PubMed中文使用手册Word文档格式.docx
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Clinical
Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:
治疗、诊断、病原学与预后。
Old
(使用以前的PubMed查询方式)
关于每一项的具体使用方法,
后面将会有详细介绍。
Related
Resources
Order
Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。
Grateful
Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。
Med也提供MEDLINE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。
Consumer
Health提供与MEDLINE
plus的链接,MEDLINE
plus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。
Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。
2.
主页面底部的介绍
Disclaimer在这里可以得到版权的相关信息,不承诺责任与担保的声明,与NLM下载的相关政策。
WritetotheHelpDesk发e-mail给NLM消费者服务部。
NCBI|NLM|NIH这里是对创建和维护PubMed的机构网页链接。
下面将举例说明查询的主体部分,也就是页面上部的使用方法。
假如我们这次的工作是查找与gallstone、pain有关的文献。
在对话框中输入查询词。
比如我们这次输入的是gallstone
pain,然后单击“go”按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索到的相关条目显示在屏幕上。
你可以随时向查询框输入查询词,点击“go”按钮开始新的查询。
“clear”按钮可以帮你清除查询框中的内容,然后开始一个新的查询。
在查询框前search提示后有一个下拉式菜单,你可以在这里选择其他的信息资源或NCBI的数据库。
Structure
搜索分子结构数据库(MMDB)The
Molecular
Modeling
Database,这个数据库保存的是由X线晶体成像、NMR分光光度法建立的三维分子结构。
Genome
提供所有基因与染色体纪录与图片的查询服务,这个库中数以百万的基因序列是由庞大的基因排序工作得来的。
PopSet
这个数据库中的内容是由相关种族、人类发展、突变研究得来的人类进化与人种差异的结果。
下面我们将详细介绍查询结果屏幕。
Display
Option(显示选项)
在Display后面有一个下拉式菜单,在这里可以选择各种显示选项。
Summary(简要格式):
在缺省设置下PubMed采用这种显示格式,他所显示的内容包括以下几项:
作者:
纪录中的所有作者都奖杯显示出来。
相关:
列出相关内容,如文章、蛋白质、核苷酸等(列出的文章不以摘要格式显示)。
文章题目:
英语以外的语种的题目将被翻译成英语,并且加上括号。
来源:
提供文献所在期刊名的缩写,出版时间,卷,页数,也包括语种(针对非英语文献),出版类型。
没有摘要的文献将显示“No
abstract
available”
标识数字:
提供PubMed标示(PMID)与MEDLINE唯一标识(UI)。
Brief(简报格式):
显示的条目内容包括作者姓名、文献名的前10个字母、PubMed唯一标识。
Abstract(摘要格式):
将会显示以下几项内容:
文献题目、作者、第一作者单位(地址)、期刊来源(期刊名简写、出版日期、卷、页数)、如果必要加上标注、出版类型、非英语文章加上标注、摘要、备注、PubMed与MEDLINE的唯一标识。
Legend(图例格式):
显示文献出处、名称、作者、第一作者单位(地址)、摘要、PubMed与MEDLINE的唯一标识。
Citation(引证格式):
提供如下信息:
