华中农业大学 分子生物学终极总结解读.docx
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华中农业大学分子生物学终极总结解读
系统生物学(SystematicBiology系统生物学是在细胞、组织、器官和生物体整体水平研究结构和功能各异的各种分子间及相互作用,并通过计算生物学来定量描述和预测生物功能的表形和行为。
S为沉降系数(sedimentationcoefficient),当用超速离心测定一个粒子的沉淀速度时,此速度与粒子的大小直径成比例。
负超螺旋(Negative Supercoiled):
指顺时针右手螺旋的DNA双螺旋以相反方向绕它的轴扭转而成负超螺旋,调节了DNA双螺旋本身的结构,松解了扭曲压力,使每个碱基对的旋转减少,甚至可打乱碱基配对。
生物体内most环状DNAisN形式存在。
基因印迹( Gene Impringting)是近年来发现的一种不遵从孟德尔定律的依靠单亲传递某些遗传学性状的现象geneconversion基因转换是指同源序列之间非交互性的信息转换。
muton突变子,一个基因内产生突变表型的最小单位
DNA shuffling体外同源重组技术。
分子伴侣(molecular chaperones)他将细胞核内能与组蛋白结合并能介导核小体有序组装的核质素称为分子伴侣。
核酶(ribozyme)催化功能的RNA分子,生物催化剂,降解特异的mRNA序列。
调节子(regulon)是指由同一个蛋白调控的一组基因
Attenuator:
衰减器,一个受到翻译控制的转录中止子结构。
由于翻译作用的影响,其后面的基因或者被转录,或者在衰减子处实现转录的中止即产生衰减作用。
Insulator:
绝缘子能阻断激活或失活效应的元件。
可在增和启之间阻断增强子的激活
作用,也可防止异染色质的扩增,引起基因表达。
Inverted repeat:
反向重复。
方向相反的两端重复序列。
TILLING:
Targeting Induced Local Lesions In Genome,即定向诱导基因组局部突变。
指以筛选突变基因为主的反向遗传学研究。
hoogsteen bonding :
在形成三螺旋与四螺旋DNA结构时,嘌呤A或G第6,7位与嘧啶3,4位形成的H键连接
heteroallele:
非全同等位基因,在同一基因座位(locus)中,不同突变位点(site)发生突变所形成的等位基因
homeobox:
不同的转录因子基因内具有相似的与DNA seq.结合的同源区域。
16. syn conformation of nucleoside:
核苷中碱基以糖苷键为轴旋转时的夹角χ= 0°±90°的构相 R-Loop;R环,当RNA链杂交的DNA双链中的互补链,从而取代DNA的杂交区上方延伸的环的形式的原始股
intron early:
早期内含子,认为所有基因原初均有intron,进化中原核生物中的intron逐渐消失
retro-transposon:
逆转录转座子,由RNA,cDNA介导的DNA分子插入基因组的现象,导致基因组的扩增
gRNA:
引导RNA,一种引导RNA编辑的小RNA分子,它能决定核苷酸对mRNA的插入或删除。
表观遗传(epigenetics)是指DNA序列不发生变化,但基因表达却发生了可遗传的改变
DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位以共价键结合一个甲基基团。
拟等位基因(pseudoalleles)是表型效应相似,功能密切相关,在染色体上的位置又紧密连锁的基因。
重复基因(duplicatefactor):
基因组中有多个拷贝的基因——真核30%,生物体快速发育
断裂基因/不连续基因(Splitgenes/interrupted):
编码蛋白质的序列中插入与编码无关的DNA间隔区,基因不连续
跳跃基因/转座子(Jumpinggene/Transposableelement):
即可移动的或可转移的遗传因子。
不仅细菌中,也较高等的动物
假基因(Pseudogenes):
是基因组中与编码基因序列非常相似的非功能性基因组DNA拷贝,不被转录,没明确生理意义。
来源:
保留了间隔序列的复制假基因.已加工假基因。
重叠基因(overlappinggene)同一段DNA顺序上,由于阅读框架不同或终止早晚不同,编码两个以上基因
复制子(replicon):
基因的一个单位。
能从起始点进行复制的部分。
复制体(replisome):
是参与DNA复制的蛋白质复合物,包含DNA聚合酶,引发酶,解旋酶,单链结合蛋白和其它辅助因子。
半保留复制(semiconservativereplication):
DNA复制的一种方式。
模板,两分子双链DNA,一条亲代链和一条新合成的链
半不连续复制(semidiscontinuousreplication):
DNA分子复制在分子全长中从若干起点向其两侧进行复制,然后经DNA连接酶将复制成的片段连接为一个完整分子,可使复制速度加快,加速生长发育
冈崎片断(Okazakifragment):
相对比较短的DNA链(大约1000核苷酸残基),是在DNA的滞后链的不连续合成期间生成的片段。
端粒(telomere):
是真核细胞染色体末端的特殊结构。
人(TTAGGG)与结合蛋白组成。
端粒有重要的生物学功能,可稳定染色体的功能,防止染色体DNA降解、末端融合,保护染色体结构基因,调节正常细胞生长。
端粒酶(tolomerase):
是使端粒延伸的反转录DNA成酶。
是个由RNA和蛋白质组成的核糖核酸-蛋白复合物。
其以RNA组分为模板,蛋白组分具有催化活性,以端粒3'末端为引物,合成端粒重复序列.主要特征是用它自身携带的RNA作模板,通过逆转录合成DNA。
酵母人工染色体(yeastartificialchromosome,YAC):
是利用酿酒酵母的染色体的复制元件构建的载体,其工作环境在酿酒酵母中。
