊糖连接组成的化合物。
核糖与碱基一般都是由糖的异头碳与嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之间形成的β-N-糖苷键连接的。
核苷磷酸化酶(nucleosidephosphorylase):
能分解核苷生成含氮碱和戊糖的磷酸酯的酶。
核苷酸(nucleotide):
核苷的戊糖成分中的羟基磷酸化形成的化合物。
核苷水解酶(nucleosidehydrolase):
能分解核苷生成含氮碱和戊糖的酶。
核酶(ribozymes):
具有象酶那样催化功能的RNA分子。
核酸内切酶(endonuclease):
核糖核酸酶和脱氧核糖核酸酶中能够水解核酸分子内磷酸二酯键的酶。
核酸外切酶(exonuclease):
从核酸链的一端逐个水解下核苷酸的酶。
核糖核酸(RNA,ribonucleicacid):
通过3ˊ,5ˊ-磷酸二酯键连接形成的特殊核糖核苷酸序列的聚核糖核苷酸。
核糖体核糖核酸(rRNA,ribosomalrobonucleicacid):
作为核糖体组成成分的一类RNA,rRNA是细胞内最丰富的RNA。
核小体(nucleosome):
用于包装染色质的结构单位,是由DNA链绕一个组蛋白核缠绕构成的。
核心酶(coreenzyme):
大肠杆菌的RNA聚合酶全酶由五个亚基(α2ββ'
δ)组成,没有δ亚基的酶叫核心酶。
核心酶只能使已开始合成的RNA链延长,但不具有起始合成RNA的能力,必需加入δ亚基才表现出全部聚合酶的活性。
呼吸电子传递链(respiratoryelectron-transportchain):
由一系列可作为电子载体的酶复合体和辅助因子构成,可将来自还原型辅酶或底物的电子传递给有氧代谢的最终电子受体分子氧(O2)。
互补DNA(cDNA,complementaryDNA):
通过逆转录酶由mRNA模板合成的双链DNA。
化学渗透理论(chemiosmotictheory):
一种学说,主要论点是底物氧化期间建立的质子浓度梯度提供了驱动由ADP和Pi形成ATP的能量。
还原糖(reducingsugar):
羰基碳(异头碳)没有参与形成糖苷键,因此可被氧化充当还原剂的糖。
黄素单核苷酸(FMN,flavinmononucleotide):
核黄素磷酸,是某些氧化还原酶的辅酶。
黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD,flavinadeninedinucleotide):
是某些氧化还原酶的辅酶,含有核黄素。
回补反应(anapleroticreaction):
酶催化的补充柠檬酸循环中间代谢物的供给的反应,例如由丙酮酸羧化生成草酰乙酸的反应。
活化能(activationenergy):
将一摩尔反应底物中的所有分子由基态转化为过渡态所需要的能量。
合成代谢反应(anabolicreaction):
合成用于细胞维持和生长所需要的分子的代谢反应。
活性部位(activesite):
酶中含有底物结合部位和参与催化底物转化为产物的氨基酸残基的部分。
活性部位通常都位于蛋白质的结构域或亚基之间的裂隙或是蛋白质表面的凹陷部位,通常都是由在三维空间上靠得很近的一些氨基酸残基组成的。
J
基因(gene):
顺反子(cistron)。
泛指被转录的一个DNA片段。
在某些情况下,基因常用来指编码一个功能蛋白或RNA分子的DNA片段。
肌红蛋白(myoglobin):
是由一条肽链和一个血红素辅基组成的结合蛋白,是肌肉内储存氧的蛋白质,它的氧饱和曲线为双曲线型。
激素(hormone):
一类由内分泌组织合成的微量的化学物质,它由血液运输到靶组织,起着一个信使的作用调节靶组织(器官)的功能。
激素受体
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