文献出处、文献题目、作者、第一作者单位(地址)、如果必要加上标注、出版类型、摘要、红体显示题目中的错误字串、备注、MeSH词、人名作为主题、(如果存在)化学物质、(如果存在)巨大数字、PubMed与MEDLINE的唯一标识。
MEDLINE格式(MEDLINE):
用两字符的形式显示MEDLINE纪录中所有的内容,使用这种格式可以把记录下载到管理书目的软件程序。
Retrieval
Summary(查询概要):
查询概要显示了查到所有条目的数量,以及需要多少页来显示,缺省情况下20条/页。
Show后的下拉式菜单可以选择相应得每页显示的条目数。
Page(选择页数):
PubMed根据你的选择而显示不同页的内容,所选中的页数以红色显示,单击〉〉或〈〈显示其他页码。
Details(详细内容):
1)单击Details按钮可以显示你正在进行的查询方案,包括查询词、MeSH表映射与PubMed词语索引的映射;
错误信息,比如禁用词、截断警告、错误拼写等;
在编辑框中可以编辑一个新的查询方案,然后重新提交;
在这里还可以保存查询方案。
2)你可以在Details的对话框中修改查询方案,然后点击“Search”按钮进行新的查询。
3)Result下的数字是查询结果,并且可以链接到现今的查询结果。
PubMed实际上是一个更大数据库PubRef的子集,PubMed的查询一般不包括PubRef中的条目,除非你在编辑框中将“AND
notpubref[sb]”删除。
4)在Details中保存一个查询方案:
单击URL按钮,PubMed将返回到查询结果窗口,经过修改的查询方案将显示在对话框中,并且查询方案也被嵌入URL中,然后使用你的浏览器的书签功能将现在的URL保存成一个书签,保存后,可以编辑书签功能将此书签改为比较容易记忆的名字,使用方法与其他的书签相同。
5)定期查找功能:
如果你想每隔一段时间进行一次同样的查询,以找到最新的文献,可以这样作:
第一步如保存查询方案,通过选择书签的方式重新运行查询方案,然后,在Limit中的Entrezdate下拉菜单将时间限定在搜索范围。
Add
to
clipboard(加入剪切板)剪切板可以帮你保存察看你在一个或多个查询里所查到的内容;
剪切板中最大的保存数目是500条;
如果你连续在PubMed或其他Enterz数据库中不进行任何操作达1小时,剪切板中的内容将会消失。
要将条目加入剪切板,先将所需要的条目前的复选框选中,然后单击“Add
clipboard”按钮,一旦你将一条内容加入剪切板,纪录数字的颜色将会改变。
Save(保存)功能是保存查询到的条目。
如须保存所有的查询结果,先在Display下的下拉菜单中选择所需显示格式,单级“Save”按钮。
如果要保存特定的条目,现在条目前的复选框选中,点击“Save”按钮。
最大的保存的数量是5000,如果你想保存超过这个书目的内容,PubMed将显示一条提示你修改查询的信息。
Text(文本)使用文本功能可以将条目以纯文本的方式重新显示,把那些Web与HTML的内容去除,当看完纯文本的内容后,按浏览器的“Back”回到以前的Web页面。
你可以使用此功能将PubMed侧框与按钮除掉,在用打印机打印。
纯文本版本将会显示你所选中的条目的内容,如果没有选中任何条目,所有的条目内容都江北显示出来。
Order(定购)通过一些中间商得到文献的全文。
3.特征栏特征栏可以选择一些其他的功能
Limit
单击特征栏上的Limit显示Limit页,这里你可以设定:
i)
将搜索范围设定在一个特定的域。
ii)
将搜索范围设定在特定的年龄组、性别组、人类或动物学范围。
iii)也可以将搜索限定在某一语种出版的或某一特定的文章类型(如综述)。
iv)
设定只搜索包含摘要的文献。
v)
设定搜索Entrez数据库或Publication数据库。
vi)
设定搜索范围为PubMed数据库的某一子数据库(如Abridged
Index
Medicus
或AIDS相关的条目)。
下面将逐一进行介绍:
Field
Selection(域选择)你可以把搜索词限定在一个特定的域,缺省设置是所有的域;
打开下拉菜单选择你所需的域名。
Only
items
with
abstract(只搜索包含摘要的条目)如果将这个复选框选中,将只搜索包含摘要的文献。
Publication
Type(出版类型)其后的下拉菜单是常用的出版类型列表。
Language(语言)
