应用STATA软件做meta分析终版PPT资料.pptx
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/,1.1STATA软件介绍,相对RevMan而言,Stata的Meta分析功能更全面和强大,该软件除了可以完成二分类变量和连续性变量的Meta分析,还可以进行Meta回归分析、累积Meta分析、单个研究影响分析、诊断试验的Meta分析、剂量反应关系Meta分析、生存分析资料meta分析等几乎所有Meta分析方法。
还可以对发表偏倚进行Beggs检验和Eggers检验。
目前,Stata软件是Meta分析备受推崇的软件。
1.2在STATA软件中下载与安装meta分析程序包,前面介绍了利用STATA软件可以进行meta分析,但这里要说明的是:
meta分析统计模块并不是STATA软件的标配,下载正版STATA软件后要进行meta分析,还必须单独下载和安装meta分析相关程序包才能进行meta分析。
具体的方法如下:
打开STATA软件,在确保计算机联网的情况下,在软件命令窗口输入如下命令:
finditmetan此时,软件将自动跳转到各种meta分析程序包的下载页面(如下图所示)。
finditmetan,右侧图中显示的是不同meta分析程序包列表,双击图中高亮蓝色数字“SJ-13-1st0284”即可安装。
因为meta分析常会涉及多个程序包,所以建议全部安装。
前面介绍了在STATA软件里安装不同的meta分析程序包,但我要告诉大家的是:
这只是说明在STATA软件中这些meta分析程序包可以用代码的形式执行了,对于很多初学者而言可能还是不太方便,接下来我们来展示一下,如何在STATA软件中为这些meta分析程序包安装一个菜单操作界面,具体的操作方式分为三个步骤:
安装”meta_dialog”程序包,生成profile.do文件运行profile.do文件,打开STATA软件,在确保计算机联网的情况下,在软件命令窗口输入如下命令:
finditmeta_dialog,点击此处进行安装请确保这些meta分析程序包都已经被安装好了,打开do文件编辑窗口:
在STATA软件命令窗口输入”helpmetadialog”在弹出的网页中复制如下部分到do文件编辑窗口,然后将文件命名为profile,并保存到电脑的C:
adoplus文件夹中。
在STATA软件命令窗口输入”runc:
adoplusprofile.do”命令,即可在STATA软件的user菜单下自动生成一个”Meta-Analysis”的菜单。
工具栏,结果窗口,命令窗口,变量窗,回顾窗,1.3STATA软件操作界面介绍STATA软件主界面,如果软件没有显示全这些界面,可参考下面的快捷方式:
ctrl+1,显示命令窗口ctrl+3,显示review窗口ctrl+4,显示variable窗口ctrl+5,显示variableproperties窗口,1.3STATA软件操作界面介绍,打开数据,数据查看,数据编辑,变量管理,STATA软件快捷菜单,1.3STATA软件操作界面介绍,STATA软件数据导入窗口,导入其他数据,1.3STATA软件操作界面介绍STATA软件meta分析模块介绍,发表偏倚,常用meta分析累积meta分析Meta回归分析漏斗图敏感性分析,2.1数据准备,作者,发表年份,对照组未发生,对照组发生数,试验组未发生,试验组发生数,更改变量名称,2.2菜单操作,2.2菜单操作,2.2菜单操作,模型,效应量,设定横坐标显示为0.05,1,15三个数值,指定图形中实验组和对照组名称,森林图字体大小,森林图权重显示大小,22,合并统计量,异质性Q检验,I2值,P值,2.3菜单输出结果解读,23异质性,中间短横线代表一个试验结果的可信区间,位于横线中间的小方块代表OR值。
最下方菱形符号代表纳入全部试验的综合结果。
短横线/菱形与无效线相交表示差异无统计学意义。
对于不利结局菱形在左边表示实验组比对照组效果好,右边表示对照组比实验组好;
有利结局则相反。
权重,95%可信区间,无效线,2.3菜单输出结果解读,2.4代码操作STATA软件实际上是以代码操作见长的,但初学者刚接触时可能会有些困难,用得多了就会发现其好处。
上述复杂的菜单操作步骤,只需用下面几行代码即可一步到位轻松实现,具体使用的是metan命令,在STATA软件中输入helpmetan可以查看帮助。
2.4代码操作metan命令可实现二分类和连续性变量meta分析,二分类变量的基本格式如下:
metanabcd,rrorrdfixedrandomfixedirandomipetoby(var)label(namevar=name,yearvar=year)rrpoolsriskratios(thedefault).orpoolsoddsratios.rdpoolsriskdifferences.fixedspecifiesafixedeffectmodelusingthemethodofMantelandHaenszel(thedefault).fixedispecifiesafixedeffectmodelusingtheinversevariancemethod.petospecifiesthatPetosmethodisusedtopooloddsratios.randomspecifiesarandomeffectsmodelusingthemethodofDerSimonian&
