生物化学简明教程第四版课后习题.docx
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生物化学简明教程第四版课后习题
生物化学简明教程(第四版)课后习题
2蛋白质化学
1.用于测定蛋白质多肽链N端、C端的常用方法有哪些?
基本原理是什么?
解答:
(1)N-末端测定法:
常采用―二硝基氟苯法、Edman降解法、丹磺酰氯法。
①―二硝基氟苯(DNFB或FDNB)法:
多肽或蛋白质的游离末端氨基与―二硝基氟苯(―DNFB)反应(Sanger反应),生成DNP―多肽或DNP―蛋白质。
由于DNFB与氨基形成的键对酸水解远比肽键稳定,因此DNP―多肽经酸水解后,只有N―末端氨基酸为黄色DNP―氨基酸衍生物,其余的都是游离氨基酸。
②丹磺酰氯(DNS)法:
多肽或蛋白质的游离末端氨基与与丹磺酰氯(DNS―Cl)反应生成DNS―多肽或DNS―蛋白质。
由于DNS与氨基形成的键对酸水解远比肽键稳定,因此DNS―多肽经酸水解后,只有N―末端氨基酸为强烈的荧光物质DNS―氨基酸,其余的都是游离氨基酸。
③苯异硫氰酸脂(PITC或Edman降解)法:
多肽或蛋白质的游离末端氨基与异硫氰酸苯酯(PITC)反应(Edman反应),生成苯氨基硫甲酰多肽或蛋白质。
在酸性有机溶剂中加热时,N―末端的PTC―氨基酸发生环化,生成苯乙内酰硫脲的衍生物并从肽链上掉下来,除去N―末端氨基酸后剩下的肽链仍然是完整的。
④氨肽酶法:
氨肽酶是一类肽链外切酶或叫外肽酶,能从多肽链的N端逐个地向里切。
根据不同的反应时间测出酶水解释放的氨基酸种类和数量,按反应时间和残基释放量作动力学曲线,就能知道该蛋白质的N端残基序列。
(2)C―末端测定法:
常采用肼解法、还原
α-脂蛋白pI5.8<环境pH9.0,带负电荷,向正极移动。
4.何谓蛋白质的变性与沉淀?
二者在本质上有何区别?
解答:
蛋白质变性的概念:
天然蛋白质受物理或化学因素的影响后,使其失去原有的生物活性,并伴随着物理化学性质的改变,这种作用称为蛋白质的变性。
变性的本质:
分子中各种次级键断裂,使其空间构象从紧密有序的状态变成松散无序的状态,一级结构不破坏。
蛋白质变性后的表现:
① 生物学活性消失; ② 理化性质改变:
溶解度下降,黏度增加,紫外吸收增加,侧链反应增强,对酶的作用敏感,易被水解。
蛋白质由于带有电荷和水膜,因此在水溶液中形成稳定的胶体。
如果在蛋白质溶液中加入适当的试剂,破坏了蛋白质的水膜或中和了蛋白质的电荷,则蛋白质胶体溶液就不稳定而出现沉淀现象。
沉淀机理:
破坏蛋白质的水化膜,中和表面的净电荷。
蛋白质的沉淀可以分为两类:
(1)可逆的沉淀:
蛋白质的结构未发生显著的变化,除去引起沉淀的因素,蛋白质仍能溶于原来的溶剂中,并保持天然性质。
如盐析或低温下的乙醇(或丙酮)短时间作用蛋白质。
(2)不可逆沉淀:
蛋白质分子内部结构发生重大改变,蛋白质变性而沉淀,不再能溶于原溶剂。
如加热引起蛋白质沉淀,与重金属或某些酸类的反应都属于此类。
蛋白质变性后,有时由于维持溶液稳定的条件仍然存在,并不析出。
因此变性蛋白质并不一定都表现为沉淀,而沉淀的蛋白质也未必都已经变性。
5.下列试剂和酶常用于蛋白质化学的研究中:
CNBr,异硫氰酸苯酯,丹磺酰氯,脲,6mol/LHClβ-巯基乙醇,水合茚三酮,过甲酸,胰蛋白酶,胰凝乳蛋白酶,其中哪一个最适合完成以下各项任务?
(1)测定小肽的氨基酸序列。
(2)鉴定肽的氨基末端残基。
(3)不含二硫键的蛋白质的可逆变性。
若有二硫键存在时还需加什么试剂?