将近40种语言列在此菜单里,都是在搜索时经常用到的。
Age(年龄)选择人类学研究的年龄组。
Gender(性别)在此下拉菜单选择人类学研究的性别组。
Human
or
Animal(人类或动物)在此下拉菜单选择研究对象。
Subset(子集)你可以将自己的搜索限制在下列4个组中的一个条目处理阶段。
Publisher:
出版商发送来的原样
PreMEDLINE:
正要往MEDLINE中加入的纪录
MEDLINE:
所有MeSH表索引的纪录主题词过滤
AIDS:
NLM’S
AIDS数据库期刊组
AIM:
Abridged
Medicus(120种英文期刊)
Dental:
牙医学期看的子集
Nursing:
护理学期刊的子集
PubRef:
这是一项将搜索词范围扩大的服务,选择此项将会搜索更广范围的科学期刊(如物理、天文等)而不是限定在PubMed中,这个选项也可以帮用户搜索到出版商网址上的文献全文。
Date:
(日期)
中包括自1966年来出版的文献,新条目周二到周四加入。
在PubMed中有两种日期表示方式:
Entrez日期是条目最初被加入PubMed的日期,Publication(出版)日期是文献出版时的日期。
PubMed已Entrez日期顺序来显示你的查询结果的,最新被加入的纪录第一个被显示出来。
Limiting
by
Date(日期限定)
使用Entrez下拉式菜单,可以把你的搜索范围设定在30天到10年,出版日期下拉菜单有Publication
Date
与Entrez
Date两项,以确定使用那种日期记法来设定搜索范围。
使用From、To框输入一个时间段;
以YYYY/MM/DD的格式输入日期(月和日可不填)
Limit
IndicatorLimit旁边的复选框如果处于选中状态则表示限定条件生效,如果开始搜索,生效的限定条件将会以黄色框Display按钮的上面。
注意再进行其他搜索前将Limit前的复选框去掉,以消除限定条件。
Preview/Index(预览/索引)
使用特征栏的Preview/Index可以做到:
①在显示条目之前显示所查到的文献数。
②随时通过增加查询单词来修改查询方案。
③在特定的搜索域中向方案里加入查询词。
④从Index中查看并选择词语来修改查询方案。
⑤在你修改查询时查看方案。
下面将详细加以介绍:
Preview(预览):
使用此功能可以在显示条目之前显示所查到的文献数。
在输入框中键入搜索词,然后单击Preview,PubMed返回的信息是条目的数量。
通过增加一个或多个单词来修改查询方案。
向查询框中加入另一个词语点击Preview,你可以继续向框中加入多个词语,点击Preview直到你希望得到的内容,当修改查询时可以看到搜索方案与查询结果的数量。
Preview显示的是历史记录中最近的三条记录,使用History可以看到最近100次的查询结果。
History中的Clear
History按钮也可以清除Preview/Index中的内容。
向下滚动Preview/Index找到“Add
Query
View
Index”部分,使用下拉菜单确定一个搜索域,向文本框中加入词语,单击Preview,向查询框中加入词语并且可以看到查询结果。
现在我们向查询框中加入MeSH词Nurse,使用下拉菜单确定一个搜索域,向文本框中填加一个词,单击Preview,你可以一直这样加入单词,单击Preview,直到完成你的搜索方案。
Preview自动使用“AND”运算符来将单词合为一体,即要求同时查询包含两个词的文献。
使用布尔运算符按钮。
使用布尔运算符将你要查找的词语连接起来,OR代表的是要查找的文献包括第一个搜索词或第二个词,NOT为“否”,包括第一个搜索词而不包括第二个词的文献。
每加入一个搜索词都要点击Preview来列出搜索结果的数量。
查询举例:
让我们查找一下有关碳水化合物(Carbohydrate)或大豆(Soybeans)对骨质疏松症影响的文献。
使用下拉菜单确定一个搜索域
,向文本框中加入一个词语,单击AND按钮,我们可以预览结果或者接续向文本框中填加搜索词,我们想找到有关Soybeans的文献,继续往下作,使用下拉菜单选择一个搜索域,向文本框中加入Soybeans,单击Preview来查看搜索结果。
Index(索引)中选择搜索词:
