我所超算平台管理及收费方案Word文档格式.docx
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0532-80662795、15192485177、qiaoyh@
背景
在当代科研活动中,计算模拟已经成为与理论、实验鼎足而立的三大支柱之一。
不断提高的计算能力为科技工作者提供了大规模数据处理分析和复杂理论模型研究的有效手段,使人们能够在更加深入、更加精细和更大规模的水平上对研究对象进行分析和计算模拟,成为发现新现象、认识科学规律、进行工程设计不可替代的手段。
目前人们利用计算模拟的方法可以研究从基本粒子、生命现象到宇宙演化、社会系统等各种问题。
这极大改变和拓展了传统研究方法,推动了新学科领域的产生和科学研究能力的革命性发展,对当代科学和技术前沿开拓起着不可替代的作用。
中国科学院青岛生物能源与过程研究所(青能所)超级计算平台(超算平台)隶属于青能所规划战略与信息中心,于2009年3月正式开始运行,主要服务于青能所内的基因组、转录组、蛋白质组、代谢物组等生物学信息的高通量获取、处理、存储、注释、模拟和分析;
代谢工程中代谢通量和细胞活动的分析与模拟;
酶工程中蛋白质结构及其与其他分子之相互作用的解析和模拟;
复杂工程反应过程和反应器的设计与模拟等科研领域,同时也向所外科研、企业等用户提供超算服务。
收费的目的、原则
1.1.
收费目的
青能所超算平台收费不以盈利为目的,而是希望利用收取适当机时费、存储使用费、机器托管费、技术支持费等,建立体现科研成本量化、引导支持重点应用的一种新运行机制,其最终目的是促进超算用户自身水平的提高,充分发挥超算平台价值、实现超算平台的可持续发展。
在超算平台实行适当收费,可以避免由于免费导致的滥用,促进用户主动提升自身水平,促进有限资源的充分利用,发挥超算平台最大效能,尽最大可能满足我所重大项目对超算资源的需求,同时在满足我所需求之外对外提供合适的服务,促进资源充分利用,扩大对外影响,有利于我所超算平台的可持续发展。
1.2.
收费基本原则
青能所超算平台收费的基本原则是:
“公益性,非盈利,优先支持大规模并行计算,谁用谁交费,多用多交,收费标准与作业优先级挂钩,鼓励用户提高自身超级计算应用水平”。
收费方案
1.3.
机时费
青能所超算平台机时收费方案是在机时收费的基本原则下,参考超算平台运行维护成本(参见附1)制定收费标准。
按照“年度总运维成本/360天/24小时/核心数/运行效率”的公式计算:
90.6万/360/24/(8*38+32*2)/0.8=0.356元/(核*小时)。
90.6万元是按照居民生活电价格核算的年度总运维成本,如果超算平台需要按照工业用电缴纳电费,那么上述计算公式也应该按照工业用电价格核算。
除以运行效率0.8是由于存在作业调度等原因,超算系统不可能以100%的理想效率运行,根据院超级计算中心等的运维经验,运行效率最好一般也就在70%~80%左右。
基于此成本,并鼓励大家使用,超算平台基本机时(不含使用超算平台购置的专业商业软件等)收费标准如下:
●曙光TC2600刀片计算系统:
0.2元/(核*小时);
●曙光A950r-FSMP胖节点计算系统:
0.25元/(核*小时)。
用户类型
机时收费标准(元/(核*小时))
刀片系统
胖节点系统
所内用户
0.2
0.25
所外教育科研用户
0.4
0.5
所外企业用户
0.6~1.0
0.75~1.25
注:
由于超算系统本身原因(如死机)造成的作业终止等,此作业已经运行的机时将不统计在内;
对于由于用户程序本身问题导致退出的或者用户自己终止掉的、或者违规运行被系统或管理员终止掉的作业等其已经运行的机时将统计在内。
超算平台同时也为用户提供不同优先级队列、计算节点独占等多种运行方式,以满足用户作业对计算规模与时限要求的不同,不同的运行方式具有不同的价格,如下表所示:
队列中的作业规模要求
收费优惠方案(收费标准的百分比)
普通优先级
高优先级
8核及以下
110
120
9~32核
100
33~64核
90
65~160核
80
160核以上
70
其中:
●普通优先级队列:
用户作业需排队等待,当有可用计算资源时才运行,其预约的资源有可能被高优先级队列的作业抢占。
●高优先级队列:
用户作业需排队等待,当有可用计算资源时才运行,在必要时可以抢占普通优先级作业预约的资源,比普通优先级队列具有更优先计算的保障。
由于某些用户运行作业时需要独占计算资源方便用户随时使用,用户也可采取包月的方式独自占用资源(以刀片为单位),经批准后,用户在包月期间提交的作业将独占申请到的计算资源,独占资源无需与其他用户分享,可随时使用。
用户能申请的独占资源规模需根据系统运行情况动态决定,尽量不影响所内其他用户使用。
同时超算平台通过对大规模的并行应用作业提供大幅优惠,以体现对大规模并行应用的支持与引导作用,收费标准如下:
包月规模(刀片数)
收费标准(元/月)
1~4
1100*n
5~8
1000*n
9~20
900*n
>
20
n为用户独占刀片数目。
以上机时收费标准的制定主要参照的是超算平台硬件等费用,尚未考虑软件投资,而国外作为一个超算平台,其在软件方面投入的费用基本上是硬件的2倍以上,因此机时收费标准也应体现在软件方面的投资,并且为鼓励用户投资参与购买所需要的商业软件,降低购买的软件利用率不高导致浪费的风险,超算平台对购买的商业软件的收费将与购买此软件时用户的投资比例有关,具体收费标准见下表:
使用的软件类型
优惠方案(机时收费标准的百分比)
免费软件
商业软件
100+p*(1-n)*m/b*100
免费软件主要指开源或由用户自行提供的非超算中心购买的商业软件,以及超算中心购置的编译器、数值函数库等用户数较多的通用商业软件;
商业软件指的是超算平台参与出资购买的用户面比较窄的专业软件。
在计算公式100+p*(1-n)*m/b*100中:
l开始的100为基本机时价格的百分比。
lP为机时的市场价格,指的并不是商业软件的采购价格,而是指使用国内其它超算中心上此软件时的机时价格,青能所超算平台主要参考院超算中心与上海超算中心的价格,如使用上海超算中心Fluent软件时的收费标准为14元/(核*小时)。
ln为采购此软件时用户投资占总费用的比例。
lm为优惠折扣,初定m=0.5。
为鼓励团队投资购买软件,n越大,m将越小。
lb为基本机时价格,即不使用商业软件时的机时价格,比如0.2元/(核*小时)。
l最后的100表示转换成百分比。
为鼓励超算用户参与投资购买专业商业软件,超算平台还将与参与投资购买此商业软件的用户分享其他用户使用此商业软件时除基本机时费之外的与软件相关的收入,并按照投资比例进行分配,其分配方案的计算公式为:
参与购买此商业软件的用户收入占其他用户使用此商业软件时缴纳的总机时费的比例=(其他用户使用此商业软件的机时费-基本机时费)*采购此软件时某用户投资占总费用的比例。
(尚未考虑优惠折扣)
1.4.
存储使用费
为督促超算用户及时清理文件释放存储空间,避免超算平台存储被个别用户大量占据影响其他用户使用,超算平台免费为用户(以团队为单位)提供100GB存储空间,如需更大存储空间,用户需要对超过的部分缴纳一定费用,收费标准如下:
项目
用户类别
收费标准(元/(GB*月))
存储空间占用费
1.0
1.5
3.0
1.5.
机器托管费
超算机房供电系统和空调制冷等设施完善,超算平台也可对用户的存储系统和计算服务器等硬件提供托管服务,并可提供必要的维护服务,避免用户需自己解决场地及专门配置管理人员等。
用户的存储系统和计算服务器等设备如需存放在超算机房,需缴纳一定的费用,收费标准如下:
收费标准(每年)
存储系统
1.0元/GB
1.5元/GB
3.0元/GB
1U服务器
3000元
2U服务器
5000元
3U服务器
7000元
4U服务器
9000元
以上费用主要为空间占用费、电费、网络费等,网络费标准与所内网络收费标准一致(包含每月8GB科技网网外流量,超出部分需按所内网络收费标准另行缴纳网络费)。
用户托管的系统如需超算平台工作人员参与管理,需缴纳一定的管理费用,具体收费标准根据需要管理的内容等由双方协商。
1.6.
技术支持与开发费
青能所超算平台不仅对超算用户提供计算机时服务、存储服务、服务器托管服务等,还可对用户提供应用程序移植、程序调优与串行程序并行化改编、海量数据可视化、系统安装配置、超算平台搭建等技术支持以及开发服务。
为了更好地督促青能所超算平台用户主动学习,提高自身水平避免形成依赖他人而不主动学习的习惯,同时使超算平台工作人员可以将更多精力投入到对大多数用户都需要的公共事务中(如,研究超算平台运行性能优化,保障超算系统的稳定高效安全运行,与用户合作进行数值模拟开发工作等),提高超级计算技术服务质量,更好地用户的科研服务,体现超算平台工作人员价值,多方共赢,促进超算平台建设,实现超算环境的可持续发展。
对于这些技术支持与开发服务,将采用适当收费、合作开发等模式,收费遵循“公益性、非盈利、谁需要谁付费”的基本原则,注重用价格体现服务的差异性。
超算平台对具有共性的超算技术支持服务不收取费用。
超算平台工作人员将尽力完善用户使用手册,对常见的具有共性的问题形成常见问题在线列表,方便用户查阅并获取解决方案,同时超算平台工作人员也会定期举办免费的超算平台使用基础培训等帮助超算用户熟悉青能所超算平台,学会自行解决基本问题,提高自身水平。
超算平台对属于系统级或者必须管理员权限处理的问题不对用户收取任何费用,对于对于超算用户在超算平台上运行时遇到的其它问题,比如用户程序在编译、安装、运行时发生的,并且用户本身权限就可以解决的问题用户需缴纳一定的技术支持费,收费标准如下:
收费项目
收费标准
备注
程序编译
普通程序
200元/次
规模大或难度高的程序
双方协商
程序运行
100元/次
Linux系统
一般命令咨询
50元/次
用户所需要的脚本编写
用户培训
(每年免费培训之外的由用户要求的培训)
编译环境使用基础
1000元/次
培训半天
作业调度系统使用基础
Linux系统使用基础
MPI并行编程基础
2000元/次
培训一天
OpenMP并行编程基础
以上价格不包含会议室使用费用,如需使用会议室,所需费用由用户承担。
程序移植、开发、优化、并行化改编、数据处理、计算可视化等
超算平台工作人员也可以对用户使用自己的系统等提供技术支持服务,用户需要缴纳一定费用,收费标准如下:
系统基本安装配置
500元/台/次
超算系统配置
系统维护
系统使用培训
程序的编译、安装、运行
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- 关 键 词:
- 平台 管理 收费 方案