(4)在芳香族氨基酸残基羧基侧水解肽键。
(5)在甲硫氨酸残基羧基侧水解肽键。
(6)在赖氨酸和精氨酸残基侧水解肽键。
解答:
(1)异硫氰酸苯酯;
(2)丹黄酰氯;(3)脲;-巯基乙醇还原二硫键;(4)胰凝乳蛋白酶;(5)CNBr;(6)胰蛋白酶。
6.由下列信息求八肽的序列。
(1)酸水解得Ala,Arg,Leu,Met,Phe,Thr,2Val。
(2)Sanger试剂处理得DNP-Ala。
(3)胰蛋白酶处理得Ala,Arg,Thr和Leu,Met,Phe,2Val。
当以Sanger试剂处理时分别得到DNP-Ala和DNP-Val。
(4)溴化氰处理得Ala,Arg,高丝氨酸内酯,Thr,2Val,和Leu,Phe,当用Sanger试剂处理时,分别得DNP-Ala和DNP-Leu。
解答:
由
(2)推出N末端为Ala;由(3)推出Val位于N端第四,Arg为第三,而Thr为第二;溴化氰裂解,得出N端第六位是Met,由于第七位是Leu,所以Phe为第八;由(4),第五为Val。
所以八肽为:
Ala-Thr-Arg-Val-Val-Met-Leu-Phe。
7.一个α螺旋片段含有180个氨基酸残基,该片段中有多少圈螺旋?
计算该α-螺旋片段的轴长。
解答:
180/3.6=50圈,50×0.54=27nm,该片段中含有50圈螺旋,其轴长为27nm。
8.当一种四肽与FDNB反应后,用5.7mol/LHCl水解得到DNP-Val及其他3种氨基酸;当这四肽用胰蛋白酶水解时发现两种碎片段;其中一片用LiBH4(下标)还原后再进行酸水解,水解液内有氨基乙醇和一种在浓硫酸条件下能与乙醛酸反应产生紫(红)色产物的氨基酸。
试问这四肽的一级结构是由哪几种氨基酸组成的?
解答:
(1)四肽与FDNB反应后,用5.7mol/LHCl水解得到DNP-Val,证明N端为Val。
(2)LiBH4还原后再水解,水解液中有氨基乙醇,证明肽的C端为Gly。
(3)水解液中有在浓H2SO4条件下能与乙醛酸反应产生紫红色产物的氨基酸,说明此氨基酸为Trp。
说明C端为Gly-Trp…
(4)根据胰蛋白酶的专一性,得知N端片段为Val-Arg(Lys)…,以
(1)、
(2)、(3)结果可知道四肽的顺序:
N-Val-Arg(Lys)-Trp-Gly-C。
9.概述测定蛋白质一级结构的基本步骤。
解答:
(1)测定蛋白质中氨基酸组成。
(2)蛋白质的N端和C端的测定。
(3)应用两种或两种以上不同的水解方法将所要测定的蛋白质肽链断裂,各自得到一系列大小不同的肽段。
(4)分离提纯所产生的肽,并测定出它们的序列。
(5)从有重叠结构的各个肽的序列中推断出蛋白质中全部氨基酸排列顺序。
如果蛋白质含有一条以上的肽链,则需先拆开成单个肽链再按上述原则确定其一级结构。
如是含二硫键的蛋白质,也必须在测定其氨基酸排列顺序前,拆开二硫键,使肽链分开,并确定二硫键的位置。
拆开二硫键可用过甲酸氧化,使胱氨酸部分氧化成两个半胱氨磺酸。
10LysGlyValPheThr在球状蛋白质中所处的位置,为什么?
核酸
2.为什么DNA不易被碱水解,而RNA容易被碱水解?
解答:
因为RNA的核糖上有2-OH基,在碱作用下形成2,3-环磷酸酯,继续水解产生2-核苷酸和3-核苷酸。
DNA的脱氧核糖上无2-OH基,不能形成碱水解的中间产物,故对碱有一定抗性。
3.一个双螺旋DNA分子中有一条链的成分[A]=0.30,[G]=0.24,①请推测这一条链上的[T]和[C]的情况。
②互补链的[A],[G],[T]和[C]的情况。
解答:
①[T]+[C]=1–0.30–0.24=0.46;②[T]=0.30,[C]=0.24,[A]+[G]=0.46。
4.对双链DNA而言,①若一条链中(A+G)/(T+C)=0.7,则互补链中和整个DNA分子中(A+G)/(T+C)分别等于多少?
②若一条链中(A+T)/(G+C)=0.7,则互补链中和整个DNA分子中(A+T)/(G+C)分别等于多少?