使用索引按钮可以从特定域中选择以索引的单词,并把他们加入查询方案之中。
Index(索引)中你可以查看某一个特定搜索域中词语列表。
在这里也可以使用布尔运算符来建立一个查询方案。
举例说明:
我们在下拉菜单中选择MeSH
Terms作为搜索域,键入搜索词Strikes,点击Index按钮,PubMed以字母序显示所选定搜索域中相关的词语,使用滚动条来上下移动列表。
在单词右边的括号里显示的是包括此词语的文献的数量。
使用Up、Down按钮按页上下翻动列表。
对话框显示了搜索词与搜索域,Result显示了文献的数量。
注意:
Preview缺省是AND将查询词语连在一起的。
你可以使用布尔运算符按自己的要求将他们结合起来,但你在使用布尔运算符将查询词语输入对话框以后,必须点击Preview才能看到查询结果。
将以Legislation
and
Jurisprudence为副标题的Strikes
Employs与以Statistics
numerical为副标题的Strikes
Employs点击高亮显示,单击AND按钮将选择的查询词加入对话框,选择缺省的设置是以OR连接起来的。
按住Ctrl键,可以在列表中连续选择多个查询词,当你所有需要的查询词都被高亮显示后,单击AND或OR将他们加入对话框,这时在PubMed的对话框中是这样的内容:
“Strikes,employee/legislationandjurisprudence”[MeSHTerms]OR“Strikes,employee/statisticsandnumericaldata”[MeSHTerms]”
让我们使用Index再把这次搜索修改一下,我们想把搜索缩小到有关Nurse与已设内容范围,在输入框中键入Nurse后点击Index,在索引中选择Nurse并单击AND将其加入对话框中。
点击Preview按钮查看查询结果的数量,对话框中显示的是搜索词、搜索域与布尔运算符。
History(历史记录)
历史记录中保存的是你所有的查询方案与查询结果,只有当你运行了一次查询之后,History中才有内容。
History屏幕将会显示:
你的查询方案、查询时间、查询到的文献数量。
使用History(历史记录)
你可以在查询方案中使用查询序数(the
search
Statement
Number),如#1、#2、#3等等。
例子:
#1
AND
#2、#7
#14。
如上个例子显示的,布尔运算符的字母必须大写。
History的一些小知识:
a)
History内所能记录的最大查询数是100
b)一旦查询数量超过100,PubMed会将最早的查询除去,加进最新的一次查询。
c)
如果两次查询内容相同,PubMed会将头一次的去除。
查询序数不能用在Detail中的保存到URL功能中,这是因为尽管查询方案被保存了,但你的History在你1小时没有动作后将会消失,这时你保存的方案中的查询序号也就会失效。
点击
Clear
History可以将History中的所有内容清除。
Clipboard(剪切板)
剪切板可以帮助你保存或查看在一个后多个查询中选择的条目,然后就可以打印、保存、订购剪切板中的内容了。
将条目左边的复选框选中,单击“Add
clipboard”就可以将其加入剪切板中,一旦某条被加入,剪切板的记录号码将会改变颜色。
剪切板使用的小知识
如果你没有用复选框选择任何条目,而去点击Add
clipboard,PubMed将会向其中加入500个条目。
b)剪切板中最大的储存数是500条。
剪切板中的内容如果你一小时没有任何操作将会消失。
使用剪切板
点击特征条上的Clipboard来观看剪切板中的内容,如果想删除剪切板中的某些项目,先将其左面的复选框选中,然后点击Remove
from
clipboard按钮;
要想清空剪切板,不选任何条目,单击Remove
clipboard按钮。
保存剪切板中的内容,首先选择一种显示方式,选中你想要的条目(如果想保存所有的条目,则哪个也不选),点击Save按钮。
Order(订购)在PubMed中查到的只是有关一篇文献的信息,而真正的文献全文是不提供的。
PubMed的Order功能提供的就是通过一些中介机构来获得全文的服务,这项服务通常是收费的。
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