它可以克隆和分析大片段的染色体DNA,DNA连接到酵母DNA上,shuzhuzhongfuzhi
细菌接合(conjugation/mating):
是细菌通过细胞的暂时沟通和染色体或质粒DNA的转移.基因重组
质粒不相容性(plasmidincompatibility):
指同种的或亲缘关系相近的两种质粒不能同时稳定地保持在一个细胞内的现象。
模板链(templatestrand):
碱基配对规律指引转录生成RNA的一股单链
转录单位(transcriptionunit):
是转录后形成一个RNA分子的一段DNA序列。
转录因子(transcriptionfactor):
结合在某基因上游特异核苷酸序列上的蛋白质,调控其基因的转录。
RNA聚合酶所需的辅助因子。
trans-splicing 反式剪接两条不同的pre-mRNA的外显子连接到一起与正常的顺式剪接不同,这里的两段外显子是来自不同的pre-mRNA的,但却可能来自同一基因。
CIS-splicing顺式剪接在同一个基因内,切除内含子,使相邻的外显子彼此相连的剪接方式顺式剪接。
调节子(regulon)是指由同一个蛋白调控的一组基因(或操纵子)
Isochizomer 制性核酸内切酶是可以识别DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶,简称限制酶。
PCD:
细胞程序性死亡(programmedcelldeath,PCD),又称凋亡(apoptosis),是指细胞内由于受到某种基因调控时所采取的一种主动的有序的死亡方式。
DNA后随链(Lagging strand of DNA ):
总体上沿着3到5方向延伸,但以小片段形式(5-3)
复制子(replicon):
是DNA复制是从一个DNA复制起点开始,最终由这个起点起始的复制叉完成的片段。
重组子(recon):
两个突变位点之间可发生交换产生野生型的最小单位.
基因的DNA双链中,转录时作为mRNA合成模板的那条单链叫做模板链或反义链(template or antisense strand)
PCR即多聚酶链式反应。
反应是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA复制,PCR的最大特点,是能将微量的DNA大幅增加
Leading strand - 先导链
snRNA(SmallnuclearRNA):
是细胞核内的小RNA,真核生物转录后RNA剪接体的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。
scRNA(SmallcytoplasmicRNA):
是细胞浆中的小RNA,它参与蛋白质的合成和运输。
snoRNAs(SmallnucleolarRNAs):
核仁小分子RNA真核核仁非编码RNA,具有保守的结构元件。
snRNPs(Smallnuclearribonucleoproteins):
是snRNA和蛋白质结合形成的小核核糖核蛋白颗粒。
剪接作用。
供体、受体剪接位点及分支顺序相互补。
同源异形盒(homeobox)是同源异形基因中都具有的保守基序
scRNPs(Smallcytoplasmicribonucleoproteins):
是scRNA与蛋白质结合形成的小核糖体蛋白颗粒,是小分子细胞浆核糖核蛋白
单顺反子(monocistronic)mRNA:
指只编码一条多肽链的的mRNA分子,真核生物。
多顺反子(polycistronic)mRNA:
指可编码多条肽链的mRNA分子,见于大多数原核生物。
密码子的简并性(degeneracy):
指同一种氨基酸具有两个或更多个密码子的现象。
同义密码子(synonym):
为同—种氨基酸编码的各个密码子。
Codonfamily(密码子家族):
为同一种氨基酸编码的所有密码子,它们相互间仅在第三密码子位置上有差异。
3’-UTR(3'UntranslatedRegion,3’非编码区):
为从终子密码子至转录终止的一段非翻译区。
5’-UTR(5'UntranslatedRegion,5'非编码区):
转录起始
RBS(ribosomalbindingsite,核糖体结合位点):
是起始密码子AUG上游的一段非翻译区序列。
等同为SD序列
蛋白质的自我剪接(self-splicing):
指蛋白质具有自我催化能力,能将自身的某些部位切除的现象。
Intein(内蛋白子):
是近年发现的一种新的翻译后加工的产物。
为一种在蛋白水平上通过自我剪接所进行的蛋白质转译后加工的方式。
Extein(蛋白外显子又称为外蛋白子):
在产生前体蛋白后再去掉内蛋白子,余下的外蛋白子以肽键的方式连接在一起成为成熟的蛋白。
整体而全面的认识。
RNA干涉(RNAinterference):
是指外源dsRNA引发生物体内的基因的同源序列降解,从而表现出的基因转录后的沉默现象,它与植物中的共抑制和真菌中的基因压制可能具有相同的作用机制。
在这一过程中,需要eIF2c类似蛋白因子、RNA螺旋酶、RNA依赖性RNA多聚酶、核糖核酸酶、ATP和转膜蛋白参与。
silent mutation沉默突变一类是虽有DNA的碱基变化,但不影响相应蛋白质的氨基酸变化,另一类DNA的碱基改变导致氨基酸变化,但不影响相应蛋白质的活性
突变(mutation):
指因DNA损伤而导致的DNA分子结构的变化。
点突变(pointmutation):
指DNA单一碱基的变异。
突变热点(hotspotsofmutation):
指DNA中突变率高的区域。
回复突变(reversemutation):
指那些从突变型等位基因变为野生型等位基因的突变。
抑制突变(suppressionmutation):
指当发生突变时,生物体采取措施,原来与此密码子对应的反密码子
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