Laird,withtheestimateofheterogeneitybeingtakenfromthefromtheMantel-Haenszelmodel.randomispecifiesarandomeffectsmodelusingthemethodofDerSimonian&
Laird,withtheestimateofheterogeneitybeingtakenfromtheinverse-variancefixed-effectmodel.,2.4代码操作,上述菜单操作,也可用如下代码实现:
metandeath1alive1death0alive0,label(namevar=trialname,yearvar=year)fixedrrcountsgroup1(treatment)group2(control)xlabel(0.05,1,15)forcetexts(120)boxsca(40)本例中,在基本的metan格式下,新增了counts选项用于在森林图上显示四格表的数值,group1()和group2()用于在森林图上显示实验组和对照组的名称,xlabel()和force用于强制指定森林图的横坐标,texts()用于指定森林图中的字体大小,boxsca()用于指定森林图中表示权重的正方形大小。
28,作者发表年份,对照组标准差,对照组均数,对照组样本数,试验组样本数,试验组均数,试验组标准差,3.1数据准备,3.2菜单操作,3.2菜单操作,前三种计算的都是SMD计算MD,2.5菜单输出结果解读,随机效应模型下的SMD结果,随机效应模型下的WMD结果,2.5菜单输出结果解读,随机效应模型下的SMD森林图,随机效应模型下的WMD森林图,3.4代码操作,连续性变量的metan命令基本格式如下:
metanntreatmeantreatsdtreatncontrolmeancontrolsdcontrol,cohenhedgesglassnostandardfixedrandomby(var)label(namevar=name,yearvar=year)合并效应量选项cohenpoolsstandardisedmeandifferencesbythemethodofCohen(thedefault).hedgespoolsstandardisedmeandifferencesbythemethodofHedges.glasspoolsstandardisedmeandifferencesbythemethodofGlass.nostandardpoolsunstandardisedmeandifferences.统计模型选项fixedspecifiesafixedeffectmodelusingtheinversevariancemethod(thedefault).randomspecifiesarandomeffectsmodelusingtheDerSimonian&
Lairdmethod.,3.4代码操作,上述菜单操作,也可用如下代码实现:
metanntreatmeantreatsdtreatncontrolmeancontrolsdcontrol,label(namevar=author,yearvar=year)randomcohenxlabel(-4,-1.34,0.1)forcetexts(180)boxsca(40)本例中,在基本的metan格式下,新增了xlabel()和force用于强制指定森林图的横坐标,texts()用于指定森林图中的字体大小。
4.1异质性的定义,Cochrane协作网给出了meta分析异质性的广义和狭义两种定义:
广义上的异质性是指描述一系列研究间测量结果的变异和多样性,或是不同研究中的内在真实性差异。
狭义上是指专指统计学上的异质性,用于表明除仅可预见的偶然机会外各研究间存在的差异性。
4.2异质性的分类,CochraneHandbook将Meta分析的异质性分为:
临床异质性、方法学异质性和统计学异质性。
临床异质性是指:
参与者不同、干预措施的差异及研究的终点指标不同所导致的变异。
方法学异质性是指:
由于试验设计和质量方面的差异引起的,如盲法的应用和分配隐藏的不同,或者由于试验过程中对结局的定义和测量方法的不一致而出现的变异。
统计学异质性是指:
不同试验间被估计的治疗效应的变异,它是研究间临床和方法学上多样性的直接结果。
统计学计算异质性以数据为基础,其原理是各研究之间可信区间的重合程度越大,则各研究间存在统计学同质性的可能性越大,相反,可信区间重合程度越小,各研究之间存在统计学异质性的可能性越大。
4.3异质性的检验,异质性检验的方法归纳起来包括两大类:
一类是图示法;
另一类是统计学检验的方法。
图示法可以直观地观察是否存在异质性,包括森林图、拉贝图、星状图;
统计检验方法可以准确检验出有无异质性及异质性的大小,包括Q检验、I2检验、H检验。
4.3异质性的检验,下面以实例说明Stata软件中评价meta分析异质性的各种具体方法,具本实例数据如下图所示:
该数据是Ann
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