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4.NAD+、NADP+和FAD等通用电子载体以及ATP(通用能量载体)、CoA(通用酰基载体)结构上都有ADP。
从进化上的角度进行解释。
代谢途径的规律和保守性是生物进化理论的重要依据,体现了生物的统一性;
都有ADP,是支持生命起源于RNA的一个证据,RNA作为酶和信息储存分子。
Ch2生物能学介绍(viewtwice)
1.生物圈中能量的来源和转化。
(1)能量直接或间接的来自于太阳能;
(2)自养生物通过吸收太阳能转化为化学能储存在化合物中,异养生物通过分解这些化合物而获得能量;
2.什么是高能化合物?
有哪几类高能化合物?
掌握一些主要的高能化合物。
(1)水解可释放出大于25千焦/摩尔自由能的化合物;
(2)磷氧键型;
氮磷键型;
硫酯键型;
甲硫键型
(3)主要的高能化合物:
磷酸肌酸(氮磷键型),磷酸肌醇式丙酮酸(磷氧键型),NTP,乙酰-CoA(硫酯键型),腺苷基蛋氨酸(甲硫键型)。
3.ATP提供能量的机理。
ATP的两个磷酸肝键水解可形成更稳定的化合物并形成大量自由能;
ATP具有中等的磷酰基团转移势能,ATP通过基团转移活化底物的形式提供能量而不是直接水解(但肌肉收缩等生化过程是直接ATP,GTP水解提供能量);
在ATP参与的反应中,ATP可以提供磷酰基团,焦磷酰基团,腺苷酰基团;
腺苷酸化是一些生化反应增加能量偶联的机制;
萤火虫发光的机制是ATP分解成AMP和PPi;
4.ATP和磷酸肌酸在生物体内能量代谢中各起什么作用?
ATP是能量的载体;
磷酸肌酸是能量的储存者;
(证据:
通过磷酸肌酸迅速转化成ATP途径)
Ch3糖酵解和己糖的分解(viewtwice)
1.糖酵解十部反应小结
准备阶段4步,消耗2分子ATP:
(1)葡萄糖--己糖激酶-----葡萄糖-6-磷酸
特点:
第一个调控位点;
不可逆的反应;
消耗1分子ATP;
ATP以镁离子-ATP复合物形式参与反应;
己糖激酶同工酶D(葡萄糖激酶)为肝细胞特有,哺乳动物体内有4种己糖激酶;
具有激酶一般特点,底物诱导狭缝关闭特点。
调节:
己糖激酶主要由底物浓度调节,主要受葡萄糖-6-磷酸调节;
葡萄糖激酶对葡萄糖的亲和力比己糖激酶低100倍,不受葡萄糖-6-磷酸抑制,其主要作用是维持血糖水平。
(2)葡萄糖-6-磷酸----磷酸己糖异构酶----果糖-6-磷酸
果糖-6-磷酸第1位的-OH伸出,为下一步磷酸化做准备;
是一步由醛糖到酮糖的过程。
(3)果糖-6-磷酸---PFK1---果糖-1,6-双磷酸
第二个调节位点;
不可逆反应;
是限速步骤;
消耗一份子ATP;
磷酸果糖激酶-1(PFK-1)是限速酶,受激素多级调节。
变构抑制剂:
柠檬酸;
ATP;
变构激活剂:
果糖-2,6,-双磷酸(F-2,6-BP);
ADP,AMP;
F-2,6-BP是最强的激活剂,其通过增强PFK-1与F-6-P以及抑制ATP的抑制作用来激活,其水平受到PFK-2以及FPBase-2共同作用调节。
(4)果糖-1,6-双磷酸---醛缩酶---甘油醛-3-磷酸(GAP)+磷酸二羟丙酮(DHAP)
特点:
DHAP与GAP是异构分子;
该步虽为裂解反应,但是实际方向可逆;
体内更倾向于逆反应。
作用阶段6步,生成2分子NADH,4分子ATP。
(5)磷酸二羟丙酮(DHAP)---磷酸丙糖异构酶---甘油醛-3-磷酸(GAP)
GAP不断被移走,反应不断向右进行;
葡萄糖碳原子顺序变化:
GAP中1号碳来自于原3或4号碳,2号碳来源于原2或5号碳,3号碳来自于原1或6号碳。
(6)甘油醛-3-磷酸(GAP)+NAD++无机磷酸---甘油醛-3-磷酸脱氢酶---1,3双磷酸甘油酸+NADH+H+
氧还反应与磷酸化反应相结合,通过酶形成半缩硫醛中间物;
实际上因为GAP两分子,生成两分子被还原的NADH;
碘乙酸是甘油醛-3-磷酸脱氢酶抑制剂,通过碘乙酸与酶的结合确定酶活性位点在其半胱甘酸巯基上;
半胱氨酸的巯基亲和攻击羰基碳,形成半羧硫醛中间物,氧化羰基硫酯键,使氧化磷酸化偶联。
砷酸会形成氧化砷酸化,解偶联,使磷酸化与氧化分开组织ATP合成但是不组织糖酵解反应,砷酸酯易水解,直接获得第7步反应产物甘油酸-3-磷酸。
(7)1,3-双磷酸甘油酸+ADP---磷酸甘油酸激酶---3磷酸甘油酸+ATP
第一个底物水平磷酸化步骤,生成两分子ATP。
(8)3-磷酸甘油酸---磷酸甘油酸变位酶---2-磷酸甘油酸
3-磷酸甘油酸由于空间位阻的影响成为2-磷酸甘油酸,为下一步脱水做准备。
(9)2-磷酸甘油酸---烯醇化酶---烯醇式丙酮酸
是一步脱水反应;
低能键变高能键,为下一步磷酸化做准备;
(10)烯醇式丙酮酸+ADP---丙酮酸激酶---丙酮酸+ATP
是第三个调控位点;
第二步底物磷酸化,产生两分子ATP;
丙酮有一步从烯醇式转变为酮式的反应。
调节:
丙酮酸激酶主要受ATP调节;
变构抑制剂:
ATP;
丙氨酸
果糖-1,6-双磷酸
2.丙酮酸脱羧酶作用机制
丙酮酸脱羧酶是乙醇发酵中的一种酶,其仅在酵母与微生物中存在。
其脱羧机制是通过焦磷酸硫铵素中的噻唑环可以形成活性碳负离子,与丙酮酸结合使后者脱羧。
3.糖酵解乳酸发酵的生理意义
(1)在缺氧条件下为生命活动提供能量的途径,尤其对肌肉的收缩很重要;
(2)某些组织所依赖的获能或主要获能的方式,如视网膜,癌组织,神经;
成熟红细胞完全依赖于乳酸发酵供能;
(3)生成的乳酸可以被利用,在肝脏经糖异生乳酸途径重新生成糖。
4.举例说明同工酶在代谢调节中的意义
(1)同工酶是催化同一反应的不同酶,其具有相同的氨基酸序列,位于不同细胞或不同亚细胞结构,在酶动力学,辅酶因子,调控活性方面有所差异。
(2)举例:
乳酸脱氢酶LDH。
LDH是由两种肽链A,B按不同比例组成的异构体,五种同工酶分别存在于不同组织,如A4存在于骨骼肌细胞,B4存在于心肌细胞,A4易于与丙酮酸结合将丙酮酸还原为乳酸,B4易于将乳酸氧化为丙酮酸。
(3)同工酶在不同的组织器官表现不同的调节方式,同一细胞不同位置作用不同,不同的发育阶段或生理状态不同的同工酶起作用,不同同工酶对变构调节的反应不同。
5.为什么肿瘤组织糖酵解速度比正常组织快?
因为肿瘤细胞乳酸发酵增强,葡萄糖消耗增加。
肿瘤细胞生长速度快超过血管的生成,肿瘤组织处于低氧状态通过糖酵解途径提供能量,因而葡萄糖的消耗和酵解速度超过一般的组织。
6.磷酸戊糖途径生理意义
磷酸戊糖途径是从葡萄糖-6-磷酸开始在葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的催化下形成6-磷酸葡萄糖酸,进而代谢生成磷酸戊糖作为中间代谢物。
生理意义:
1.产生NADPH,其作为供氢体,作为谷胱甘肽的辅酶,参与超氧阴离子反应具有杀菌作用,参加肝脏生物转化反应。
2.合成核糖-5-磷酸。
3.是植物光合作用从CO2合成葡萄糖的部分反应。
4.非氧化阶段将5C变成6C,与糖酵解途径连接起来,使产物可根据需要调节。
7.蚕豆病的病因是什么?
