实验12父权指数与父权概率文档格式.docx
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将已知实验结果的图谱进行分析,分别列出复合STR基因座分型结果,打开亲权鉴定软件,点击亲权鉴定菜单,选择三联体和试剂盒型号,按照方法输入父母子3人的基因型。
输入完毕后,在生成结果表中勾选,点击右下角的计算器计算PI。
2.二联体〔父子〕案件PI和父权概率计算
将已知实验结果的图谱进行分析,分别列出复合STR基因座分型结果,打开亲权鉴定软件,点击亲权鉴定菜单,选择二联体和试剂盒型号,按照方法输入父子3人的基因型。
注意事项
a.性别基因座〔AMEL〕中的X和Y在程序中分别用1和2表示,在设置基因座时,基因座序号 X请设为1,Y设为2。
b.等位基因输入时,分隔符可为'
/'
、'
-'
+'
,"
13/15"
或"
13-15"
13+15"
都是正确的,纯合子可只输入一个等位基因,如"
13/13"
可输入为"
13"
,性别基因〔AMEL〕在输入时可不使用分隔符,如"
X/Y"
可直接输入为"
XY"
XX"
可简化输入为"
X"
〔"
YY"
Y"
将不被程序所授〕,在偶合率计算时,AMEL的Pi值始终为,而在亲权鉴定中,AMEL不列入计算。
c.如果出现突变时,需按照司法部颁布的《亲权鉴定技术标准》〔SF/ZJD0105001-2010〕标准方法计算变异PI值。
【实验结果与分析】
三联体〔母子亲生关系已经确定〕及二联体案件PI和父权概率计算参照司法部颁布的《亲权鉴定技术标准》〔SF/ZJD0105001-2010〕标准方法,具体如下文所示。
鉴定意见是依据DNA分型结果对是否存在亲权关系进行的判断,一般分为“排除存在亲权关系”和“支持存在亲权关系”两种。
经过累积非父排除率大于99.99%的多个基因座检测,发现有3个以上的基因座不符合遗传规律,可以排除亲权关系。
经过累积非父排除率大于99.99%的多个基因座检测,发现所检测基因座均符合遗传规律,此时必须计算亲权指数PI〔即似然率LR〕,假设CPI≥10000,则支持亲权关系。
在p、q、r分别表示等位基因P、Q、R的分布频率时,可根据下列图表计算PI值。
图12-1三联体常染体STR基因座亲权指数计算公式
图12-2二联体常染体STR基因座亲权指数计算公式
图12-3三联体常染体不符合遗传规律的亲权指数计算公式
【实验注意事项】
1.在遇到突变时,务必按照常染体不符合遗传规律的亲权指数计算公式,以免PI计算错误。
【思考题】
1.使用多少个STR位点的试剂盒才能到达亲权鉴定PI值计算支持和排除的标准?
【附图】
图12-4父亲样本STR基因型图谱
图12-5母亲样本STR基因型图谱
图12-6孩子样本STR基因型图谱
图12-7DNA相关概率计算软件界面
附:
STR基因座的非父排除率参考表
基因座
非父排除率
D3S1358
TPOX
vWA
CSF1PO
FGA
D7S820
D8S1179
D2S1338
D18S51
D19S433
D21S11
D6S1043
D5S818
D12S391
D13S317
PentaD
D16S539
PentaE
TH01
19个STR基因座的等位基因分布频率
11
13
0.0020
16
8
12
14
0.2567
17
9
15
0.0303
18
10
27
0.1644
19
0.2361
20
28
0.1947
21
0.0948
29
0.0192
22
0.0018
30
23
31
24
32
25
33
26
34
35
7
7
5
8
6
9
10
11
12
13
14
15
17
THO1
0.0032
0.0053
0.0242
0.0021
0.0691
0.0043
0.3647
0.0139
0.1263
0.0544
0.1232
0.1948
0.1328
0.1177
0.1012
0.0674
0.0433
0.0851
0.0072
0.0752
0.0010
0.0693
21
0.0012
0.0581
22
0.0014
0.0772
25
0.0533
0.0489
0.0285
0.0168
0.0169
0.0058
0.0025
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