生物统计学笔记.docx

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生物统计学

Statisticsistheintroductionofmathematicallanguageintospecificfieldsofscienc.

Itisanartandscienceforcollecting,analyzing,showingandinterpretingdata.

Sourcesofrandomness

Theprobleminvolvesalargenumberofdata,cannotbefullystudied,canonlybeusedina"certainway"toinvestigatepartofit.

Therandomerroroftheexperiment,thatis,theerrorcausedbytheuncontrolled,unrecongnizedfactorsinthetestprocess.

Twomajorfactions

Classical

Theprobabilityofaneventcanbeexplainedbyalargenumberofrepeatedexperiments,andthisexplanationdoesnotdependonthecognitivebody.

Bayes

Anyinferenceoftheparametersisnecessaryandcanonlybebasedontheposteriordistributionofparameters.

Commonstatisticalterms

Population:

Individual:

Sample:

asetofindividualsdrawnfromapopulationiscalledasample.

Eachindividualthatmakesupasampleiscalledasampleunit.

Thenumberofindividualsincludedinthesampleiscalledsamplesizeorsamplesizes,andthesamplecapacityisoftenrecordedasn.

Generallyinbiologicalresearch,n<=30samplesareusuallycalledsmallsamples.thecalculationandanalysisofsomestaticsbetweensmallandbigsamplesaredifferent.

Thebasiccharactersticofstatisticalanalysisistoinferthewholebysample.

Variablesandconstants

Deviationanderror

Deviation:

randomerror:

samplingerror

systematicerror:

lopsodederror

生物统计学教学大纲

2018年3月5日

18:

26

第一章 绪论（2学时）

        主要内容：

介绍课程的性质、内容和考核方式；了解生物统计学的发展历史和基本概念；通过具体实例说明生物体中随机现象的普遍性。

        重点和难点：

让学生认识到随机性在生命系统中具有普遍性。

          1.生物统计发展历史

          2.生物体中随机现象的普遍性

第二章：

试验·与特征数的计算（2学时）

主要内容：

试验资料的类型、收集与整理，层次分布表、直方图等收集和显示数据方式；特征数的计算，包括平均数、众数、方差、极差等。

重点和难点：

特征数的计算，平均数、众数、方差和极差的含义

1.试验材料的收集与整理

2.特征数的计算

第三章：

概率和概率分布（4学时）

主要内容：

大数定理；几种常见的理论分布，二项分布、泊松分布和正态分布；统计数的分布，t分布、χ2分布、F分布。

   重点和难点：

几种常见的理论分布和统计数的分布

   1.概率基础知识

   2.几种常见的理论分布

   3.统计数的分布

第四章：

统计推断 （8学时）

主要内容：

假设检验的原理和方法，具体假设检验方法，包括u检验、t检验和方差的同质性检验；参数估计和点估计，非参数检验。

   重点和难点：

假设检验的原理和方法，具体假设检验方法

   1.假设检验的原理和方法

   2.样本平均数的假设检验

   3.样本频率的假设检验

   4.方差的同质性检验

第五章：

卡方检验（2学时）

主要内容：

卡方检验的原理和方法，Pearson定理；卡方检验的应用，适合性检验和独立性检验。

重点和难点：

卡方检验的原理和方法

1.卡方检验的原理和方法

2.适合性检验

3.独立性检验

第六章：

方差分析（4学时）

主要内容：

方差分析、协方差分析的原理和方法，单因素、多因素方差分析，单因素、多因素协方差分析。

   重点和难点：

方差分析、协方差分析的原理和方法

   1.方差分析的基本原理

   2.单因素方差分析

   3.二因素方差分析

第七章：

直线回归与相关分析（4学时）

主要内容：

直线回归的原理和方法，曲线拟合的原理和方法，相关分析的原理和方法。

   重点和难点：

重点是直线回归的原理和方法，相关分析的原理和方法

   1.直线回归分析

    2.直线相关

第八章：

试验设计及其统计分析（2学时）

主要内容：

试验设计的基本原理，常用试验设计和分析方法。

   重点和难点：

重点是试验设计的基本原理，难点是每个原理的具体实现方式和相关分析方法。

   1.试验设计的基本原则：

重复、随机和局部控制

   2.局部控制的方法：

比对设计、随机区组设计和拉丁方设计等

第九章：

扩展知识（4学时,理论课）

主要内容：

课程项目实践相关知识，包括统计学和生物学相关基础知识，如多重检验和小样本检验等统计学知识，以及DNA突变和单核苷酸多态性、基因型与表型、转录因子结合等生物学知识。

   重点和难点：

生物学和统计学之间的内在逻辑关系

   1.DNA突变、转录因子结合、表型之间的联系

   2.课程项目实践和统计学在各个环节的衔接关系

实践环节：

课程项目实践（16学时，上机操作）

主要内容：

根据生物统计学基本原理约设置4个生物学问题，在教师提供数据和具体解析待解决生物学问题的前提下，学生自行完成项目。

项目结果以书面报告形式和课堂展示两种方式进行。

   重点和难点：

通过课程项目实践使学生初步具备应用统计学基本概念和方法分析并解决具体生物问题的能力。

        1.模式生物基因组GC含量特征或基因突变方向特征

         2.基因型和表型关联分析

        3.转录因子结合位点

        4.自由选题

来自<

生物统计学概念及主要内容

2018年3月9日

19:

54

Theconceptandmaincontentofbiostatistics

Concept:

Biostatisticsistheapplicationofmathematicalstatisticsinbiologicalresearch

Sourcesofbiologicalrandomness

Variability,uncertainty,complexity

Collationofdata&caculationofthecharacteristicnumber

2018年3月9日

20:

03

Typeoftestdata:

Collectionandcollationoftestdata

Quantitativecharacterisacharacterwhichcouldbecountedormeasured,thedatagetinthiswayiscalleddataofquantitativecharacteristics

Thequantitativetraitdataisdividedintotwokinds,discretetypeandcontinous.

Qualitativecharactermeansthecharacterwhichcouldbemeasureddirectly.

Thedataobtainedfromtheobservationofqualitytraitsisthequalitycharacterdata.Thistypeoftraitcannotbedirecylyusedasanumericalvalue,toobtaindataonsuchtraits,itisnecessarytoquantifytheresultsoftheirobservations.

Collectionoftestdata:

Overall,samples

Randomsampingmustmeet2conditions:

Equalopportunityofeachindividualbeingdrawninthewhole

Independentofeachotherinthewhole,whetherbeingdrawnisnotaffectedbyotherindividual.

Finishingoftestdata:

Theformulationofthedistributiontable

Thecaculationofthecharacteristicnumber

2018年3月11日

16:

47

Thedistributionofvariableshastwodistinctbasiccharacteristics:

centealizationanddispersion

Arithmeticmean:

thesummeansthenumber

Median:

thenumberstandingatthemiddleoftheline

Mode:

thevaluethathasthemostoccurrencesoftheobservedvalue

Geometric:

Applicationscope：

thegeometricalmeannumberisapplicabletothelogarithmicnormaldistributionofvariable