如何体现疾病与遗传环境相互作用?
蚕豆病病因是葡萄糖-6-磷酸缺乏症,是一种伴性遗传病,导致NADPH合成不足,谷胱甘肽缺乏辅酶,无法抑制体内因为线粒体呼吸,磺胺类药物引起的体内的自由的羟氧自由基的毒性作用,从而导致红细胞溶解,血红蛋白释放至血液,引起黄疸和肾功能障碍。
诱因有进食黄豆,磺胺类抗生素等。
但这类患者抗疟疾的抵抗力比一般人强。
Ch4三羧酸循环(viewtwice)
1.丙酮酸脱羧氧化生成乙酰CoA
(1)反应部位:
真核细胞位于线粒体基质中
(2)丙酮酸脱羧酶复合体:
3个酶,5个辅酶
3个酶:
丙酮酸脱羧酶(TPP),二氢硫辛酸乙酰转移酶(硫辛酸),二氢硫辛酸脱羧酶(FAD)
5个辅酶:
TPP(acyl),FAD(electron),CoA(acyl),NAD+(electron),硫辛酸(both)
(3)五步反应:
【1】丙酮酸先与E1的TPP连接,释放一分子的CO2。
【2】与TPP解连接,与E2上的硫辛酸通过一个-SH连接,硫辛酸环打开。
【3】与CoA-SH结合,生成acyl-CoA,硫辛酸回复两个-SH结构。
【4】E3上的FAD被还原生成FADH2,硫辛酸彻底恢复环状结构。
【5】NAD+被还原为NADH,FADH2被氧化还原为FAD。
2.TCA循环的8步反应
(1)乙酰-CoA+草酰乙酸---柠檬酸合酶---柠檬酸
柠檬酸合酶的诱导契合效应,其需要先与草酰乙酸结合再与乙酰-CoA结合,避免乙酰-CoA的水解。
(2)柠檬酸--乌头酸酶--顺乌头酸+H2O--乌头酸酶---异柠檬酸
柠檬酸有前手性,其与酶活性位点上有互补性结合,所以生成的产物只能是异柠檬酸。
(3)异柠檬酸+NAD+---异柠檬酸脱氢酶---NADH+α-酮戊二酸+CO2
生成一分子NADH,释放一分子CO2。
第一步氧化
(4)α-酮戊二酸+CoA-SH+NAD+---α-酮戊二酸脱氢酶复合体---琥珀酰-CoA+NADH+CO2
第二步氧化
(5)琥珀酰-CoA+GDP---琥珀酰合成酶---琥珀酸+GTP+CoA-SH
底物水平磷酸化
(6),(7),(8)连续的三步氧化,水化,氧化
(6)琥珀酸+FAD---琥珀酸脱氢酶---延胡索酸+FADH2
第三步氧化
丙二酸是琥珀酸脱氢酶强有力的抑制剂
琥珀酸脱氢酶是TCA唯一的位于线粒体内膜的酶,直接与呼吸链相连。
(7)延胡索酸+H2O--延胡索酸酶--L-苹果酸
延胡索酸酶缺乏会导致严重的神经系统缺陷,肌张力障碍,线粒体脑肌病。
(8)L-苹果酸+NAD+--苹果酸脱氢酶--草酰乙酸+NADH
第四步氧化
3.三羧酸循环的限速步骤,能量生成反应,碳原子去向。
限速步骤:
第一步的乙酰CoA+草酰乙酸--柠檬酸合酶--柠檬酸
第三步的异柠檬酸+NAD+--异柠檬酸脱氢酶--α-酮戊二酸+NADH+CO2
第四步的α-酮戊二酸+CoA-SH+NAD+--α-酮戊二酸脱氢酶复合体--琥珀酰-CoA+NADH+CO2
能量生成反应:
第五步的琥珀酰-CoA+GDP--琥珀酰合成酶--GTP+琥珀酸+CoA-SH
碳原子去向
4.什么是回补反应?
意义是什么?
TCA循
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