解答:
①设DNA的两条链分别为α和β则:
Aα=Tβ,Tα=Aβ,Gα=Cβ,Cα=Gβ,因为:
(Aα+Gα)/(Tα+Cα)=(Tβ+Cβ)/(Aβ+Gβ)=0.7,所以互补链中(Aβ+Gβ)/(Tβ+Cβ)=1/0.7=1.43;在整个DNA分子中,因为A=T,G=C,所以,A+G=T+C,(A+G)/(T+C)=1;②假设同
(1),则Aα+Tα=Tβ+Aβ,Gα+Cα=Cβ+Gβ,所以,(Aα+Tα)/(Gα+Cα)=(Aβ+Tβ)/(Gβ+Cβ)=0.7;在整个DNA分子中,(Aα+Tα+Aβ+Tβ)/(Gα+Cα+Gβ+Cβ)=2(Aα+Tα)/2(Gα+Cα)=0.7
12.什么是DNA变性?
DNA变性后理化性质有何变化?
解答:
DNA双链转化成单链的过程称变性。
引起DNA变性的因素很多,如高温、超声波、强酸、强碱、有机溶剂和某些化学试剂(如尿素,酰胺)等都能引起变性。
DNA变性后的理化性质变化主要有:
①天然DNA分子的双螺旋结构解链变成单链的无规则线团,生物学活性丧失;②天然的线型DNA分子直径与长度之比可达1∶10,其水溶液具有很大的黏度。
变性后,发生了螺旋-线团转变,黏度显著降低;③在氯化铯溶液中进行密度梯度离心,变性后的DNA浮力密度大大增加,故沉降系数S增加;④DNA变性后,碱基的有序堆积被破坏,碱基被暴露出来,因此,紫外吸收值明显增加,产生所谓增色效应。
⑤DNA分子具旋光性,旋光方向为右旋。
由于DNA分子的高度不对称性,因此旋光性很强,其[a]=150。
当DNA分子变性时,比旋光值就大大下降。
4糖类的结构与功能
7.说明下列糖所含单糖的种类、糖苷键的类型及有无还原性?
(1)纤维二糖
(2)麦芽糖
(3)龙胆二糖(4)海藻糖
(5)蔗糖(6)乳糖
解答:
(1)纤维二糖含葡萄糖,β→1,4糖苷键,有还原性。
(2)麦芽糖含葡萄糖,α→1,4糖苷键,有还原性。
(3)龙胆二糖含葡萄糖,β→1,6糖苷键,有还原性。
(4)海藻糖含葡萄糖,α→1,1糖苷键,无还原性。
(5)蔗糖含葡萄糖和果糖,α→1,2糖苷键,无还原性。
(6)乳糖含葡萄糖和半乳糖,α→1,4糖苷键,有还原性。
6酶
11.对于一个符合米氏方程的酶,当[S]=3Km,[I]=2KI时(I为非竞争性抑制剂),则υ/Vmax的数值是多少(此处Vmax指[I]=0时对应的最大反应速率)?
解答:
利用非竞争性抑制剂的动力学方程计算:
其中α=1+[I]/Ki=3,则
所以,υ/Vmax=0.25。
12.试通过一种反竞争性抑制剂的动力学分析解释其抑制常数KI在数值上是否可能等于该抑制剂的IC50(IC50即酶的活力被抑制一半时的抑制剂浓度,假设酶浓度与底物浓度均固定不变)。
解答:
令v0为不存在抑制剂时的酶促反应速率,vi是存在反竞争性抑制剂时的反应速率,则当[I]=IC50时,酶活力被抑制一半,vi=v0/2。
由于
因此
Km=(α-2)[S]
如果KI在数值上等于IC50,则α=2,α-2=0,Km=0,而实际上,Km并不为零。
因此KI在数值上不可能等于IC50。
7维生素
1.什么是维生素?
列举脂溶性维生素与水溶性维生素的成员。
解答:
维生素的科学定义是参与生物生长发育与代谢所必需的一类微量小分子有机化合物。
脂溶性维生素主要包括维生素A、维生素D、维生素E、维生素K等,水溶性维生素主要包括维生素B族(维生素B1、维生素B2、维生素PP、维生素B6、维生素B12、叶酸、泛酸、生物素)、硫辛酸和维生素C。
2.为什么维生素D可数个星期补充一次,而维生素C必须经常补充?
解答:
维生素D是脂溶性的维生素,可以贮存在肝等器官中。
维生素C是水溶性的,不能贮存,所以必须经常补充。
3.维生素A主要存在于肉类食物中,为什么素食者并不缺乏维生素A?
解答:
维生素A可在人体内由植物性食物中的β―胡萝卜素转化而成。
4.将下面列出的酶、辅酶与维生素以短线连接。
解答:
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- 生物化学 简明 教程 第四 课后 习题
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